Mercurial > repos > iuc > ivar_variants
directory /test-data/zika/ @ 10:584beffa972b draft
| name | size | permissions |
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| [up] | drwxr-xr-x | |
 db/
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drwxr-xr-x | |
 Z52.consensus.fa
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10188 | -rw-r--r-- |
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Z52.consensus.fa.fai
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68 | -rw-r--r-- |
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Z52.consensus.qual.txt
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10140 | -rw-r--r-- |
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Z52.masked.sorted.depth
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Z52.merged.bam
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Z52.sorted.depth
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183059 | -rw-r--r-- |
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Z52.trimmed.sorted.depth
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179048 | -rw-r--r-- |
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Z52.tsv
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1516 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.masked.bam
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3366621 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.masked.sorted.bam
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3366621 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.sorted.bam
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4021097 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.sorted.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.trimmed.bam
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3524783 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.trimmed.sorted.bam
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Z52_a.trimmed.sorted.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.tsv
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1304 | -rw-r--r-- |
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Z52_a.vcf
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2621 | -rw-r--r-- |
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Z52_a_pass.vcf
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2002 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.masked.bam
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3968214 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.masked.sorted.bam
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3968214 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.sorted.bam
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4762174 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.sorted.bam.bai
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96 | -rw-r--r-- |
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Z52_b.trimmed.bam
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Z52_b.trimmed.sorted.bam
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Z52_b.trimmed.sorted.bam.bai
|
96 | -rw-r--r-- |
|
Z52_b.tsv
|
1455 | -rw-r--r-- |
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primer_mismatchers_indices.txt
|
40 | -rw-r--r-- |
|
primers_Z52_consensus.tsv
|
336 | -rw-r--r-- |