comparison test-data/kc-align.clustal @ 8:1c65ddbaeefa draft

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date Mon, 05 Oct 2020 20:09:54 +0000
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118 118
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141 MN996528.1 TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGA
140 MT019531.1 TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGA 142 MT019531.1 TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGA
141 MN996528.1 TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGA
142 MT019532.1 TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGA
143 143
144 NC_045512.2 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG 144 NC_045512.2 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
145 MT019532.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
146 MN996528.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
145 MT019531.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG 147 MT019531.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
146 MN996528.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
147 MT019532.1 TATTTCAACTGAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTG
148 148
149 NC_045512.2 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT 149 NC_045512.2 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
150 MT019532.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
151 MN996528.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
150 MT019531.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT 152 MT019531.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
151 MN996528.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
152 MT019532.1 AAGGTTTTAATTGTTACTTTCCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACT
153 153
154 NC_045512.2 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT 154 NC_045512.2 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
155 MT019532.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
156 MN996528.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
155 MT019531.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT 157 MT019531.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
156 MN996528.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
157 MT019532.1 AATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTAGTAGTACTTTCTTTTGAACT
158 158
159 NC_045512.2 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG 159 NC_045512.2 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG
160 MT019532.1 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG
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160 MT019531.1 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG 162 MT019531.1 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG
161 MN996528.1 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG
162 MT019532.1 TCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCTACTAATTTGG
163 163
164 NC_045512.2 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT 164 NC_045512.2 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT
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166 MN996528.1 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT
165 MT019531.1 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT 167 MT019531.1 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT
166 MN996528.1 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT
167 MT019532.1 TTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT
168 168
169 NC_045512.2 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG 169 NC_045512.2 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG
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171 MN996528.1 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG
170 MT019531.1 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG 172 MT019531.1 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG
171 MN996528.1 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG
172 MT019532.1 GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAG
173 173
174 NC_045512.2 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA 174 NC_045512.2 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA
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175 MT019531.1 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA 177 MT019531.1 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA
176 MN996528.1 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA
177 MT019532.1 AGACATTGCTGACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGA
178 178
179 NC_045512.2 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA 179 NC_045512.2 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
180 MT019532.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
181 MN996528.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
180 MT019531.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA 182 MT019531.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
181 MN996528.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
182 MT019532.1 TTCTTGACATTACACCATGTTCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCA
183 183
184 NC_045512.2 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG 184 NC_045512.2 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG
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186 MN996528.1 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG
185 MT019531.1 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG 187 MT019531.1 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG
186 MN996528.1 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG
187 MT019532.1 GGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTTCTTTATCAGGATGTTAACTG
188 188
189 NC_045512.2 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC 189 NC_045512.2 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
190 MT019532.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
191 MN996528.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
190 MT019531.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC 192 MT019531.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
191 MN996528.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
192 MT019532.1 CACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACTCCTACTTGGC
193 193
194 NC_045512.2 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA 194 NC_045512.2 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
195 MT019532.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
196 MN996528.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
195 MT019531.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA 197 MT019531.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
196 MN996528.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
197 MT019532.1 GTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA
198 198
199 NC_045512.2 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG 199 NC_045512.2 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
200 MT019532.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
201 MN996528.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
200 MT019531.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG 202 MT019531.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
201 MN996528.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
202 MT019532.1 ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGG
203 203
204 NC_045512.2 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG 204 NC_045512.2 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
205 MT019532.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
206 MN996528.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
205 MT019531.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG 207 MT019531.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
206 MN996528.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
207 MT019532.1 TGCAGGTATATGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGG
208 208
209 NC_045512.2 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT 209 NC_045512.2 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
210 MT019532.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
211 MN996528.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
210 MT019531.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT 212 MT019531.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
211 MN996528.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
212 MT019532.1 CACGTAGTGTAGCTAGTCAATCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGT
213 213
214 NC_045512.2 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA 214 NC_045512.2 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
215 MT019532.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
216 MN996528.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
215 MT019531.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA 217 MT019531.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
216 MN996528.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
217 MT019532.1 GCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAACTCTATTGCCATACCCACAAA
218 218
219 NC_045512.2 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA 219 NC_045512.2 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
220 MT019532.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
221 MN996528.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
220 MT019531.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA 222 MT019531.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
221 MN996528.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
222 MT019532.1 TTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCTATGACCAAGA
223 223
224 NC_045512.2 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC 224 NC_045512.2 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC
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225 MT019531.1 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC 227 MT019531.1 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC
226 MN996528.1 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC
227 MT019532.1 CATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC
228 228
229 NC_045512.2 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT 229 NC_045512.2 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
230 MT019532.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
231 MN996528.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
230 MT019531.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT 232 MT019531.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
231 MN996528.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
232 MT019532.1 AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTT
233 233
234 NC_045512.2 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC 234 NC_045512.2 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC
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235 MT019531.1 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC 237 MT019531.1 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC
236 MN996528.1 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC
237 MT019532.1 AACTGGAATAGCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCAC
238 238
239 NC_045512.2 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT 239 NC_045512.2 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
240 MT019532.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
241 MN996528.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
240 MT019531.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT 242 MT019531.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
241 MN996528.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
242 MT019532.1 AAGTCAAACAAATTTACAAAACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTT
243 243
244 NC_045512.2 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT 244 NC_045512.2 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
245 MT019532.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
246 MN996528.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
245 MT019531.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT 247 MT019531.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
246 MN996528.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
247 MT019532.1 AATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCAAAACCAAGCAAGAGGTCATT
248 248
249 NC_045512.2 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA 249 NC_045512.2 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
250 MT019532.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
251 MN996528.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
250 MT019531.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA 252 MT019531.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
251 MN996528.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
252 MT019532.1 TATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGATGCTGGCTTCA
253 253
254 NC_045512.2 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT 254 NC_045512.2 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
255 MT019532.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
256 MN996528.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
255 MT019531.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT 257 MT019531.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
256 MN996528.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
257 MT019532.1 TCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT
258 258
259 NC_045512.2 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA 259 NC_045512.2 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA
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261 MN996528.1 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA
260 MT019531.1 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA 262 MT019531.1 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA
261 MN996528.1 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA
262 MT019532.1 TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGA
263 263
264 NC_045512.2 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT 264 NC_045512.2 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
265 MT019532.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
266 MN996528.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
265 MT019531.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT 267 MT019531.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
266 MN996528.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
267 MT019532.1 TGAAATGATTGCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTT
268 268
269 NC_045512.2 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG 269 NC_045512.2 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
270 MT019532.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
271 MN996528.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
270 MT019531.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG 272 MT019531.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
271 MN996528.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
272 MT019532.1 CTGGTTGGACCTTTGGTGCAGGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATG
273 273
274 NC_045512.2 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA 274 NC_045512.2 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
275 MT019532.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
276 MN996528.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
275 MT019531.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA 277 MT019531.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
276 MN996528.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
277 MT019532.1 CAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGAGTTACACAGAATGTTCTCTA
278 278
279 NC_045512.2 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA 279 NC_045512.2 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
280 MT019532.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
281 MN996528.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
280 MT019531.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA 282 MT019531.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
281 MN996528.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
282 MT019532.1 TGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCTATTGGCAAAA
283 283
284 NC_045512.2 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT 284 NC_045512.2 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT
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285 MT019531.1 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT 287 MT019531.1 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT
286 MN996528.1 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT
287 MT019532.1 TTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT
288 288
289 NC_045512.2 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG 289 NC_045512.2 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG
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290 MT019531.1 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG 292 MT019531.1 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG
291 MN996528.1 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG
292 MT019532.1 GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAG
293 293
294 NC_045512.2 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC 294 NC_045512.2 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC
295 MT019532.1 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC
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295 MT019531.1 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC 297 MT019531.1 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC
296 MN996528.1 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC
297 MT019532.1 CTCCAATTTTGGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTC
298 298
299 NC_045512.2 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA 299 NC_045512.2 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA
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300 MT019531.1 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA 302 MT019531.1 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA
301 MN996528.1 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA
302 MT019532.1 TTGACAAAGTTGAGGCTGAAGTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGA
303 303
304 NC_045512.2 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA 304 NC_045512.2 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
305 MT019532.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
306 MN996528.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
305 MT019531.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA 307 MT019531.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
306 MN996528.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
307 MT019532.1 CTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAACAATTAATTAGAGCTGCAGA
308 308
309 NC_045512.2 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC 309 NC_045512.2 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
310 MT019532.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
311 MN996528.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
310 MT019531.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC 312 MT019531.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
311 MN996528.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
312 MT019532.1 AATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCAGAGTGTGTAC
313 313
314 NC_045512.2 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG 314 NC_045512.2 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
315 MT019532.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
316 MN996528.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
315 MT019531.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG 317 MT019531.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
316 MN996528.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
317 MT019532.1 TTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG
318 318
319 NC_045512.2 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA 319 NC_045512.2 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
320 MT019532.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
321 MN996528.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
320 MT019531.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA 322 MT019531.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
321 MN996528.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
322 MT019532.1 TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTA
323 323
324 NC_045512.2 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG 324 NC_045512.2 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
325 MT019532.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
326 MN996528.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
325 MT019531.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG 327 MT019531.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
326 MN996528.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
327 MT019532.1 TGTCCCTGCACAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATG
328 328
329 NC_045512.2 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA 329 NC_045512.2 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
330 MT019532.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
331 MN996528.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
330 MT019531.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA 332 MT019531.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
331 MN996528.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
332 MT019532.1 ATGGAAAAGCACACTTTCCTCGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACA
333 333
334 NC_045512.2 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC 334 NC_045512.2 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
335 MT019532.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
336 MN996528.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
335 MT019531.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC 337 MT019531.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
336 MN996528.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
337 MT019532.1 CACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTATGAACCACAAATCATTACTAC
338 338
339 NC_045512.2 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA 339 NC_045512.2 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
340 MT019532.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
341 MN996528.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
340 MT019531.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA 342 MT019531.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
341 MN996528.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
342 MT019532.1 AGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATAGGAATTGTCA
343 343
344 NC_045512.2 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG 344 NC_045512.2 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
345 MT019532.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
346 MN996528.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
345 MT019531.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG 347 MT019531.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
346 MN996528.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
347 MT019532.1 ACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG
348 348
349 NC_045512.2 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG 349 NC_045512.2 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG
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351 MN996528.1 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG
350 MT019531.1 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG 352 MT019531.1 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG
351 MN996528.1 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG
352 MT019532.1 GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGG
353 353
354 NC_045512.2 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG 354 NC_045512.2 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
355 MT019532.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
356 MN996528.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
355 MT019531.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG 357 MT019531.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
356 MN996528.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
357 MT019532.1 TGACATCTCTGGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTG
358 358
359 NC_045512.2 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC 359 NC_045512.2 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
360 MT019532.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
361 MN996528.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
360 MT019531.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC 362 MT019531.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
361 MN996528.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
362 MT019532.1 ACCGCCTCAATGAGGTTGCCAAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTC
363 363
364 NC_045512.2 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG 364 NC_045512.2 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
365 MT019532.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
366 MN996528.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
365 MT019531.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG 367 MT019531.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
366 MN996528.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
367 MT019532.1 CAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATAAAATGGCCATGGTACATTTG
368 368
369 NC_045512.2 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC 369 NC_045512.2 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
370 MT019532.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
371 MN996528.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
370 MT019531.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC 372 MT019531.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
371 MN996528.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
372 MT019532.1 GCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTGACAATTATGC
373 373
374 NC_045512.2 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT 374 NC_045512.2 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
375 MT019532.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
376 MN996528.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
375 MT019531.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT 377 MT019531.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
376 MN996528.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
377 MT019532.1 TTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT
378 378
379 NC_045512.2 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG 379 NC_045512.2 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG
380 MT019532.1 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG
381 MN996528.1 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG
380 MT019531.1 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG 382 MT019531.1 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG
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382 MT019532.1 GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGG
383 383
384 NC_045512.2 AGTCAAATTACATTACACA 384 NC_045512.2 AGTCAAATTACATTACACA
385 MT019532.1 AGTCAAATTACATTACACA
386 MN996528.1 AGTCAAATTACATTACACA
385 MT019531.1 AGTCAAATTACATTACACA 387 MT019531.1 AGTCAAATTACATTACACA
386 MN996528.1 AGTCAAATTACATTACACA 388
387 MT019532.1 AGTCAAATTACATTACACA 389
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