Mercurial > repos > iuc > kc_align
view test-data/kc-align.fasta @ 0:04b13fc809ac draft
"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/kc-align commit 3b23039a67d8cb2d185c56df50b837e5601a95bf"
| author | iuc |
|---|---|
| date | Tue, 17 Mar 2020 15:24:15 -0400 |
| parents | |
| children | 60ed1c94f584 |
line wrap: on
line source
>MN908947.3 Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome ATG---TTTGTTTTTCTTGTTTTA---TTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTT ACAACCAGAACTCAATTACCC------------CCTGCATACACTAAT------TCTTTC ACACGTGGTGTTTATTACCCTGACAAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAG GACTTGTTCTTACCTTTCTTTTCCAATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGG ACCAATGGTACTAAGAGGTTTGATAACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTT GCTTCCACTGAGAAGTCTAACATAATAAGAGGCTGGATTTTTGGTACTACTTTAGATTCG AAGACCCAGTCCCTACTTATTGTTAATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAA TTTCAATTTTGTAATGATCCATTTTTGGGTGTTTATTACCACAAAAACAACAAAAGTTGG ATGGAAAGTGAGTTCAGAGTTTATTCTAGTGCGAATAATTGCACTTTTGAATATGTCTCT CAGCCTTTTCTTATGGACCTTGAAGGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTT GTGTTTAAGAATATTGATGGTTATTTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTA GTGCGTGATCTCCCTCAGGGTTTTTCGGCTTTAGAACCATTGGTAGATTTGCCAATAGGT ATTAACATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGCTTTACATAGAAGTTATTTGACTCCTGGT GAT------TCTTCTTCAGGTTGGACAGCTGGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTT CAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATAATGAAAATGGAACCATTACAGATGCTGTAGAC TGTGCACTTGACCCTCTCTCAGAAACAAAGTGTACGTTGAAATCCTTCACTGTAGAAAAA GGAATCTATCAAACTTCTAACTTTAGAGTCCAACCAACAGAATCTATTGTTAGATTTCCT AATATTACAAACTTGTGCCCTTTTGGTGAAGTTTTTAACGCCACCAGATTTGCATCTGTT TATGCTTGGAACAGGAAGAGAATCAGCAACTGTGTTGCTGATTATTCTGTCCTATATAAT TCCGCATCATTTTCCACTTTTAAGTGTTATGGAGTGTCTCCTACTAAATTAAATGATCTC TGCTTTACTAATGTCTATGCAGATTCATTTGTAATTAGAGGTGATGAAGTCAGACAAATC GCTCCAGGGCAAACTGGAAAGATTGCTGATTATAATTATAAATTACCAGATGATTTTACA GGCTGCGTTATAGCTTGGAATTCTAACAATCTTGATTCTAAGGTTGGTGGTAATTATAAT TACCTGTATAGATTGTTTAGGAAGTCTAATCTCAAACCTTTTGAGAGAGATATTTCAACT GAAATCTATCAGGCCGGTAGCACACCTTGTAATGGTGTTGAAGGTTTTAATTGTTACTTT CCTTTACAATCATATGGTTTCCAACCCACTAATGGTGTTGGTTACCAACCATACAGAGTA GTAGTACTTTCTTTTGAACTTCTACATGCACCAGCAACTGTTTGTGGACCTAAAAAGTCT ACTAATTTGGTTAAAAACAAATGTGTCAATTTCAACTTCAATGGTTTAACAGGCACAGGT GTTCTTACTGAGTCTAACAAAAAGTTTCTGCCTTTCCAACAATTTGGCAGAGACATTGCT GACACTACTGATGCTGTCCGTGATCCACAGACACTTGAGATTCTTGACATTACACCATGT TCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAATACTTCTAACCAGGTTGCTGTT CTTTATCAGGATGTTAACTGCACAGAAGTCCCTGTTGCTATTCATGCAGATCAACTTACT CCTACTTGGCGTGTTTATTCTACAGGTTCTAATGTTTTTCAAACACGTGCAGGCTGTTTA ATAGGGGCTGAACATGTCAACAACTCATATGAGTGTGACATACCCATTGGTGCAGGTATA TGCGCTAGTTATCAGACTCAGACTAATTCTCCTCGGCGGGCACGTAGTGTAGCTAGTCAA TCCATCATTGCCTACACTATGTCACTTGGTGCAGAAAATTCAGTTGCTTACTCTAATAAC TCTATTGCCATACCCACAAATTTTACTATTAGTGTTACCACAGAAATTCTACCAGTGTCT ATGACCAAGACATCAGTAGATTGTACAATGTACATTTGTGGTGATTCAACTGAATGCAGC AATCTTTTGTTGCAATATGGCAGTTTTTGTACACAATTAAACCGTGCTTTAACTGGAATA GCTGTTGAACAAGACAAAAACACCCAAGAAGTTTTTGCACAAGTCAAACAAATTTACAAA ACACCACCAATTAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCAGATCCATCA AAACCAAGCAAGAGGTCATTTATTGAAGATCTACTTTTCAACAAAGTGACACTTGCAGAT GCTGGCTTCATCAAACAATATGGTGATTGCCTTGGTGATATTGCTGCTAGAGACCTCATT TGTGCACAAAAGTTTAACGGCCTTACTGTTTTGCCACCTTTGCTCACAGATGAAATGATT GCTCAATACACTTCTGCACTGTTAGCGGGTACAATCACTTCTGGTTGGACCTTTGGTGCA GGTGCTGCATTACAAATACCATTTGCTATGCAAATGGCTTATAGGTTTAATGGTATTGGA GTTACACAGAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAATTGATTGCCAACCAATTTAATAGTGCT ATTGGCAAAATTCAAGACTCACTTTCTTCCACAGCAAGTGCACTTGGAAAACTTCAAGAT GTGGTCAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTTTTAAATGATATCCTTTCACGTCTTGACAAAGTTGAGGCTGAA GTGCAAATTGATAGGTTGATCACAGGCAGACTTCAAAGTTTGCAGACATATGTGACTCAA CAATTAATTAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCA GAGTGTGTACTTGGACAATCAAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAGGGCTATCATCTTATG TCCTTCCCTCAGTCAGCACCTCATGGTGTAGTCTTCTTGCATGTGACTTATGTCCCTGCA CAAGAAAAGAACTTCACAACTGCTCCTGCCATTTGTCATGATGGAAAAGCACACTTTCCT CGTGAAGGTGTCTTTGTTTCAAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAATTTTTAT GAACCACAAATCATTACTACAGACAACACATTTGTGTCTGGTAACTGTGATGTTGTAATA GGAATTGTCAACAACACAGTTTATGATCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCATTCAAGGAG GAGTTAGATAAATATTTTAAGAATCATACATCACCAGATGTTGATTTAGGTGACATCTCT GGCATTAATGCTTCAGTTGTAAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCC AAGAATTTAAATGAATCTCTCATCGATCTCCAAGAACTTGGAAAGTATGAGCAGTATATA AAATGGCCATGGTACATTTGGCTAGGTTTTATAGCTGGCTTGATTGCCATAGTAATGGTG ACAATTATGCTTTGCTGTATGACCAGTTGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGT GGATCCTGCTGCAAATTTGATGAAGACGACTCTGAGCCAGTGCTCAAAGGAGTCAAATTA CATTACACATAA > AY304486.1 SARS coronavirus SZ3, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAAAATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTAAATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAAGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAAAGATTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTCCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TCATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTTAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCGCACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGTTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTGCCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > AY394996.1 SARS coronavirus ZS-B, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAAGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > MG772934.1 Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZXC21, complete genome ATG---TTGTTTTTCTTGTTTCTTCAGTTCGCCTTAGTAAACTCCCAGTGT---GATTTG ACAGGTAGAACTCCACTCAAT------------CCCAATTATACTAAT------TCTTCA CAAAGAGGTGTTTATTACCCTGACACAATTTATAGATCTGACACACTAGTGCTTAGTCAG GGTTATTTTCTTCCATTTTATTCCAATGTTAGCTGGTATTATTCATTA---ACAACCAAC AATGCTGCCACAAAGAGGACTGACAACCCTATATTAGATTTCAAGGACGGCATATATTTT GCTGCCACTGAACACTCAAATATTGTCAGGGGCTGGATCTTTGGAACAACTCTTGACAAC ACTTCTCAATCTCTCTTGATAGTTAACAATGCAACGAATGTTATTATCAAGGTTTGTAAT TTTGACTTTTGTTACGATCCCTACCTTAGTGGTTACTATCAT---AACAACAAAACCTGG AGCATCAGAGAATTTGCTGTCTATTCCTTTTATGCTAATTGTACTTTTGAGTATGTCTCA AAATCCTTTATGTTGAACATTTCTGGTAATGGTGGTCTGTTCAACACTCTCAGAGAGTTT GTTTTTAGAAATGTCGATGGGCATTTCAAGATTTACTCAAAATTTACACCAGTAAACTTA AATCGTGGCTTACCTACTGGTCTTTCAGTACTTCAACCGTTGGTTGAATTACCAGTTAGC ATAAATATTACTAAATTTAGAACACTCCTCACTATTCATAGA---------------GGA GACCCTATGTCTAATAATGGCTGGACTGCTTTTTCAGCTGCTTATTTCGTGGGCTATCTT AAACCACGTACCTTTATGCTGAAATATAATGAGAATGGCACCATTACTGATGCTGTTGAT TGTGCACTTGACCCTCTTTCGGAGACAAAGTGTACGTTAAAATCTCTTAGTGTTCAAAAG GGTATCTATCAGACTTCTAACTTTCGAGTGCAACCCACTCAGTCTATAGTTAGATTTCCT AATATTACCAATGTGTGTCCATTTCACAAGGTTTTTAATGCCACAAGGTTTCCTTCTGTT TACGCGTGGGAAAGAACTAAAATTTCTGATTGCATTGCAGACTACACTGTTTTCTACAAT TCAACTTCTTTTTCTACTTTCAAATGTTATGGTGTTTCACCCTCTAAATTGATTGATTTG TGTTTTACGAGTGTGTATGCTGATACATTTCTCATAAGATTTTCAGAGGTCAGACAAGTG GCACCAGGACAGACTGGTGTTATTGCTGACTACAATTATAAATTACCTGATGATTTTACA GGTTGTGTCATAGCCTGGAACACAGCAAAACAGGACACAGGT---------------CAT TATTTCTATAGGTCTCATCGCTCTACCAAATTAAAACCATTTGAAAGAGACCTTTCTTCA GATGAG------------------------AATGGTGTCCGT------------------ ACACTTAGTACTTATGACTTTAACCCTAATGTACCGCTTGAATATCAAGCTACAAGGGTT GTTGTCTTGTCATTTGAGCTTCTAAATGCACCAGCTACAGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACACAACTAGTAAAAAATCAGTGCGTTAATTTCAATTTTAACGGACTCAAGGGCACTGGT GTCTTGACTGATTCTTCTAAGAGGTTTCAGTCATTCCAACAATTTGGTAAAGATGCGTCT GACTTTATTGATTCAGTACGTGATCCTCAAACACTTGAGATACTTGACATTACACCTTGC TCTTTTGGTGGTGTCAGTGTTATAACACCAGGAACAAACACTTCTTCAGAGGTGGCTGTT CTTTACCAAGATGTTAACTGCACTGATGTACCAACTACTATACATGCAGACCAATTAACA CCTGCTTGGCGCATTTATGCTATTGGCACTAGTGTGTTTCAAACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAACATGTCAATGCTTCTTATGAGTGTGACATCCCAATTGGTGCTGGTATT TGTGCTAGCTACCATACGGCTTCT------------ATATTACGTAGTACAGGCCAGAAA GCTATTGTGGCTTATACTATGTCCCTTGGTGCTGAGAACTCTATTGCTTATGCTAACAAT TCTATAGCCATACCTACAAATTTTTCAATCAGTGTCACCACTGAAGTTATGCCTGTATCA ATGGCTAAAACTTCTGTAGATTGCACTATGTATATCTGCGGTGACTCTATAGAGTGTAGC AACTTGTTGTTACAATATGGCAGTTTTTGCACACAACTAAATCGTGCTTTAAGTGGAATT GCTATTGAACAAGACAAGAACACTCAAGAGGTTTTTGCTCAAGTCAAGCAAATCTATAAA ACACCACCTATTAAGGATTTTGGTGGTTTCAATTTTTCACAGATATTACCCGATCCTTCT AAACCCAGCAAGAGGTCGTTTATTGAAGATTTACTCTTCAATAAAGTCACTCTTGCTGAT GCTGGTTTTATAAAACAGTACGGTGATTGTTTGGGTGATATTTCTGCTAGAGATTTGATT TGTGCTCAAAAGTTCAATGGACTCACTGTCTTACCACCATTGCTCACAGATGAAATGATC GCTGCTTATACAGCTGCATTAATTAGCGGCACTGCCACTGCTGGATGGACCTTTGGTGCT GGTGCTGCTCTTCAAATACCATTTGCCATGCAAATGGCTTATAGATTTAATGGAATTGGA GTTACTCAGAATGTTCTCTATGAGAATCAGAAATTAATAGCCAATCAGTTTAATAGTGCT ATTGGAAAAATCCAAGAGTCTTTGACATCTACAGCTAGTGCACTTGGAAAATTGCAGGAT GTTGTTAACCAAAATGCACAAGCTTTAAACACGCTTGTTAAACAACTTAGTTCCAATTTT GGTGCAATTTCAAGCGTGTTGAATGATATTCTTTCACGCCTTGACAAAGTCGAGGCTGAG GTTCAGATTGATAGGTTGATCACAGGTAGACTTCAGAGTTTACAGACGTATGTGACTCAA CAATTAATCAGAGCTGCAGAAATCAGAGCTTCTGCTAATCTTGCTGCGACTAAAATGTCC GAGTGTGTACTAGGACAATCTAAAAGAGTTGATTTTTGTGGAAAAGGTTATCACCTAATG TCTTTTCCCCAGTCAGCGCCTCATGGTGTTGTTTTCTTACATGTGACTTACATTCCTTCG CAAGAAAAGAACTTCACAACAGCTCCTGCCATTTGTCATGAAGGTAAAGCACACTTCCCA CGTGAAGGTGTTTTCGTTTCGAATGGCACACACTGGTTTGTAACACAAAGGAACTTTTAC GAACCCCAAATTATAACCACTGACAATACATTTGTCTCCGGTAACTGTGATGTTGTAATT GGAATTATCAATAACACAGTTTATGATCCTTTACAACCAGAACTTGATTCATTTAAGGAG GAGTTAGATAAATATTTTAAAAATCATACATCACCTGATATTGATCTTGGTGATATTTCT GGCATTAATGCTTCTGTTGTCAATATTCAAAAGGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTTGCC AGAAATTTAAATGAATCACTCATTGATCTCCAAGAACTTGGAAAATATGAGCACTATATC AAATGGCCATGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTCATTGCTATAGTCATGGTT ACAATCCTGCTTTGTTGCATGACAAGTTGTTGCAGTTGTCTCAAGGGCTGTTGTTCTTGC GGATTTTGCTGTAAATTTGATGAAGATGACTCTGAGCCTGTGCTCAAAGGAGTCAAATTA CATTACACGTAA > AY304488.1 SARS coronavirus SZ16, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAAAATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- ---------GCTCAAGATACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTAAATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATCTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAAAGATTATGGTTTTTACACCACTAGTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATATCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTCCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TCATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTTAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCGCACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGTTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTGCCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCTCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > EU371564.1 SARS coronavirus BJ182-12, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGGCAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCT--------------- ---------GCTCAAGACATTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAATATTTTGATGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAATTAAAAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTCCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCGAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > MK211376.1 Coronavirus BtRs-BetaCoV/YN2018B, complete genome ATGAAATTGTTAGTTTTAGTTTTT---GCTACTTTGGTCTCTTCTTAC------ACTATA GAGAAGTGCACTGACTTTGATGATCGCACTCCACCTTCAAACACTCAATTTCTGTCTTCT CACAGAGGTGTTTATTACCCAGATGATATTTTTAGGTCTAATGTCTTGCATTTAGTACAA GATCACTTTCTACCTTTTGACTCTAATGTCACTAGGTTTATAACATTT------------ ---------GGCCTAAATTTTGATAATCCCATAATACCCTTTAGGGATGGTGTTTACTTT GCTGCGACTGAAAAGTCTAATGTTATTAGAGGATGGGTTTTTGGTTCTACAATGAACAAT AAATCTCAATCCGTTATAATAATGAACAACTCAACTAATTTAGTCATTAGGGCTTGTAAT TTTGAGTTGTGTGACAATCCATTCTTTGTTGTG------------TTGAGATCCAACAAC ACTCAGATACCGTCTTACATATTCAATAATGCATTCAATTGCACATTTGAATATGTTTCT AAGGATTTTAACCTTGACATTGGTGAAAAACCAGGTAATTTCAAGGATCTTAGAGAGTTT GTTTTCAGGAATAAAGATGGTTTTTTGCATGTTTACTCTGGTTACCAACCCATTTCTGCT GCTAGTGGCTTGCCAACTGGTTTTAATGCACTTAAACCTATTTTTAAGTTACCTCTGGGT ATTAATATTACTAATTTCAGAACTCTTCTGACTGCTTTTCCTCCT--------------- ---------AACCCTGGTTATTGGGGTACTTCAGCTGCAGCTTATTTTGTAGGATATTTA AAGCCAACTACATTCATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTCGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAAAGTTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAAACCTCCAATTTTAGGGTAGCACCCTCAAAGGAAGTTGTGAGGTTCCCT AATATTACAAACCTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTACATTTCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTACTCTACAAC TCAACATCTTTTTCAACTTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGCTGAATGATCTT TGCTTCTCTAATGTCTATGCAGATTCATTCGTAGTCAAAGGAGATGATGTAAGGCAAATA GCACCAGGACAGACCGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTTATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGATCTCTCAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATTTCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCATGTACCCCACCTGCT---TTCAACTGTTACTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTTCACTACTAATGGCATAGGCTATCAACCCTATAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCTGCTACAGTCTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAAAACCAGTGTGTCAATTTTAACTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGTCGTGATGTTTCG GATTTCACTGATTCAGTTCGAGATCCTAAAACGTCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGCGGTGTAAGTGTAATTACACCCGGAACAAATACTTCATCAGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTCCTGTAGCAATCCATGCAGACCAACTCACA CCTGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAATAATGTATTTCAAACTCAGGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCACACAGTTTCT------------TCACTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAATTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGCGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAATTAAATCGTGCACTCTCAGGTATC GCTGTTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTGAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGATCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTTATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTTTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTCAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATCAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTCAAACAACTTAGCTCCAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTCTCGCGACTTGACAAAGTCGAGGCTGAG GTACAAATTGATAGGTTAATTACAGGCAGACTGCAAAGCCTGCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAAGGCTATCATCTTATG TCCTTCCCGCAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACATATGTGCCATCC CAAGAGAGAAACTTCACCACTGCGCCAGCAATTTGTCACGAAGGCAAAGCATACTTCCCG CGTGAAGGTGTTTTTGTTTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCCGGAAGTTGTGATGTCGTAATC GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCACACATCACCAGATGTTGATCTCGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAATATTCAGAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCC AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATACATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > KY417146.1 Bat SARS-like coronavirus isolate Rs4231, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTCTTT---CTCACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GAGAGTTGTACCACTTTTGATGATGTTCAAGCCCCTAATTACCCTCAACACTCTTCATCC AGGAGAGGGGTTTATTATCCTGATGAAATCTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATCTATTTCTTCCATTCTATTCTAATGTCACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTGTTTATTTT GCTGCCACTGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGCTCTACCATGAACAAC AAGTCTCAGTCGGTGATTATCATCAATAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAT TTTGAGTTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTC------------TCTAAACCTACGGGA ACACAGACACACACTATGATATTCGACAATGCATTTAATTGCACTTTCGAATACATATCA GACTCCTTTTCGCTCGATGTTGCTGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAGGATGGGTTTCTCTATGTTTACAAGGGTTATCAACCTATAGACGTA GTCCGTGATCTACCATCTGGCTTTAATATTTTGAAACCTATTTTTAAGTTACCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCATTTTTGCCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGTACATCAGCTGCTGCTTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAGCTACATTCATGCTTAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCCCTTGCTGAACTCAAATGTTCTGTTAAAAGTTTTGAGATTGATAAA GGAATTTACCAAACCTCCAATTTTAGGGTAGCACCCTCAAAGGAAGTTGTGAGGTTCCCT AATATTACAAACCTGTGTCCTTTTGGGGAGGTTTTTAATGCTACTACATTTCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTACTCTACAAC TCAACATCTTTTTCAACTTTTAAGTGTTATGGCGTTTCTGCCACTAAGCTGAATGACCTT TGCTTCTCCAACGTCTATGCAGATTCATTCGTAGTCAAAGGAGATGATGTAAGGCAAATA GCACCAGGACAGACCGGTGTTATTGCTGATTATAATTACAAATTACCAGATGACTTCTTG GGTTGTGTCCTAGCATGGAACACCAATTCTAAAGATTCTTCCACTTCCGGTAATTATAAT TATTTATATAGATGGGTTAGAAGGTCTAAGCTTAACCCTTATGAGCGCGACTTATCTAAC GACATCTATTCACCTGGAGGTCAGTCTTGCTCAGCTATAGGT---CCTAATTGTTATAAC CCCTTACGTCCATATGGCTTTTTTACAACAGCTGGTGTTGGACACCAACCTTATAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCCGCTACAGTCTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAAAACCAGTGTGTCAATTTTAACTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTTCTTCCTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGTCGTGATGTTTCG GATTTCACTGATTCAGTTCGAGACCCGAAGACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGCGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATACTTCATCAGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAATTGCACTGATGTTCCTGTAGCAATCCATGCAGACCAACTCACA CCTGCTTGGCGCATATACTCTACTGGAAATAATGTATTTCAAACTCAGGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCACACAGTTTCT------------TCACTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAATTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGCGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAATTAAATCGTGCACTCTCAGGTATC GCTGTCGAACAGGACCGCAACACGCGTGAAGTGTTCGCTCAAGTGAAACAGATGTACAAA ACCCCAGCTTTGAAAGATTTCGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGATCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTTATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATGTTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAATCAATTTAATAAGGCG ATTAGCCAAATTCAAGAATCACTTACAACTACATCCACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCCAATTTT GGTGCTATTTCAAGTGTGTTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTGCAAAGCCTGCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAAGGCTACCATCTCATG TCCTTCCCGCAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACATGTGTGCCATCC CAAGAGAGAAACTTCACCACTGCGCCAGCAATTTGTCACGAAGGCAAAGCATACTTCCCG CGTGAAGGTGTTTTTGTTTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCTGGGAGTTGTGATGTCGTAATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCACACATCACCAGATGTTGATCTCGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCCGTCGTCAATATTCAGAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCC AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATACATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGCTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAATTTGATGAGGATGACTCTGAGCCGGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > AY395003.1 SARS coronavirus ZS-C, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATAGGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAAGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > AY278554.2 SARS coronavirus CUHK-W1, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAATATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAAAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > AY394985.1 SARS coronavirus HSZ-Bb, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCTATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTCACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAGGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGAAAAAAAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGTGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA > AY390556.1 SARS coronavirus GZ02, complete genome ATG---TTTATTTTCTTATTATTT---CTTACTCTCACTAGTGGTAGT------GACCTT GACCGGTGCACCACTTTTGATGATGTTCAAGCTCCTAATTACACTCAACATACTTCATCT ATGAGGGGGGTTTACTATCCTGATGAAATTTTTAGATCAGACACTCTTTATTTAACTCAG GATTTATTTCTTCCATTTTATTCTAATGTTACAGGGTTTCATACTATT------------ ---------AATCATACGTTTGACAACCCTGTCATACCTTTTAAGGATGGTATTTATTTT GCTGCCACAGAGAAATCAAATGTTGTCCGTGGTTGGGTTTTTGGTTCTACCATGAACAAC AAGTCACAGTCGGTGATTATTATTAACAATTCTACTAATGTTGTTATACGAGCATGTAAC TTTGAATTGTGTGACAACCCTTTCTTTGCTGTT------------TCTAAACCCATGGGT ACACAGACACATACTATGATATTCGATAATGCATTTAATTGCACTTTCGAGTACATATCT GATGCCTTTTCGCTTGATGTTTCAGAAAAGTCAGGTAATTTTAAACACTTACGAGAGTTT GTGTTTAAAAATAAAGATGGGTTTCTCTATGTTTATAAGGGCTATCAACCTATAGATGTA GTTCGTGATCTACCTTCTGGTTTTAACACTTTGAAACCCATTTTTAAGTTGCCTCTTGGT ATTAACATTACAAATTTTAGAGCCATTCTTACAGCCTTTTTACCT--------------- ---------GCTCAAGACACTTGGGGCACGTCAGCTGCAGCCTATTTTGTTGGCTATTTA AAGCCAACTACATTTATGCTCAAGTATGATGAAAATGGTACAATCACAGATGCTGTTGAT TGTTCTCAAAATCCACTTGCTGAACTCAAATGCTCTGTTAAGAGCTTTGAGATTGACAAA GGAATTTACCAGACCTCTAATTTCAGGGTTGTTCCCTCAAGAGATGTTGTGAGATTCCCT AATATTACAAACTTGTGTCCTTTTGGAGAGGTTTTTAATGCTACTAAATTCCCTTCTGTC TATGCATGGGAGAGGAAAAGAATTTCTAATTGTGTTGCTGATTACTCTGTGCTCTACAAC TCAACATTTTTTTCAACCTTTAAGTGCTATGGCGTTTCTGCCACTAAGTTGAATGATCTT TGCTTCTCCAATGTCTATGCAGATTCTTTTGTAGTCAAGGGAGATGATGTAAGACAAATA GCGCCAGGACAAACTGGTGTTATTGCTGATTATAATTATAAATTGCCAGATGATTTCATG GGTTGTGTCCTTGCTTGGAATACTAGGAACATTGATGCTACTTCAACTGGTAATTATAAT TATAAATATAGGTATCTTAGACATGGCAAGCTTAGGCCCTTTGAGAGAGACATATCTAAT GTGCCTTTCTCCCCTGATGGCAAACCTTGCACCCCACCTGCT---CTTAATTGTTATTGG CCATTAAATGATTATGGTTTTTACACCACTACTGGCATTGGCTACCAACCTTACAGAGTT GTAGTACTTTCTTTTGAACTTTTAAATGCACCGGCCACGGTTTGTGGACCAAAATTATCC ACTGACCTTATTAAGAACCAGTGTGTCAATTTTAATTTTAATGGACTCACTGGTACTGGT GTGTTAACTCCTTCTTCAAAGAGATTTCAACCATTTCAACAATTTGGCCGTGATGTTTCT GATTTCACTGATTCCGTTCGAGATCCTAAAACATCTGAAATATTAGACATTTCACCTTGC TCTTTTGGGGGTGTAAGTGTAATTACACCTGGAACAAATGCTTCATCTGAAGTTGCTGTT CTATATCAAGATGTTAACTGCACTGATGTTTCTACAGCAATTCATGCAGATCAACTCACA CCAGCTTGGCGCATATATTCTACTGGAAACAATGTATTCCAGACTCAAGCAGGCTGTCTT ATAGGAGCTGAGCATGTCGACACTTCTTATGAGTGCGACATTCCTATTGGAGCTGGCATT TGTGCTAGTTACCATACAGTTTCT------------TTATTACGTAGTACTAGCCAAAAA TCTATTGTGGCTTATACTATGTCTTTAGGTGCTGATAGTTCAATTGCTTACTCTAATAAC ACCATTGCTATACCTACTAACTTTTCAATTAGCATTACTACAGAAGTAATGCCTGTTTCT ATGGCTAAAACCTCCGTAGATTGTAATATGTACATCTGCGGAGATTCTACTGAATGTGCT AATTTGCTTCTCCAATATGGTAGCTTTTGCACACAACTAAATCGTGCACTCTCAGGTATT GCTGCTGAACAGGATCGCAACACACGTGAAGTGTTCGCTCAAGTCAAACAAATGTACAAA ACCCCAACTTTGAAAGATTTTGGTGGTTTTAATTTTTCACAAATATTACCTGACCCTCTA AAGCCAACTAAGAGGTCTTTTATTGAGGACTTGCTCTTTAATAAGGTGACACTCGCTGAT GCTGGCTTCATGAAGCAATATGGCGAATGCCTAGGTGATATTAATGCTAGAGATCTCATT TGTGCGCAGAAGTTCAATGGACTTACAGTGTTGCCACCTCTGCTCACTGATGATATGATT GCTGCCTACACTGCTGCTCTAGTTAGTGGTACTGCCACTGCTGGATGGACATTTGGTGCT GGCGCTGCTCTTCAAATACCTTTTGCTATGCAAATGGCATATAGGTTCAATGGCATTGGA GTTACCCAAAATGTTCTCTATGAGAACCAAAAACAAATCGCCAACCAATTTAACAAGGCG ATTAGTCAAATTCAAGAATCACTTACAACAACATCAACTGCATTGGGCAAGCTGCAAGAC GTTGTTAACCAGAATGCTCAAGCATTAAACACACTTGTTAAACAACTTAGCTCTAATTTT GGTGCAATTTCAAGTGTGCTAAATGATATCCTTTCGCGACTTGATAAAGTCGAGGCGGAG GTACAAATTGACAGGTTAATTACAGGCAGACTTCAAAGCCTTCAAACCTATGTAACACAA CAACTAATCAGGGCTGCTGAAATCAGGGCTTCTGCTAATCTTGCTGCTACTAAAATGTCT GAGTGTGTTCTTGGACAATCAAAAAGAGTTGACTTTTGCGGAAAGGGCTACCACCTTATG TCCTTCCCACAAGCAGCCCCGCATGGTGTTGTCTTCCTACATGTCACGTATGTGCCATCC CAGGAGAGGAACTTCACCACAGCGCCAGCAATTTGTCATGAAGGCAAAGCATACTTCCCT CGTGAAGGTGTTTTTGTGTTTAATGGCACTTCTTGGTTTATTACACAGAGGAACTTCTTT TCTCCACAAATAATTACTACAGACAATACATTTGTCTCAGGAAATTGTGATGTCGTTATT GGCATCATTAACAACACAGTTTATGATCCTCTGCAACCTGAGCTTGACTCATTCAAAGAA GAGCTGGACAAGTACTTCAAAAATCATACATCACCAGATGTTGATCTTGGCGACATTTCA GGCATTAACGCTTCTGTCGTCAACATTCAAGAAGAAATTGACCGCCTCAATGAGGTCGCT AAAAATTTAAATGAATCACTCATTGACCTTCAAGAATTGGGAAAATATGAGCAATATATT AAATGGCCTTGGTATGTTTGGCTCGGCTTCATTGCTGGACTAATTGCCATCGTCATGGTT ACAATCTTGCTTTGTTGCATGACTAGTTGTTGCAGTTGCCTCAAGGGTGCATGCTCTTGT GGTTCTTGCTGCAAGTTTGATGAGGATGACTCTGAGCCAGTTCTCAAGGGTGTCAAATTA CATTACACATAA