view test-data/out.mle.gene_summary.txt @ 5:3bcf77e9c7e3 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mageck commit 4478aabdcb10e4787450b1b23944defa7dc38ffe
author iuc
date Mon, 04 Jun 2018 10:57:50 -0400
parents b80c0e046539
children
line wrap: on
line source

Gene	sgRNA	HL60|beta	HL60|z	HL60|p-value	HL60|fdr	HL60|wald-p-value	HL60|wald-fdr	KBM7|beta	KBM7|z	KBM7|p-value	KBM7|fdr	KBM7|wald-p-value	KBM7|wald-fdr
A1CF	10	0.21726	2.3501	0.09	0.098901	0.018771	0.045548	0.22205	2.4019	0.11	0.13258	0.016311	0.044445
AAAS	10	0.20562	2.038	0.108	0.11368	0.041547	0.048311	0.22245	2.2047	0.11	0.13258	0.027472	0.044445
AAK1	10	0.25639	2.1126	0.054	0.07	0.034633	0.045548	0.31519	2.5972	0.026	0.092857	0.0093995	0.044445
AATF	10	0.26019	2.137	0.048	0.07	0.032596	0.045548	0.17209	1.4898	0.202	0.20612	0.13627	0.14195
AATK	10	0.37034	2.5201	0.012	0.07	0.011733	0.045548	0.32484	2.2105	0.024	0.088889	0.027074	0.044445
ABCB8	10	0.25311	2.4583	0.054	0.07	0.013958	0.045548	0.2626	2.5505	0.058	0.10345	0.010756	0.044445
ABCC1	10	0.20905	2.0722	0.106	0.11277	0.038249	0.045548	0.2381	2.3602	0.086	0.10886	0.018265	0.044445
ABCF1	10	0.26857	2.0808	0.046	0.07	0.037453	0.045548	0.2407	1.8649	0.082	0.10886	0.062201	0.069889
ABHD14B	10	0.25291	2.1394	0.054	0.07	0.032402	0.045548	0.24531	2.0751	0.076	0.10857	0.037979	0.049559
ABI1	10	0.28136	2.2952	0.038	0.07	0.021724	0.045548	0.23619	1.9267	0.086	0.10886	0.054023	0.062096
ABL1	10	0.35653	2.8826	0.014	0.07	0.0039444	0.045548	0.19033	1.5389	0.172	0.17938	0.12383	0.13174
ABL2	10	0.31786	2.537	0.026	0.07	0.011181	0.045548	0.28849	2.3026	0.044	0.096154	0.0213	0.044445
ABLIM2	10	0.33199	2.1246	0.024	0.07	0.033624	0.045548	0.35781	2.2898	0.016	0.088889	0.022035	0.044445
ABT1	10	0.64492	1.2807	0	0	0.20031	0.20031	0.56048	1.113	0	0	0.26572	0.26572
ABTB1	10	0.25881	2.2156	0.048	0.07	0.026717	0.045548	0.27981	2.3954	0.048	0.096154	0.016601	0.044445
ACAD11	10	0.2457	2.1273	0.056	0.07	0.033397	0.045548	0.26753	2.3163	0.052	0.098113	0.020539	0.044445
ACAD9	10	0.28033	2.3396	0.038	0.07	0.019306	0.045548	0.23942	1.9982	0.084	0.10886	0.045699	0.055059
ACAT2	10	0.33017	1.9472	0.024	0.07	0.051509	0.056401	0.34801	2.0524	0.016	0.088889	0.040129	0.049805
ACBD6	10	0.26005	2.4829	0.048	0.07	0.013031	0.045548	0.22982	2.1942	0.094	0.1175	0.028219	0.044707
ACD	10	0.29956	2.263	0.028	0.07	0.023633	0.045548	0.30306	2.2895	0.036	0.096154	0.022052	0.044445
ACHE	10	0.26039	1.9394	0.048	0.07	0.052453	0.056401	0.27459	2.0451	0.05	0.096154	0.04084	0.049805
ACIN1	10	0.24992	1.6773	0.054	0.07	0.093484	0.097379	0.16332	1.1553	0.222	0.22424	0.24796	0.25047
ACLY	10	0.64139	1.3277	0	0	0.18428	0.18614	0.56404	1.1676	0	0	0.24298	0.24794
ACO2	10	0.26736	2.3551	0.048	0.07	0.018518	0.045548	0.24404	2.1496	0.078	0.10886	0.031586	0.045123
ACP1	10	0.30066	2.0818	0.028	0.07	0.037363	0.045548	0.32268	2.2343	0.024	0.088889	0.025465	0.044445
ACRC	10	0.316	2.1738	0.026	0.07	0.029722	0.045548	0.32721	2.2508	0.024	0.088889	0.024396	0.044445
ACSL6	10	0.30715	2.5085	0.028	0.07	0.012125	0.045548	0.27154	2.2176	0.05	0.096154	0.026579	0.044445
ACSS2	10	0.27125	2.396	0.044	0.07	0.016573	0.045548	0.31578	2.7894	0.024	0.088889	0.0052812	0.044445
ACTL6A	10	0.23154	2.2408	0.072	0.085714	0.025038	0.045548	0.20097	1.945	0.138	0.14681	0.051771	0.060199
ACTL6B	10	0.30195	2.3158	0.028	0.07	0.020569	0.045548	0.29791	2.2849	0.036	0.096154	0.02232	0.044445
ACTL7A	10	0.22531	2.1897	0.078	0.089655	0.028544	0.045548	0.2423	2.3549	0.082	0.10886	0.018527	0.044445
ACTN1	10	0.30451	2.4532	0.028	0.07	0.014161	0.045548	0.27462	2.2124	0.05	0.096154	0.026942	0.044445
ACTN4	10	0.3039	2.2464	0.028	0.07	0.024679	0.045548	0.33156	2.4509	0.022	0.088889	0.01425	0.044445
ACTR1A	10	0.28127	2.1093	0.038	0.07	0.034915	0.045548	0.30952	2.3212	0.028	0.093333	0.020274	0.044445
ACTR3	10	0.28223	2.1469	0.038	0.07	0.031799	0.045548	0.25252	1.9209	0.068	0.10462	0.054741	0.062206
ACTR5	10	0.2754	2.7989	0.04	0.07	0.0051271	0.045548	0.20514	2.0849	0.136	0.14624	0.037074	0.049433
ACTR8	10	0.23674	1.6117	0.06	0.074074	0.10703	0.10922	0.21097	1.4362	0.122	0.13407	0.15095	0.15562
ACTRT3	10	0.2132	1.984	0.096	0.10435	0.047252	0.053696	0.25182	2.3435	0.068	0.10462	0.019105	0.044445
ACVR1B	10	0.28652	2.2884	0.034	0.07	0.022117	0.045548	0.27138	2.1674	0.05	0.096154	0.030201	0.045123
ACVR1C	10	0.28949	2.3641	0.032	0.07	0.018076	0.045548	0.33664	2.7491	0.02	0.088889	0.0059762	0.044445
ACVR1	10	0.34616	2.4128	0.018	0.07	0.015832	0.045548	0.32005	2.2308	0.024	0.088889	0.025696	0.044445
ACVR2A	10	0.27696	2.1093	0.04	0.07	0.034917	0.045548	0.33802	2.5743	0.02	0.088889	0.010044	0.044445
ACVR2B	10	0.36371	2.2098	0.012	0.07	0.027116	0.045548	0.37311	2.267	0.01	0.088889	0.023392	0.044445
ACVRL1	10	0.39229	2.5262	0.006	0.07	0.011531	0.045548	0.36154	2.3281	0.012	0.088889	0.019905	0.044445
ADAD1	10	0.30909	2.331	0.028	0.07	0.019753	0.045548	0.30601	2.3077	0.03	0.096154	0.021014	0.044445
ADAM10	10	0.25292	2.1622	0.054	0.07	0.030601	0.045548	0.24874	2.1265	0.072	0.10746	0.033463	0.04584
ADAM12	10	0.25552	2.205	0.054	0.07	0.027456	0.045548	0.27084	2.3371	0.05	0.096154	0.019433	0.044445
ADAMTS5	10	0.24419	2.1566	0.056	0.07	0.031038	0.045548	0.27619	2.4392	0.048	0.096154	0.014719	0.044445
ADAP1	10	0.20948	2.1011	0.106	0.11277	0.035635	0.045548	0.25866	2.5944	0.06	0.10345	0.0094755	0.044445
ADARB1	10	0.27489	2.3109	0.04	0.07	0.02084	0.045548	0.27467	2.309	0.05	0.096154	0.020942	0.044445
ADARB2	10	0.30137	2.3429	0.028	0.07	0.019132	0.045548	0.30102	2.3402	0.036	0.096154	0.019273	0.044445
ADAR	10	0.25245	2.4669	0.054	0.07	0.013631	0.045548	0.2202	2.1517	0.116	0.13258	0.031424	0.045123
ADCK1	10	0.36605	2.2853	0.012	0.07	0.022294	0.045548	0.42581	2.6584	0.002	0.033333	0.0078507	0.044445
ADCK2	10	0.28085	2.5525	0.038	0.07	0.010697	0.045548	0.24246	2.2035	0.08	0.10886	0.027556	0.044445
ADCK3	10	0.37764	2.128	0.008	0.07	0.033335	0.045548	0.41407	2.3334	0.002	0.033333	0.019629	0.044445
ADCK4	10	0.37984	2.2562	0.008	0.07	0.024061	0.045548	0.36256	2.1535	0.012	0.088889	0.031278	0.045123
ADCK5	10	0.35764	2.5433	0.012	0.07	0.010981	0.045548	0.32232	2.2921	0.024	0.088889	0.021897	0.044445
ADCY1	10	0.2228	2.0734	0.084	0.094382	0.038132	0.045548	0.2199	2.0464	0.116	0.13258	0.040715	0.049805
ADD1	10	0.25091	2.5127	0.054	0.07	0.011981	0.045548	0.23536	2.357	0.086	0.10886	0.018424	0.044445
ADD3	10	0.34943	2.4372	0.014	0.07	0.014802	0.045548	0.30967	2.1599	0.028	0.093333	0.030784	0.045123
ADH5	10	0.31325	2.0785	0.028	0.07	0.037665	0.045548	0.3371	2.2368	0.02	0.088889	0.025302	0.044445
ADH7	10	0.23185	2.1764	0.072	0.085714	0.029529	0.045548	0.25313	2.3761	0.068	0.10462	0.017497	0.044445
ADI1	10	0.26344	2.2066	0.048	0.07	0.027345	0.045548	0.2966	2.4843	0.038	0.096154	0.012981	0.044445
ADIRF	10	0.23157	2.1952	0.072	0.085714	0.028148	0.045548	0.21758	2.0626	0.118	0.13258	0.039152	0.049559
ADK	10	0.25823	2.3541	0.05	0.07	0.018569	0.045548	0.25466	2.3215	0.066	0.10462	0.020258	0.044445
ADNP2	10	0.19944	2.0931	0.12	0.12245	0.036336	0.045548	0.25778	2.7054	0.06	0.10345	0.0068216	0.044445
ADNP	10	0.33596	1.9412	0.024	0.07	0.052236	0.056401	0.44376	2.5641	0	0	0.010346	0.044445
ADPRHL2	10	0.26332	2.3044	0.048	0.07	0.021202	0.045548	0.27219	2.382	0.05	0.096154	0.017218	0.044445
ADRA1A	10	0.26321	2.4075	0.048	0.07	0.016062	0.045548	0.24245	2.2176	0.08	0.10886	0.026583	0.044445
ADRA1B	10	0.26869	2.4689	0.046	0.07	0.013554	0.045548	0.24756	2.2747	0.076	0.10857	0.022923	0.044445
ADRB1	10	0.26113	2.1522	0.048	0.07	0.031385	0.045548	0.25076	2.0666	0.068	0.10462	0.038768	0.049559
ADRB2	10	0.3434	2.0721	0.018	0.07	0.038261	0.045548	0.32418	1.9561	0.024	0.088889	0.050457	0.059361
ADRB3	10	0.27356	2.3431	0.042	0.07	0.019123	0.045548	0.26345	2.1408	0.056	0.10345	0.032287	0.045408
ADRBK1	10	0.39621	2.5298	0.006	0.07	0.011414	0.045548	0.38361	2.4493	0.004	0.057143	0.014314	0.044445
ADRBK2	10	0.311	2.4196	0.028	0.07	0.015537	0.045548	0.30224	2.3515	0.036	0.096154	0.018698	0.044445
ADRM1	10	0.19795	2.0633	0.12	0.12245	0.039089	0.045987	0.21217	2.2114	0.122	0.13407	0.027005	0.044445
AEBP1	10	0.30109	2.094	0.028	0.07	0.036256	0.045548	0.31995	2.2252	0.024	0.088889	0.026067	0.044445
AEBP2	10	0.25078	2.3902	0.054	0.07	0.016839	0.045548	0.25977	2.4758	0.06	0.10345	0.013293	0.044445
AEN	10	0.31767	2.5501	0.026	0.07	0.010771	0.045548	0.21703	1.7422	0.118	0.13258	0.081467	0.089524
AES	10	0.27613	2.5026	0.04	0.07	0.01233	0.045548	0.28435	2.5771	0.048	0.096154	0.0099638	0.044445
AFAP1L2	10	0.27787	2.5825	0.038	0.07	0.0098091	0.045548	0.25248	2.3465	0.068	0.10462	0.018949	0.044445
AFF1	10	0.24186	2.0236	0.056	0.07	0.043007	0.049434	0.28577	2.391	0.044	0.096154	0.0168	0.044445
AFF2	10	0.22079	1.9621	0.086	0.095556	0.049749	0.055889	0.28962	2.5737	0.044	0.096154	0.010061	0.044445
AFF3	10	0.22476	2.1578	0.078	0.089655	0.030942	0.045548	0.21756	2.0887	0.118	0.13258	0.03673	0.049433
AFF4	10	0.31149	2.1142	0.028	0.07	0.034496	0.045548	0.3627	2.4618	0.012	0.088889	0.013825	0.044445
AFMID	10	0.22778	2.1955	0.078	0.089655	0.02813	0.045548	0.22159	2.1358	0.112	0.13258	0.032694	0.045408
AFTPH	10	0.25053	2.1997	0.054	0.07	0.027828	0.045548	0.24929	2.1888	0.072	0.10746	0.028613	0.044707
AGAP2	10	0.3135	2.4258	0.028	0.07	0.015274	0.045548	0.27805	2.1516	0.048	0.096154	0.031432	0.045123
AGAP3	10	0.27682	2.4409	0.04	0.07	0.01465	0.045548	0.31626	2.7887	0.024	0.088889	0.0052921	0.044445
AGBL5	10	0.18851	1.7706	0.146	0.14747	0.076634	0.080668	0.25487	2.3938	0.066	0.10462	0.016673	0.044445
AGFG1	10	0.26133	2.2912	0.048	0.07	0.021954	0.045548	0.24813	2.0639	0.074	0.10857	0.039025	0.049559
AGL	10	0.65242	1.6625	0	0	0.096417	0.099399	0.60099	1.5314	0	0	0.12566	0.13228
AGPAT3	10	0.20246	2.1377	0.112	0.11667	0.03254	0.045548	0.18609	1.9649	0.174	0.17938	0.049424	0.058838
AGPAT5	10	0.32784	1.8786	0.024	0.07	0.060303	0.064152	0.31917	1.8289	0.024	0.088889	0.067418	0.074909
AGTPBP1	10	0.25153	2.1735	0.054	0.07	0.029741	0.045548	0.29805	2.5755	0.036	0.096154	0.01001	0.044445
AHCTF1	10	0.24987	2.2694	0.054	0.07	0.023245	0.045548	0.18875	1.7143	0.174	0.17938	0.086471	0.09399
AHCY	10	0.25511	1.9574	0.054	0.07	0.0503	0.055889	0.20591	1.5799	0.136	0.14624	0.11413	0.12272
AHNAK2	10	0.27116	2.5067	0.044	0.07	0.012185	0.045548	0.27693	2.5601	0.048	0.096154	0.010466	0.044445
AHNAK	10	0.22102	2.4775	0.084	0.094382	0.01323	0.045548	0.21459	2.4055	0.118	0.13258	0.016151	0.044445
AHRR	9	0.19687	2.5399	0.15	0.15	0.011087	0.045548	0.18565	2.2584	0.226	0.226	0.023923	0.044445