comparison test-data/out.mle.gene_summary.txt @ 0:eab37e8fea75 draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mageck commit 71cef018eec5ee7ff7f3853599c027e80e2637fe
author iuc
date Wed, 14 Feb 2018 06:42:36 -0500
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:eab37e8fea75
1 Gene sgRNA HL60|beta HL60|z HL60|p-value HL60|fdr HL60|wald-p-value HL60|wald-fdr KBM7|beta KBM7|z KBM7|p-value KBM7|fdr KBM7|wald-p-value KBM7|wald-fdr
2 A1CF 10 0.21726 2.3501 0.09 0.098901 0.018771 0.045548 0.22205 2.4019 0.11 0.13258 0.016311 0.044445
3 AAAS 10 0.20562 2.038 0.108 0.11368 0.041547 0.048311 0.22245 2.2047 0.11 0.13258 0.027472 0.044445
4 AAK1 10 0.25639 2.1126 0.054 0.07 0.034633 0.045548 0.31519 2.5972 0.026 0.092857 0.0093995 0.044445
5 AATF 10 0.26019 2.137 0.048 0.07 0.032596 0.045548 0.17209 1.4898 0.202 0.20612 0.13627 0.14195
6 AATK 10 0.37034 2.5201 0.012 0.07 0.011733 0.045548 0.32484 2.2105 0.024 0.088889 0.027074 0.044445
7 ABCB8 10 0.25311 2.4583 0.054 0.07 0.013958 0.045548 0.2626 2.5505 0.058 0.10345 0.010756 0.044445
8 ABCC1 10 0.20905 2.0722 0.106 0.11277 0.038249 0.045548 0.2381 2.3602 0.086 0.10886 0.018265 0.044445
9 ABCF1 10 0.26857 2.0808 0.046 0.07 0.037453 0.045548 0.2407 1.8649 0.082 0.10886 0.062201 0.069889
10 ABHD14B 10 0.25291 2.1394 0.054 0.07 0.032402 0.045548 0.24531 2.0751 0.076 0.10857 0.037979 0.049559
11 ABI1 10 0.28136 2.2952 0.038 0.07 0.021724 0.045548 0.23619 1.9267 0.086 0.10886 0.054023 0.062096
12 ABL1 10 0.35653 2.8826 0.014 0.07 0.0039444 0.045548 0.19033 1.5389 0.172 0.17938 0.12383 0.13174
13 ABL2 10 0.31786 2.537 0.026 0.07 0.011181 0.045548 0.28849 2.3026 0.044 0.096154 0.0213 0.044445
14 ABLIM2 10 0.33199 2.1246 0.024 0.07 0.033624 0.045548 0.35781 2.2898 0.016 0.088889 0.022035 0.044445
15 ABT1 10 0.64492 1.2807 0 0 0.20031 0.20031 0.56048 1.113 0 0 0.26572 0.26572
16 ABTB1 10 0.25881 2.2156 0.048 0.07 0.026717 0.045548 0.27981 2.3954 0.048 0.096154 0.016601 0.044445
17 ACAD11 10 0.2457 2.1273 0.056 0.07 0.033397 0.045548 0.26753 2.3163 0.052 0.098113 0.020539 0.044445
18 ACAD9 10 0.28033 2.3396 0.038 0.07 0.019306 0.045548 0.23942 1.9982 0.084 0.10886 0.045699 0.055059
19 ACAT2 10 0.33017 1.9472 0.024 0.07 0.051509 0.056401 0.34801 2.0524 0.016 0.088889 0.040129 0.049805
20 ACBD6 10 0.26005 2.4829 0.048 0.07 0.013031 0.045548 0.22982 2.1942 0.094 0.1175 0.028219 0.044707
21 ACD 10 0.29956 2.263 0.028 0.07 0.023633 0.045548 0.30306 2.2895 0.036 0.096154 0.022052 0.044445
22 ACHE 10 0.26039 1.9394 0.048 0.07 0.052453 0.056401 0.27459 2.0451 0.05 0.096154 0.04084 0.049805
23 ACIN1 10 0.24992 1.6773 0.054 0.07 0.093484 0.097379 0.16332 1.1553 0.222 0.22424 0.24796 0.25047
24 ACLY 10 0.64139 1.3277 0 0 0.18428 0.18614 0.56404 1.1676 0 0 0.24298 0.24794
25 ACO2 10 0.26736 2.3551 0.048 0.07 0.018518 0.045548 0.24404 2.1496 0.078 0.10886 0.031586 0.045123
26 ACP1 10 0.30066 2.0818 0.028 0.07 0.037363 0.045548 0.32268 2.2343 0.024 0.088889 0.025465 0.044445
27 ACRC 10 0.316 2.1738 0.026 0.07 0.029722 0.045548 0.32721 2.2508 0.024 0.088889 0.024396 0.044445
28 ACSL6 10 0.30715 2.5085 0.028 0.07 0.012125 0.045548 0.27154 2.2176 0.05 0.096154 0.026579 0.044445
29 ACSS2 10 0.27125 2.396 0.044 0.07 0.016573 0.045548 0.31578 2.7894 0.024 0.088889 0.0052812 0.044445
30 ACTL6A 10 0.23154 2.2408 0.072 0.085714 0.025038 0.045548 0.20097 1.945 0.138 0.14681 0.051771 0.060199
31 ACTL6B 10 0.30195 2.3158 0.028 0.07 0.020569 0.045548 0.29791 2.2849 0.036 0.096154 0.02232 0.044445
32 ACTL7A 10 0.22531 2.1897 0.078 0.089655 0.028544 0.045548 0.2423 2.3549 0.082 0.10886 0.018527 0.044445
33 ACTN1 10 0.30451 2.4532 0.028 0.07 0.014161 0.045548 0.27462 2.2124 0.05 0.096154 0.026942 0.044445
34 ACTN4 10 0.3039 2.2464 0.028 0.07 0.024679 0.045548 0.33156 2.4509 0.022 0.088889 0.01425 0.044445
35 ACTR1A 10 0.28127 2.1093 0.038 0.07 0.034915 0.045548 0.30952 2.3212 0.028 0.093333 0.020274 0.044445
36 ACTR3 10 0.28223 2.1469 0.038 0.07 0.031799 0.045548 0.25252 1.9209 0.068 0.10462 0.054741 0.062206
37 ACTR5 10 0.2754 2.7989 0.04 0.07 0.0051271 0.045548 0.20514 2.0849 0.136 0.14624 0.037074 0.049433
38 ACTR8 10 0.23674 1.6117 0.06 0.074074 0.10703 0.10922 0.21097 1.4362 0.122 0.13407 0.15095 0.15562
39 ACTRT3 10 0.2132 1.984 0.096 0.10435 0.047252 0.053696 0.25182 2.3435 0.068 0.10462 0.019105 0.044445
40 ACVR1B 10 0.28652 2.2884 0.034 0.07 0.022117 0.045548 0.27138 2.1674 0.05 0.096154 0.030201 0.045123
41 ACVR1C 10 0.28949 2.3641 0.032 0.07 0.018076 0.045548 0.33664 2.7491 0.02 0.088889 0.0059762 0.044445
42 ACVR1 10 0.34616 2.4128 0.018 0.07 0.015832 0.045548 0.32005 2.2308 0.024 0.088889 0.025696 0.044445
43 ACVR2A 10 0.27696 2.1093 0.04 0.07 0.034917 0.045548 0.33802 2.5743 0.02 0.088889 0.010044 0.044445
44 ACVR2B 10 0.36371 2.2098 0.012 0.07 0.027116 0.045548 0.37311 2.267 0.01 0.088889 0.023392 0.044445
45 ACVRL1 10 0.39229 2.5262 0.006 0.07 0.011531 0.045548 0.36154 2.3281 0.012 0.088889 0.019905 0.044445
46 ADAD1 10 0.30909 2.331 0.028 0.07 0.019753 0.045548 0.30601 2.3077 0.03 0.096154 0.021014 0.044445
47 ADAM10 10 0.25292 2.1622 0.054 0.07 0.030601 0.045548 0.24874 2.1265 0.072 0.10746 0.033463 0.04584
48 ADAM12 10 0.25552 2.205 0.054 0.07 0.027456 0.045548 0.27084 2.3371 0.05 0.096154 0.019433 0.044445
49 ADAMTS5 10 0.24419 2.1566 0.056 0.07 0.031038 0.045548 0.27619 2.4392 0.048 0.096154 0.014719 0.044445
50 ADAP1 10 0.20948 2.1011 0.106 0.11277 0.035635 0.045548 0.25866 2.5944 0.06 0.10345 0.0094755 0.044445
51 ADARB1 10 0.27489 2.3109 0.04 0.07 0.02084 0.045548 0.27467 2.309 0.05 0.096154 0.020942 0.044445
52 ADARB2 10 0.30137 2.3429 0.028 0.07 0.019132 0.045548 0.30102 2.3402 0.036 0.096154 0.019273 0.044445
53 ADAR 10 0.25245 2.4669 0.054 0.07 0.013631 0.045548 0.2202 2.1517 0.116 0.13258 0.031424 0.045123
54 ADCK1 10 0.36605 2.2853 0.012 0.07 0.022294 0.045548 0.42581 2.6584 0.002 0.033333 0.0078507 0.044445
55 ADCK2 10 0.28085 2.5525 0.038 0.07 0.010697 0.045548 0.24246 2.2035 0.08 0.10886 0.027556 0.044445
56 ADCK3 10 0.37764 2.128 0.008 0.07 0.033335 0.045548 0.41407 2.3334 0.002 0.033333 0.019629 0.044445
57 ADCK4 10 0.37984 2.2562 0.008 0.07 0.024061 0.045548 0.36256 2.1535 0.012 0.088889 0.031278 0.045123
58 ADCK5 10 0.35764 2.5433 0.012 0.07 0.010981 0.045548 0.32232 2.2921 0.024 0.088889 0.021897 0.044445
59 ADCY1 10 0.2228 2.0734 0.084 0.094382 0.038132 0.045548 0.2199 2.0464 0.116 0.13258 0.040715 0.049805
60 ADD1 10 0.25091 2.5127 0.054 0.07 0.011981 0.045548 0.23536 2.357 0.086 0.10886 0.018424 0.044445
61 ADD3 10 0.34943 2.4372 0.014 0.07 0.014802 0.045548 0.30967 2.1599 0.028 0.093333 0.030784 0.045123
62 ADH5 10 0.31325 2.0785 0.028 0.07 0.037665 0.045548 0.3371 2.2368 0.02 0.088889 0.025302 0.044445
63 ADH7 10 0.23185 2.1764 0.072 0.085714 0.029529 0.045548 0.25313 2.3761 0.068 0.10462 0.017497 0.044445
64 ADI1 10 0.26344 2.2066 0.048 0.07 0.027345 0.045548 0.2966 2.4843 0.038 0.096154 0.012981 0.044445
65 ADIRF 10 0.23157 2.1952 0.072 0.085714 0.028148 0.045548 0.21758 2.0626 0.118 0.13258 0.039152 0.049559
66 ADK 10 0.25823 2.3541 0.05 0.07 0.018569 0.045548 0.25466 2.3215 0.066 0.10462 0.020258 0.044445
67 ADNP2 10 0.19944 2.0931 0.12 0.12245 0.036336 0.045548 0.25778 2.7054 0.06 0.10345 0.0068216 0.044445
68 ADNP 10 0.33596 1.9412 0.024 0.07 0.052236 0.056401 0.44376 2.5641 0 0 0.010346 0.044445
69 ADPRHL2 10 0.26332 2.3044 0.048 0.07 0.021202 0.045548 0.27219 2.382 0.05 0.096154 0.017218 0.044445
70 ADRA1A 10 0.26321 2.4075 0.048 0.07 0.016062 0.045548 0.24245 2.2176 0.08 0.10886 0.026583 0.044445
71 ADRA1B 10 0.26869 2.4689 0.046 0.07 0.013554 0.045548 0.24756 2.2747 0.076 0.10857 0.022923 0.044445
72 ADRB1 10 0.26113 2.1522 0.048 0.07 0.031385 0.045548 0.25076 2.0666 0.068 0.10462 0.038768 0.049559
73 ADRB2 10 0.3434 2.0721 0.018 0.07 0.038261 0.045548 0.32418 1.9561 0.024 0.088889 0.050457 0.059361
74 ADRB3 10 0.27356 2.3431 0.042 0.07 0.019123 0.045548 0.26345 2.1408 0.056 0.10345 0.032287 0.045408
75 ADRBK1 10 0.39621 2.5298 0.006 0.07 0.011414 0.045548 0.38361 2.4493 0.004 0.057143 0.014314 0.044445
76 ADRBK2 10 0.311 2.4196 0.028 0.07 0.015537 0.045548 0.30224 2.3515 0.036 0.096154 0.018698 0.044445
77 ADRM1 10 0.19795 2.0633 0.12 0.12245 0.039089 0.045987 0.21217 2.2114 0.122 0.13407 0.027005 0.044445
78 AEBP1 10 0.30109 2.094 0.028 0.07 0.036256 0.045548 0.31995 2.2252 0.024 0.088889 0.026067 0.044445
79 AEBP2 10 0.25078 2.3902 0.054 0.07 0.016839 0.045548 0.25977 2.4758 0.06 0.10345 0.013293 0.044445
80 AEN 10 0.31767 2.5501 0.026 0.07 0.010771 0.045548 0.21703 1.7422 0.118 0.13258 0.081467 0.089524
81 AES 10 0.27613 2.5026 0.04 0.07 0.01233 0.045548 0.28435 2.5771 0.048 0.096154 0.0099638 0.044445
82 AFAP1L2 10 0.27787 2.5825 0.038 0.07 0.0098091 0.045548 0.25248 2.3465 0.068 0.10462 0.018949 0.044445
83 AFF1 10 0.24186 2.0236 0.056 0.07 0.043007 0.049434 0.28577 2.391 0.044 0.096154 0.0168 0.044445
84 AFF2 10 0.22079 1.9621 0.086 0.095556 0.049749 0.055889 0.28962 2.5737 0.044 0.096154 0.010061 0.044445
85 AFF3 10 0.22476 2.1578 0.078 0.089655 0.030942 0.045548 0.21756 2.0887 0.118 0.13258 0.03673 0.049433
86 AFF4 10 0.31149 2.1142 0.028 0.07 0.034496 0.045548 0.3627 2.4618 0.012 0.088889 0.013825 0.044445
87 AFMID 10 0.22778 2.1955 0.078 0.089655 0.02813 0.045548 0.22159 2.1358 0.112 0.13258 0.032694 0.045408
88 AFTPH 10 0.25053 2.1997 0.054 0.07 0.027828 0.045548 0.24929 2.1888 0.072 0.10746 0.028613 0.044707
89 AGAP2 10 0.3135 2.4258 0.028 0.07 0.015274 0.045548 0.27805 2.1516 0.048 0.096154 0.031432 0.045123
90 AGAP3 10 0.27682 2.4409 0.04 0.07 0.01465 0.045548 0.31626 2.7887 0.024 0.088889 0.0052921 0.044445
91 AGBL5 10 0.18851 1.7706 0.146 0.14747 0.076634 0.080668 0.25487 2.3938 0.066 0.10462 0.016673 0.044445
92 AGFG1 10 0.26133 2.2912 0.048 0.07 0.021954 0.045548 0.24813 2.0639 0.074 0.10857 0.039025 0.049559
93 AGL 10 0.65242 1.6625 0 0 0.096417 0.099399 0.60099 1.5314 0 0 0.12566 0.13228
94 AGPAT3 10 0.20246 2.1377 0.112 0.11667 0.03254 0.045548 0.18609 1.9649 0.174 0.17938 0.049424 0.058838
95 AGPAT5 10 0.32784 1.8786 0.024 0.07 0.060303 0.064152 0.31917 1.8289 0.024 0.088889 0.067418 0.074909
96 AGTPBP1 10 0.25153 2.1735 0.054 0.07 0.029741 0.045548 0.29805 2.5755 0.036 0.096154 0.01001 0.044445
97 AHCTF1 10 0.24987 2.2694 0.054 0.07 0.023245 0.045548 0.18875 1.7143 0.174 0.17938 0.086471 0.09399
98 AHCY 10 0.25511 1.9574 0.054 0.07 0.0503 0.055889 0.20591 1.5799 0.136 0.14624 0.11413 0.12272
99 AHNAK2 10 0.27116 2.5067 0.044 0.07 0.012185 0.045548 0.27693 2.5601 0.048 0.096154 0.010466 0.044445
100 AHNAK 10 0.22102 2.4775 0.084 0.094382 0.01323 0.045548 0.21459 2.4055 0.118 0.13258 0.016151 0.044445
101 AHRR 9 0.19687 2.5399 0.15 0.15 0.011087 0.045548 0.18565 2.2584 0.226 0.226 0.023923 0.044445