Mercurial > repos > iuc > mageck_mle
diff test-data/out.mle.gene_summary.txt @ 0:eab37e8fea75 draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mageck commit 71cef018eec5ee7ff7f3853599c027e80e2637fe
| author | iuc |
|---|---|
| date | Wed, 14 Feb 2018 06:42:36 -0500 |
| parents | |
| children |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/out.mle.gene_summary.txt Wed Feb 14 06:42:36 2018 -0500 @@ -0,0 +1,101 @@ +Gene sgRNA HL60|beta HL60|z HL60|p-value HL60|fdr HL60|wald-p-value HL60|wald-fdr KBM7|beta KBM7|z KBM7|p-value KBM7|fdr KBM7|wald-p-value KBM7|wald-fdr +A1CF 10 0.21726 2.3501 0.09 0.098901 0.018771 0.045548 0.22205 2.4019 0.11 0.13258 0.016311 0.044445 +AAAS 10 0.20562 2.038 0.108 0.11368 0.041547 0.048311 0.22245 2.2047 0.11 0.13258 0.027472 0.044445 +AAK1 10 0.25639 2.1126 0.054 0.07 0.034633 0.045548 0.31519 2.5972 0.026 0.092857 0.0093995 0.044445 +AATF 10 0.26019 2.137 0.048 0.07 0.032596 0.045548 0.17209 1.4898 0.202 0.20612 0.13627 0.14195 +AATK 10 0.37034 2.5201 0.012 0.07 0.011733 0.045548 0.32484 2.2105 0.024 0.088889 0.027074 0.044445 +ABCB8 10 0.25311 2.4583 0.054 0.07 0.013958 0.045548 0.2626 2.5505 0.058 0.10345 0.010756 0.044445 +ABCC1 10 0.20905 2.0722 0.106 0.11277 0.038249 0.045548 0.2381 2.3602 0.086 0.10886 0.018265 0.044445 +ABCF1 10 0.26857 2.0808 0.046 0.07 0.037453 0.045548 0.2407 1.8649 0.082 0.10886 0.062201 0.069889 +ABHD14B 10 0.25291 2.1394 0.054 0.07 0.032402 0.045548 0.24531 2.0751 0.076 0.10857 0.037979 0.049559 +ABI1 10 0.28136 2.2952 0.038 0.07 0.021724 0.045548 0.23619 1.9267 0.086 0.10886 0.054023 0.062096 +ABL1 10 0.35653 2.8826 0.014 0.07 0.0039444 0.045548 0.19033 1.5389 0.172 0.17938 0.12383 0.13174 +ABL2 10 0.31786 2.537 0.026 0.07 0.011181 0.045548 0.28849 2.3026 0.044 0.096154 0.0213 0.044445 +ABLIM2 10 0.33199 2.1246 0.024 0.07 0.033624 0.045548 0.35781 2.2898 0.016 0.088889 0.022035 0.044445 +ABT1 10 0.64492 1.2807 0 0 0.20031 0.20031 0.56048 1.113 0 0 0.26572 0.26572 +ABTB1 10 0.25881 2.2156 0.048 0.07 0.026717 0.045548 0.27981 2.3954 0.048 0.096154 0.016601 0.044445 +ACAD11 10 0.2457 2.1273 0.056 0.07 0.033397 0.045548 0.26753 2.3163 0.052 0.098113 0.020539 0.044445 +ACAD9 10 0.28033 2.3396 0.038 0.07 0.019306 0.045548 0.23942 1.9982 0.084 0.10886 0.045699 0.055059 +ACAT2 10 0.33017 1.9472 0.024 0.07 0.051509 0.056401 0.34801 2.0524 0.016 0.088889 0.040129 0.049805 +ACBD6 10 0.26005 2.4829 0.048 0.07 0.013031 0.045548 0.22982 2.1942 0.094 0.1175 0.028219 0.044707 +ACD 10 0.29956 2.263 0.028 0.07 0.023633 0.045548 0.30306 2.2895 0.036 0.096154 0.022052 0.044445 +ACHE 10 0.26039 1.9394 0.048 0.07 0.052453 0.056401 0.27459 2.0451 0.05 0.096154 0.04084 0.049805 +ACIN1 10 0.24992 1.6773 0.054 0.07 0.093484 0.097379 0.16332 1.1553 0.222 0.22424 0.24796 0.25047 +ACLY 10 0.64139 1.3277 0 0 0.18428 0.18614 0.56404 1.1676 0 0 0.24298 0.24794 +ACO2 10 0.26736 2.3551 0.048 0.07 0.018518 0.045548 0.24404 2.1496 0.078 0.10886 0.031586 0.045123 +ACP1 10 0.30066 2.0818 0.028 0.07 0.037363 0.045548 0.32268 2.2343 0.024 0.088889 0.025465 0.044445 +ACRC 10 0.316 2.1738 0.026 0.07 0.029722 0.045548 0.32721 2.2508 0.024 0.088889 0.024396 0.044445 +ACSL6 10 0.30715 2.5085 0.028 0.07 0.012125 0.045548 0.27154 2.2176 0.05 0.096154 0.026579 0.044445 +ACSS2 10 0.27125 2.396 0.044 0.07 0.016573 0.045548 0.31578 2.7894 0.024 0.088889 0.0052812 0.044445 +ACTL6A 10 0.23154 2.2408 0.072 0.085714 0.025038 0.045548 0.20097 1.945 0.138 0.14681 0.051771 0.060199 +ACTL6B 10 0.30195 2.3158 0.028 0.07 0.020569 0.045548 0.29791 2.2849 0.036 0.096154 0.02232 0.044445 +ACTL7A 10 0.22531 2.1897 0.078 0.089655 0.028544 0.045548 0.2423 2.3549 0.082 0.10886 0.018527 0.044445 +ACTN1 10 0.30451 2.4532 0.028 0.07 0.014161 0.045548 0.27462 2.2124 0.05 0.096154 0.026942 0.044445 +ACTN4 10 0.3039 2.2464 0.028 0.07 0.024679 0.045548 0.33156 2.4509 0.022 0.088889 0.01425 0.044445 +ACTR1A 10 0.28127 2.1093 0.038 0.07 0.034915 0.045548 0.30952 2.3212 0.028 0.093333 0.020274 0.044445 +ACTR3 10 0.28223 2.1469 0.038 0.07 0.031799 0.045548 0.25252 1.9209 0.068 0.10462 0.054741 0.062206 +ACTR5 10 0.2754 2.7989 0.04 0.07 0.0051271 0.045548 0.20514 2.0849 0.136 0.14624 0.037074 0.049433 +ACTR8 10 0.23674 1.6117 0.06 0.074074 0.10703 0.10922 0.21097 1.4362 0.122 0.13407 0.15095 0.15562 +ACTRT3 10 0.2132 1.984 0.096 0.10435 0.047252 0.053696 0.25182 2.3435 0.068 0.10462 0.019105 0.044445 +ACVR1B 10 0.28652 2.2884 0.034 0.07 0.022117 0.045548 0.27138 2.1674 0.05 0.096154 0.030201 0.045123 +ACVR1C 10 0.28949 2.3641 0.032 0.07 0.018076 0.045548 0.33664 2.7491 0.02 0.088889 0.0059762 0.044445 +ACVR1 10 0.34616 2.4128 0.018 0.07 0.015832 0.045548 0.32005 2.2308 0.024 0.088889 0.025696 0.044445 +ACVR2A 10 0.27696 2.1093 0.04 0.07 0.034917 0.045548 0.33802 2.5743 0.02 0.088889 0.010044 0.044445 +ACVR2B 10 0.36371 2.2098 0.012 0.07 0.027116 0.045548 0.37311 2.267 0.01 0.088889 0.023392 0.044445 +ACVRL1 10 0.39229 2.5262 0.006 0.07 0.011531 0.045548 0.36154 2.3281 0.012 0.088889 0.019905 0.044445 +ADAD1 10 0.30909 2.331 0.028 0.07 0.019753 0.045548 0.30601 2.3077 0.03 0.096154 0.021014 0.044445 +ADAM10 10 0.25292 2.1622 0.054 0.07 0.030601 0.045548 0.24874 2.1265 0.072 0.10746 0.033463 0.04584 +ADAM12 10 0.25552 2.205 0.054 0.07 0.027456 0.045548 0.27084 2.3371 0.05 0.096154 0.019433 0.044445 +ADAMTS5 10 0.24419 2.1566 0.056 0.07 0.031038 0.045548 0.27619 2.4392 0.048 0.096154 0.014719 0.044445 +ADAP1 10 0.20948 2.1011 0.106 0.11277 0.035635 0.045548 0.25866 2.5944 0.06 0.10345 0.0094755 0.044445 +ADARB1 10 0.27489 2.3109 0.04 0.07 0.02084 0.045548 0.27467 2.309 0.05 0.096154 0.020942 0.044445 +ADARB2 10 0.30137 2.3429 0.028 0.07 0.019132 0.045548 0.30102 2.3402 0.036 0.096154 0.019273 0.044445 +ADAR 10 0.25245 2.4669 0.054 0.07 0.013631 0.045548 0.2202 2.1517 0.116 0.13258 0.031424 0.045123 +ADCK1 10 0.36605 2.2853 0.012 0.07 0.022294 0.045548 0.42581 2.6584 0.002 0.033333 0.0078507 0.044445 +ADCK2 10 0.28085 2.5525 0.038 0.07 0.010697 0.045548 0.24246 2.2035 0.08 0.10886 0.027556 0.044445 +ADCK3 10 0.37764 2.128 0.008 0.07 0.033335 0.045548 0.41407 2.3334 0.002 0.033333 0.019629 0.044445 +ADCK4 10 0.37984 2.2562 0.008 0.07 0.024061 0.045548 0.36256 2.1535 0.012 0.088889 0.031278 0.045123 +ADCK5 10 0.35764 2.5433 0.012 0.07 0.010981 0.045548 0.32232 2.2921 0.024 0.088889 0.021897 0.044445 +ADCY1 10 0.2228 2.0734 0.084 0.094382 0.038132 0.045548 0.2199 2.0464 0.116 0.13258 0.040715 0.049805 +ADD1 10 0.25091 2.5127 0.054 0.07 0.011981 0.045548 0.23536 2.357 0.086 0.10886 0.018424 0.044445 +ADD3 10 0.34943 2.4372 0.014 0.07 0.014802 0.045548 0.30967 2.1599 0.028 0.093333 0.030784 0.045123 +ADH5 10 0.31325 2.0785 0.028 0.07 0.037665 0.045548 0.3371 2.2368 0.02 0.088889 0.025302 0.044445 +ADH7 10 0.23185 2.1764 0.072 0.085714 0.029529 0.045548 0.25313 2.3761 0.068 0.10462 0.017497 0.044445 +ADI1 10 0.26344 2.2066 0.048 0.07 0.027345 0.045548 0.2966 2.4843 0.038 0.096154 0.012981 0.044445 +ADIRF 10 0.23157 2.1952 0.072 0.085714 0.028148 0.045548 0.21758 2.0626 0.118 0.13258 0.039152 0.049559 +ADK 10 0.25823 2.3541 0.05 0.07 0.018569 0.045548 0.25466 2.3215 0.066 0.10462 0.020258 0.044445 +ADNP2 10 0.19944 2.0931 0.12 0.12245 0.036336 0.045548 0.25778 2.7054 0.06 0.10345 0.0068216 0.044445 +ADNP 10 0.33596 1.9412 0.024 0.07 0.052236 0.056401 0.44376 2.5641 0 0 0.010346 0.044445 +ADPRHL2 10 0.26332 2.3044 0.048 0.07 0.021202 0.045548 0.27219 2.382 0.05 0.096154 0.017218 0.044445 +ADRA1A 10 0.26321 2.4075 0.048 0.07 0.016062 0.045548 0.24245 2.2176 0.08 0.10886 0.026583 0.044445 +ADRA1B 10 0.26869 2.4689 0.046 0.07 0.013554 0.045548 0.24756 2.2747 0.076 0.10857 0.022923 0.044445 +ADRB1 10 0.26113 2.1522 0.048 0.07 0.031385 0.045548 0.25076 2.0666 0.068 0.10462 0.038768 0.049559 +ADRB2 10 0.3434 2.0721 0.018 0.07 0.038261 0.045548 0.32418 1.9561 0.024 0.088889 0.050457 0.059361 +ADRB3 10 0.27356 2.3431 0.042 0.07 0.019123 0.045548 0.26345 2.1408 0.056 0.10345 0.032287 0.045408 +ADRBK1 10 0.39621 2.5298 0.006 0.07 0.011414 0.045548 0.38361 2.4493 0.004 0.057143 0.014314 0.044445 +ADRBK2 10 0.311 2.4196 0.028 0.07 0.015537 0.045548 0.30224 2.3515 0.036 0.096154 0.018698 0.044445 +ADRM1 10 0.19795 2.0633 0.12 0.12245 0.039089 0.045987 0.21217 2.2114 0.122 0.13407 0.027005 0.044445 +AEBP1 10 0.30109 2.094 0.028 0.07 0.036256 0.045548 0.31995 2.2252 0.024 0.088889 0.026067 0.044445 +AEBP2 10 0.25078 2.3902 0.054 0.07 0.016839 0.045548 0.25977 2.4758 0.06 0.10345 0.013293 0.044445 +AEN 10 0.31767 2.5501 0.026 0.07 0.010771 0.045548 0.21703 1.7422 0.118 0.13258 0.081467 0.089524 +AES 10 0.27613 2.5026 0.04 0.07 0.01233 0.045548 0.28435 2.5771 0.048 0.096154 0.0099638 0.044445 +AFAP1L2 10 0.27787 2.5825 0.038 0.07 0.0098091 0.045548 0.25248 2.3465 0.068 0.10462 0.018949 0.044445 +AFF1 10 0.24186 2.0236 0.056 0.07 0.043007 0.049434 0.28577 2.391 0.044 0.096154 0.0168 0.044445 +AFF2 10 0.22079 1.9621 0.086 0.095556 0.049749 0.055889 0.28962 2.5737 0.044 0.096154 0.010061 0.044445 +AFF3 10 0.22476 2.1578 0.078 0.089655 0.030942 0.045548 0.21756 2.0887 0.118 0.13258 0.03673 0.049433 +AFF4 10 0.31149 2.1142 0.028 0.07 0.034496 0.045548 0.3627 2.4618 0.012 0.088889 0.013825 0.044445 +AFMID 10 0.22778 2.1955 0.078 0.089655 0.02813 0.045548 0.22159 2.1358 0.112 0.13258 0.032694 0.045408 +AFTPH 10 0.25053 2.1997 0.054 0.07 0.027828 0.045548 0.24929 2.1888 0.072 0.10746 0.028613 0.044707 +AGAP2 10 0.3135 2.4258 0.028 0.07 0.015274 0.045548 0.27805 2.1516 0.048 0.096154 0.031432 0.045123 +AGAP3 10 0.27682 2.4409 0.04 0.07 0.01465 0.045548 0.31626 2.7887 0.024 0.088889 0.0052921 0.044445 +AGBL5 10 0.18851 1.7706 0.146 0.14747 0.076634 0.080668 0.25487 2.3938 0.066 0.10462 0.016673 0.044445 +AGFG1 10 0.26133 2.2912 0.048 0.07 0.021954 0.045548 0.24813 2.0639 0.074 0.10857 0.039025 0.049559 +AGL 10 0.65242 1.6625 0 0 0.096417 0.099399 0.60099 1.5314 0 0 0.12566 0.13228 +AGPAT3 10 0.20246 2.1377 0.112 0.11667 0.03254 0.045548 0.18609 1.9649 0.174 0.17938 0.049424 0.058838 +AGPAT5 10 0.32784 1.8786 0.024 0.07 0.060303 0.064152 0.31917 1.8289 0.024 0.088889 0.067418 0.074909 +AGTPBP1 10 0.25153 2.1735 0.054 0.07 0.029741 0.045548 0.29805 2.5755 0.036 0.096154 0.01001 0.044445 +AHCTF1 10 0.24987 2.2694 0.054 0.07 0.023245 0.045548 0.18875 1.7143 0.174 0.17938 0.086471 0.09399 +AHCY 10 0.25511 1.9574 0.054 0.07 0.0503 0.055889 0.20591 1.5799 0.136 0.14624 0.11413 0.12272 +AHNAK2 10 0.27116 2.5067 0.044 0.07 0.012185 0.045548 0.27693 2.5601 0.048 0.096154 0.010466 0.044445 +AHNAK 10 0.22102 2.4775 0.084 0.094382 0.01323 0.045548 0.21459 2.4055 0.118 0.13258 0.016151 0.044445 +AHRR 9 0.19687 2.5399 0.15 0.15 0.011087 0.045548 0.18565 2.2584 0.226 0.226 0.023923 0.044445