Mercurial > repos > iuc > mitos

view test-data/mitos2_NC_012920.fas @ 6:ca1142e5df8b draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/mitos commit ce2e351eec55ba7cd976386c1ede76ea98c8db1c
author iuc
date Thu, 25 Jan 2024 16:47:32 +0000
parents 39b6485e2d34
children
line wrap: on
line source

>NC_012920; 577-647; +; trnF(gaa)
GTTTATGTAGCTTACCTCCTCAAAGCAATACACTGAAAATGTTTAGACGGGCTCACATCA
CCCCATAAACA
>NC_012920; 648-1601; +; rrnS
AATAGGTTTGGTCCTAGCCTTTCTATTAGCTCTTAGTAAGATTACACATGCAAGCATCCC
CGTTCCAGTGAGTTCACCCTCTAAATCACCACGATCAAAAGGAACAAGCATCAAGCACGC
AGCAATGCAGCTCAAAACGCTTAGCCTAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGTGATTAA
CCTTTAGCAATAAACGAAAGTTTAACTAAGCTATACTAACCCCAGGGTTGGTCAATTTCG
TGCCAGCCACCGCGGTCACACGATTAACCCAAGTCAATAGAAGCCGGCGTAAAGAGTGTT
TTAGATCACCCCCTCCCCAATAAAGCTAAAACTCACCTGAGTTGTAAAAAACTCCAGTTG
ACACAAAATAGACTACGAAAGTGGCTTTAACATATCTGAACACACAATAGCTAAGACCCA
AACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACCTCAACAGTTAAATCAACAAAA
CTGCTCGCCAGAACACTACGAGCCACAGCTTAAAACTCAAAGGACCTGGCGGTGCTTCAT
ATCCCTCTAGAGGAGCCTGTTCTGTAATCGATAAACCCCGATCAACCTCACCACCTCTTG
CTCAGCCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTGATGAAGGCTACAAAGTAAGCGCAAG
TACCCACGTAAAGACGTTAGGTCAAGGTGTAGCCCATGAGGTGGCAAGAAATGGGCTACA
TTTTCTACCCCAGAAAACTACGATAGCCCTTATGAAACTTAAGGGTCGAAGGTGGATTTA
GCAGTAAACTAAGAGTAGAGTGCTTAGTTGAACAGGGCCCTGAAGCGCGTACACACCGCC
CGTCACCCTCCTCAAGTATACTTCAAAGGACATTTAACTAAAACCCCTACGCATTTATAT
AGAGGAGACAAGTCGTAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGGACGAAC
>NC_012920; 3230-3304; +; trnL2(taa)
GTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATCGCATAAAACTTAAAACTTTACAGTCAGAGGTTCAA
TTCCTCTTCTTAACA
>NC_012920; 4263-4331; +; trnI(gat)
AGAAATATGTCTGATAAAAGAGTTACTTTGATAGAGTAAATAATAGGAGCTTAAACCCCC
TTATTTCTA
>NC_012920; 4402-4469; +; trnM(cat)
AGTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTATACCCTTC
CCGTACTA
>NC_012920; 5587-5655; -; trnA(tgc)
AAGGGCTTAGCTTAATTAAAGTGGCTGATTTGCGTTCAGTTGATGCAGAGTGGGGTTTTG
CAGTCCTTA
>NC_012920; 5657-5729; -; trnN(gtt)
TAGATTGAAGCCAGTTGATTAGGGTGCTTAGCTGTTAACTAAGTGTTTGTGGGTTTAAGT
CCCATTGGTCTAG
>NC_012920; 5826-5891; -; trnY(gta)
GGTAAAATGGCTGAGTGAAGCATTGGACTGTAAATCTAAAGACAGGGGTTAGGCCTCTTT
TTACCA
>NC_012920; 7446-7514; -; trnS2(tga)
GAAAAAGTCATGGAGGCCATGGGGTTGGCTTGAAACCAGCTTTGGGGGGTTCGATTCCTT
CCTTTTTTG
>NC_012920; 7518-7585; +; trnD(gtc)
AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
ATATCTTA
>NC_012920; 8295-8364; +; trnK(ttt)
CACTGTAAAGCTAACTTAGCATTAACCTTTTAAGTTAAAGATTAAGAGAACCAACACCTC
TTTACAGTGA
>NC_012920; 10405-10469; +; trnR(tcg)
TGGTATATAGTTTAAACAAAACGAATGATTTCGACTCATTAAATTATGATAATCATATTT
ACCAA
>NC_012920; 12138-12206; +; trnH(gtg)
GTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTACGACCCC
TTATTTACC
>NC_012920; 12266-12336; +; trnL1(tag)
ACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCC
AAATAAAAGTA
>NC_012920; 14149-14670; -; nad6
ATGTATGCTTTGTTTCTGTTGAGTGTGGGTTTAGTAATGGGGTTTGTGGGGTTTTCTTCT
AAGCCTTCTCCTATTTATGGGGGTTTAGTATTGATTGTTAGCGGTGTGGTCGGGTGTGTT
ATTATTCTGAATTTTGGGGGAGGTTATATGGGTTTAATAGTTTTTTTAATTTATTTAGGG
GGAATGATGGTTGTCTTTGGATATACTACAGCGATGGCTATTGAGGAGTATCCTGAGGCA
TGGGGGTCAGGGGTTGAGGTCTTGGTGAGTGTTTTAGTGGGGTTAGCGATGGAGGTAGGA
TTGGTGCTGTGGGTGAAAGAGTATGATGGGGTGGTGGTTGTGGTAAACTTTAATAGTGTA
GGAAGCTGAATAATTTATGAAGGAGAGGGGTCAGGGTTGATTCGGGAGGATCCTATTGGT
GCGGGGGCTTTGTATGATTATGGGCGTTGATTAGTAGTAGTTACTGGTTGAACATTGTTT
GTTGGTGTATATATTGTAATTGAGATTGCTCGGGGGAATAGG
>NC_012920; 14674-14742; -; trnE(ttc)
GTTCTTGTAGTTGAAATACAACGATGGTTTTTCATATCATTGGTCGTGGTTGTAGTCCGT
GCGAGAATA
>NC_012920; 15888-15953; +; trnT(tgt)
GTCCTTGTAGTATAAACTAATACACCAGTCTTGTAAACCGGAGATGAAAACCTTTTTCCA
AGGACA
>NC_012920; 15956-16023; -; trnP(tgg)
CAGAGAATAGTTTAAATTAGAATCTTAGCTTTGGGTGCTAATGGTGGAGTTAAAGACTTT
TTCTCTGA