diff test-data/ngmlr-in2.fa @ 0:95e4757d8da7 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/ngmlr commit bae3393450ab5f0564a2fd2b06db6a3566504663"
author iuc
date Thu, 29 Oct 2020 15:43:54 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/ngmlr-in2.fa	Thu Oct 29 15:43:54 2020 +0000
@@ -0,0 +1,118 @@
+>100bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+>200bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+>300bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+>400bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+>500bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+>600bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+>800bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+>1000bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+AAAATATAAAATATGAAAAGTAAACAAGAGAAGAAGCATAGGTTTTGTGAACAAATCTGTGCTTCTGTAAGAAAGCAGCTAAATAGAAGAAAATACATC
+AGGCTTTGCCAATCAAAATTGATACTAAACATTTAGCTGTGCAAACTTAGAAAAATAAGCTCTCCTCTCTCAGCTTCACTTCTGACCTGTAAGACCAAA
+>1200bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+AAAATATAAAATATGAAAAGTAAACAAGAGAAGAAGCATAGGTTTTGTGAACAAATCTGTGCTTCTGTAAGAAAGCAGCTAAATAGAAGAAAATACATC
+AGGCTTTGCCAATCAAAATTGATACTAAACATTTAGCTGTGCAAACTTAGAAAAATAAGCTCTCCTCTCTCAGCTTCACTTCTGACCTGTAAGACCAAA
+AGAATAGTTTTCTGTATATCATGGACAATGCTTGTTACATCGATTAAGAAAAAAAGTGTCAGTTTTCTAGTTTCTACTTCTTCTAGGATGTCTGTAAAT
+TCAAAATGGTTGTCCAGCTCTGTGAAGTTAAAATTTATTCACAAATTCCTATAAACAGATTTGTTTTTTTGCCATGTGTTTCTGCCCAAGACTTTTTAA
+>1400bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+AAAATATAAAATATGAAAAGTAAACAAGAGAAGAAGCATAGGTTTTGTGAACAAATCTGTGCTTCTGTAAGAAAGCAGCTAAATAGAAGAAAATACATC
+AGGCTTTGCCAATCAAAATTGATACTAAACATTTAGCTGTGCAAACTTAGAAAAATAAGCTCTCCTCTCTCAGCTTCACTTCTGACCTGTAAGACCAAA
+AGAATAGTTTTCTGTATATCATGGACAATGCTTGTTACATCGATTAAGAAAAAAAGTGTCAGTTTTCTAGTTTCTACTTCTTCTAGGATGTCTGTAAAT
+TCAAAATGGTTGTCCAGCTCTGTGAAGTTAAAATTTATTCACAAATTCCTATAAACAGATTTGTTTTTTTGCCATGTGTTTCTGCCCAAGACTTTTTAA
+GTCCTCAGAATGAATCCTGACTTGTTATTGTGGCCACTTTCTATGTTGATGTGCGCAGCACACCATAGTCCATCAAAGTCGTTCCTCTGCAGTTAGTTA
+ATTCACTGGGGCCACAGGCTACCCACACCAATGGCTACAAGGCTACAGAAATCTAATACATCATCTTCTTTTCACTGTAGCAGAACATCTCTTTTCCTT
+>1800bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+AAAATATAAAATATGAAAAGTAAACAAGAGAAGAAGCATAGGTTTTGTGAACAAATCTGTGCTTCTGTAAGAAAGCAGCTAAATAGAAGAAAATACATC
+AGGCTTTGCCAATCAAAATTGATACTAAACATTTAGCTGTGCAAACTTAGAAAAATAAGCTCTCCTCTCTCAGCTTCACTTCTGACCTGTAAGACCAAA
+AGAATAGTTTTCTGTATATCATGGACAATGCTTGTTACATCGATTAAGAAAAAAAGTGTCAGTTTTCTAGTTTCTACTTCTTCTAGGATGTCTGTAAAT
+TCAAAATGGTTGTCCAGCTCTGTGAAGTTAAAATTTATTCACAAATTCCTATAAACAGATTTGTTTTTTTGCCATGTGTTTCTGCCCAAGACTTTTTAA
+GTCCTCAGAATGAATCCTGACTTGTTATTGTGGCCACTTTCTATGTTGATGTGCGCAGCACACCATAGTCCATCAAAGTCGTTCCTCTGCAGTTAGTTA
+ATTCACTGGGGCCACAGGCTACCCACACCAATGGCTACAAGGCTACAGAAATCTAATACATCATCTTCTTTTCACTGTAGCAGAACATCTCTTTTCCTT
+TTAACTATAATTGCAAAACCTGCATAGAGGGACAAGATTAACAAAAATATGCTCTCCTATCCACTTTAAACAGCCTAAAAAAATGGCTCTCTGCAACAA
+CATGGACTAATCTGAGAGAACAATTTAAATGTACAACCTTTGTCCTTTCCATTTGGGTGGATTTGGCAACAGATAACCCAATAATCTGATTTCCATGAA
+GGGTCCAGAATAAAATTCATATTTTGTGCCAGAATAATATTTAGTTTTACACTCGCAAAACTAACAACTGTATTTGGCAATGCAATGGTAAACTAGTTA
+GAAAAGCCCCCTGCTCTGAAGAACTTAAGAATTGAAATGACTGCGAGATCCAATTTAAGTCAAAATAAGAGTGTGTGTGTGTGGCTGTGTGTGTGTGTG
+>2200bp
+GGGGGTCTCCCCCATTGACTTTCAGATGGCCACTTTCTCCTGTGTCTATCACATGGTCTTCGCTCTGTGTACACGTGCCCCTGGTGTCTGTCTCCCTCT
+GTGTCCTAATCTTCCCTTCTTATAAAGACACCACGCATATTGGATCAGGGCCTGGGTTAACTTAATTATCTTTTAAAGGCCCTATTTCCAAATATAATC
+ACATTCTGAGGTACTGGGAGTGCTTTGACATAAGAATTTTGGAGATACACAATTCATCCCACGACACCATTCATCATTTCTCTTCAGAGAATCAGGTTT
+AATATTTCTATATCTTTCTCCTTACTTCTTGTTTTCTTAATGATTTTGCATAAGACAATTTATTAAAAATATGTTCATATTTTTGACATACAAATTTTC
+CTGGGTTTTTATAAATACACAAATTTTTTTTGGTCTCTTGATTCTTTTCAGCTCTGTTATTTTCCAATGATTTCGTATTGTGTGTGATAGAAGCAGAAT
+AGTAAACAAAAGTTCATTCTGGAATTAGATTGCCTGGATTTTGTTATAGTCTCTTCCCACTTACTATCTGAGTAACTTTGAGCTCGTCCCTTCCATTGG
+TTTCTTCATCCCCTTATACAGGGAAAATAGAACCAACCTTGTAGAGTTGTTGTCAGAATTTAAGTAATATGGGCAAAGCACACAGAACAGTTTCTAAAC
+CAACATTAAACAACAAATGATTAACACTTAGGAATGACACCTTTAGATAGCTCCATGATTAGTACATAAGAATCATATAAAAGAGTAGGTGTTACCTTT
+AAAATATAAAATATGAAAAGTAAACAAGAGAAGAAGCATAGGTTTTGTGAACAAATCTGTGCTTCTGTAAGAAAGCAGCTAAATAGAAGAAAATACATC
+AGGCTTTGCCAATCAAAATTGATACTAAACATTTAGCTGTGCAAACTTAGAAAAATAAGCTCTCCTCTCTCAGCTTCACTTCTGACCTGTAAGACCAAA
+AGAATAGTTTTCTGTATATCATGGACAATGCTTGTTACATCGATTAAGAAAAAAAGTGTCAGTTTTCTAGTTTCTACTTCTTCTAGGATGTCTGTAAAT
+TCAAAATGGTTGTCCAGCTCTGTGAAGTTAAAATTTATTCACAAATTCCTATAAACAGATTTGTTTTTTTGCCATGTGTTTCTGCCCAAGACTTTTTAA
+GTCCTCAGAATGAATCCTGACTTGTTATTGTGGCCACTTTCTATGTTGATGTGCGCAGCACACCATAGTCCATCAAAGTCGTTCCTCTGCAGTTAGTTA
+ATTCACTGGGGCCACAGGCTACCCACACCAATGGCTACAAGGCTACAGAAATCTAATACATCATCTTCTTTTCACTGTAGCAGAACATCTCTTTTCCTT
+TTAACTATAATTGCAAAACCTGCATAGAGGGACAAGATTAACAAAAATATGCTCTCCTATCCACTTTAAACAGCCTAAAAAAATGGCTCTCTGCAACAA
+CATGGACTAATCTGAGAGAACAATTTAAATGTACAACCTTTGTCCTTTCCATTTGGGTGGATTTGGCAACAGATAACCCAATAATCTGATTTCCATGAA
+GGGTCCAGAATAAAATTCATATTTTGTGCCAGAATAATATTTAGTTTTACACTCGCAAAACTAACAACTGTATTTGGCAATGCAATGGTAAACTAGTTA
+GAAAAGCCCCCTGCTCTGAAGAACTTAAGAATTGAAATGACTGCGAGATCCAATTTAAGTCAAAATAAGAGTGTGTGTGTGTGGCTGTGTGTGTGTGTG
+TGTGTATGAATAAAGGCAGGTAATATTCCATGTCAAATTCTGTATAGAATGTGAAAGAGAAAACAGATTGAGAATAGATGAACTTGGCAATCAGAAGAT
+TTACAGTAGAATAGAGGAAAGATTATAGTAGTATAGTTTGTGAGTAGTGGGTATTACTATGTTTGAAATAAAAAAGCTATTTTTAGTAATTTAATAAAA
+TATTTAGTTGATAGTACTTTTATTTTTGATCGATAAATATAAATGCATTGTTTATATTTTGTGAAAACACACATGGAAGATATTACCCAGGTGTGCTGA
+ATGTTTCCCATTCCTCCCTACCTTACATCCCTGTTGACCTCCAGGAGGCTATCCAGGAAGCTGATCTCAGTAAACTGCATATGCATACAGAGTGTTCAT
+philipp_@kronig(4639.ngmlr_test:0):/project/ngs/philipp/sv-paper/testcases/hs37d5$
\ No newline at end of file