comparison test-data/test.gfa1 @ 0:575b4d5bd444 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/salsa2 commit 67cd735c6709a56ad1c4d65cd84e38fccd59603b"
author iuc
date Sun, 17 Jan 2021 13:24:22 +0000
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:575b4d5bd444
1 # Downloaded from https://github.com/sjackman/gfalint/blob/master/examples/big1.gfa
2 H VN:Z:1.0
3 S 3 * LN:i:5376 KC:i:485841
4 S 5 * LN:i:124 KC:i:6306
5 S 7 * LN:i:3602 KC:i:327981
6 S 8 * LN:i:52 KC:i:2218
7 S 9 * LN:i:48 KC:i:154
8 S 10 * LN:i:144 KC:i:4604
9 S 11 * LN:i:6491 KC:i:611916
10 S 13 * LN:i:10648 KC:i:1023627
11 S 14 * LN:i:48 KC:i:16
12 S 15 * LN:i:5930 KC:i:599587
13 S 17 * LN:i:9404 KC:i:991226
14 S 18 * LN:i:2206 KC:i:240150
15 S 19 * LN:i:893 KC:i:82277
16 S 20 * LN:i:12201 KC:i:1351219
17 S 21 * LN:i:49 KC:i:300
18 S 22 * LN:i:11669 KC:i:1131776
19 S 23 * LN:i:7665 KC:i:766424
20 S 27 * LN:i:48 KC:i:35
21 S 28 * LN:i:1597 KC:i:142681
22 S 30 * LN:i:48 KC:i:7874
23 S 31 * LN:i:94 KC:i:805
24 S 32 * LN:i:3065 KC:i:275287
25 S 33 * LN:i:70 KC:i:5123
26 S 34 * LN:i:49 KC:i:23
27 S 36 * LN:i:12335 KC:i:1315304
28 S 37 * LN:i:130 KC:i:5258
29 S 38 * LN:i:4516 KC:i:440430
30 S 39 * LN:i:59 KC:i:4094
31 S 41 * LN:i:215 KC:i:11423
32 S 42 * LN:i:146 KC:i:3161
33 S 43 * LN:i:50 KC:i:563
34 S 44 * LN:i:3913 KC:i:434585
35 S 46 * LN:i:2710 KC:i:268203
36 S 47 * LN:i:49 KC:i:200
37 S 49 * LN:i:61 KC:i:3442
38 S 50 * LN:i:5010 KC:i:532820
39 S 51 * LN:i:9644 KC:i:950549
40 S 52 * LN:i:417 KC:i:16750
41 S 54 * LN:i:50 KC:i:600
42 S 55 * LN:i:69 KC:i:11532
43 S 56 * LN:i:1550 KC:i:141042
44 S 57 * LN:i:346 KC:i:12512
45 S 58 * LN:i:3825 KC:i:349334
46 S 59 * LN:i:11508 KC:i:1237494
47 S 60 * LN:i:720 KC:i:72448
48 S 61 * LN:i:1086 KC:i:83405
49 S 62 * LN:i:4818 KC:i:464490
50 S 63 * LN:i:8207 KC:i:822244
51 S 65 * LN:i:67 KC:i:2088
52 S 66 * LN:i:4375 KC:i:421128
53 S 67 * LN:i:5063 KC:i:530425
54 S 68 * LN:i:78 KC:i:10057
55 S 69 * LN:i:10204 KC:i:1039066
56 S 71 * LN:i:789 KC:i:65350
57 S 72 * LN:i:95 KC:i:6170
58 S 73 * LN:i:48 KC:i:14
59 S 76 * LN:i:54 KC:i:1373
60 S 77 * LN:i:4167 KC:i:460259
61 S 78 * LN:i:49 KC:i:925
62 S 79 * LN:i:95 KC:i:5402
63 S 83 * LN:i:15015 KC:i:1487985
64 S 84 * LN:i:9811 KC:i:1021233
65 S 85 * LN:i:3483 KC:i:365113
66 S 86 * LN:i:7953 KC:i:722908
67 L 3 + 65 - 47M
68 L 3 - 76 - 47M
69 L 5 + 47 - 47M
70 L 5 - 22 - 47M
71 L 5 - 32 + 47M
72 L 7 + 49 - 47M
73 L 8 + 33 - 47M
74 L 8 + 55 - 36M
75 L 8 - 78 + 47M
76 L 8 - 79 + 47M
77 L 9 + 37 - 47M
78 L 9 + 47 + 46M
79 L 9 - 67 - 47M
80 L 9 - 69 - 47M
81 L 10 + 47 + 47M
82 L 11 - 43 - 47M
83 L 14 + 30 + 47M
84 L 14 + 31 + 47M
85 L 14 + 73 - 47M
86 L 17 + 21 - 47M
87 L 18 + 78 - 47M
88 L 19 + 76 + 47M
89 L 19 - 76 - 47M
90 L 20 - 76 + 47M
91 L 21 + 51 - 47M
92 L 21 - 32 - 47M
93 L 21 - 66 + 47M
94 L 22 + 63 + 47M
95 L 23 + 68 - 47M
96 L 27 + 30 + 47M
97 L 27 + 31 + 47M
98 L 27 + 73 - 47M
99 L 27 - 31 - 47M
100 L 27 - 83 + 47M
101 L 28 + 43 + 47M
102 L 30 + 30 + 47M
103 L 30 + 31 + 47M
104 L 30 + 73 - 47M
105 L 30 - 34 - 47M
106 L 31 - 34 - 47M
107 L 32 - 63 + 47M
108 L 33 + 72 - 47M
109 L 33 - 44 - 47M
110 L 33 - 55 - 16M
111 L 34 + 73 - 47M
112 L 36 - 63 - 47M
113 L 36 - 85 + 47M
114 L 37 - 49 + 47M
115 L 39 + 56 + 47M
116 L 39 + 67 + 47M
117 L 39 - 71 - 47M
118 L 39 - 65 + 14M
119 L 41 + 43 + 47M
120 L 42 + 65 - 47M
121 L 43 + 60 + 47M
122 L 47 + 59 + 47M
123 L 49 + 71 + 47M
124 L 49 - 84 + 47M
125 L 52 - 65 + 47M
126 L 54 + 77 - 47M
127 L 54 + 54 + 46M
128 L 54 - 58 - 47M
129 L 55 + 72 - 36M
130 L 55 - 79 - 47M
131 L 55 - 78 - 44M
132 L 57 + 63 - 47M
133 L 57 + 85 + 47M
134 L 61 + 68 + 47M
135 L 68 + 68 + 26M
136 L 72 - 78 + 47M
137 L 72 - 79 + 47M