Mercurial > repos > iuc > samtools_view

view test-data/test_ds.sam @ 4:fdc58a0cc1d4 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tool_collections/samtools/samtools_view commit 640b53919bfc0ae4b895451218e919a52ac14b9d
author iuc
date Tue, 20 Nov 2018 06:21:33 -0500
parents 02afb5ea2fce
children
line wrap: on
line source

@HD	VN:1.4	SO:unsorted
@SQ	SN:CHROMOSOME_I	LN:100
@RG	ID:UNKNOWN	SM:UNKNOWN
@PG	ID:bowtie2	PN:bowtie2	VN:2.0.0-beta5
@PG	ID:0	CL:aaaaa/aaa/aaaaa/aaaaaa/aaaaaaaaa/aaa/iuc/package_aaaaaaaaa_x_y/aaaaaaaaaaaa/bin/aaaaaaaaaaaaaaaaa aaaaaaaaaa /aaaa/aaaaa/aaa/aaaaaaaaaaaaaaaaaaa/tools/aaaaaaaaa/test-data/test.cram aa /aaaa/aaaaa/aaa/aaaaaaaaaaaaaaaaaaa/tools/aaaaaaaaa/test-data/test.fa -O test	PN:samtools	VN:1.2
SRR065390.14978392	16	CHROMOSOME_I	2	1	27M1D73M	*	0	0	CCTAGCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	#############################@B?8B?BA@@DDBCDDCBC@CDCDCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC	RG:Z:UNKNOWN	XG:i:1	XM:i:5	XN:i:0	XO:i:1	AS:i:-18	XS:i:-18	YT:Z:UU
SRR065390.921023	16	CHROMOSOME_I	3	12	100M	*	0	0	CTAAGCCTAAATCTAAGCCTAACCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAA	###############################################???88:;98768700000<>:BBA?BBAB?BBBBBBBB>B>BB::;?:00000	RG:Z:UNKNOWN	XG:i:0	XM:i:3	XN:i:0	XO:i:0	AS:i:-6	XS:i:-13	YT:Z:UU
SRR065390.6023338	0	CHROMOSOME_I	3	1	100M	*	0	0	CTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAGCCTAAAGCTAC	CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC@CCDDDBCCABB=DABBA?################	RG:Z:UNKNOWN	XG:i:0	XM:i:3	XN:i:0	XO:i:0	AS:i:-6	XS:i:-6	YT:Z:UU