Mercurial > repos > iuc > stacks2_gstacks
comparison test-data/gstacks/catalog.calls.vcf @ 0:d35cb34f2b85 draft
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236 2 28 . T . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
237 2 29 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
238 2 30 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
239 2 31 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
240 2 32 . A . . . DP=56;AD=55 DP 28 28 | |
241 2 33 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
242 2 34 . G . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
243 2 35 . G . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
244 2 36 . A . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
245 2 37 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
246 2 38 . A . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
247 2 39 . T . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
248 2 40 . A . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
249 2 41 . A . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
250 2 42 . C . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
251 2 43 . T . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
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254 2 46 . T . . . DP=56;AD=56 DP 28 28 | |
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400 2 202 . A . . . DP=34;AD=34 DP 23 11 | |
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403 2 205 . G . . . DP=34;AD=34 DP 23 11 | |
404 3 1 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
405 3 2 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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407 3 4 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
408 3 5 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
409 3 6 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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411 3 8 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
412 3 9 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
413 3 10 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
414 3 11 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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417 3 14 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
418 3 15 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
419 3 16 . A . . . DP=40;AD=39 DP 20 20 | |
420 3 17 . G . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
421 3 18 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
422 3 19 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
423 3 20 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
424 3 21 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
425 3 22 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
426 3 23 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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430 3 27 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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432 3 29 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
433 3 30 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
434 3 31 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
435 3 32 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
436 3 33 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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440 3 37 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
441 3 38 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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449 3 46 . G . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
450 3 47 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
451 3 48 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
452 3 49 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
453 3 50 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
454 3 51 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
455 3 52 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
456 3 53 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
457 3 54 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
458 3 55 . G . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
459 3 56 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
460 3 57 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
461 3 58 . G . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
462 3 59 . T . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
463 3 60 . T . . . DP=40;AD=39 DP 20 20 | |
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465 3 62 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
466 3 63 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
467 3 64 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
468 3 65 . A . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
469 3 66 . C . . . DP=40;AD=40 DP 20 20 | |
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