Mercurial > repos > iuc > tasmanian_mismatch

comparison test-data/cached_locally/small_region.fa @ 0:bc0b40dec7d2 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
"planemo upload for repository https://github.com/nebiolabs/tasmanian-mismatch commit a64a371ca1ed117c9bd8af743d847128fbce461c"
author iuc
date Wed, 20 May 2020 17:23:42 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:bc0b40dec7d2
1 >chr1
2 TCCTCAGAAAATGGATTTTTCTTTTCTATCACAGTGTCATGCTACAAATTTTCTGAACGTTTATGCTCTG
3 TTTTCCTGTTAAAACTGAGTGCTTTTAACACACCCAAGTCACTCTTGAATGATTTGCTGCTTAGAAATTT
4 CTTCTGCCAGATACCCTAACTCATCTCCCTCAAGTTCAAAGTTCCACAAATCTCTAGGGCAGGGACAAAA
5 TGCTGCCAGTCTCTCTCGATAGCAAGAGACACCTTTACTCCAGTTCCCATTGAGTTCCTCATCTCCATCT
6 GAGACCATCTCAGCCTGGATTTCATTGTCTATATCATTATTTGACATTTTAGTCAAAGCCATTCAACAAG
7 TCTCTAGGAAGTTCCAAACTTTCCCACATTTTCCTGTCGTTTTCTGAGCCCTCCAAACTGTTTCAACCCC
8 TGCCTGTTACCCAGTTCCAAAGTCGCTTCCACATTTTTGGGTTATCTTTACAACAGCACCCCACTCTACC
9 AGTACCAATGTACTGTATTAGTCTGTTTTCATGCTGCTGATAAAGACATACCTGAGACTGAGTGATTTAT
10 GAAGAAAAAGACACTTAATGGACTCACATTTCCAGGTGGATGGGGAGGCCTCACAATCATGGTGGAAGGC
11 AAAAGGCACATCTCTACATGATGGCAGACAAGACAGAATGAGAGCTAAGTGAAAGGGGAACCCCCTTATA
12 AAATCATCAGCTCTTGTGAGACTTATTCAAGACCACGAGAACAGTATGGGGGAAATACTCCTGTGATTCA
13 GTTATCTCCCGTTGGATCCCTCCCACAAGACACGGAAATTATGGGAGCTACAATTCAAGATGAGATTTGG
14 GTGGGGACACATCCAAACCATATTGCTGCTGAATAGATCATGTAGACAGGCTCTCAAACTACACGGAGAG
15 CAAGAGAGGCCCACCTTACCACAACATTTCATCCAATCCACTAATAAAACAGGCACATCACTGAAGCCAC
16 CTTCAACTCTCCAGACTACCCAGCTGCCAGCTGAATACCACAGATGGCTACAGTTAATACCACATGGAGC
17 AGAATCATGTAGCTAAGCCCTGCTTGCGCTAATACAAGTCCACAATTTTTTTTAAGTTTGTTGTTTTAAG
18 CTGCTAAGTTTTGAGGTGGTTTGTGGTACGTGGAATAAGATGTCACTCTAATATAATATAAACTTAAACT
19 ATGTGGCATTGGCTTTGGAATCAGACAATGGATAGAAGCCAGAAGGATTTCACAAAGACTGTTAGTGAAA
20 AGTGAACAGACTTCAAGGAAAATGATAGCAAAACCTGTAAAAGCATTCTGGGAACTGACAGTAAACACTG
21 AATGGTCCTTAAGGAGACTGAAAACTTGAAAGAGCTTAAGAAGTCTACTGGAAAGGGCTTTAAGGATAAT
22 GAGAAAAAATCATCAGTGGAGGCTGAGGAAAACGCACCAAAGTCATATTCTGATGGGAGAATTAGAAAAC
23 GCTTGCCTGGAATGATATAAAAAATAGGAAAAATACCGAAAAAGTTTGTGGATCTGGCTGGGGAGATTTT
24 TGGTGTCAACTAAAGAAAAAAATTAAGCTTTTAAGAAATTAAAGTTAGATTTATTTAGGGGTCTGAGAAC
25 AAGAGACTGAGGATTACAGCCTAGGAGAAGTCTTCCAGAGAGGTTCTGTCAGACTGCTCTGGTGAAGGTC
26 TTTAGCCCACAGTTTATATGCAGGCTGTACATATACACCATGGAATACTATGCCGCCATTAAAAAATGAT
27 ATCATGTCTTTTGCTGGAACATGGATGGACCTTCTATTATCCTTAGCAAACTAATGCAGGAACAGAAAAC
28 CAAATACAGCATACTCTCAGTTATAAGTGGGAGCTAAATGATGAGAACTCATGAACACAAAGAATAAAAC
29 AGACACTGGGGTCTACTTGAGGGTGGAGGGTGAGAAAAGGAAGAGAAGCAGAAAAGATAACTATTGGGTA
30 CTAGGTTTAATACCTGGGTGATGAAATGATCTGTACAATAACCCCCTGTGACACCAGTCTACCTATGTAA
31 CAAATGCCCCTAAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAAAAGAAAATTAAAATCTCCTTATCATCTACCTGGT
32 AATATGAAAAACACAAATCTTTCATTCATTCCTTTCAACTGATGAGGAAAATGAGGCATCGGGAGTTAGT
33 AAAAGTCCACATTGAGATATGAGACCCACCACTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC
34 TTTGGGAGGCCGATGCTGGTGGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCGGGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAA
35 CCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGCACCTGTAATACCAGCTACTAG
36 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGTTTACAGTGAGCCAAAATCACGCCATTG
37 CACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCTGTCGGGGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACCACCGCCATC
38 ATTTTGCAAGTGTTACCACTATTGTGTGTTAATATTGTAGAAGTATTCCTAATTATGATTTCTTTGTATT
39 CCTAATTGTAATAGCTTTGTATTTGAAAAATTATTGATTCATACTCTATATGTTATTATTTTGTATGTGA
40 TGACAACAGAATATATTATCATGCTCCTTTTGTGAATCTCATTCATAATATAAAGTATAAATTTGTGATT
41 TTGCTTTAATTTGAAATATTAACTTCAAATATGTTATCACAATTTGATACAAACTATTGACAGTAAATCT
42 GTGGATTAAGTAATGTCTTAGTAGGTATTGGGAAAATTTGAAACTAGTAACATGGAGGACTATTGTCATT
43 GTTTATTTCAAAGCCAGTTAAAATTCTGCAAAGCAGTGTACATAAAAATAATTTCAAGAAATTTATAAAA
44 TACCGAGATTATGGTGTATAAACAACTTTAGATTCTTTGTTTAAGAAATTCTGCCAGTTTGTAATATATG
45 CTTCATTCAAAGTAGCTAAGGGCTGTACCTGGCTAATAGTAGGCACCTAATATTTGTTGAAAAGGAATAC
46 TGAGTAGCTGGGACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACACACATTTAACCTGTATTTATAAAATTACTGTTTA
47 GAGAATAACATTTGATGGAATCATGCTTTTACTTTCTGCTTACGACTCAATTGTTTGTACTGACATTAAC
48 ATCCCAAATCCTTAGCATGGCCTACAAGGCCCTGAGCAATGTGGCACCTGCTGAAGCCTGCTGCCTCATT
49 TAATAACTCTTTGTCTCTTTCCCAGATCCAGCCACTCTAACATTTTTTAGCTCCTGGACCAAGACAAGCT
50 CTTCCCAGAACCTGACCTTTGTACCTGTTCTTTATTCCTGGAGTATTTTTCCCCTGACAAATTACTTATC
51 ATCTATCATAATTCAGGTTAAATGGCACTAACTCAGGGAAGGCTTCCCTAACTGCCTCCCTTCTCCAACC
52 AAATTAGGAACAATTATATGGCCACATAGTATCGAATCAAGTTTATAATTTTAAAATAATTGGGAGATTT
53 TGTTGTTTAACACTTGTTTTCACTATAAGACTGTAATTACATGCAAGTAAGAACCATGCCTGTTTGTTCA
54 CTCCTGCCACAGTCAGAATAGTGCCTGGAATATGCAGTAAGGGCTGAACAAGCACTAAATAAATGAACAA
55 GTGAATAAATGGATATTGTCTCATTTTTAGAACAGAGTACTGAATGGATCATGAACACTATCTGGTATGT
56 CACGTAGGTAATTTACAAGGGCTACAATTTCAGCTCAGATTTACCTTTTCCTGGATACAGGTCTTGATAG
57 GTCTCTTGATGTCATTTCACTTCAGATTCTTCTTTAGAAAACTTGGACAATAGCATTTGCTGTCTTGTCC
58 AAATTGTTACTAAGAATCAAGAGAGATATCTGACATGAAATGACATTGGAAAACATTAAACACGATTGAA
59 ATAATGCTAGCCAATATGGTTATTATTAGAAACCAATTACATTTTCAACTTAAAAATAGTAATACTTATT
60 GCAGACTCAAATGTGCTTATTCTAAAACAAGTAAATGTTTGCCTATGGTCTGAGATTCTAATCCACGGAG
61 TTCATTCTAATCCACATTCAACACTATCATGTACCAGTGGGCCTCATAACCCACCTAGCCCTGTGATTTT
62 TCAGGTTCACTTTTCTAAACTTGTGAATTAAATATTTATTTTCTTAGTTCAGAAGAGGAAAAAAACTCTT
63 GTAATTGTTGCCCATTTCAGGAGAAATCTTGCATATGAAAACAAGAGATAAATATACACAACTGAGGGCT
64 GTGGTTTAAACAAAATCTTGAGAATGTTTTTTGACCTTACACATTTGTGCTTTAGTATAACAAAATGATA
65 TAGACAAAGGTAACTTTTAATAGAACCAGTCACTAAATTAAAAAAATGACAAATTCTTCTGCTTAGCTAA
66 GCAACAGAGAAGGTAAAATACTAATTCAATTCATCAATTTAAGCAATACTCATTAAGAGCCAAGTATGTG
67 CTCACTGAATAAGCTGCTAAGGTTTGGTGGTTACAGAGTGTGCGGTGAAATGATGTCTACATCACAGTCC
68 AACATTCACAGAGTTTAAAAGCCTACCAAGAATCAAGACAGACACAAATACCTAACATAGACATTTGTAT
69 ATGATAAGAGAGCCAGAGTACAATTTAGGAGAAGAAATTGTATGGAAGGAAGGTTCATTTCCATTAGACC
70 AGAAAAGACAGCACATTTGAAGGCCTGAATAAGAAATATTCTGGATAAGATATTGTGGCTGCTACCAGAA
71 TGGCTCTTGATGATCTCTACCTCTTGGTATTTATACCCTTATATAATCTCTTTCCTATAGTGTAAGCTGG
72 TCCCAGGTACTTGTTTCTATTGAATAGAATAGAACAAAAGAAATGAGATGCCACTTCTGAGATTAGATTA
73 TAAGATACTGTGAATTTCTTCTTGTGCCCTCTCCCTCTCTCTCTTTCTCTTGCCCTCTCATTTGAATGAA
74 GCCAACTGGCATGCTGTCAGTGGCCCAGTGTAAGTCCTGTTACAAGAAATTGATGATTACCTGTAGCCAA
75 CCCTAAGTGAAGAACTGAGGTCCTCAGTCCTACAAATGGAGAGAAACTGAATCTAGCTAAGAACCATGTG
76 AGTGAGCTGGGAAGAAGATCCACCCTCAGTTGAAATTTAAGATGACATATTGAGCAGACATACTGAGACA
77 CACTGAAAGTAAGAGAGCAGGAGGAAACAAAACCAGGGTCATACAAAGAACACAACTGATTTTGAGATTC
78 TCACATAAGTATTACACCTTCAGTGAGCACGTGTACTAGAAATTTAAAAAATAAATAAAATAAACCTTCA
79 AAGTGAGCTAGCAAATAAATTTCCCTATGGTCTCAGCTCTGAGTGGAGAGAGAAAATGTTCCCTGTGGAG
80 TTTATAGCCAGAATCCAGCTCTCAAACAGGTTTCAGCCTGAACTCACACAATCTGTGTGGCTTCCAAATT
81 TGCAAGCTGAGAATTTAATTCAAAGTGGTCTCAGGTTGATAGCAGTCCAAAATGCTAGGTAGGAAAAAAA
82 ATCCTCTCTGGACAAATAAATCATCAAAGCAAGCTCATAAGAGCAGGTTTCAAAGGTCATGAGCTTCTAA
83 CACACACACAAAAATCACACACACAAAATGGGGGTAGCAGCAACATGGGTAGCGTATTCAAACTTGAAAA
84 GACTTTAAATATTTGTATTATTAGATGTAGATTATGAAACACATATTTTAATGTGGTTAATTTTTTTAAG
85 GAATCAAAACTATGAGTAAAGACCAAGAAAATTGTGCTGGATGGCCACTTCCACCATGGCTCCCCTCCTA
86 TTTAAGTCTGGGTACTGTGTCACCCGAAGTCTTCAGGCACATTGTTCCAGGTCTGGGTTTGCCTATGAAA
87 GAAACTCATGAGAGCTGGAAATGAGGAGTGAAGAGGAGGTCTTCAAATAAAGCAGGCTTAAGGATTAGAC
88 ATAGCAGGTTTGACAGATGTGATGGCTTGCAGAATCCTTTATGAGCTCCCACTGTCCATCTGGATAAGAT
89 TTACAGACCTTTCAGAAATTCCTATAAGCTTGGGTTCTGTGCCCACACTCTAGACTGTCAGGCTAAGATC
90 TCTGATATAAAACAGACCTCTTCTGATTTTGTCTAGCTGCTTTTCTAATATCTATTCACCAAGCTCTTCC
91 AATAATAGCATAAGGCCCTAATTAATATTAAACTTTTATCATTATAATACATAGGATGTCTTCTGTTTTC
92 CTGATCAAATTCTGACTACTATTAAAATATAAAGAATTGTCCAGAAATATATAAAAAAAGAATCACACAT
93 TGATCTTCTTTAAATGAAAATATAACAATTGTATGGACTAGGATGATTACAGTTGTTCAGTTCTGACTGT
94 TATTTGAAGAAAAAAGCAATAAGAAGCCTCAGCAACTTAACAGAAGGAGCTGCCATTTACTAGGAGAAAA
95 GATTGTGGATGAGAGTGTAGCAAAGGTCAGAATTCTGTGAAGCTTGAGATGTTTATTATAATGAATTATC
96 TTTTATACTCACTACAATTTCCTAACAATTTTGGGGTTTATATTTTTGAAAGAGATATACCTTTAATTTT
97 CTTTCTTTGTACTATTGTTAGGTAACTTTGATGTGCAGATTATACTACAGTGAAAGTTGCCAATGACAAG
98 GCAAAGTCACTTACATCAGACCCAAAGCAAAGTGGAGCCGGGTCATGAAAAAGGGGATCTTGTGTGTCTG
99 TCCACGATAAGCACTATCACAAGGACTTTCTATAAACTCACAAGAAATTTCTGCCCACCCAGCACACTCT
100 GTTTGTCCAGCTCATCCTGTAGGTGTCTCTATAATAGGACCTATCATAAAAAATTCCTCAAGACTGCAGC
101 ATTTCAGATAAGCCACCCTCACAAGAACACTTGCCTAGCAATGGCTGTTTCTGCCAGTAAGTTAACACCA
102 GCTCCTGCATCAGACCCTGTGACCAATGATGTTTGTTTCAAAACAGCTTGCATGGACTTCTTTTTGTCTT