Mercurial > repos > iuc > tasmanian_mismatch
comparison test-data/small_region.fa @ 0:bc0b40dec7d2 draft
"planemo upload for repository https://github.com/nebiolabs/tasmanian-mismatch commit a64a371ca1ed117c9bd8af743d847128fbce461c"
author | iuc |
---|---|
date | Wed, 20 May 2020 17:23:42 -0400 |
parents | |
children |
comparison
equal
deleted
inserted
replaced
-1:000000000000 | 0:bc0b40dec7d2 |
---|---|
1 >chr1 | |
2 TCCTCAGAAAATGGATTTTTCTTTTCTATCACAGTGTCATGCTACAAATTTTCTGAACGTTTATGCTCTG | |
3 TTTTCCTGTTAAAACTGAGTGCTTTTAACACACCCAAGTCACTCTTGAATGATTTGCTGCTTAGAAATTT | |
4 CTTCTGCCAGATACCCTAACTCATCTCCCTCAAGTTCAAAGTTCCACAAATCTCTAGGGCAGGGACAAAA | |
5 TGCTGCCAGTCTCTCTCGATAGCAAGAGACACCTTTACTCCAGTTCCCATTGAGTTCCTCATCTCCATCT | |
6 GAGACCATCTCAGCCTGGATTTCATTGTCTATATCATTATTTGACATTTTAGTCAAAGCCATTCAACAAG | |
7 TCTCTAGGAAGTTCCAAACTTTCCCACATTTTCCTGTCGTTTTCTGAGCCCTCCAAACTGTTTCAACCCC | |
8 TGCCTGTTACCCAGTTCCAAAGTCGCTTCCACATTTTTGGGTTATCTTTACAACAGCACCCCACTCTACC | |
9 AGTACCAATGTACTGTATTAGTCTGTTTTCATGCTGCTGATAAAGACATACCTGAGACTGAGTGATTTAT | |
10 GAAGAAAAAGACACTTAATGGACTCACATTTCCAGGTGGATGGGGAGGCCTCACAATCATGGTGGAAGGC | |
11 AAAAGGCACATCTCTACATGATGGCAGACAAGACAGAATGAGAGCTAAGTGAAAGGGGAACCCCCTTATA | |
12 AAATCATCAGCTCTTGTGAGACTTATTCAAGACCACGAGAACAGTATGGGGGAAATACTCCTGTGATTCA | |
13 GTTATCTCCCGTTGGATCCCTCCCACAAGACACGGAAATTATGGGAGCTACAATTCAAGATGAGATTTGG | |
14 GTGGGGACACATCCAAACCATATTGCTGCTGAATAGATCATGTAGACAGGCTCTCAAACTACACGGAGAG | |
15 CAAGAGAGGCCCACCTTACCACAACATTTCATCCAATCCACTAATAAAACAGGCACATCACTGAAGCCAC | |
16 CTTCAACTCTCCAGACTACCCAGCTGCCAGCTGAATACCACAGATGGCTACAGTTAATACCACATGGAGC | |
17 AGAATCATGTAGCTAAGCCCTGCTTGCGCTAATACAAGTCCACAATTTTTTTTAAGTTTGTTGTTTTAAG | |
18 CTGCTAAGTTTTGAGGTGGTTTGTGGTACGTGGAATAAGATGTCACTCTAATATAATATAAACTTAAACT | |
19 ATGTGGCATTGGCTTTGGAATCAGACAATGGATAGAAGCCAGAAGGATTTCACAAAGACTGTTAGTGAAA | |
20 AGTGAACAGACTTCAAGGAAAATGATAGCAAAACCTGTAAAAGCATTCTGGGAACTGACAGTAAACACTG | |
21 AATGGTCCTTAAGGAGACTGAAAACTTGAAAGAGCTTAAGAAGTCTACTGGAAAGGGCTTTAAGGATAAT | |
22 GAGAAAAAATCATCAGTGGAGGCTGAGGAAAACGCACCAAAGTCATATTCTGATGGGAGAATTAGAAAAC | |
23 GCTTGCCTGGAATGATATAAAAAATAGGAAAAATACCGAAAAAGTTTGTGGATCTGGCTGGGGAGATTTT | |
24 TGGTGTCAACTAAAGAAAAAAATTAAGCTTTTAAGAAATTAAAGTTAGATTTATTTAGGGGTCTGAGAAC | |
25 AAGAGACTGAGGATTACAGCCTAGGAGAAGTCTTCCAGAGAGGTTCTGTCAGACTGCTCTGGTGAAGGTC | |
26 TTTAGCCCACAGTTTATATGCAGGCTGTACATATACACCATGGAATACTATGCCGCCATTAAAAAATGAT | |
27 ATCATGTCTTTTGCTGGAACATGGATGGACCTTCTATTATCCTTAGCAAACTAATGCAGGAACAGAAAAC | |
28 CAAATACAGCATACTCTCAGTTATAAGTGGGAGCTAAATGATGAGAACTCATGAACACAAAGAATAAAAC | |
29 AGACACTGGGGTCTACTTGAGGGTGGAGGGTGAGAAAAGGAAGAGAAGCAGAAAAGATAACTATTGGGTA | |
30 CTAGGTTTAATACCTGGGTGATGAAATGATCTGTACAATAACCCCCTGTGACACCAGTCTACCTATGTAA | |
31 CAAATGCCCCTAAACTTAAAATAAAAGTTAAAAAAAAAGAAAATTAAAATCTCCTTATCATCTACCTGGT | |
32 AATATGAAAAACACAAATCTTTCATTCATTCCTTTCAACTGATGAGGAAAATGAGGCATCGGGAGTTAGT | |
33 AAAAGTCCACATTGAGATATGAGACCCACCACTGGCTGGACGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCAC | |
34 TTTGGGAGGCCGATGCTGGTGGATCACCTAAGGTCAGGAGTTCGGGACCAGGCTGGCCAACATGGTGAAA | |
35 CCCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGCAGGCACCTGTAATACCAGCTACTAG | |
36 GGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGTTTACAGTGAGCCAAAATCACGCCATTG | |
37 CACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCTGTCGGGGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACCACCGCCATC | |
38 ATTTTGCAAGTGTTACCACTATTGTGTGTTAATATTGTAGAAGTATTCCTAATTATGATTTCTTTGTATT | |
39 CCTAATTGTAATAGCTTTGTATTTGAAAAATTATTGATTCATACTCTATATGTTATTATTTTGTATGTGA | |
40 TGACAACAGAATATATTATCATGCTCCTTTTGTGAATCTCATTCATAATATAAAGTATAAATTTGTGATT | |
41 TTGCTTTAATTTGAAATATTAACTTCAAATATGTTATCACAATTTGATACAAACTATTGACAGTAAATCT | |
42 GTGGATTAAGTAATGTCTTAGTAGGTATTGGGAAAATTTGAAACTAGTAACATGGAGGACTATTGTCATT | |
43 GTTTATTTCAAAGCCAGTTAAAATTCTGCAAAGCAGTGTACATAAAAATAATTTCAAGAAATTTATAAAA | |
44 TACCGAGATTATGGTGTATAAACAACTTTAGATTCTTTGTTTAAGAAATTCTGCCAGTTTGTAATATATG | |
45 CTTCATTCAAAGTAGCTAAGGGCTGTACCTGGCTAATAGTAGGCACCTAATATTTGTTGAAAAGGAATAC | |
46 TGAGTAGCTGGGACCTCCTGAGTAGCTGGGACCACACACATTTAACCTGTATTTATAAAATTACTGTTTA | |
47 GAGAATAACATTTGATGGAATCATGCTTTTACTTTCTGCTTACGACTCAATTGTTTGTACTGACATTAAC | |
48 ATCCCAAATCCTTAGCATGGCCTACAAGGCCCTGAGCAATGTGGCACCTGCTGAAGCCTGCTGCCTCATT | |
49 TAATAACTCTTTGTCTCTTTCCCAGATCCAGCCACTCTAACATTTTTTAGCTCCTGGACCAAGACAAGCT | |
50 CTTCCCAGAACCTGACCTTTGTACCTGTTCTTTATTCCTGGAGTATTTTTCCCCTGACAAATTACTTATC | |
51 ATCTATCATAATTCAGGTTAAATGGCACTAACTCAGGGAAGGCTTCCCTAACTGCCTCCCTTCTCCAACC | |
52 AAATTAGGAACAATTATATGGCCACATAGTATCGAATCAAGTTTATAATTTTAAAATAATTGGGAGATTT | |
53 TGTTGTTTAACACTTGTTTTCACTATAAGACTGTAATTACATGCAAGTAAGAACCATGCCTGTTTGTTCA | |
54 CTCCTGCCACAGTCAGAATAGTGCCTGGAATATGCAGTAAGGGCTGAACAAGCACTAAATAAATGAACAA | |
55 GTGAATAAATGGATATTGTCTCATTTTTAGAACAGAGTACTGAATGGATCATGAACACTATCTGGTATGT | |
56 CACGTAGGTAATTTACAAGGGCTACAATTTCAGCTCAGATTTACCTTTTCCTGGATACAGGTCTTGATAG | |
57 GTCTCTTGATGTCATTTCACTTCAGATTCTTCTTTAGAAAACTTGGACAATAGCATTTGCTGTCTTGTCC | |
58 AAATTGTTACTAAGAATCAAGAGAGATATCTGACATGAAATGACATTGGAAAACATTAAACACGATTGAA | |
59 ATAATGCTAGCCAATATGGTTATTATTAGAAACCAATTACATTTTCAACTTAAAAATAGTAATACTTATT | |
60 GCAGACTCAAATGTGCTTATTCTAAAACAAGTAAATGTTTGCCTATGGTCTGAGATTCTAATCCACGGAG | |
61 TTCATTCTAATCCACATTCAACACTATCATGTACCAGTGGGCCTCATAACCCACCTAGCCCTGTGATTTT | |
62 TCAGGTTCACTTTTCTAAACTTGTGAATTAAATATTTATTTTCTTAGTTCAGAAGAGGAAAAAAACTCTT | |
63 GTAATTGTTGCCCATTTCAGGAGAAATCTTGCATATGAAAACAAGAGATAAATATACACAACTGAGGGCT | |
64 GTGGTTTAAACAAAATCTTGAGAATGTTTTTTGACCTTACACATTTGTGCTTTAGTATAACAAAATGATA | |
65 TAGACAAAGGTAACTTTTAATAGAACCAGTCACTAAATTAAAAAAATGACAAATTCTTCTGCTTAGCTAA | |
66 GCAACAGAGAAGGTAAAATACTAATTCAATTCATCAATTTAAGCAATACTCATTAAGAGCCAAGTATGTG | |
67 CTCACTGAATAAGCTGCTAAGGTTTGGTGGTTACAGAGTGTGCGGTGAAATGATGTCTACATCACAGTCC | |
68 AACATTCACAGAGTTTAAAAGCCTACCAAGAATCAAGACAGACACAAATACCTAACATAGACATTTGTAT | |
69 ATGATAAGAGAGCCAGAGTACAATTTAGGAGAAGAAATTGTATGGAAGGAAGGTTCATTTCCATTAGACC | |
70 AGAAAAGACAGCACATTTGAAGGCCTGAATAAGAAATATTCTGGATAAGATATTGTGGCTGCTACCAGAA | |
71 TGGCTCTTGATGATCTCTACCTCTTGGTATTTATACCCTTATATAATCTCTTTCCTATAGTGTAAGCTGG | |
72 TCCCAGGTACTTGTTTCTATTGAATAGAATAGAACAAAAGAAATGAGATGCCACTTCTGAGATTAGATTA | |
73 TAAGATACTGTGAATTTCTTCTTGTGCCCTCTCCCTCTCTCTCTTTCTCTTGCCCTCTCATTTGAATGAA | |
74 GCCAACTGGCATGCTGTCAGTGGCCCAGTGTAAGTCCTGTTACAAGAAATTGATGATTACCTGTAGCCAA | |
75 CCCTAAGTGAAGAACTGAGGTCCTCAGTCCTACAAATGGAGAGAAACTGAATCTAGCTAAGAACCATGTG | |
76 AGTGAGCTGGGAAGAAGATCCACCCTCAGTTGAAATTTAAGATGACATATTGAGCAGACATACTGAGACA | |
77 CACTGAAAGTAAGAGAGCAGGAGGAAACAAAACCAGGGTCATACAAAGAACACAACTGATTTTGAGATTC | |
78 TCACATAAGTATTACACCTTCAGTGAGCACGTGTACTAGAAATTTAAAAAATAAATAAAATAAACCTTCA | |
79 AAGTGAGCTAGCAAATAAATTTCCCTATGGTCTCAGCTCTGAGTGGAGAGAGAAAATGTTCCCTGTGGAG | |
80 TTTATAGCCAGAATCCAGCTCTCAAACAGGTTTCAGCCTGAACTCACACAATCTGTGTGGCTTCCAAATT | |
81 TGCAAGCTGAGAATTTAATTCAAAGTGGTCTCAGGTTGATAGCAGTCCAAAATGCTAGGTAGGAAAAAAA | |
82 ATCCTCTCTGGACAAATAAATCATCAAAGCAAGCTCATAAGAGCAGGTTTCAAAGGTCATGAGCTTCTAA | |
83 CACACACACAAAAATCACACACACAAAATGGGGGTAGCAGCAACATGGGTAGCGTATTCAAACTTGAAAA | |
84 GACTTTAAATATTTGTATTATTAGATGTAGATTATGAAACACATATTTTAATGTGGTTAATTTTTTTAAG | |
85 GAATCAAAACTATGAGTAAAGACCAAGAAAATTGTGCTGGATGGCCACTTCCACCATGGCTCCCCTCCTA | |
86 TTTAAGTCTGGGTACTGTGTCACCCGAAGTCTTCAGGCACATTGTTCCAGGTCTGGGTTTGCCTATGAAA | |
87 GAAACTCATGAGAGCTGGAAATGAGGAGTGAAGAGGAGGTCTTCAAATAAAGCAGGCTTAAGGATTAGAC | |
88 ATAGCAGGTTTGACAGATGTGATGGCTTGCAGAATCCTTTATGAGCTCCCACTGTCCATCTGGATAAGAT | |
89 TTACAGACCTTTCAGAAATTCCTATAAGCTTGGGTTCTGTGCCCACACTCTAGACTGTCAGGCTAAGATC | |
90 TCTGATATAAAACAGACCTCTTCTGATTTTGTCTAGCTGCTTTTCTAATATCTATTCACCAAGCTCTTCC | |
91 AATAATAGCATAAGGCCCTAATTAATATTAAACTTTTATCATTATAATACATAGGATGTCTTCTGTTTTC | |
92 CTGATCAAATTCTGACTACTATTAAAATATAAAGAATTGTCCAGAAATATATAAAAAAAGAATCACACAT | |
93 TGATCTTCTTTAAATGAAAATATAACAATTGTATGGACTAGGATGATTACAGTTGTTCAGTTCTGACTGT | |
94 TATTTGAAGAAAAAAGCAATAAGAAGCCTCAGCAACTTAACAGAAGGAGCTGCCATTTACTAGGAGAAAA | |
95 GATTGTGGATGAGAGTGTAGCAAAGGTCAGAATTCTGTGAAGCTTGAGATGTTTATTATAATGAATTATC | |
96 TTTTATACTCACTACAATTTCCTAACAATTTTGGGGTTTATATTTTTGAAAGAGATATACCTTTAATTTT | |
97 CTTTCTTTGTACTATTGTTAGGTAACTTTGATGTGCAGATTATACTACAGTGAAAGTTGCCAATGACAAG | |
98 GCAAAGTCACTTACATCAGACCCAAAGCAAAGTGGAGCCGGGTCATGAAAAAGGGGATCTTGTGTGTCTG | |
99 TCCACGATAAGCACTATCACAAGGACTTTCTATAAACTCACAAGAAATTTCTGCCCACCCAGCACACTCT | |
100 GTTTGTCCAGCTCATCCTGTAGGTGTCTCTATAATAGGACCTATCATAAAAAATTCCTCAAGACTGCAGC | |
101 ATTTCAGATAAGCCACCCTCACAAGAACACTTGCCTAGCAATGGCTGTTTCTGCCAGTAAGTTAACACCA | |
102 GCTCCTGCATCAGACCCTGTGACCAATGATGTTTGTTTCAAAACAGCTTGCATGGACTTCTTTTTGTCTT |