diff test-data/test.fa @ 0:8aef9a17faae draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/transdecoder commit 993ba7c18dcabb15aa76bca2fcc9211a5f58bf1d
author iuc
date Fri, 20 Nov 2015 06:49:25 -0500
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test.fa	Fri Nov 20 06:49:25 2015 -0500
@@ -0,0 +1,10 @@
+>CUFF.51.1 CUFF.51
+CGACGTTAATAAAATATTTAACAAAGCCTTTAAAAAATTAACGATAGCTAGTCAAAGGAAGCTTAACGCGTATTCAGCCTCATTAAGACAATCAGGAAGCTTTTTTTTACCATCAGCATATACCTCTAACCCTTTGATTTATTTTTATATCTCGAGATTTCGTTCGTTATTTTATAGGTCGTTTCGATAAGACCTTAATACAATCTGATTTAGTGGTTGTTTAAGATTTCGGAAAAGCCTTTTTTTCAAAAAAAGTTTTCCAGTTATTGTTTCATTATTTCTAATTGATTTACTGAAGAATTGTTATAACCTAAAGATGGCACTTATGTTATCCAGGATTCCACGTCGTTTTTTTTTCTTATTTTTAACGGTCGGCTTGATTGCTGGCGCGTTTCTATACTCGTTGATATATTTTGTGGACGTTGATTTGGTGTCGAAGGTTAACCAGTTGTATGATCAGCAAATTGCACCCATGCTCTCCGATGCTATTGGCACTCCATCCGTTAATCACTCGTTTGAGTTGGCGCCGTTAGACTCTCATTTGGTGGCCACAAGCACTACATTCCACGAGGCGTCATACGAGTCAGAGCCTCAGCAAAATCCTGCCAGTCAAAATATTGTCTTATTACTAGTTAGTGATGGACACACTTCTTACAATAATGGAGCTAATACGTTTGAAGAAGCTATACAGAACAGAGTTGACTATAGTACCAAACAAAACTACAACTTTGAGTATGTCAATGTTACTGGCCTCCCTATTCCCGCCGTTTGGTCCAAGATGCCCGCCGTCTTACAAACTATGAAGAAATACCCCAAAGCGGAATGGATCTGGTTGTTGGATCAGGATGCAATTATTACTAATACCCATCTTTCCCTTCAAGACTCCTTTTTGAAACCTGAGAACTTGCAAAAGACCTTAATTACTAATACCATCCTCACTAAACGGCCTATAAATGCTAACGGGGATTTGCGTTATACACCAAGTAATTATAGTTTAAAAGATATCGAAAATCTCATGGTCATAATCTCACAGGATCACAATGGATTAAACGCAGGTAGTATCTTGTTCCGTAATTCACCTGCTACTGCCTTGTTTTTGGATATTTGGACAGATCCTGTTGTTGCAGAATGTGCGAAAGCCAATAATGAACAAGACATGCTTGGATATTTGATTTCTAAGCATTCACAACTTGCTTCGCTGGTTGGCCTTATTCCTCAAAGAAAAATAAATGCTTTTCACGAAGGTCCGGAAAATATGGAATGGCAAAAAGGTGATTTGGTAATTCACTTTGCTGGATGTTGGGTTGAAAACCGCTGCGATGAACTATGGCAAAAGTTTTACGCCTTGATTGACTAAGTTGCTTATTCATTATATCCGTCTGTTTAATTTGTTTGTGTTTTAAAAAATTTTATATATATAAACAAAGCGCCGTATAATTTTCCGTCAATCTTCCTTTCTTTATCTGAATCTCTAATAATGTTTACTATTTTTTAATCTTTACATACCTAATTAATATAGCGGTTGTGCCATAGCAATCAAAGTTTCAGGTTAGTTTTTTATAGCGAGATATCTGGGAGTTTTGTTTTACACAATCGTCCATCAATAATTGTTATATATTGTATATATTTCACATTGACTTTGAAGCTGTTTCTGTTGGTTCAACTAATTTGCTTTGGCAATTTACCAATGCAATATTGAAGATTGGAATAACAGTTTGGCGTTAATAAATCTTTTTAATAATTTGCATTTCACCGCAGCTGCCATTTTCTGTTAAATGCTGATAGAAGTTTTATTGAATCATTCGTGTCGGATTATACTAAGTTTTTATTTATCTTGTTTTTTGGCCCTACAAAGTATTGGTATGTCCTTATTTTATATTGATTACACTGGCTTTTGGCCTTATAAAGATATAGATTAGTTGCTAAGTCTAAAAGATGTATTTTTTAACGGTGGTTCCATTACGTCTGTGCACCCACTGTTTACACTTGTGTCTTTACAAACCTAGAAGCATTTTCCGATTAATGAGGTCTATCAGGTCAAGGAGAAAGAATATTTGAATAGATTTATCGACAAAATATATTTCGTTAAATTTACACAATATTTACTTTACCAATAAGCTAAATGGTATTTCCAATACTTTTCCAGCTAACAGTCAGATTTTTCACTGTTTGAAACAACTTCACCAAATTAATTCATTAGTGTCAATTTCTATTACATGCTTAAGCTCATAATTTTCAACATCCAGATAGCTCGAAAGTTGACACCATTACACACAAACTAAGATGATTGTGAAAAAACAAAGCGTTAGGATTTGTAAAAGGCAATTCCACAATTTGAATTACAATACTGTAACTGAATATAGCGCGGCACATGGTACAAACAACGTGCTGGTAATAAATTGACAAATGCAGAGCAACCCGCGTGATGAAACATAAATCTCGGATATTTTTTCTTTAAAGGGTTGTTAACGCAAGTCGTTTAAGGGTAAAAGAAATAAATAAATTTTAGAGGGTAACATCCTCATAAAGGGAGTCATCTTTAGAGCCTTTTTTCATTTTTTTAAGGCTTTCGAAAATTTCACGTGTCTCAAATTCTATTGTTTCAGCGGTTCGTTGAATTAATCTCTTATCATGTCTCGAATTTCACTTTCAAATTTTTTATCTCTTCCGCGTTACAAATTCCTGTTGTTTTCTGTGGTTTTGATTATTGTGATGACAACCTTAGTGTTTAACGGACACGATTATAAGCAAACCCTTAATGACCGGCTTACTTCATTAAAAAACAACTTTGTTGAGGAAAATGATAATGCCGTCTTAAAAGAAGAGCCTGGCAAATATACGTATATGAGTTTGTTTACTATGCCTTCTACTGAAGAGGATTACTACTTCAACGCTACTAGGGTTTTAATTCACCGATTGAAATATCATCCTACTACCAAAAGTAAATACCCTATCCATATCCTTGCACTCCGTGGAGTAGATGAGTGGAAAATTGAACGTTTTCGAAAGGATGGTGCTTCTGTGATTGTTATAGACCCCATTGCTTCATCGGATATTGTATACGATACATCCTCATTTAGTCAAGAAATATCTGCTAGATATGAACAAATGTTTTCGAAGTTGCGAATTTTCGAACAAATACAATTTGACAAAATTTGCGTAATTGACAGTGATATATTGATCATGAAGAACATTGATGATATATTTGATACTCCTTATATGTACCAACAAATTAATACCTTGAACTATACACGGCTACCTTCCTACACGAAGCCTGATGATGATACCGTCTATCACTTCAATGAGGATTTTAAAGAATATGGTGCCAGTCGAAGCGAATTTTACCCTTATCTTCTCGCAGCCGTCTCTGATAGAGGAGAGCATCATAGTATACCTCCAGAAGATACTCCTTATTTCAATGCTGGCTTAATGCTTATACGTCCAAGCGAGCTTCATTTTAACCGTATACTTAAAATCGGAAGGTTTCCTTATATGTATGAGAATGCCAAAATGATGGAGCAAAGCTTGTTGAATCTTGCATTTTCCTTGGACGGATGGTTTCCCTGGACTCGTCTTGATCCTTATTACAATGGCGTGTGGCCCTCAATTGACGAACGTCCTCTCTTAAAAACAGCACACGGAAAATTCTGGAATATTGGTAGCTCAGAATTTGCACCAGTATATTTAGCTGACTGGTATGCTGCTTATGGCGAAATGCTGTCTTTTCATAAGTATGAAACTCATTAAAGGAGGAATACCTTTCTTTTTTCTGTATTGTGACCTTATTTTACAATTAGAAGTTAAAATCTAATTGTATGTTATATATTTGAAAATTTCTTTAACTTATTACCATAATTTTATTTTAGACTTGCTATCCTTATTGTCTAAACGCACATTGTTTAGATCTCTTCAGCTTTCTTTGATTGCTGGCTATGTATACAACTTTATTACCTGCGTCTGTCTATAAATCCCGTTAGCGGTGATTTGCTTTCGGTCAGCCTATTTTTAGAATATAATTTTGGACTTGCGGTTGATTTTAATATACCTCTCATCTCTCCTTCATTATGGACTCATTAGACCTTATGAACAAACCCCAATTTTAATTATTATCACAAGCGTTTAGCAATTTTTGATGCTTAAACTAGCCTGAGGTCCAAACAGGATAGTTTAATTAGTGTTAGACATTAATATTTTTTAGAAAAAGATACTTTATGTCTAGAGGGTTGTTTTTGAAGCATTTTATAGAATTTATTCTTTTTTAAGAAAATTAATTAGATTTGTAAAAATGTGCAGCTTCATAATTATTTATGGAGCGAATCATTTATGTTTAAATAAGACGGCA
+>CUFF.57.1 CUFF.57
+GAATTTCTGAGCTACTTTAGGTAGTAAAATAAGAGGTGAATTGTGAGCCCCGGTTTGCTTTTTTAGACATAAGGCGAACACGAGTTTAGTTGCTTGTCTTGGTTTGCCAAATTATTTTAATTCGGCTTTATCAAAACAATATAGCATCGAATCTCATCATTTCTTGTGTTTACCACTTAGCATTGTTAATGTTCGATAGCTTTATGAAGAGAAATCAGCTAGCCTTAATCATGTTTCGTGCTTGCTCGAAGTTGCAGTACCATGGAGTAAATACCAGCCTTTCGAGGCATTTGTTTCTTGCTAAAAGAAATTTATCCATTTCTTCAGCTTGTCTAGAAGCTAAAAACTCCCAAAAGTTTCCTGCTCTTGATACTTTTGAACCTCGACACATTGGACCTTCTAAAACGGATCAACAATATCAATTGGAGTCACTAGGGTATAAGGATTTTGATTCTTTCCTCAAAGATGTAATTCCAGATTCTGTGCGAACACCTGAGAGCCAATTGATGGCTTTTGGGTCTGTGAATCCCAACGAAAAAAATCCTCCTGTTAACTACTCCGAAAGCGAATTTACGACTCTGGCAAACAATGTGGCTAATCAAAATAAGCTGATTAAGAGCTTCATTGGCATGGGATACTATAATGTAAAGCTTCCTGCTGCTATTCAGCGTAATGTTCTTGAGAACCCTGAATGGTATACTCAATATACTCCATATCAGGCTGAAATTTCTCAAGGGCGTCTGGAATCTATGATGAATTATCAAACCATGATTGCTGATCTCACAGGTCTCAGCATTAGCAATGCTAGTTTACTGGATGAAGGAACTGCTGCTGGAGAAGCAATGGTTATGTTGATGGCCAACGACAAAAAGAAGCGCAAAACGTTTTTAGTGGACAAGAATATATACCCCAATACTCTGTCTGTTTTACGTACTCGTGCTTCTGGTTTTGGTATCAAAATTGAATTAGACAATATCACTCCTGAACTCATTACGAAGTCTGCTAAGCATGTTTTTGGTATCTTTGTGCAATACCCAGCGGCGGATGGCTCTATTTTTGACTATGGTCATTTAGCTGCTACAGCACGCTCTTTTAATATGCACGTCGTAGCTGCCACCGATTTACTAGCTCTCACTATTTTGAAATCGCCTGGGGAATGGGGTGCCGATGTTGCTGTTGGTTCCACTCAGCGCTTTGGTCTGCCCATGGGCTATGGTGGCCCCCATGCCGGATTCTTTGCTTGTAGTGAAGAATTTAAACGAAAGATACCCGGTCGTCTTATTGGTCTCAGCAAAGATCGTTTAGAAAATCCCGCATACCGGTTGGCTCTTCAAACAAGAGAACAACATATTCGTCGTGAAAAGGCTACAAGTAACATTTGCACGGCTCAAGCTTTGTTAGCCAATATGTCTGCATTCTATGCTATTTACCATGGGCCAAATGGTCTCCAAGAAATTGCAAACCGTATTTACGCTAGTACCTCCTTCTTAAAATCTGCTTTGGAATCTTCAGGATATAAAATTGTTAATAAAAGTCATTTCTTTGACACATTAACTATCGAAGTTGAGTCGGCTGACAAAGTTCTTGCGAAAGCACTTGATCACGGTTACAATTTAAGAAAGGTTGATGATTCACATGTTGGTCTTTCATTGGACGAGACCGTTTGCGATAAAGATATTCAAGCTTTGTTTAGCATCTTTAATATAAATAAGAGTGTTGATCAGTATTATATGGAAATTGCAACGTCGGAACCTAATGGAAATTCTGCTTCAACAGTCGATAATCTCAGCATTTGTTCTCTTCCTGAAAACTTTAGACGAACAACCCTCTATTTACAACATCCCGTGTTTAACAGATACCATTCGGAAACTGAACTTATGCGTTATATTCATCATTTGCAGTCGAAGGATCTATCTTTAGCTCATGCCATGACCCCATTGGGTTCGTGCACAATGAAGTTGAATGCTGTCACCGAAATGATGCCAATCACAAATCCATTATTTGCCAACATTCATCCATATGTTCCAGAGGAACAAGCTAAAGGTTATCGTCATGTTATCGAAGATTTGCAGTTAATGTTAACGACCATCACCGGCTTTGATGCTGCATGCTTTCAACCAAATTCGGGAGCCGCTGGAGAATACACTGGCTTAAGTGTTATTCGAGCATATCAGCGGTCTATTGGTCAAGGTCATCGCAATATTTGCTTAATTCCTGTTTCGGCTCACGGTACTAATCCAGCTTCAGCTGCTATGGCTGGGTTTACTGTTATTCCTGTAAAATGTCTCAATAACGGTTATTTGGATATGCAAGACTTAAAAGAAAAGGCCTCTAAACACGCCGACAAGTTAGCTGCCTTTATGGTAACTTATCCTAGTACTTTTGGCATTTTTGAGCCTGATGTTAAGGAAGCTTTGGAAGTAATTCACGAACATGGTGGTCAGGTTTACTTTGATGGTGCTAACATGAATGCAATGGTTGGTTTATGCAAGGCTGGTGATATTGGTGCTGATGTTTGTCACTTAAATCTTCATAAGACATTTTGCATTCCTCACGGCGGTGGCGGTCCTGGTGTAGGTCCTATTTGTGTAAAAAAGCATCTTGCTGATTTCCTACCATCTCATCCTGTAGTTTCATGCGGCGGTAAGAATGGTATCACATCTGTTAGCTCTTCTCCTTTTGGCTCTGCTGGTATTTTACCTATCTCATGGGCATACATGAGAATGATGGGACTTGCCGGTTTGCGTGACGCTTCCAAAGCCGCTCTGTTAAATGCCAATTATATGGCCAAGCGCCTGTCATCTCATTATAAACTTGTTTACACTAATAAGAACAACCTCTGTGCTCATGAGTTTATTCTAGATGCTCGCGAATTTAAAGCTACTGCGGGTGTAGATGCAACTGATATAGCTAAACGTTTGCAAGATTACAGTTTCCATGCACCAACTCTTTCCTGGCCTATTGCTAATACACTGATGATTGAGCCTACCGAGTCTGAGAGTATGTATGAGATGGACCGCTTCTGTGATGCTTTAATTTCTATTCGACAAGAAATTCGTGAAATTGAAGAAGGTCTCCAGCCTAAGGACAATAACCTGCTCGTTAATGCTCCCCACCCTCAAAAGGACATTGCATCTGAGAAATGGGATCGTCCTTATACTCGAGAGCGGGCTGTCTATCCTGTGCCTCTTTTAAAGGAACGGAAATTCTGGCCTAGCGTTGCTCGATTAGATGATGCGTACGGTGACAAGAACTTATTTTGTACTTGTTCCCCAGTTGTTTAGCGGTCAAAAAGAGCTCACCTGCTAGATTACTTCAACCTTTTCCCAGTTAAGTTCAACCTAATTTTTACTCCATTTGGTAGTTCGTTCAACACCAATTCCCACGTTTATATATAGACCAATTTTTTACTACATCTTGTTAGACAATTCTTTCCGTTATCACTTTTTCGAATTTTTTTTAATTACGTTTTAATTTTGAAGGTTAGAATTATCCTTTGCTGGAACATGAGGTTTTCAACAACCTTTTTTTAATCTGATAATCTAATTTTGCTAGTCATATAATTGCGACTTTCTGATAAAAACATTACCTATACTTTATAAATATGTCGTTTTTAAATATTAACTCCTATGTCTTACTTGCATCCTTGAAATTTACGACTAGAAATTTGGTGCTTTGGATTTTCGTTACATTAAGTAAGGCCATTGAATCGATATGACACGTAAATGTTAAATTTCAAAATATTTTGGAGAGCACCATGTATAATTTAAATATACGAATTTTTTCCTTTAAATTTGTGGTTCTTTTTTAAAAAATATCAAGACGAGTACTCGATTACTCGTAAGTATTCAAG
+>CUFF.36.1 CUFF.36
+TGACTAAGTGGCAATGATGCTCCTAATGAAACCACTGATCCTCGATCATCAGCAGTAGTATCAATAGCAGCATCAGCACCGTTAGACAGCTGTTTTTCTAAACCATTCAATGATTCATCTGAAAAACGTGAACCCACTTTCGAATAGTGCTTTTCAAATTTCTTTCCCGTAATTAAGGAAAGTAAATCCATGTGCAGTTAGTATTGAAAAGGAAAGAATAAATAAAAGTGGGTCAAAAGTAACGCCAAACAAACGAAGGTTATCGAAATATATGCGAAGGAGAGATTTATATACTAGTCAAATTTAAACAGCTGAGATTGCTTTAGTCATCGCGTTGTTCCAGATCGTGAACGAAAACACCGATTCGCTCGCTAAAGTAGATACGAAATGTCCAGCAGATTTTGCTTAATTAAAACATAAATATTGATGAGCAAGAGCAGCTCGTTATAAATCAGACCTCCAAGGATTTTATCAACTACTCAACTGGTTATGTGAATAATGACTCAGTTAAATATTAAATGTACTCTAAACGGTTATCATACAATTTATTAGGAGGATTATACCAGCTAGTAGGAATTTAACCATTTCAAATTTAAACCTCTTTTTTTTCGTAACTTGGGGTCGTCATAATGAATAATTCTGTTTGTCGAATTTGAAGGGAAAAACACACTTGTTATCTAATTCCAAAAAAAAATAAAAAATTTTTAAAAATTAGTGGGGTTTTTTTTTCACCAATGTCTAATGATGTGTGATTTAAAAAAAAACGTGTGTAACGCATTGTAGTATTACTTACCTTTGCATGATTAAAAGTATATGTTGATATCGACTATTTAGAGTACTGTGCGACACATTACCCTATGTTTCCCACTCTTAATCACCAAAAATTTTTTCCGAATGTCGCAAGACTCAGAATCGTTCATCCGGCAACTGTTTAAGGCATTTACGGATTTTAGTACTGACGTTGAGTCACTTAGAGGATTTTTAACGCCAGATTATCGACAGCTTGTCGATGGACGTGAATTGACACTTGACGATTTTATTTCTCATGCCAAAGCACTACGTACCCATCTTCATCGGCTCGACATCAACGTTCAACAAATTGTCTGTCAAGGTAACAAGGCTGCCACTGTGCATATTGCCCATGCGATACGTTCCTCTGGCGAGTCCAGCAGAATCAAAGTCATTGCATTTTACAGTTTTAAAGACGGGCGTATTTCTTTGATCGATGAGTTGACGTACGTTCTTGAAGGTGGTAATGCAGACAGAGAGCTTGGATCAGTACAATGACTTCAATTACCTTGACACTGCATTGCCCACGTTATTCAACGTCCATCAGGAACCGGACAAATTATTCAGAGTCCTTTTGAACTACTTCATAATTTTACAAATATTCAAGTGTAATTCGTAATATAATCAGTTTTATTCATCTTCGTTGTCTAAAACTTTTATGTGCTGCAATATTTGGGGAATCTCGATTTGACATAATGATCCCAGTGCC
+>CUFF.4.1 CUFF.4
+CTCTTTTTAATATTTTACCGATGAGATTGCTATTATTAGTTACGTTGCTATCTATCGTTGGTTACACTAATCAGTTGCTTTCCAACTGACCTCGAAGACGCTCCAGCTGTAATCTGGGTAGCCCAATTTCCTCCAGATAACACTACACAGCACTATGAATTCAGATATATCGTAAATGAATTATATAATGCTAGCAAGATGACTGCATTAATGAACCATATATATATCGATAATCCGCTTATAAGCAATTCAACTAATAACGTTACTCACGAGTTATTGATTGATCTCCATGAACTTTATAATGACGGAGAGATTTCCAGGATAGTTCTACTCAGAACTTTGGTAACTCAATCTGCGGATGATGCTACATGGATAATCAACTTGACAGATGATGTGCTTAATGGATTACCACTGCTGAAGAAGCGAGACCGATACACCACACAATGTCATAGTACAAATATGGCAAGCACATATGACTGTGACACTGGAGCCAATGCTGTTGGAGCCCGAGGTGGAGCCACGTTAGCAGCCGACTATAGAGGTGATTGGGGGGGG
+>CUFF.9.1 CUFF.9
+AGCGAAACAAACAAATCACGTTATAGACGGTGGCAGGGCCATAAAAGGTATTCCCTCGCTTTAAAAAGAAACAATGTCAAAAAGCTTTCTTTATAAACTATTGGAAGATTGAAGACATTAAAGAAGAAAAGTCCTGCTTACCCTTGGACTTTTTTCAGCAGTTTTCATTGCCATGCCTATCAACCAAAAGTTTTATTCATATCTGGTAAAGCGAAATGGTGGTGAAGGTGAACCTGAATTTCGACTTCCTATGGGTTTTATTGGAATCACACTTTTTGAAATAGGAATTTTACTTTTCGGTTGGACTGCAAGATATAAGATTTTTTGGTTTGTGCCAACAATTGGATCAGCCATTATGGGTGGTGGGTACATTATGACTTCCAATCCCTTAAACATGTATGTGGTAGATTCATATGGAATTTACTCAGCCAGTGCGTCAGCGGGTGTAAAAATATTTCAACTATTATTAGGAGCCATCTTTCCATTATTTGCTGAAAGTCTATTTCGTCGACTGAACTACGGATGGGGGTGTACTTTACTTGCCTTTATTTTATTAGCTTGTGGCTGTAGTCTTCCAATCTTATTCAAGTATGGAAAACAAATTAGAAATCTACGACCATTTGACCCCTCAAAATACTAGTTGATTTAACTGATCAAAGTGAGGATTTTCACACACATTTTCAGAGTACTTGGAACGTGCCGAGCTGATTAAAAAACACCGGTATTAACAAAAAATTTTATTTATGAAGCAATACGCTATTTCGTTATGAGAAACTTGATTCAATGAAACTATTATAAACCTTA