Mercurial > repos > iuc > transdecoder
view test-data/raw/test.fa.transdecoder.cds @ 0:8aef9a17faae draft
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/transdecoder commit 993ba7c18dcabb15aa76bca2fcc9211a5f58bf1d
author | iuc |
---|---|
date | Fri, 20 Nov 2015 06:49:25 -0500 |
parents | |
children |
line wrap: on
line source
>CUFF.36.1|m.4 CUFF.36.1|g.4 ORF CUFF.36.1|g.4 CUFF.36.1|m.4 type:complete len:131 (+) CUFF.36.1:895-1287(+) ATGTCGCAAGACTCAGAATCGTTCATCCGGCAACTGTTTAAGGCATTTACGGATTTTAGT ACTGACGTTGAGTCACTTAGAGGATTTTTAACGCCAGATTATCGACAGCTTGTCGATGGA CGTGAATTGACACTTGACGATTTTATTTCTCATGCCAAAGCACTACGTACCCATCTTCAT CGGCTCGACATCAACGTTCAACAAATTGTCTGTCAAGGTAACAAGGCTGCCACTGTGCAT ATTGCCCATGCGATACGTTCCTCTGGCGAGTCCAGCAGAATCAAAGTCATTGCATTTTAC AGTTTTAAAGACGGGCGTATTTCTTTGATCGATGAGTTGACGTACGTTCTTGAAGGTGGT AATGCAGACAGAGAGCTTGGATCAGTACAATGA >CUFF.4.1|m.5 CUFF.4.1|g.5 ORF CUFF.4.1|g.5 CUFF.4.1|m.5 type:3prime_partial len:120 (+) CUFF.4.1:199-555(+) ATGACTGCATTAATGAACCATATATATATCGATAATCCGCTTATAAGCAATTCAACTAAT AACGTTACTCACGAGTTATTGATTGATCTCCATGAACTTTATAATGACGGAGAGATTTCC AGGATAGTTCTACTCAGAACTTTGGTAACTCAATCTGCGGATGATGCTACATGGATAATC AACTTGACAGATGATGTGCTTAATGGATTACCACTGCTGAAGAAGCGAGACCGATACACC ACACAATGTCATAGTACAAATATGGCAAGCACATATGACTGTGACACTGGAGCCAATGCT GTTGGAGCCCGAGGTGGAGCCACGTTAGCAGCCGACTATAGAGGTGATTGGGGGGGG >CUFF.51.1|m.2 CUFF.51.1|g.2 ORF CUFF.51.1|g.2 CUFF.51.1|m.2 type:complete len:347 (+) CUFF.51.1:317-1357(+) ATGGCACTTATGTTATCCAGGATTCCACGTCGTTTTTTTTTCTTATTTTTAACGGTCGGC TTGATTGCTGGCGCGTTTCTATACTCGTTGATATATTTTGTGGACGTTGATTTGGTGTCG AAGGTTAACCAGTTGTATGATCAGCAAATTGCACCCATGCTCTCCGATGCTATTGGCACT CCATCCGTTAATCACTCGTTTGAGTTGGCGCCGTTAGACTCTCATTTGGTGGCCACAAGC ACTACATTCCACGAGGCGTCATACGAGTCAGAGCCTCAGCAAAATCCTGCCAGTCAAAAT ATTGTCTTATTACTAGTTAGTGATGGACACACTTCTTACAATAATGGAGCTAATACGTTT GAAGAAGCTATACAGAACAGAGTTGACTATAGTACCAAACAAAACTACAACTTTGAGTAT GTCAATGTTACTGGCCTCCCTATTCCCGCCGTTTGGTCCAAGATGCCCGCCGTCTTACAA ACTATGAAGAAATACCCCAAAGCGGAATGGATCTGGTTGTTGGATCAGGATGCAATTATT ACTAATACCCATCTTTCCCTTCAAGACTCCTTTTTGAAACCTGAGAACTTGCAAAAGACC TTAATTACTAATACCATCCTCACTAAACGGCCTATAAATGCTAACGGGGATTTGCGTTAT ACACCAAGTAATTATAGTTTAAAAGATATCGAAAATCTCATGGTCATAATCTCACAGGAT CACAATGGATTAAACGCAGGTAGTATCTTGTTCCGTAATTCACCTGCTACTGCCTTGTTT TTGGATATTTGGACAGATCCTGTTGTTGCAGAATGTGCGAAAGCCAATAATGAACAAGAC ATGCTTGGATATTTGATTTCTAAGCATTCACAACTTGCTTCGCTGGTTGGCCTTATTCCT CAAAGAAAAATAAATGCTTTTCACGAAGGTCCGGAAAATATGGAATGGCAAAAAGGTGAT TTGGTAATTCACTTTGCTGGATGTTGGGTTGAAAACCGCTGCGATGAACTATGGCAAAAG TTTTACGCCTTGATTGACTAA >CUFF.51.1|m.1 CUFF.51.1|g.1 ORF CUFF.51.1|g.1 CUFF.51.1|m.1 type:complete len:372 (+) CUFF.51.1:2632-3747(+) ATGTCTCGAATTTCACTTTCAAATTTTTTATCTCTTCCGCGTTACAAATTCCTGTTGTTT TCTGTGGTTTTGATTATTGTGATGACAACCTTAGTGTTTAACGGACACGATTATAAGCAA ACCCTTAATGACCGGCTTACTTCATTAAAAAACAACTTTGTTGAGGAAAATGATAATGCC GTCTTAAAAGAAGAGCCTGGCAAATATACGTATATGAGTTTGTTTACTATGCCTTCTACT GAAGAGGATTACTACTTCAACGCTACTAGGGTTTTAATTCACCGATTGAAATATCATCCT ACTACCAAAAGTAAATACCCTATCCATATCCTTGCACTCCGTGGAGTAGATGAGTGGAAA ATTGAACGTTTTCGAAAGGATGGTGCTTCTGTGATTGTTATAGACCCCATTGCTTCATCG GATATTGTATACGATACATCCTCATTTAGTCAAGAAATATCTGCTAGATATGAACAAATG TTTTCGAAGTTGCGAATTTTCGAACAAATACAATTTGACAAAATTTGCGTAATTGACAGT GATATATTGATCATGAAGAACATTGATGATATATTTGATACTCCTTATATGTACCAACAA ATTAATACCTTGAACTATACACGGCTACCTTCCTACACGAAGCCTGATGATGATACCGTC TATCACTTCAATGAGGATTTTAAAGAATATGGTGCCAGTCGAAGCGAATTTTACCCTTAT CTTCTCGCAGCCGTCTCTGATAGAGGAGAGCATCATAGTATACCTCCAGAAGATACTCCT TATTTCAATGCTGGCTTAATGCTTATACGTCCAAGCGAGCTTCATTTTAACCGTATACTT AAAATCGGAAGGTTTCCTTATATGTATGAGAATGCCAAAATGATGGAGCAAAGCTTGTTG AATCTTGCATTTTCCTTGGACGGATGGTTTCCCTGGACTCGTCTTGATCCTTATTACAAT GGCGTGTGGCCCTCAATTGACGAACGTCCTCTCTTAAAAACAGCACACGGAAAATTCTGG AATATTGGTAGCTCAGAATTTGCACCAGTATATTTAGCTGACTGGTATGCTGCTTATGGC GAAATGCTGTCTTTTCATAAGTATGAAACTCATTAA >CUFF.57.1|m.3 CUFF.57.1|g.3 ORF CUFF.57.1|g.3 CUFF.57.1|m.3 type:complete len:1032 (+) CUFF.57.1:189-3284(+) ATGTTCGATAGCTTTATGAAGAGAAATCAGCTAGCCTTAATCATGTTTCGTGCTTGCTCG AAGTTGCAGTACCATGGAGTAAATACCAGCCTTTCGAGGCATTTGTTTCTTGCTAAAAGA AATTTATCCATTTCTTCAGCTTGTCTAGAAGCTAAAAACTCCCAAAAGTTTCCTGCTCTT GATACTTTTGAACCTCGACACATTGGACCTTCTAAAACGGATCAACAATATCAATTGGAG TCACTAGGGTATAAGGATTTTGATTCTTTCCTCAAAGATGTAATTCCAGATTCTGTGCGA ACACCTGAGAGCCAATTGATGGCTTTTGGGTCTGTGAATCCCAACGAAAAAAATCCTCCT GTTAACTACTCCGAAAGCGAATTTACGACTCTGGCAAACAATGTGGCTAATCAAAATAAG CTGATTAAGAGCTTCATTGGCATGGGATACTATAATGTAAAGCTTCCTGCTGCTATTCAG CGTAATGTTCTTGAGAACCCTGAATGGTATACTCAATATACTCCATATCAGGCTGAAATT TCTCAAGGGCGTCTGGAATCTATGATGAATTATCAAACCATGATTGCTGATCTCACAGGT CTCAGCATTAGCAATGCTAGTTTACTGGATGAAGGAACTGCTGCTGGAGAAGCAATGGTT ATGTTGATGGCCAACGACAAAAAGAAGCGCAAAACGTTTTTAGTGGACAAGAATATATAC CCCAATACTCTGTCTGTTTTACGTACTCGTGCTTCTGGTTTTGGTATCAAAATTGAATTA GACAATATCACTCCTGAACTCATTACGAAGTCTGCTAAGCATGTTTTTGGTATCTTTGTG CAATACCCAGCGGCGGATGGCTCTATTTTTGACTATGGTCATTTAGCTGCTACAGCACGC TCTTTTAATATGCACGTCGTAGCTGCCACCGATTTACTAGCTCTCACTATTTTGAAATCG CCTGGGGAATGGGGTGCCGATGTTGCTGTTGGTTCCACTCAGCGCTTTGGTCTGCCCATG GGCTATGGTGGCCCCCATGCCGGATTCTTTGCTTGTAGTGAAGAATTTAAACGAAAGATA CCCGGTCGTCTTATTGGTCTCAGCAAAGATCGTTTAGAAAATCCCGCATACCGGTTGGCT CTTCAAACAAGAGAACAACATATTCGTCGTGAAAAGGCTACAAGTAACATTTGCACGGCT CAAGCTTTGTTAGCCAATATGTCTGCATTCTATGCTATTTACCATGGGCCAAATGGTCTC CAAGAAATTGCAAACCGTATTTACGCTAGTACCTCCTTCTTAAAATCTGCTTTGGAATCT TCAGGATATAAAATTGTTAATAAAAGTCATTTCTTTGACACATTAACTATCGAAGTTGAG TCGGCTGACAAAGTTCTTGCGAAAGCACTTGATCACGGTTACAATTTAAGAAAGGTTGAT GATTCACATGTTGGTCTTTCATTGGACGAGACCGTTTGCGATAAAGATATTCAAGCTTTG TTTAGCATCTTTAATATAAATAAGAGTGTTGATCAGTATTATATGGAAATTGCAACGTCG GAACCTAATGGAAATTCTGCTTCAACAGTCGATAATCTCAGCATTTGTTCTCTTCCTGAA AACTTTAGACGAACAACCCTCTATTTACAACATCCCGTGTTTAACAGATACCATTCGGAA ACTGAACTTATGCGTTATATTCATCATTTGCAGTCGAAGGATCTATCTTTAGCTCATGCC ATGACCCCATTGGGTTCGTGCACAATGAAGTTGAATGCTGTCACCGAAATGATGCCAATC ACAAATCCATTATTTGCCAACATTCATCCATATGTTCCAGAGGAACAAGCTAAAGGTTAT CGTCATGTTATCGAAGATTTGCAGTTAATGTTAACGACCATCACCGGCTTTGATGCTGCA TGCTTTCAACCAAATTCGGGAGCCGCTGGAGAATACACTGGCTTAAGTGTTATTCGAGCA TATCAGCGGTCTATTGGTCAAGGTCATCGCAATATTTGCTTAATTCCTGTTTCGGCTCAC GGTACTAATCCAGCTTCAGCTGCTATGGCTGGGTTTACTGTTATTCCTGTAAAATGTCTC AATAACGGTTATTTGGATATGCAAGACTTAAAAGAAAAGGCCTCTAAACACGCCGACAAG TTAGCTGCCTTTATGGTAACTTATCCTAGTACTTTTGGCATTTTTGAGCCTGATGTTAAG GAAGCTTTGGAAGTAATTCACGAACATGGTGGTCAGGTTTACTTTGATGGTGCTAACATG AATGCAATGGTTGGTTTATGCAAGGCTGGTGATATTGGTGCTGATGTTTGTCACTTAAAT CTTCATAAGACATTTTGCATTCCTCACGGCGGTGGCGGTCCTGGTGTAGGTCCTATTTGT GTAAAAAAGCATCTTGCTGATTTCCTACCATCTCATCCTGTAGTTTCATGCGGCGGTAAG AATGGTATCACATCTGTTAGCTCTTCTCCTTTTGGCTCTGCTGGTATTTTACCTATCTCA TGGGCATACATGAGAATGATGGGACTTGCCGGTTTGCGTGACGCTTCCAAAGCCGCTCTG TTAAATGCCAATTATATGGCCAAGCGCCTGTCATCTCATTATAAACTTGTTTACACTAAT AAGAACAACCTCTGTGCTCATGAGTTTATTCTAGATGCTCGCGAATTTAAAGCTACTGCG GGTGTAGATGCAACTGATATAGCTAAACGTTTGCAAGATTACAGTTTCCATGCACCAACT CTTTCCTGGCCTATTGCTAATACACTGATGATTGAGCCTACCGAGTCTGAGAGTATGTAT GAGATGGACCGCTTCTGTGATGCTTTAATTTCTATTCGACAAGAAATTCGTGAAATTGAA GAAGGTCTCCAGCCTAAGGACAATAACCTGCTCGTTAATGCTCCCCACCCTCAAAAGGAC ATTGCATCTGAGAAATGGGATCGTCCTTATACTCGAGAGCGGGCTGTCTATCCTGTGCCT CTTTTAAAGGAACGGAAATTCTGGCCTAGCGTTGCTCGATTAGATGATGCGTACGGTGAC AAGAACTTATTTTGTACTTGTTCCCCAGTTGTTTAG >CUFF.9.1|m.6 CUFF.9.1|g.6 ORF CUFF.9.1|g.6 CUFF.9.1|m.6 type:complete len:156 (+) CUFF.9.1:173-640(+) ATGCCTATCAACCAAAAGTTTTATTCATATCTGGTAAAGCGAAATGGTGGTGAAGGTGAA CCTGAATTTCGACTTCCTATGGGTTTTATTGGAATCACACTTTTTGAAATAGGAATTTTA CTTTTCGGTTGGACTGCAAGATATAAGATTTTTTGGTTTGTGCCAACAATTGGATCAGCC ATTATGGGTGGTGGGTACATTATGACTTCCAATCCCTTAAACATGTATGTGGTAGATTCA TATGGAATTTACTCAGCCAGTGCGTCAGCGGGTGTAAAAATATTTCAACTATTATTAGGA GCCATCTTTCCATTATTTGCTGAAAGTCTATTTCGTCGACTGAACTACGGATGGGGGTGT ACTTTACTTGCCTTTATTTTATTAGCTTGTGGCTGTAGTCTTCCAATCTTATTCAAGTAT GGAAAACAAATTAGAAATCTACGACCATTTGACCCCTCAAAATACTAG