comparison test-data/NC_002945v4.fasta @ 1:0bc0009f9ea0 draft

"planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/vsnp commit 6a0c9a857c1f4638ef18e106b1f8c0681303acc5"
author iuc
date Sun, 27 Sep 2020 10:08:14 +0000
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equal deleted inserted replaced
0:5e258fba246c 1:0bc0009f9ea0
1 >NC_002945.4 Mycobacterium bovis AF2122/97 genome assembly, chromosome: Mycobacterium_bovis_AF2122/97
2 TTGACCGATGACCCCGGTTCAGGCTTCACCACAGTGTGGAACGCGGTCGTCTCCGAACTTAACGGCGACC
3 CTAAGGTTGACGACGGACCCAGCAGTGATGCTAATCTCAGCGCTCCGCTGACCCCTCAGCAAAGGGCTTG
4 GCTCAATCTCGTCCAGCCATTGACCATCGTCGAGGGGTTTGCTCTGTTATCCGTGCCGAGCAGCTTTGTC
5 CAAAACGAAATCGAGCGCCATCTGCGGGCCCCGATTACCGACGCTCTCAGCCGCCGACTCGGACATCAGA
6 TCCAACTCGGGGTCCGCATCGCTCCGCCGGCGACCGACGAAGCCGACGACACTACCGTGCCGCCTTCCGA
7 AAATCCTGCTACCACATCGCCAGACACCACAACCGACAACGACGAGATTGATGACAGCGCTGCGGCACGG
8 GGCGATAACCAGCACAGTTGGCCAAGTTACTTCACCGAGCGCCCGCGCAATACCGATTCCGCTACCGCTG
9 GCGTAACCAGCCTTAACCGTCGCTACACCTTTGATACGTTCGTTATCGGCGCCTCCAACCGGTTCGCGCA
10 CGCCGCCGCCTTGGCGATCGCAGAAGCACCCGCCCGCGCTTACAACCCCCTGTTCATCTGGGGCGAGTCC
11 GGTCTCGGCAAGACACACCTGCTACACGCGGCAGGCAACTATGCCCAACGGTTGTTCCCGGGAATGCGGG
12 TCAAATATGTCTCCACCGAGGAATTCACCAACGACTTCATTAACTCGCTCCGCGATGACCGCAAGGTCGC
13 ATTCAAACGCAGCTACCGCGACGTAGACGTGCTGTTGGTCGACGACATCCAATTCATTGAAGGCAAAGAG
14 GGTATTCAAGAGGAGTTCTTCCACACCTTCAACACCTTGCACAATGCCAACAAGCAAATCGTCATCTCAT
15 CTGACCGCCCACCCAAGCAGCTCGCCACCCTCGAGGACCGGCTGAGAACCCGCTTTGAGTGGGGGCTGAT
16 CACTGACGTACAACCACCCGAGCTGGAGACCCGCATCGCCATCTTGCGCAAGAAAGCACAGATGGAACGG
17 CTCGCGATCCCCGACGATGTCCTCGAACTCATCGCCAGCAGTATCGAACGCAATATCCGTGAACTCGAGG
18 GCGCGCTGATCCGGGTCACCGCGTTCGCCTCATTGAACAAAACACCAATCGACAAAGCGCTGGCCGAGAT
19 TGTGCTTCGCGATCTGATCGCCGACGCCAACACCATGCAAATCAGCGCGGCGACGATCATGGCTGCCACC
20 GCCGAATACTTCGACACTACCGTCGAAGAGCTTCGCGGGCCCGGCAAGACCCGAGCACTGGCCCAGTCAC
21 GACAGATTGCGATGTACCTGTGTCGTGAGCTCACCGATCTTTCGTTGCCCAAAATCGGCCAAGCGTTCGG
22 CCGTGATCACACAACCGTCATGTACGCCCAACGCAAGATCCTGTCCGAGATGGCCGAGCGCCGTGAGGTC
23 TTTGATCACGTCAAAGAACTCACCACTCGCATCCGTCAGCGCTCCAAGCGCTAGCACGGCGTGTTCTTCC
24 GACAACGTTCTTAAAAAAACTTCTCTCTCCCAGGTCACACCAGTCACAGAGATTGGCTGTGAGTGTCGCT
25 GTGCACAAACCGCGCACAGACTCATACAGTCCCGGCGGTTCCGTTCACAACCCACGCCTCATCCCCACCG
26 ACCCAACACACACCCCACAGTCATCGCCACCGTCATCCACAACTCCGACCGACGTCGACCTGCACCAAGA
27 CCAGACTGTCCCCAAACTGCACACCCTCTAATACTGTTACCGAGATTTCTTCGTCGTTTGTTCTTGGAAA
28 GACAGCGCTGGGGATCGTTCGCTGGATACCACCCGCATAACTGGCTCGTCGCGGTGGGTCAGAGGTCAAT
29 GATGAACTTTCAAGTTGACGTGAGAAGCTCTACGGTTGTTGTTCGACTGCTGTTGCGGCCGTCGTGGCGG
30 GTCACGCGTCATGGGCGTTCGTCGTTGGCAGTCCCCACGCTAGCGGGGCGCTAGCCACGGGATCGAACTC
31 ATCGTGAGGTGAAAGGGCGCAATGGACGCGGCTACGACAAGAGTTGGCCTCACCGACTTGACGTTTCGTT
32 TGCTACGAGAGTCTTTCGCCGATGCGGTGTCGTGGGTGGCTAAAAATCTGCCAGCCAGGCCCGCGGTGCC
33 GGTGCTCTCCGGCGTGTTGTTGACCGGCTCGGACAACGGTCTGACGATTTCCGGATTCGACTACGAGGTT
34 TCCGCCGAGGCCCAGGTTGGCGCTGAAATTGTTTCTCCTGGAAGCGTTTTAGTTTCTGGCCGATTGTTGT
35 CCGATATTACCCGGGCGTTGCCTAACAAGCCCGTAGGCGTTCATGTCGAAGGTAACCGGGTCGCATTGAC
36 CTGCGGTAACGCCAGGTTTTCGCTACCGACGATGCCAGTCGAGGATTATCCGACGCTGCCGACGCTGCCG
37 GAAGAGACCGGATTGTTGCCTGCGGAATTATTCGCCGAGGCAATCAGTCAGGTCGCTATCGCCGCCGGCC
38 GGGACGACACGCTGCCTATGTTGACCGGCATCCGGGTCGAAATCCTCGGTGAGACGGTGGTTTTGGCCGC
39 TACCGACAGGTTTCGCCTGGCTGTTCGAGAACTGAAGTGGTCGGCGTCGTCGCCAGATATCGAAGCGGCT
40 GTGCTGGTCCCGGCCAAGACGCTGGCCGAGGCCGCCAAAGCGGGCATCGGCGGCTCTGACGTTCGTTTGT
41 CGTTGGGTACTGGGCCGGGGGTGGGCAAGGATGGCCTGCTCGGTATCAGTGGGAACGGCAAGCGCAGCAC
42 CACGCGACTTCTTGATGCCGAGTTCCCGAAGTTTCGGCAGTTGCTACCAACCGAACACACCGCGGTGGCC
43 ACCATGGACGTGGCCGAGTTGATCGAAGCGATCAAGCTGGTTGCGTTGGTAGCTGATCGGGGCGCGCAGG
44 TGCGCATGGAGTTCGCTGATGGCAGCGTGCGGCTTTCTGCGGGTGCCGATGATGTTGGACGAGCCGAGGA
45 AGATCTTGTTGTTGACTATGCCGGTGAACCATTGACGATTGCGTTTAACCCAACCTATCTAACGGACGGT
46 TTGAGTTCGTTGCGCTCGGAGCGAGTGTCTTTCGGGTTTACGACTGCGGGTAAGCCTGCCTTGCTACGTC
47 CGGTGTCCGGGGACGATCGCCCTGTGGCGGGTCTGAATGGCAACGGTCCGTTCCCGGCGGTGTCGACGGA
48 CTATGTCTATCTGTTGATGCCGGTTCGGTTGCCGGGCTGAGCACTTGGCGCCCGGGTAGGTGTACGTCCG
49 TCATTTGGGGCTGCGTGACTTCCGGTCCTGGGCATGTGTAGATCTGGAATTGCATCCAGGGCGGACGGTT
50 TTTGTTGGGCCTAACGGTTATGGTAAGACGAATCTTATTGAGGCACTGTGGTATTCGACGACGTTAGGTT
51 CGCACCGCGTTAGCGCCGATTTGCCGTTGATCCGGGTAGGTACCGATCGTGCGGTGATCTCCACGATCGT
52 GGTGAACGACGGTAGAGAATGTGCCGTCGACCTCGAGATCGCCACGGGGCGAGTCAACAAAGCGCGATTG
53 AATCGATCATCGGTCCGAAGTACACGTGATGTGGTCGGAGTGCTTCGAGCTGTGTTGTTTGCCCCTGAGG
54 ATCTGGGGTTGGTTCGTGGGGATCCCGCTGACCGGCGGCGCTATCTGGATGATCTGGCGATCGTGCGTAG
55 GCCTGCGATCGCTGCGGTACGAGCCGAATATGAGAGGGTGGTGCGCCAGCGGACGGCGTTATTGAAGTCC
56 GTACCTGGAGCACGGTATCGGGGTGACCGGGGTGTGTTTGACACTCTTGAGGTATGGGACAGTCGTTTGG
57 CGGAGCACGGGGCTGAACTGGTGGCCGCCCGCATCGATTTGGTCAACCAGTTGGCACCGGAAGTGAAGAA
58 GGCATACCAGCTGTTGGCGCCGGAATCGCGATCGGCGTCTATCGGTTATCGGGCCAGCATGGATGTAACC
59 GGTCCCAGCGAGCAGTCAGATACCGATCGGCAATTGTTAGCAGCTCGGCTGTTGGCGGCGCTGGCGGCCC
60 GTCGGGATGCCGAACTCGAGCGTGGGGTTTGTCTAGTTGGTCCGCACCGTGACGACCTAATACTGCGACT
61 AGGCGATCAACCCGCGAAAGGATTTGCTAGCCATGGGGAGGCGTGGTCGTTGGCGGTGGCACTGCGGTTG
62 GCGGCCTATCAACTGTTACGCGTTGATGGTGGTGAGCCGGTGTTGTTGCTCGACGACGTGTTCGCCGAAC
63 TGGATGTCATGCGCCGTCGAGCGTTGGCGACGGCGGCCGAGTCCGCCGAACAGGTGTTGGTGACTGCCGC
64 GGTGCTCGAGGATATTCCCGCCGGCTGGGACGCCAGGCGGGTGCACATCGATGTGCGTGCCGATGACACC
65 GGATCGATGTCGGTGGTTCTGCCATGACGGGTTCTGTTGACCGGCCCGACCAGAATCGCGGTGAGCGATT
66 AATGAAGTCACCAGGGTTGGATTTGGTCAGGCGCACCCTGGACGAAGCTCGTGCTGCTGCCCGCGCGCGC
67 GGACAAGACGCCGGTCGAGGGCGGGTCGCTTCCGTTGCGTCGGGTCGGGTGGCCGGACGGCGACGAAGCT
68 GGTCGGGTCCGGGGCCCGACATTCGTGATCCACAACCGCTGGGTAAGGCCGCTCGTGAGCTGGCAAAGAA
69 ACGCGGCTGGTCGGTGCGGGTCGCCGAGGGTATGGTGCTCGGCCAGTGGTCTGCGGTGGTCGGCCACCAG
70 ATCGCCGAACATGCACGCCCGACTGCGCTAAACGACGGGGTGTTGAGCGTGATTGCGGAGTCGACGGCGT
71 GGGCGACGCAGTTGAGGATCATGCAGGCCCAGCTTCTGGCCAAGATCGCCGCAGCGGTTGGCAACGATGT
72 GGTGCGATCGCTAAAGATCACCGGGCCGGCGGCACCATCGTGGCGCAAGGGGCCTCGCCATATTGCCGGT
73 AGGGGTCCGCGCGACACCTACGGATAACACGTCGATCGGCCCAGAACAAGGCGCTCCGGTCCCGGCCTGA
74 GAGCCTCGAGGACGAAGCGGATCCGTATGCCGGACGTCGGGACGCACCAGGAAGAAAGATGTCCGACGCA
75 CGGCGCGGTTAGATGGGTAAAAACGAGGCCAGAAGATCGGCCCTGGCGCCCGATCACGGTACAGTGGTGT
76 GCGACCCCCTGCGGCGACTCAACCGCATGCACGCAACCCCTGAGGAGAGTATTCGGATCGTGGCTGCCCA
77 GAAAAAGAAGGCCCAAGACGAATACGGCGCTGCGTCTATCACCATTCTCGAAGGGCTGGAGGCCGTCCGC
78 AAACGTCCCGGCATGTACATTGGCTCGACCGGTGAGCGCGGTTTACACCATCTCATTTGGGAGGTGGTCG
79 ACAACGCGGTCGACGAGGCGATGGCCGGTTATGCAACCACAGTGAACGTAGTGCTGCTTGAGGATGGCGG
80 TGTCGAGGTCGCCGACGACGGCCGCGGCATTCCGGTCGCCACCCACGCCTCCGGCATACCGACCGTCGAC
81 GTGGTGATGACACAACTACATGCCGGCGGCAAGTTCGACTCGGACGCGTATGCGATATCTGGTGGTCTGC
82 ACGGCGTCGGCGTGTCGGTGGTTAACGCGCTATCCACCCGGCTCGAAGTCGAGATCAAGCGCGACGGGTA
83 CGAGTGGTCTCAGGTTTATGAGAAGTCGGAACCCCTGGGCCTCAAGCAAGGGGCGCCGACCAAGAAGACG
84 GGGTCAACGGTACGGTTCTGGGCCGACCCCGCTGTTTTCGAAACCACGGAATACGACTTCGAAACCGTCG
85 CCCGCCGGCTGCAAGAGATGGCGTTCCTCAACAAGGGGCTGACCATCAACCTGACCGACGAGAGGGTGAC
86 CCAAGACGAGGTCGTCGACGAAGTGGTCAGCGACGTCGCCGAGGCGCCGAAGTCGGCAAGTGAACGCGCA
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88 TGAAACACATCAACCGCACCAAGAACGCGATTCATAGCAGCATCGTGGACTTTTCCGGCAAGGGCACCGG
89 GCACGAGGTGGAGATCGCGATGCAATGGAACGCCGGGTATTCGGAGTCGGTGCACACCTTCGCCAACACC
90 ATCAACACCCACGAGGGCGGCACCCACGAAGAGGGCTTCCGCAGCGCGCTGACGTCGGTGGTGAACAAGT
91 ACGCCAAGGACCGCAAGCTACTGAAGGACAAGGACCCCAACCTCACCGGTGACGATATCCGGGAAGGCCT
92 GGCCGCTGTGATCTCGGTGAAGGTCAGCGAACCGCAGTTCGAGGGCCAGACCAAGACCAAGTTGGGCAAC
93 ACCGAGGTCAAATCGTTTGTGCAGAAGGTCTGTAATGAACAGCTGACCCACTGGTTTGAAGCCAACCCCA
94 CCGACTCGAAAGTCGTTGTGAACAAGGCTGTGTCCTCGGCGCAAGCCCGTATCGCGGCACGTAAGGCACG
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96 ACGGATCCGCGCAAGTCCGAACTGTATGTCGTAGAAGGTGACTCGGCCGGCGGTTCTGCAAAAAGCGGTC
97 GCGATTCGATGTTCCAGGCGATACTTCCGCTGCGCGGCAAGATCATCAATGTGGAGAAAGCGCGCATCGA
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101 ACAACCGCCGCTGTACAAACTCAAGTGGCAGCGCAGTGACCCGGAATTCGCATACTCCGACCGCGAGCGC