Mercurial > repos > iuc > vsnp_get_snps

directory /test-data/ @ 4:4535ad8b74f3 draft default tip

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
name size permissions
[up] drwxr-xr-x
file 01_1787_FL_Zoo_Jaguar.vcf 207126 -rw-r--r--
file 02_0585_COA_TX_Fed.vcf 332310 -rw-r--r--
file 02_5877_MEX_TX_Fed.vcf 248130 -rw-r--r--
file 13-1941-6_S4_L001_R1_600000.fastq.gz 8899 -rw-r--r--
file 13-1941-6_S4_L001_R2_600000.fastq.gz 8672 -rw-r--r--
file BCG_Pasteur_Unknown_FR_SRR8886989.vcf 3930356 -rw-r--r--
file BCG_Tokyo_Unknown_JP_DRR029468.vcf 1344449 -rw-r--r--
file CMC_20E1_R1.fastq.gz 1694789 -rw-r--r--
file CMC_20E1_R2.fastq.gz 1694789 -rw-r--r--
file Mbovis-01D6_avg_mq.json 13178 -rw-r--r--
file Mbovis-01D6_snps.json 1200 -rw-r--r--
file Mbovis-01D6_snps.newick 104 -rw-r--r--
file Mbovis-01D_avg_mq.json 13178 -rw-r--r--
file Mbovis-01D_snps.json 1200 -rw-r--r--
file Mbovis-01D_snps.newick 104 -rw-r--r--
file Mbovis-01_avg_mq.json 13698 -rw-r--r--
file Mbovis-01_snps.json 1200 -rw-r--r--
file Mbovis-01_snps.newick 104 -rw-r--r--
file Mbovis_define_filter.xlsx 183486 -rw-r--r--
file Mcap_Deer_DE_SRR650221.fastq.gz 1694789 -rw-r--r--
file NC_002945v4.fasta 7202 -rw-r--r--
file NC_002945v4.yml 50 -rw-r--r--
file SRR1792272_zc.vcf 7871 -rw-r--r--
file SRR8073662_zc.vcf 5339 -rw-r--r--
file bam_input.bam 14314 -rw-r--r--
file fasta_indexes.loc 57 -rw-r--r--
file input_avg_mq_json.json 13178 -rw-r--r--
file input_newick.newick 104 -rw-r--r--
file input_snps_json.json 1200 -rw-r--r--
file input_zc_vcf.vcf 9997 -rw-r--r--
file json_all_vcf.json 13 -rw-r--r--
file json_avg_mq_all_vcf.json 23 -rw-r--r--
file output_dbkey.txt 6 -rw-r--r--
file output_metrics.txt 162 -rw-r--r--
file output_summary.html 123 -rw-r--r--
file paired_collection_metrics.txt 152 -rw-r--r--
file paired_dbkey.txt 6 -rw-r--r--
file paired_metrics.txt 152 -rw-r--r--
file r1_seqkit_fx2tab1.tabular 24425 -rw-r--r--
file r1_seqkit_fx2tab2.tabular 24425 -rw-r--r--
file r1_seqkit_stats1.tabular 197 -rw-r--r--
file r1_seqkit_stats2.tabular 197 -rw-r--r--
file r2_seqkit_fx2tab2.tabular 24425 -rw-r--r--
file r2_seqkit_stats2.tabular 197 -rw-r--r--
file statistics_output1.tabular 244 -rw-r--r--
file statistics_output2.tabular 578 -rw-r--r--
file statistics_output3.tabular 548 -rw-r--r--
file vcf_input.vcf 8529 -rw-r--r--
file vsnp_dnaprints.loc 338 -rw-r--r--
file vsnp_excel.loc 138 -rw-r--r--
file vsnp_genbank.loc 134 -rw-r--r--