Mercurial > repos > iuc > yahs

diff test-data/test_01_scaffolds_final.fa @ 0:d87433f2a54d draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/yahs commit 92823b21835509dde34557b6922e1b9a39311069
author iuc
date Wed, 29 Jun 2022 13:06:23 +0000
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/test_01_scaffolds_final.fa	Wed Jun 29 13:06:23 2022 +0000
@@ -0,0 +1,133 @@
+>scaffold_1
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGC
+CATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACA
+CTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGG
+TACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTG
+AAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGT
+GTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCAC
+TGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGAGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGAGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGC
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAG
+CAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAG
+ATCTCCCCTAGCCGTAAGGTACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGG
+TATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCC
+ATCGCATTGTGTCTGGTGTGTAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACAC
+TTTGATGGGCAACCATCACTGTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGT
+ACTTTGAACGCCCCTTCGACGACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGA
+AGCTTTCTGCATGTGATGTGCCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCGCATTGTGTCTGGTGTG
+TAGGTACCCAGACACTTAAGCAAACTCGATCGTTGTACACTTTGATGGGCAACCATCACT
+GTGTCTCCGTGCCGTGCTAGATCTCCCCTAGCCGTAAGGCACTTTGAACGCCCCTTCGAC
+GACGAGTTACAAGAGTGTGGTATGTGTCATAATCTGGTGAAGCTTTCTGCATGTGATGTG
+CCTTGTGTGGATCCGTGGCCATCTGGCATTGTAGGTACCAGACACTAACAAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCTCGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTGCCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT
+CGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAG
+TGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACA
+CACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTC
+ACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTAC
+CTTACGGCTAGGGGAGATCTAGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGT
+GTACAACGATCGAGTTTGCTTAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGG
+CCACGGATCCACACAAGGCACATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACC
+ACACTCTTGTAACTCGTCGTCGAAGGGGCGTTCAAAGTACCTTACGGCTAGGGGAGATCT
+AGCACGGCACGGAGACACAGTGATGGTTGCCCATCAAAGTGTACAACGATCGAGTTTGCT
+TAAGTGTCTGGGTACCTACACACCAGACACAATGCGATGGCCACGGATCCACACAAGGCA
+CATCACATGCAGAAAGCTTCACCAGATTATGACACATACCACACTCTTGTAACTCGTCGT