comparison test-data/test_raw_variable_out.txt @ 0:1422de181204 draft

planemo upload for repository https://github.com/workflow4metabolomics/mixmodel4repeated_measures commit 6ea32b3182383c19e5333201d2385a61d8da3d50
author jfrancoismartin
date Wed, 10 Oct 2018 05:18:42 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:1422de181204
1 variableMetadata var withNA Shapiro.pvalue.residuals Subject.Variance REML pval_time pval_trt pval_inter pvalue.time.T1...T2 pvalue.time.T1...T3 pvalue.time.T2...T3 pvalue.fixfact.A...B pvalue.T1.A....T2.A pvalue.T1.A....T3.A pvalue.T1.A....T1.B pvalue.T1.A....T2.B pvalue.T1.A....T3.B pvalue.T2.A....T3.A pvalue.T2.A....T1.B pvalue.T2.A....T2.B pvalue.T2.A....T3.B pvalue.T3.A....T1.B pvalue.T3.A....T2.B pvalue.T3.A....T3.B pvalue.T1.B....T2.B pvalue.T1.B....T3.B pvalue.T2.B....T3.B estimate.time.T1...T2 estimate.time.T1...T3 estimate.time.T2...T3 estimate.fixfact.A...B estimate.T1.A....T2.A estimate.T1.A....T3.A estimate.T1.A....T1.B estimate.T1.A....T2.B estimate.T1.A....T3.B estimate.T2.A....T3.A estimate.T2.A....T1.B estimate.T2.A....T2.B estimate.T2.A....T3.B estimate.T3.A....T1.B estimate.T3.A....T2.B estimate.T3.A....T3.B estimate.T1.B....T2.B estimate.T1.B....T3.B estimate.T2.B....T3.B
2 var1 var1 0 0.00152990892918407 0 254.537609570589 0.989895081688929 0.000142332953130264 0.999851637979215 NA NA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -575.6908 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3 var2 var2 0 0.960464619805585 0 262.571810056621 0.443498818238816 0.602652253312485 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4 var3 var3 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
5 var4 var4 0 0.0441977246388017 7213.02082711591 254.223292186154 0.983046491866558 0.0690481436570156 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
6 var5 var5 0 0.064287156921339 17220.7805833911 266.097162357616 0.983046491866558 0.850330775367304 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
7 var6 var6 0 0.0381978835199867 0 244.361560756404 0.983046491866558 1.69724227738755e-05 0.877939640795251 NA NA NA 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -535.4342 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
8 var7 var7 0 0.193737436286724 0 254.906518619133 0.0157977802240783 0.293529919182109 0.877939640795251 0.012 0.028 0.977485714285714 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -453.5379 -432.3569 21.1809 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
9 var8 var8 0 0.014695144502403 15197.0828494013 259.222125604721 1 0.0697160454979429 1 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
10 var9 var9 0 0.148540192056018 1.8132043075478e-10 259.983587153763 0.983046491866558 0.818040560247076 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
11 var10 var10 0 0.768501224171673 4386.50412060244 262.180681429873 0.983046491866558 0.372670267631705 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
12 var11 var11 0 0.711106348589254 19233.8026294981 260.769418500537 0.983046491866558 0.819708219928867 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
13 var12 var12 0 0.388310543095299 0 254.652163866062 0.000451504869487529 1 0.861541599913403 0.002 0.908 0 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 553.8303 -128.3101 -682.1404 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
14 var13 var13 0 0.846722054364422 0 263.195387302844 0.983046491866558 0.102587754537138 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
15 var14 var14 0 0.0360856422369758 0 255.35073473538 0.0804913814946417 1 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
16 var15 var15 0 0.0626184338173826 8153.26008240148 262.067244816087 0.983046491866558 0.592722965710858 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
17 var16 var16 0 0.171687740370142 10568.0720173727 237.006726048068 6.02686289052912e-05 0.372670267631705 0.861541599913403 0 0.008 0.01 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA 563.4853 294.9395 -268.5459 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18 var17 var17 0 0.746933462377266 23409.8484229528 266.135923308681 0.983046491866558 0.465689496368746 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
19 var18 var18 0 0.735764575145315 0 262.073544952402 0.983046491866558 0.711384175405778 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
20 var19 var19 0 0.194540582137284 0 268.220382686494 0.983046491866558 0.477013011572336 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
21 var20 var20 0 0.287706917791718 0 266.878020990071 0.983046491866558 0.285791545615653 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
22 var21 var21 0 0.0515625925674887 21271.8195701478 265.151387312325 0.983046491866558 0.711384175405778 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
23 var22 var22 0 0.607405931022872 0 263.535518930099 0.983046491866558 0.568870942400682 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
24 var23 var23 0 0.212615804058253 0 263.751117472845 0.983046491866558 0.644803266722344 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
25 var24 var24 0 0.453100802782389 29510.6568674354 260.71769299974 0.989895081688929 0.853232770669574 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
26 var25 var25 0 0.511477701192744 0 286.65672225126 0.983046491866558 0.285791545615653 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
27 var26 var26 0 0.815661522629652 0 281.509414777202 0.983046491866558 0.0688280391920837 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
28 var27 var27 0 0.653920548984792 0 280.838740914533 0.989895081688929 0.14979041564372 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
29 var28 var28 0 0.719759503524831 0 277.41708583405 0.983046491866558 0.196622531113559 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
30 var29 var29 0 0.725675776865143 86615.1480315815 268.196774164521 0.443498818238816 0.121470044896006 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
31 var30 var30 0 0.857478473660295 37081.0431925278 286.162827544403 0.983046491866558 0.253530786238282 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
32 var31 var31 0 0.751744017902084 0 276.362228496729 0.989895081688929 1 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
33 var32 var32 0 0.978108618401383 0 285.72256677923 0.983046491866558 0.306024424517496 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
34 var33 var33 0 0.99993316514364 124822.847216428 276.589351488647 0.147948925847613 0.121470044896006 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
35 var34 var34 0 0.242528626574342 0 281.137098865892 0.983046491866558 0.196622531113559 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
36 var35 var35 0 0.508321244841884 0 273.186257975745 0.983046491866558 0.0141133867640431 0.924958848665671 NA NA NA 0.0146666666666667 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA -603.4358 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
37 var36 var36 0 0.316164521545126 2.61433151397349e-10 268.90084474405 0.983046491866558 0.644803266722344 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
38 var37 var37 0 0.953719843399109 20144.5877011241 271.448160048801 0.800264575774149 0.356750278198418 0.861541599913403 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
39 var38 var38 0 0.428134779270157 0 285.508280238472 0.989895081688929 0.592722965710858 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
40 var39 var39 0 0.868929253676507 74721.1043100503 271.9525623048 0.983046491866558 0.568870942400682 0.924958848665671 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
41 var40 var40 0 0.967902408294312 97407.8193511745 276.870664881354 0.983046491866558 0.121470044896006 0.877939640795251 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA