comparison rnaseq/cutadapt/test-data/random_phiX_1.fastqsanger @ 11:a712b378e090

cutadapt added
author jjkoehorst <jasperkoehorst@gmail.com>
date Sat, 21 Feb 2015 16:33:42 +0100
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
10:3378d12591ea 11:a712b378e090
1 @random_phiX_region_0
2 TTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTTGTGGGATACCCTCGCTTT
3 +
4 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
5 @random_phiX_region_1
6 GTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCATCAGCAAACGCAGAATCAGCGGTA
7 +
8 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
9 @random_phiX_region_2
10 AATAGGTAAGAAATCATGAGTCAAGTTACTGAACAATCCGTACGTTTCCA
11 +
12 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
13 @random_phiX_region_3
14 GGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTC
15 +
16 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
17 @random_phiX_region_4
18 ACGCAAAAAGAGAGATGAGATTGAGGCTGGGAAAAGTTACTGTAGCCGAC
19 +
20 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
21 @random_phiX_region_5
22 AGCTAAAGAATGGAACAACTCACTAAAAACCAAGCTGTCGCTACTTCCCA
23 +
24 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
25 @random_phiX_region_6
26 CACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGTGTTAATGC
27 +
28 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
29 @random_phiX_region_7
30 AACTACTCCGGTTATCGCTGGCGACTCCTTCGAGATGGACGCCGTTGGCG
31 +
32 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
33 @random_phiX_region_8
34 CTCGTGCTCGTCGCTGCGTTGAGGCTTGCGTTTATGGTACGCTGGACTTT
35 +
36 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
37 @random_phiX_region_9
38 CAAATCAAAGAAATGACTCGCAAGGTTAGTGCTGAGGTTGACTTAGTTCA
39 +
40 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
41 @random_phiX_region_10
42 TACAGTATGCCCATCGCAGTTCGCTACACGCAGGACGCTTTTTCACGTTC
43 +
44 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
45 @random_phiX_region_11
46 TATGTTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGA
47 +
48 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
49 @random_phiX_region_12
50 AGAGATTCTGTCTTTTCGTATGCAGGGCGTTGAGTTCGATAATGGTGATA
51 +
52 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
53 @random_phiX_region_13
54 TTTACTCTTGCGCTTGTTCGTTTTCCGCCTACTGCGACTAAAGAGATTCA
55 +
56 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
57 @random_phiX_region_14
58 CCGGGCAATAACGTTTATGTTGGTTTCATGGTTTGGTCTAACTTTACCGC
59 +
60 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
61 @random_phiX_region_15
62 AACGCTAAAGGTGCTTTGACTTATACCGATATTGCTGGCGACCCTGTTTT
63 +
64 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
65 @random_phiX_region_16
66 GCCGGATTTGAGAATCAAAAAGAGCTTACTAAAATGCAACTGGACAATCA
67 +
68 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
69 @random_phiX_region_17
70 CATGATTATGACCAGTGTTTCCAGTCCGTTCAGTTGTTGCAGTGGAATAG
71 +
72 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
73 @random_phiX_region_18
74 TGGTATCGTTATGCGCCTTCGTATGTTTCTCCTGCTTATCACCTTCTTGA
75 +
76 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
77 @random_phiX_region_19
78 GCTGTCGCTACTTCCCAAGAAGCTGTTCAGAATCAGAATGAGCCGCAACT
79 +
80 ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~