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author jjohnson
date Sat, 26 Jan 2019 12:53:08 -0500
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1	127773930	bnd_3783_2	T	[1:127753955[T	181	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_3783_1;DP=8;SPLITCNT=2;SPANCNT=6;GENE=Acmsd,Ccnt2;GENEID=ENSMUSG00000026348,ENSMUSG00000026349;GENELOC=intron,upstream;EXPR=0,752;HOMLEN=0;SPLICESCORE=3;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
1	161036581	bnd_5020_2	A	[5:79638362[A	208	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_5020_1;DP=36;SPLITCNT=27;SPANCNT=9;GENE=7SK,Gas5;GENEID=ENSMUSG00000088422,ENSMUSG00000053332;GENELOC=downstream,intron;EXPR=0,0;HOMLEN=0;SPLICESCORE=1;INTERCHROM;ALTSPLICE
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2	174472832	bnd_2385_1	C	C[2:174462629[	194	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_2385_2;DP=12;SPLITCNT=7;SPANCNT=5;GENE=Slmo2,Atp5e;GENEID=ENSMUSG00000016257,ENSMUSG00000016252;GENELOC=coding,coding;EXPR=3085,3617;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;ORF;EXONBND;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
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3	144201813	bnd_8647_1	T	T]5:149198645]	242	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_8647_2;DP=9;SPLITCNT=4;SPANCNT=5;GENE=Lmo4,Uspl1;GENEID=ENSMUSG00000028266,ENSMUSG00000041264;GENELOC=coding,coding;EXPR=2482,2085;HOMLEN=1;SPLICESCORE=4;EXONBND;INTERCHROM
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4	124705614	bnd_12092_1	C	C[4:124696071[	187	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_12092_2;DP=11;SPLITCNT=2;SPANCNT=9;GENE=Fhl3,U6;GENEID=ENSMUSG00000032643,ENSMUSG00000088067;GENELOC=utr5p,downstream;EXPR=2072,0;HOMLEN=0;SPLICESCORE=1;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
4	148948907	bnd_12095_1	C	C]4:148961548]	249	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_12095_2;DP=11;SPLITCNT=6;SPANCNT=5;GENE=Gm13205,Pex14;GENEID=ENSMUSG00000086606,ENSMUSG00000028975;GENELOC=intron,coding;EXPR=0,1453;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
4	148961548	bnd_12095_2	C	[4:148948907[C	249	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_12095_1;DP=11;SPLITCNT=6;SPANCNT=5;GENE=Gm13205,Pex14;GENEID=ENSMUSG00000086606,ENSMUSG00000028975;GENELOC=intron,coding;EXPR=0,1453;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
5	23703360	bnd_11497_1	G	G[15:33221484[	230	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11497_2;DP=230;SPLITCNT=67;SPANCNT=163;GENE=SNORD93,Pgcp;GENEID=ENSMUSG00000096832,ENSMUSG00000039007;GENELOC=downstream,intron;EXPR=0,1604;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;INTERCHROM;ALTSPLICE
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7	84689743	bnd_1851_2	C	[7:84634406[C	182	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_1851_1;DP=62;SPLITCNT=21;SPANCNT=41;GENE=Zfand6,2610206C17Rik;GENEID=ENSMUSG00000030629,ENSMUSG00000085236;GENELOC=utr5p,intron;EXPR=1944,1;HOMLEN=0;SPLICESCORE=1;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
7	90125032	bnd_1855_1	T	T]7:90129872]	242	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_1855_2;DP=13;SPLITCNT=4;SPANCNT=9;GENE=AC130210.1,Picalm;GENEID=ENSMUSG00000097162,ENSMUSG00000039361;GENELOC=intron,upstream;EXPR=0,8476;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
7	90129872	bnd_1855_2	C	[7:90125032[C	242	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_1855_1;DP=13;SPLITCNT=4;SPANCNT=9;GENE=AC130210.1,Picalm;GENEID=ENSMUSG00000097162,ENSMUSG00000039361;GENELOC=intron,upstream;EXPR=0,8476;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
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7	97854436	bnd_1886_2	T	[7:97788974[T	247	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_1886_1;DP=36;SPLITCNT=18;SPANCNT=18;GENE=Aqp11,Pak1;GENEID=ENSMUSG00000042797,ENSMUSG00000030774;GENELOC=upstream,utr5p;EXPR=16,2476;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
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8	55037328	bnd_11601_2	G	[8:54779650[G	245	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11601_1;DP=78;SPLITCNT=45;SPANCNT=33;GENE=Wdr17,Gpm6a;GENEID=ENSMUSG00000039375,ENSMUSG00000031517;GENELOC=intron,coding;EXPR=195,2438;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
8	84816537	bnd_11605_1	C	C]8:84832174]	193	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11605_2;DP=23;SPLITCNT=11;SPANCNT=12;GENE=Dand5,Gadd45gip1;GENEID=ENSMUSG00000053226,ENSMUSG00000033751;GENELOC=intron,utr5p;EXPR=167,2428;HOMLEN=0;SPLICESCORE=2;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
8	84832174	bnd_11605_2	G	[8:84816537[G	193	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11605_1;DP=23;SPLITCNT=11;SPANCNT=12;GENE=Dand5,Gadd45gip1;GENEID=ENSMUSG00000053226,ENSMUSG00000033751;GENELOC=intron,utr5p;EXPR=167,2428;HOMLEN=0;SPLICESCORE=2;READTHROUGH;ADJACENT;ALTSPLICE;DELETION
8	95682960	bnd_11596_2	G	]8:95739809]G	222	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11596_1;DP=24;SPLITCNT=8;SPANCNT=16;GENE=Cnot1,Ndrg4;GENEID=ENSMUSG00000036550,ENSMUSG00000036564;GENELOC=coding,intron;EXPR=6004,544;HOMLEN=0;SPLICESCORE=1;ALTSPLICE;DELETION
8	95739809	bnd_11596_1	A	A[8:95682960[	222	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_11596_2;DP=24;SPLITCNT=8;SPANCNT=16;GENE=Cnot1,Ndrg4;GENEID=ENSMUSG00000036550,ENSMUSG00000036564;GENELOC=coding,intron;EXPR=6004,544;HOMLEN=0;SPLICESCORE=1;ALTSPLICE;DELETION
8	126422269	bnd_13923_2	C	]5:105728723]C	207	PASS	SVTYPE=BND;MATEID=bnd_13923_1;DP=11;SPLITCNT=4;SPANCNT=7;GENE=Lrrc8d,1810063B05Rik;GENEID=ENSMUSG00000046079,ENSMUSG00000051671;GENELOC=intron,upstream;EXPR=590,367;HOMLEN=0;SPLICESCORE=4;INTERCHROM;ALTSPLICE
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