Mercurial > repos > kaymccoy > enhanced_bowtie_mapper

diff bowtie_in5.fastqsolexa @ 15:4ed64c37b14a draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author kaymccoy
date Sun, 07 Aug 2016 22:31:59 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/bowtie_in5.fastqsolexa	Sun Aug 07 22:31:59 2016 -0400
@@ -0,0 +1,72 @@
+@Dummy:1:1:1761:343/1
+TTTATCGCTTCCATGACGCAGAAGTTAACACTTTCGGATATTTCTGATGA
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhh^hOhhhhghhhfhhhhhOhh^h;;hhhhhh
+@Dummy:1:1:1578:331/1
+TGTCAAAAACTGACGCGTTGGATGAGGAGAAGTGGCTTAATATGCTTGGC
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1647:512/1
+TACTGAACAATCCGTACGTTTCCAGACCGCTTTGGCCTCTATTAAGCTCA
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1570:620/1
+GAGTAACAAAGTaaaGTTTGGAccGTTTTTGTCTCGTGCTCGTCGCTGCG
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhahhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1599:330/1
+AGAAGAAAACGTGCGTCAAAAATTACGTGCaGAAGGAGTGATGTAATGTC
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhh[hhh_hh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1652:270/1
+AGCGTAAAGGCGCTCGTCTTTGGTATGTAGGacTTTGCATTGTTTAATTG
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhUhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1746:351/1
+CTCATCGTCACGTTTATGGTGAACAGTGGATTAAGTTCATGAAGGATGGT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1582:633/1
+CCGCTTCCTCCTGAGACTGAGCTTTCTCGCCAAATGACGACTTCTACCAC
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1598:534/1
+GCGCTCTAATCTCTGGGCATCTGGCTATGATGTTGATGGAACTGACCAAA
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1572:324/1
+AAGGTGCTTaaaTTCgtGGGTCCTGAGCTGGCGACCCTGTTTTGTATGGC
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhJVhOTh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1749:466/1
+TTGCAGTGGAATAGTCAGGTTAAATTTAATGTGACCGTTTATCGCAATCT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1629:446/1
+AGGTTATAACGCCGAAGCGGTAAAAATTTTAATTTTTGCCGCTGAGGGGT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1763:587/1
+AAGCTACATCGTCAACGTTATATTTTGATAGTTTGACGGTTAATGCTGGT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1616:363/1
+TGTTTATCCTTTGAATGGTCGCCATGATGGTGGTTATTATACCGTCAAGG
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhchhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1768:715/1
+ACCCTGATGAGGCCGCCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhchhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1572:270/1
+TGAGATGCTTGCTTATCAACAGAAGGAGTCTACTGCTCGCGTTGCGTCTA
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhh;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1673:514/1
+ATTATTTTGACTTTGAGCGTATCGAGGCTCTTAAACCTGCTATTGAGGCT
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhP;hhhhhhhOOOhhhh
+@Dummy:1:1:1634:330/1
+GGATATTCGCGATGAGTATAATTACCCCAAAAAGAAAGGTATTAAGGATG
++
+hhhhhhh;;hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhWhh;hhhhhhhOOOhhhh