view test-data/c1215_fixmate_filtered.sam @ 1:806b3253c996

add test data
author lomereiter
date Tue, 14 Aug 2012 21:25:40 +0400
parents
children
line wrap: on
line source

@HD	VN:1.3	SO:coordinate
AL096846_1043_1176_1df2	83	AL096846	1142	60	35M	=	1043	-134	AAGGCACCTACTTTGACATTCGCGTCTCTCTTAGC	<2<<).<<4<5<<<<;<<<<<<77<;<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:4T8A21
AL096846_1080_1249_1915	83	AL096846	1215	60	35M	=	1080	-170	CTGACTTGTCGACGGATTTGACTAAGAAAATTTTA	<<<:5:;77;<<&&<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:2T9A22
AL096846_1123_1300_24a3	83	AL096846	1268	37	2S33M	=	1123	-178	TGCCGTTATCGCTTAGCAGATTCTAGTCAATTGCC	:<:5<:;&..<7;<<<<<<<<<<<;<<<<<<<<<<	XT:A:M	NM:i:2	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:5T8A18
AL096846_1243_1428_10f2	83	AL096846	1394	60	35M	=	1243	-186	TTAAATAGTTTTTGAATTGAATATAAATATCAATT	:<(1(%1;<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:2T2A29
AL096846_1416_1591_243b	99	AL096846	1416	60	35M	=	1557	176	ATAAATATCAATTGTTTGATTCCTTTTAGGATTCC	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<:6<<)<<<<;.2&(	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:33T0A0
AL096846_1474_1657_a28	99	AL096846	1474	60	35M	=	1623	184	CGATTGAATCTTGGATTCCTGTCTAGCTTGTTTTG	<<<<<<<<<<<<;81<<<<<7<<<6&/))58(5-:	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:25T1A7
AL096846_1672_1856_10fe	83	AL096846	1822	60	35M	=	1672	-185	TAAAGCTAACTTAATCACTTAGAGAGCAAGATACA	&&)/2<<<<<&;;0*<<<<<<<<7<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:1T8A24
AL096846_1730_1901_15fc	83	AL096846	1867	37	35M	=	1730	-172	AGTGGACATCGGTTTTGCTTCATGGTGTGTTTTGT	<8<:<9&&&&0<8<<<<<;+%%%8<<<<<<<<<<8	XT:A:M	NM:i:4	XM:i:4	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:7T0A0G11G13
AL096846_2233_2441_22fa	99	AL096846	2233	60	35M	=	2407	209	TTACACCGTTGCAAGAAGCCGAGCATGTTTAGAGA	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<6<;(<<<(27,2:28.	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:22T6A5
AL096846_2323_2487_e93	99	AL096846	2323	60	35M	=	2453	165	ATAGTATCACTTGGTATTCTCTAAGTGTGGTGTCA	<<<<<9<<<;<<<;<<<297;<<;<<<;97+/;<&	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:3T27A3
AL096846_2333_2512_1e12	99	AL096846	2333	60	35M	=	2478	180	TTGGTATGCTCTAAGTGTGGTATCAGCTATAGTGC	<<<<<<<+<<<<<</<<<72797<<<:<:<;.37<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:7T23A3
AL096846_2202_2396_2370	83	AL096846	2362	60	35M	=	2202	-195	TAATGCTTTACGTCTATTGTGAGAGAGGTTCAGGC	:<;;:1.;<1<<<<<;<<<<-<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:18T1A14
AL096846_2481_2600_30	99	AL096846	2481	60	35M	=	2566	120	TAAATATTATCTACCTAAAAATTTACAATTTTTGG	<<<<<<<<<17<<<<<<;<;,9<<<:5:&<-:;48	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:20T7A6
AL096846_2553_2701_2372	83	AL096846	2667	60	35M	=	2553	-149	GCTTCCGATAAATTGCTCAGCCAAGAGTTTGACAA	8);.&&46<3<:<<4;<<<<<:<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:1T3A29
AL096846_2674_2838_1c01	99	AL096846	2674	37	35M	=	2804	165	ATAAATTGCTCAGCCAAGAGTCTGACGACAATACT	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<4&&5)3-<6<5<49:	XT:A:M	NM:i:3	XM:i:3	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:21T4A5T2
AL096846_3076_3258_9	99	AL096846	3076	60	35M	=	3224	183	TAATCCCAGTTGGATCAATAACTTCATATGATCAA	<<<<<<<<<<<<;(:<<<<;.&<<<655<<68;;<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:21T9A3
AL096846_2940_3123_2559	83	AL096846	3089	60	35M	=	2940	-184	ATCAATAATTTCATAGGATCAATTTCTTCCGAAGT	51;;*<<)&<<<<<:)49:<;<<<<<<<<<<7<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:15T2A16
AL096846_3046_3204_b51	83	AL096846	3170	60	35M	=	3046	-159	ATTGCACTTAAAACGGCCTTTTCAAAATCGCCGTT	(5(<<<<;<<;;<<<<<;<<5<<<<<;6<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:0T1A32
AL096846_3197_3382_e42	99	AL096846	3197	60	35M	=	3348	186	TCGCCGTTTACTATGCTGTCTGGAACGGGAGAATG	99<<<<<<<<<<7<8<:<<<-)<<<<:+<<898<(	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:21T5A7
AL096846_3084_3238_81a	83	AL096846	3204	60	35M	=	3084	-155	TTACTATGCAGTCTTGAACGGGAGAATGACCAATG	66<3;<<<,&<<<<3-<<<<<<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:9T10A14
AL096846_3223_3369_7cf	83	AL096846	3335	60	35M	=	3223	-147	TTCGAATCTCGATTATCTTTCGGAGATGAACATTT	;;1(3:<4;;<<<<;<<<<<<<<7<7<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:2T0A31
AL096846_3409_3567_1d5d	83	AL096846	3533	60	35M	=	3409	-159	TCTGGTGTTTCAAACTCATCCGAACCATGTATTTT	8:<<<<<<<<<:;:<<<<6&;<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:19T8A6
AL096846_3468_3617_26aa	83	AL096846	3584	37	1S34M	=	3468	-150	TTAGTGAGAAGCAACTGAAGATGGATAATAGGTAG	94/<:5;<<73&<<-&9;<<<<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:M	NM:i:2	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:10T3A19
AL096846_4024_4157_53b	99	AL096846	4024	60	35M	=	4123	134	GATCTTCAGAAGCAAAACCTCAGCATAATATTTAT	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<;<<<<:78<&<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:27T0A6
AL096846_4087_4249_b46	99	AL096846	4087	60	35M	=	4215	163	AATGAAAGATGAATAACTACTTACTTCATTGGATT	<<<:6;<<<<<<<<8<+2<<<<<<<<<):89<891	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:1T14A18
AL096846_4048_4222_c82	83	AL096846	4188	60	35M	=	4048	-175	GAGAAGGTCTCCAATCTTCAAAAACAATTGGTTTC	7&(<<7;<<:<-<;<<<<<<<8<<<<<<<<;<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:2T8A23
AL096846_4195_4357_1ffa	99	AL096846	4195	60	35M	=	4323	163	TCTCAAATCTTCAAAAACAATCGGTTTCATATACT	<<<<<<<<<<<<<9.(<<;;:%<<<<<88<:<8;&	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:21T12A0
AL096846_4281_4459_2018	83	AL096846	4425	60	35M	=	4281	-179	TGGGTAGCACTATCCAGCAAAGCTTTGCAAACCTT	.)<<))7<;7:<<<<<<;<<<<<<<<<9<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:1T2A30
AL096846_4675_4848_795	99	AL096846	4675	60	35M	=	4814	174	AATCGACATCACCTGTTGGTTTTTCGAAAATGAGT	<<<<<<9<</<<5;<<<7<<<,<<<1;<<22<..&	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:6T2A25
AL096846_4708_4889_21f7	99	AL096846	4708	60	35M	=	4855	182	GTTTAGCAGTTTTTTCAGCTAGTGCTCTCAGCCAA	<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<<&1-<<2<<<5-8	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:26T5A2
AL096846_4715_4910_2396	83	AL096846	4876	60	35M	=	4715	-196	ATAAAGATCTTACCTTTCTTTGGTGAGACTATGAT	:9+<<<<<<7;9:<<<<<<<<<<<<<<<2&<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:2T26A5
AL096846_4891_5068_fcd	99	AL096846	4891	25	35M	=	5034	178	TTCTTTGGGGAGACCATGATTTGTTGCGAATAGAT	2<<<<<<<<<<<<<<<<137<<<<<<<<3.<<<<<	XT:A:M	NM:i:3	XM:i:3	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:8T5A8A11
AL096846_4762_4965_1f7d	83	AL096846	4931	60	35M	=	4762	-204	GAAGTAAGCGCATAAGTTTTTTTCCTGCTTTCCAT	;;,773<::)&8<<<<<.73<<<<<;<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:9T0A24
AL096846_4779_4974_c25	83	AL096846	4940	60	35M	=	4779	-196	TAATAAGCTTTTTTCCTGCTTTCCTTAAGTTTGCA	:8:05+<&::<<<<<<:<<<<<<<<<<<<<<<<<<	XT:A:U	NM:i:2	X0:i:1	X1:i:0	XM:i:2	XO:i:0	XG:i:0	MD:Z:7T16A10