# HG changeset patch
# User lxue
# Date 1431722448 14400
# Node ID af338b471ed334c01d67421c610b6715deab7707
# Parent  5938ae6682231e20831e00cba40da88b75c2e74b
read file for testing.

diff -r 5938ae668223 -r af338b471ed3 read_test.fastq
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/read_test.fastq	Fri May 15 16:40:48 2015 -0400
@@ -0,0 +1,92 @@
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16153:1340 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAA
++
+BBABBAAFFFFFGGFGGFGGGAFCBGHHHFGHHFBFGHHHHDHHGHGHHGHHGHHGHGHHEHHFFABG?EFEHEBBGHFGFGHHHHHHGHHHG5FGFFGAFDEGFHG3FGH1FFHHEG/EH0?3GHHEGHHGG4EGHFG2FDGHF?DGBFBH3DF0F?FGF2/CDHGDD1?DD1FGFFFCCCCD;.;.:/C..;C/....
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16134:1356 1:N:0:2
+CTGGTATTAAATCTGCCATTCAAGGCTCTAATGTTCCTAACCCTGATGAGGCCGTCCCTAGTTTTGTTTCTGGTGCTATGGCTAAAGCTGGTAAAGGACTTCTTGAAGGTACGTTGCAGGCTGGCACTTCTGCCGTTTCTGATAAGTTGCTTGATTTGGTTGGACTTGGTGGCAAGTCTGCCGCTGATAAAGGAAAGGAT
++
+ABBBAFFFFFFFGGGGGGGGGGHHGHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGGGEGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGHHHHHHHHHHHFGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHGHHGGHHGGHHHHHHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHEHGGHHHHHHGGGHHHGGHHHHHGGCCGFHHHHHHGGCGG<
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14989:1390 1:N:0:2
+CGTCCCGCAAGTTAAATATGAAAATGAAAACGGTAGAGGTATTTTACCGACCGTTACCGACCGTTTTCATCCCTAATTATAAGACATTGATAGATTTGATAGATAAAATCATAAAAGTCTACGCATTCTTATGAATCACTAGTGAATTCGCGGCCGGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTC
++
+>AAA1A@>DD1BEBGGGBGFGGHCGGFEGHHGGEHCHHHHCFHHHHGHFGGG?EEFGHG/>EEEFFEHHHHHHGD0FGFHBGGBFHHHHHFHFHGGGGHHHHHHHHHFGHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHDDFHHHHHHGHFHHHHHGGCCGGGGGGGEEGFGFGGHHHHGGHHEHHHGGGGF;FFGGGGGEFGFGGG
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16401:1701 1:N:0:2
+TTTGCCGAAACTCACCTCATATCTCGGAAGGGCGCTGCTGGGTTATTTTTGGGCATCAAGAAAGGCGATGTAATCATGACCCTGCTCCAAAACTACCCAGAATTCGTCGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAACAACAGTCACAGTACAATG
++
+AAAAAF?1>ADFFGCFGCG1FGB3FCCEFC000AE?/E111/BB/DGGFHCGGHFHHH1@GFG10B//>/BBGFHFHBBB10G0>FBGFHBG0>FCB0B/?BD1B/BEEEAA/<CFCFFFFF0FCC<0<1?G1DCG1@GHHGDGHGGFD1<G0..0>10-<A.<GDGFGHC.;0C:--;A@A..;./000000000000/
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:15892:1694 1:N:0:2
+TTTGCCGAAACTCACCTCATATCTCGGAAGGTCGCTGCTGGGTTATTTTTGGGCATCAAGAAAGGCGATGTAATCATGACCCTGCTCCAAAACTGCCCAGAATTCGTCGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAACAAACATAGAATGAAAT
++
+BBBBBFBDBBBFGGGGGGGGGGHGHHGGGGGGFFGFGEGHHGGFEHHHHHGGGHHGHHGHHFHGHHGGGGHFFBHHGGFHHHHFHHHHHGHHHHEGFHFFGHHHHGHGGCGHGD<FGAGFHHHHGHHHGHHFGHHHHHHHHHGHHHHHHDHFHGDHHHHGEGHGHHEHHHE.CHGHCGCF-;;9;....09000;//9//
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:18648:2005 1:N:0:2
+GGCAATTGCTAAGTCACCTGATCTTGACAAGCATGACTTGTCTTCTTTGAGGATGATAAAAGAGGGGCTCCATTGGGCAAGGAACTTGAAGATACTGTCAGAGCTAAGTTTCCTCAGGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAACAGAAGGACA
++
+BBBBBFFFFFFFGGGGCGGGGGGBHHHHHHHHFGGHHHHHHHHHHHHHHGGHHHHHHHGHHHGHHGGGGHGHHHHHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH3GHHHHGGHHHGHHHHHHHFGGG/GHHHHHHGHHHGHHHHHGHHHHHHHHHHHHGHBHHFFGHHHGGGGHGHHHGHGHHHHHHGFGAA:./::/.../
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14258:1422 1:N:0:2
+GGCAATTGCCAAGTCACCTGATCTTGATAAACATGACTTGTCTTCGTTGAGGATGTTGAAGTCTGGAGGGTCGCCGTTGGGGAAGGAGCTTGAAGATACTGTCAGAGCTAAGTTTCCTCAGGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAATCACA
++
+CCCCCFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHGHHHHHHBGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHIIHHHHHHHHHGGGHFGGGGGGHGGGGGGHHHHHFHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHHHGHHFGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHG1GHHGGHHHHGEGHGHHHHHHHHHHHHGGGG?D.0990
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16582:1722 1:N:0:2
+GGCAATTGCCAAGTCACCTGATCTTGATAAACATGACTTGTCTTCGTTGAGGATGTTGAAGTCTGGAGGGTCGCCGTTGGGGAAGGAGCTTGAAGATACTGTCAGAGCCAAGTTTCCGCAGGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAACAAAA
++
+BBBBBFFBFFFFGGGGGGGGGGHHHHHGHHHHBGEGHHGHGHHHHGHHHHHHFHHHH5AHHHFHHHHF?0FGGGGGEFGHGGAFG1FGFFHHHHHHHGHHHHHHHH33GHFGGGBGGCEFE?CGC/?/FDH0GFHHHGGEHFHHFHHHHHHHHHHHBGHGHF1DD0>CGFHD?EDGGHHGGHGHHFHCGG-A?B?9:.9.
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14342:1402 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAACCAG
++
+BBBABABFFFFFGGGFACFFGB54FAGCGHHHHG5FG3GHHDGHHDFFCFHH5AFGFHHHHHHDGFEFGGCGFHHHGHFHGHFHGHHHEFGGD4FG?FFEGHHHHHHFGGCEGHHHGGGGFHHHHHH?GHHGHEHHHHFFHHHHHHHHHGEGFHHHGGHHHHCGGHGHHHHHHHGHHHFGCCGG@;-;;---9//9/9..
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:15477:1458 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAGGAAA
++
+BBBBBBBFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHGHHHHHFHGHHHGHHHFHGHGHHHHHHHHHHHHHHFFGGGGGGHGHHHGHFGGGHHHGHHHFGHFFHGFFHHGHHHHH1EEGGGHHHGGGE?CGHFHHCGHHGGHHHHGGHHHHH2>FGHHHEDHDGCEHHH1CEGHGHHHHHHHHHBGHGGGGGGG9.;;C:EAA...99
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16772:1421 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAATCTTCAAATTACA
++
+CCCCBBBFFFFFGGGGGGGGGGHHHGHHHGHHHHFGHHHHHHHHHHGHHGHHHHHHHHHHGHHFFGEFGGAFGFGHGHHHHHHHHHGHHHHHHGGHEGGHH4GHHHHFFHFGHHHEGGGGGFFHHFHGHHHGHHHHHHHGHHGHHHGHHFHHHHHHFGHHHHGGGHGHHHHHHHHHGHHGGGGFF:;.;000;0;0000;
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14889:1465 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAGCACCACCCTG
++
+BBBBBBBFFFFFGGGGGGGGGGHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHGHHHHFGHHHGGGGGGHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHFHGGGHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGFHHHHHHGHHHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHGDHHHHGGGHGHHHHHHHFHHGHGGGG-B---;..;9A......
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14829:1477 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAATACCTATCCAA
++
+AAAAAAAFFFFFFGF1ABFFDGFGGHHCA11A3F3BBBFFHGBGHE11FGFD1BF1F0BE2DDD1FEFGGAECFBG1F1FFFHHBFHHHHEHHFHHGGGHGHHHHFHHHHFAFFHGG/FGHHHHHHHEHHHGEGHHHHHHHHHHGHHHHHGHFHHHGGHGHHGGGGGHHHHHHHHFHHHCGGGG@----.0000000:;0
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:13459:1557 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAGACAATCTCAA
++
+CCCCCCCFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHGHHGGGGEGHHHHHHHHHHHHGHHHHHFHHHHHGGGHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHGFHFHGHHHGHHHHHHHHHHHHGHGHHHHHFGHHGGHHHHFGGHGHHEFHHGHHHHHGGGG@;--9:--../:/:00000
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14794:1599 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTCTTGAAAACTTGTCTAACCATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGCGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAGAAATCAACTCA
++
+BBBBBAAFFFFBGFGGGGGGFFGHHHHHHHHHGHGHHCHHHHHHHHHHHGHGHGHHHFHHHGHFFHGGGGGGHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHFHGGGHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHHHHHHGHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHGHHHGGHGHHC.CHGHHHHFHHHHHHE-CFGGB--:..9/0900/;0;
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:15192:1460 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGATCCCG
++
+BBBBBBAFFFFFGFGGGGGGGGGHGHHHHFGFHHFHHHHHFFHHGHHGFGHHHGHFGFHHHFHHFHBHGGGGGHHHHHHFHHHHHHGHHHHHFF5GGCFHHHHEHHHHGGGGF3GHGGEGHFHGHHHGHHHCHGFHHHBGFGHHHHHHHHHGDFHHFDHHHGGGGHEGHHHHHHHGBDFD?@CG:-;@-..9/.=000/.
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16608:1508 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAACAACTCAAAAAAAAA
++
+BBBBBBBFFFFFGGGGGGGGGG2GGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHGHHHHHHHHHHHHHHHGHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGGHHHHFHGHHHGGHHHHHGHHHHHHHHHHEGHFHHHGGHHHHGGGHGHHHHHHHGHHGGDGCGGG..;./90;099----
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:13331:1593 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAATATCG
++
+BBBAA?AFFFFFGGGGGGGGGGEHHHHGHCHHHGHHHHHHHDHHGHHHFFHHFHHHHHHHEHHHHFHHCGEGHHHHHGHHHHHHGHHHHGHHHGHHGFGHEHHHHHHHHGHHHFGHDEEGFGEGHHHCHHHFHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHFDGFFGHFHHGGGHGHHHHHHGFBDGFGGF-CD---;;-9:.90///:
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:17753:1644 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACAGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAACAAAA
++
+BBBBBBBFFFFFGGGGGGGGGCFHHHHFHFHGHCHHHCHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHGHFHHHHFHHFGCFGHHHGHHHHHGHHHHHHFHHHHHGGGGHHHGHHHHHHAHHHHHHGGEFHHHHFHHGHHHGHHHHHHHHHGHHHHHHHHHEFFHHFFHHHHGGGHGGHHHHHHHHHHHGGGGG@-;:;...;/9:A:.F
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:18234:1657 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAACTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAATCAAA
++
+BBBBBBBFFFFFFGGGFGGGGGGHHHHHHHHHHHHFHHHHHGHHHHHGHGHHHHHHGHHHFHHHFGHHCFCGHHEFFGEHHHHHFHHGHHFHHHHHGGGHHHHHHHHHGGCGGHHGGGGGHHHHHHHGHHHGHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHGHHHGGHHHHGGGHGHHHHHHGHHFHHGGGCGG:;-9..;/:C00;90
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:12691:1794 1:N:0:2
+CCCCTGCATTCATACGTTTTTGAAAACTTGTCTAAACATTCATCAAAACCTTGCCTGATAAATGGTGCGAATGGAGATGTCTACACCTATGCTGACGTTGAGCTCACGGCAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTGAAAAAAAAAAAAAAACGAAAACACAC
++
+CCCCBBBFFFFFGGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHDHHGHHGHHHHHHFFHHHGHHHGGGGHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHEFGGHHGHHHHGGGGGGHHHGGGGGGHHHHHGHHHGGHHHHHHHHHHHHHHHHFHHFHHGFGHFHHGFGHGHHEHHHGHHHHHCGGG@--;--.-.9.-/;...
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:16102:1419 1:N:0:2
+CTTACCCCTATTAAATGTGCATGACACACCAGTGAAACCCCCATTGTGACTGGCCTTATGAAATAAATTTTAGTAAAACGTGCAATGAATCGACGTCATCACTGTAAACAAAAATAAAGACAATGAAACATACAAATGCATTTCAAAAACAAACACAACCCATCAGAACTCATGACCAAATCATAAACAAAAAATTGAAA
++
+BBBBBFFBBAFFGGGGGGGGGGCHHHHHGGDFFHHGHHGGGGGHHHFHHHHHHGHHHHHFFFHGHHHHHGHFHEBGFHHGGGEHHHHHHGBFHEC/EFGHHHHHFHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHH4HHHHHHGHHHHGFGGDEGFGHHHHGGGDHHHHFFHHHHFHFGHHGHHHHHG.GGHDD
+@M00313:155:000000000-G025B:1:1101:14522:1426 1:N:0:2
+CTTACCCCTATTAAATGTGCATGACACACCAGTGAAACCCCCATTGTGACTGGCCTTATGAAATAAATTTTAGTAAAACGTGCAATGAATCGACGTCATCACTGTAAACAAAAATAATCACTAGTGAATTCGCGGCCGGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCACTTGTTGATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTT
++
+DDDDDFFDCBFFGGGGGGGGFGHHHHHHGGHHHHGHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHGHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGGGGGGGGGGGGHHHHHHHGHHHGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH0GHHGC;CHHACEGGHGEHGE
\ No newline at end of file