Mercurial > repos > marcel > caddsuite_linux_x86_64

diff CADDSuite-1.0.1/data/fragments/Names.DNA.db @ 9:2cff9609f2c7

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author marcel
date Tue, 15 Nov 2011 10:40:26 -0500
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/CADDSuite-1.0.1/data/fragments/Names.DNA.db	Tue Nov 15 10:40:26 2011 -0500
@@ -0,0 +1,174 @@
+<node>DNA<value>PDB</value>
+ <node>C:P<value>C:P</value></node>
+ <node>DC:OP1<value>C:O1P</value></node>
+ <node>DC:OP2<value>C:O2P</value></node>
+ <node>DC:*<value>C:*</value></node>
+ <node>C:OP1<value>C:O1P</value></node>
+ <node>C:OP2<value>C:O2P</value></node>
+ <node>C:O5'<value>C:O5*</value></node>
+ <node>C:C5'<value>C:C5*</value></node>
+ <node>C:H5'<value>C:1H5*</value></node>
+ <node>C:H5''<value>C:2H5*</value></node>
+ <node>C:C4'<value>C:C4*</value></node>
+ <node>C:H4'<value>C:H4*</value></node>
+ <node>C:O4'<value>C:O4*</value></node>
+ <node>C:C1'<value>C:C1*</value></node>
+ <node>C:H1'<value>C:H1*</value></node>
+ <node>C:N1<value>C:N1</value></node>
+ <node>C:C6<value>C:C6</value></node>
+ <node>C:H6<value>C:H6</value></node>
+ <node>C:C5<value>C:C5</value></node>
+ <node>C:H5<value>C:H5</value></node>
+ <node>C:C4<value>C:C4</value></node>
+ <node>C:N4<value>C:N4</value></node>
+ <node>C:H41<value>C:1H4</value></node>
+ <node>C:H42<value>C:2H4</value></node>
+ <node>C:N3<value>C:N3</value></node>
+ <node>C:C2<value>C:C2</value></node>
+ <node>C:O2<value>C:O2</value></node>
+ <node>C:O2'<value>C:O2*</value></node>
+ <node>C:HO2'<value>C:HO3*</value></node>
+ <node>C:C3'<value>C:C3*</value></node>
+ <node>C:H3'<value>C:H3*</value></node>
+ <node>C:C2'<value>C:C2*</value></node>
+ <node>C:H2'<value>C:1H2*</value></node>
+ <node>C:H2''<value>C:2H2*</value></node>
+ <node>C:O3'<value>C:O3*</value></node>
+ <node>A:P<value>A:P</value></node>
+ <node>DA:OP1<value>A:O1P</value></node>
+ <node>DA:OP2<value>A:O2P</value></node>
+ <node>DA:*<value>A:*</value></node>
+ <node>A:OP1<value>A:O1P</value></node>
+ <node>A:OP2<value>A:O2P</value></node>
+ <node>A:O5'<value>A:O5*</value></node>
+ <node>A:C5'<value>A:C5*</value></node>
+ <node>A:H5'<value>A:1H5*</value></node>
+ <node>A:H5''<value>A:2H5*</value></node>
+ <node>A:C4'<value>A:C4*</value></node>
+ <node>A:H4'<value>A:H4*</value></node>
+ <node>A:O4'<value>A:O4*</value></node>
+ <node>A:C1'<value>A:C1*</value></node>
+ <node>A:H1'<value>A:H1*</value></node>
+ <node>A:N9<value>A:N9</value></node>
+ <node>A:C8<value>A:C8</value></node>
+ <node>A:H8<value>A:H8</value></node>
+ <node>A:N7<value>A:N7</value></node>
+ <node>A:C5<value>A:C5</value></node>
+ <node>A:C6<value>A:C6</value></node>
+ <node>A:N6<value>A:N6</value></node>
+ <node>A:H61<value>A:1H6</value></node>
+ <node>A:H62<value>A:2H6</value></node>
+ <node>A:N1<value>A:N1</value></node>
+ <node>A:C2<value>A:C2</value></node>
+ <node>A:H2<value>A:2H</value></node>
+ <node>A:N3<value>A:N3</value></node>
+ <node>A:C4<value>A:C4</value></node>
+ <node>A:C3'<value>A:C3*</value></node>
+ <node>A:H3'<value>A:H3*</value></node>
+ <node>A:C2'<value>A:C2*</value></node>
+ <node>A:H2'<value>A:1H2*</value></node>
+ <node>A:H2''<value>A:2H2*</value></node>
+ <node>A:O3'<value>A:O3*</value></node>
+ <node>U:P<value>U:P</value></node>
+ <node>U:OP1<value>U:O1P</value></node>
+ <node>U:OP2<value>U:O2P</value></node>
+ <node>U:O5'<value>U:O5*</value></node>
+ <node>U:C5'<value>U:C5*</value></node>
+ <node>U:H5'<value>U:1H5*</value></node>
+ <node>U:H5''<value>U:2H5*</value></node>
+ <node>U:C4'<value>U:C4*</value></node>
+ <node>U:H4'<value>U:H4*</value></node>
+ <node>U:O4'<value>U:O4*</value></node>
+ <node>U:C1'<value>U:C1*</value></node>
+ <node>U:H1'<value>U:H1*</value></node>
+ <node>U:N1<value>U:N1</value></node>
+ <node>U:C6<value>U:C6</value></node>
+ <node>U:H6<value>U:H6</value></node>
+ <node>U:C5<value>U:C5</value></node>
+ <node>U:C4<value>U:C4</value></node>
+ <node>U:O4<value>U:O4</value></node>
+ <node>U:N3<value>U:N3</value></node>
+ <node>U:H3<value>U:H3</value></node>
+ <node>U:C2<value>U:C2</value></node>
+ <node>U:O2<value>U:O2</value></node>
+ <node>U:O2'<value>U:O2*</value></node>
+ <node>U:HO2'<value>U:HO2*</value></node>
+ <node>U:C3'<value>U:C3*</value></node>
+ <node>U:H3'<value>U:H3*</value></node>
+ <node>U:C2'<value>U:C2*</value></node>
+ <node>U:H2'<value>U:1H2*</value></node>
+ <node>U:H2''<value>U:2H2*</value></node>
+ <node>U:O3'<value>U:O3*</value></node>
+ 
+ <node>T:P<value>T:P</value></node>
+ <node>DT:OP1<value>T:O1P</value></node>
+ <node>DT:OP2<value>T:O2P</value></node>
+ <node>DT:*<value>T:*</value></node>
+ <node>T:OP1<value>T:O1P</value></node>
+ <node>T:OP2<value>T:O2P</value></node>
+ <node>T:O5'<value>T:O5*</value></node>
+ <node>T:C5'<value>T:C5*</value></node>
+ <node>T:H5'<value>T:1H5*</value></node>
+ <node>T:H5''<value>T:2H5*</value></node>
+ <node>T:C4'<value>T:C4*</value></node>
+ <node>T:H4'<value>T:H4*</value></node>
+ <node>T:O4'<value>T:O4*</value></node>
+ <node>T:C1'<value>T:C1*</value></node>
+ <node>T:H1'<value>T:H1*</value></node>
+ <node>T:N1<value>T:N1</value></node>
+ <node>T:C6<value>T:C6</value></node>
+ <node>T:H6<value>T:H6</value></node>
+ <node>T:C5<value>T:C5</value></node>
+ <node>T:C7<value>T:C5M</value></node>
+ <node>T:H71<value>T:1H5M</value></node>
+ <node>T:H72<value>T:2H5M</value></node>
+ <node>T:H73<value>T:3H5M</value></node>
+ <node>T:C4<value>T:C4</value></node>
+ <node>T:O4<value>T:O4</value></node>
+ <node>T:N3<value>T:N3</value></node>
+ <node>T:C2<value>T:C2</value></node>
+ <node>T:O2<value>T:O2</value></node>
+ <node>T:C3'<value>T:C3*</value></node>
+ <node>T:H3'<value>T:H3*</value></node>
+ <node>T:C2'<value>T:C2*</value></node>
+ <node>T:H2'<value>T:1H2*</value></node>
+ <node>T:H2''<value>T:2H2*</value></node>
+ <node>T:O3'<value>T:O3*</value></node>
+ <node>T:H3<value>T:3H</value></node>
+ <node>G:P<value>G:P</value></node>
+ <node>DG:OP1<value>G:O1P</value></node>
+ <node>DG:OP2<value>G:O2P</value></node>
+ <node>DG:*<value>G:*</value></node>
+ <node>G:OP1<value>G:O1P</value></node>
+ <node>G:OP2<value>G:O2P</value></node>
+ <node>G:O5'<value>G:O5*</value></node>
+ <node>G:C5'<value>G:C5*</value></node>
+ <node>G:H5'<value>G:1H5*</value></node>
+ <node>G:H5''<value>G:2H5*</value></node>
+ <node>G:C4'<value>G:C4*</value></node>
+ <node>G:H4'<value>G:H4*</value></node>
+ <node>G:O4'<value>G:O4*</value></node>
+ <node>G:C1'<value>G:C1*</value></node>
+ <node>G:H1'<value>G:H1*</value></node>
+ <node>G:N9<value>G:N9</value></node>
+ <node>G:C8<value>G:C8</value></node>
+ <node>G:H8<value>G:H8</value></node>
+ <node>G:N7<value>G:N7</value></node>
+ <node>G:C5<value>G:C5</value></node>
+ <node>G:C6<value>G:C6</value></node>
+ <node>G:O6<value>G:O6</value></node>
+ <node>G:N1<value>G:N1</value></node>
+ <node>G:H1<value>G:1H</value></node>
+ <node>G:C2<value>G:C2</value></node>
+ <node>G:N2<value>G:N2</value></node>
+ <node>G:H21<value>G:1H2</value></node>
+ <node>G:H22<value>G:2H2</value></node>
+ <node>G:N3<value>G:N3</value></node>
+ <node>G:C4<value>G:C4</value></node>
+ <node>G:C3'<value>G:C3*</value></node>
+ <node>G:H3'<value>G:H3*</value></node>
+ <node>G:C2'<value>G:C2*</value></node>
+ <node>G:H2'<value>G:1H2*</value></node>
+ <node>G:H2''<value>G:2H2*</value></node>
+ <node>G:O3'<value>G:O3*</value></node>
+</node>