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comparison mitos/test-data/mitos2_NC_012920.fas @ 0:1f945d382bc7 draft

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author menegidio
date Wed, 26 May 2021 18:18:25 +0000
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-1:000000000000 0:1f945d382bc7
1 >NC_012920; 577-647; +; trnF(gaa)
2 GTTTATGTAGCTTACCTCCTCAAAGCAATACACTGAAAATGTTTAGACGGGCTCACATCA
3 CCCCATAAACA
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5 AATAGGTTTGGTCCTAGCCTTTCTATTAGCTCTTAGTAAGATTACACATGCAAGCATCCC
6 CGTTCCAGTGAGTTCACCCTCTAAATCACCACGATCAAAAGGAACAAGCATCAAGCACGC
7 AGCAATGCAGCTCAAAACGCTTAGCCTAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGTGATTAA
8 CCTTTAGCAATAAACGAAAGTTTAACTAAGCTATACTAACCCCAGGGTTGGTCAATTTCG
9 TGCCAGCCACCGCGGTCACACGATTAACCCAAGTCAATAGAAGCCGGCGTAAAGAGTGTT
10 TTAGATCACCCCCTCCCCAATAAAGCTAAAACTCACCTGAGTTGTAAAAAACTCCAGTTG
11 ACACAAAATAGACTACGAAAGTGGCTTTAACATATCTGAACACACAATAGCTAAGACCCA
12 AACTGGGATTAGATACCCCACTATGCTTAGCCCTAAACCTCAACAGTTAAATCAACAAAA
13 CTGCTCGCCAGAACACTACGAGCCACAGCTTAAAACTCAAAGGACCTGGCGGTGCTTCAT
14 ATCCCTCTAGAGGAGCCTGTTCTGTAATCGATAAACCCCGATCAACCTCACCACCTCTTG
15 CTCAGCCTATATACCGCCATCTTCAGCAAACCCTGATGAAGGCTACAAAGTAAGCGCAAG
16 TACCCACGTAAAGACGTTAGGTCAAGGTGTAGCCCATGAGGTGGCAAGAAATGGGCTACA
17 TTTTCTACCCCAGAAAACTACGATAGCCCTTATGAAACTTAAGGGTCGAAGGTGGATTTA
18 GCAGTAAACTAAGAGTAGAGTGCTTAGTTGAACAGGGCCCTGAAGCGCGTACACACCGCC
19 CGTCACCCTCCTCAAGTATACTTCAAAGGACATTTAACTAAAACCCCTACGCATTTATAT
20 AGAGGAGACAAGTCGTAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGGACGAAC
21 >NC_012920; 3230-3304; +; trnL2(taa)
22 GTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATCGCATAAAACTTAAAACTTTACAGTCAGAGGTTCAA
23 TTCCTCTTCTTAACA
24 >NC_012920; 4263-4331; +; trnI(gat)
25 AGAAATATGTCTGATAAAAGAGTTACTTTGATAGAGTAAATAATAGGAGCTTAAACCCCC
26 TTATTTCTA
27 >NC_012920; 4402-4469; +; trnM(cat)
28 AGTAAGGTCAGCTAAATAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTATACCCTTC
29 CCGTACTA
30 >NC_012920; 5587-5655; -; trnA(tgc)
31 AAGGGCTTAGCTTAATTAAAGTGGCTGATTTGCGTTCAGTTGATGCAGAGTGGGGTTTTG
32 CAGTCCTTA
33 >NC_012920; 5657-5729; -; trnN(gtt)
34 TAGATTGAAGCCAGTTGATTAGGGTGCTTAGCTGTTAACTAAGTGTTTGTGGGTTTAAGT
35 CCCATTGGTCTAG
36 >NC_012920; 5826-5891; -; trnY(gta)
37 GGTAAAATGGCTGAGTGAAGCATTGGACTGTAAATCTAAAGACAGGGGTTAGGCCTCTTT
38 TTACCA
39 >NC_012920; 7446-7514; -; trnS2(tga)
40 GAAAAAGTCATGGAGGCCATGGGGTTGGCTTGAAACCAGCTTTGGGGGGTTCGATTCCTT
41 CCTTTTTTG
42 >NC_012920; 7518-7585; +; trnD(gtc)
43 AAGGTATTAGAAAAACCATTTCATAACTTTGTCAAAGTTAAATTATAGGCTAAATCCTAT
44 ATATCTTA
45 >NC_012920; 8295-8364; +; trnK(ttt)
46 CACTGTAAAGCTAACTTAGCATTAACCTTTTAAGTTAAAGATTAAGAGAACCAACACCTC
47 TTTACAGTGA
48 >NC_012920; 10405-10469; +; trnR(tcg)
49 TGGTATATAGTTTAAACAAAACGAATGATTTCGACTCATTAAATTATGATAATCATATTT
50 ACCAA
51 >NC_012920; 12138-12206; +; trnH(gtg)
52 GTAAATATAGTTTAACCAAAACATCAGATTGTGAATCTGACAACAGAGGCTTACGACCCC
53 TTATTTACC
54 >NC_012920; 12266-12336; +; trnL1(tag)
55 ACTTTTAAAGGATAACAGCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAAAAATTTTGGTGCAACTCC
56 AAATAAAAGTA
57 >NC_012920; 14149-14670; -; nad6
58 ATGTATGCTTTGTTTCTGTTGAGTGTGGGTTTAGTAATGGGGTTTGTGGGGTTTTCTTCT
59 AAGCCTTCTCCTATTTATGGGGGTTTAGTATTGATTGTTAGCGGTGTGGTCGGGTGTGTT
60 ATTATTCTGAATTTTGGGGGAGGTTATATGGGTTTAATAGTTTTTTTAATTTATTTAGGG
61 GGAATGATGGTTGTCTTTGGATATACTACAGCGATGGCTATTGAGGAGTATCCTGAGGCA
62 TGGGGGTCAGGGGTTGAGGTCTTGGTGAGTGTTTTAGTGGGGTTAGCGATGGAGGTAGGA
63 TTGGTGCTGTGGGTGAAAGAGTATGATGGGGTGGTGGTTGTGGTAAACTTTAATAGTGTA
64 GGAAGCTGAATAATTTATGAAGGAGAGGGGTCAGGGTTGATTCGGGAGGATCCTATTGGT
65 GCGGGGGCTTTGTATGATTATGGGCGTTGATTAGTAGTAGTTACTGGTTGAACATTGTTT
66 GTTGGTGTATATATTGTAATTGAGATTGCTCGGGGGAATAGG
67 >NC_012920; 14674-14742; -; trnE(ttc)
68 GTTCTTGTAGTTGAAATACAACGATGGTTTTTCATATCATTGGTCGTGGTTGTAGTCCGT
69 GCGAGAATA
70 >NC_012920; 15888-15953; +; trnT(tgt)
71 GTCCTTGTAGTATAAACTAATACACCAGTCTTGTAAACCGGAGATGAAAACCTTTTTCCA
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74 CAGAGAATAGTTTAAATTAGAATCTTAGCTTTGGGTGCTAATGGTGGAGTTAAAGACTTT
75 TTCTCTGA