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comparison hd.py @ 16:ea67840d0514 draft

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planemo upload for repository https://github.com/monikaheinzl/galaxyProject/tree/master/tools/hd commit 797ff8e0461392fe4542de33e7b58f9e0abefc7c
author mheinzl
date Wed, 23 May 2018 14:31:48 -0400
parents cf7874bb4934
children 4a30328b1af9
comparison
equal deleted inserted replaced
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178 plt.grid(b=True, which='major', color='#424242', linestyle=':') 178 plt.grid(b=True, which='major', color='#424242', linestyle=':')
179 179
180 180
181 plt.axis((minimumX - 1, maximumX + 1, 0, maximumY * 1.1)) 181 plt.axis((minimumX - 1, maximumX + 1, 0, maximumY * 1.1))
182 plt.xticks(numpy.arange(0, maximumX + 1, 1.0)) 182 plt.xticks(numpy.arange(0, maximumX + 1, 1.0))
183 plt.ylim((0, maximumY * 1.1)) 183 plt.ylim((0, maximumY * 1.2))
184 184
185 legend = "sample size= {:,} against {:,}".format(len(ham[0]), lenTags, lenTags) 185 legend = "sample size= {:,} against {:,}".format(len(ham[0]), lenTags, lenTags)
186 plt.text(0.14, -0.01, legend, size=12, transform=plt.gcf().transFigure) 186 plt.text(0.14, -0.01, legend, size=12, transform=plt.gcf().transFigure)
187 pdf.savefig(fig, bbox_inches="tight") 187 pdf.savefig(fig, bbox_inches="tight")
188 plt.close("all") 188 plt.close("all")
904 pdf=pdf,relative=False, title_file1=name_file, diff=False) 904 pdf=pdf,relative=False, title_file1=name_file, diff=False)
905 905
906 ########################## Plot HD within tags ######################################################## 906 ########################## Plot HD within tags ########################################################
907 ###################################################################################################################### 907 ######################################################################################################################
908 # plotHDwithinSeq_Sum2(HDhalf1, HDhalf2, minHDs, pdf=pdf, lenTags=lenTags, title_file1=name_file) 908 # plotHDwithinSeq_Sum2(HDhalf1, HDhalf2, minHDs, pdf=pdf, lenTags=lenTags, title_file1=name_file)
909 plotHDwithinSeq_Sum2(HDhalf1, HDhalf1min,HDhalf2min, HDhalf2 , minHDs, pdf=pdf, lenTags=lenTags, title_file1=name_file) 909 plotHDwithinSeq_Sum2(HDhalf1, HDhalf1min,HDhalf2, HDhalf2min , minHDs, pdf=pdf, lenTags=lenTags, title_file1=name_file)
910 910
911 911
912 ########################## Plot difference between HD's separated after FSD #################################### 912 ########################## Plot difference between HD's separated after FSD ####################################
913 ###################################################################################################################### 913 ######################################################################################################################
914 plotHDwithFSD(listDifference1, maximumXDifference, minimumXDifference, pdf=pdf, 914 plotHDwithFSD(listDifference1, maximumXDifference, minimumXDifference, pdf=pdf,