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bam_readtagger
directory /test-data/ @ 58:
84f51c5d69e3
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.
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[up]
drwxr-xr-x
a_pasteurianus_tagged_with_dm6.bam
637
-rw-r--r--
a_pasteurianus_tagged_with_dm6_discarded.bam
702
-rw-r--r--
a_pasteurianus_tagged_with_dm6_verified.bam
217
-rw-r--r--
all_control_insertions.gff
314
-rw-r--r--
all_fasta.loc
59
-rw-r--r--
all_treatment_insertions.gff
3544
-rw-r--r--
confirmed_insertions.gff
1824
-rw-r--r--
dm6.bam
21624
-rw-r--r--
dm6_mate_annotated.bam
21748
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dm6_tagged_with_a_pasteurianus.bam
21720
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dm6_tagged_with_a_pasteurianus_discarded.bam
21738
-rw-r--r--
dm6_tagged_with_a_pasteurianus_verified.bam
21589
-rw-r--r--
extended_and_annotated_roi.bam
26126
-rw-r--r--
long_insert_tagged.bam
1479
-rw-r--r--
long_insertion.bam
9659
-rw-r--r--
not_a_proper_pair.bam
22185
-rw-r--r--
pasteurianus.bam
620
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22185
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proper_pair_discard_verified_empty.bam
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proper_pair_out_suboptimal_tags.bam
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putative_insertions.gff
1799
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reference.fasta
402
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remapped_supplementary.bam
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supplementary.bam
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supplementary.fastq
1190
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supplementary_new_mapq.bam
23519
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tagged_dm6.bam
24859
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three_cluster_out.bam
25423
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three_cluster_out.gff
2540
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three_cluster_out.vcf
85325
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three_cluster_plot.pdf
15462
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transposon.fa
4798
-rw-r--r--