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file ChipSeqRatioAnalysis.R 2874 -rw-r--r--
file ChipSeqRatioAnalysis.py 6874 -rw-r--r--
file ChipSeqRatioDef.xml 3640 -rw-r--r--
file README.md 5913 -rw-r--r--
file RM_custom_search.py 2985 -rw-r--r--
file RM_custom_search.xml 1733 -rw-r--r--
file RM_html_report.R 4471 -rw-r--r--
file annot2krona.py 1443 -rw-r--r--
file cluster_table2krona_format.py 1703 -rw-r--r--
file cluster_table2krona_format.xml 2540 -rw-r--r--
file contributors.txt 11 -rw-r--r--
file deinterlacer.py 962 -rw-r--r--
file extract_contigs_from_archive.xml 866 -rw-r--r--
file extract_files_from_re_archive.xml 1752 -rw-r--r--
file fasta_affixer.py 1122 -rw-r--r--
file fasta_affixer.xml 3288 -rw-r--r--
file fasta_interlacer.py 6462 -rw-r--r--
file fasta_interlacer.xml 1558 -rw-r--r--
file fasta_manual_input.xml 637 -rw-r--r--
file fastq_name_affixer.py 949 -rw-r--r--
file fastq_name_affixer.xml 4134 -rw-r--r--
file name_affixer.py 949 -rw-r--r--
file pairScan.py 5224 -rw-r--r--
file pairScan.xml 1811 -rw-r--r--
file paired_fastq_filtering.R 15733 -rw-r--r--
file paired_fastq_filtering.xml 9404 -rw-r--r--
file paired_fastq_filtering_wrapper.sh 1684 -rw-r--r--
file parallel.py 11257 -rw-r--r--
file plot_comparative_clustering_summary.R 11723 -rw-r--r--
file plot_comparative_clustering_summary.xml 3469 -rw-r--r--
file renameSequences.xml 1392 -rw-r--r--
file renameSequences2.py 1218 -rw-r--r--
file rmsk_summary_table_multiple.r 3379 -rw-r--r--
file sampleFasta.xml 2124 -rw-r--r--
file single_fastq_filtering.R 9418 -rw-r--r--
file single_fastq_filtering.xml 8326 -rw-r--r--
file single_fastq_filtering_wrapper.sh 1340 -rw-r--r--
file summarize_cluster_table.R 1953 -rw-r--r--
file summarize_cluster_table.xml 2485 -rw-r--r--
file test_run1.sh 1313 -rw-r--r--
file test_run2.sh 2158 -rw-r--r--
file test_run_affixer.sh 115 -rw-r--r--