Mercurial > repos > pjbriggs > pal_finder

comparison test-data/illuminaPE_r2.fq @ 2:b6ccc7dd7b02 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Version 0.02.04.3.
author pjbriggs
date Fri, 04 Dec 2015 07:43:30 -0500
parents 3f908e7fff4f
children
comparison
equal deleted inserted replaced
1:771ebe02636f 2:b6ccc7dd7b02
1 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:10979:1695#0/2 1 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:10979:1695 2:N:0:TCCTGA
2 TACTGTTTAGAAAGCCTGTTCCAGAACTTGATCACTGTCACAGAAAATCTTTCTTACTATCCAGACTGAAGCTACCCTGGTGCAGCTTTGTGCTGTTACCTTGAGTCATGTCATCA 2 TACTGTTTAGAAAGCCTGTTCCAGAACTTGATCACTGTCACAGAAAATCTTTCTTACTATCCAGACTGAAGCTACCCTGGTGCAGCTTTGTGCTGTTACCTTGAGTCATGTCATCA
3 + 3 +
4 hhhhhghhhhhghhhhghghhhhhhhghhhghhhghgfhhhhhhgdgggggggghhghhgeggdgghfggfgfhgfggef`fhdggfdfgaehecagggfcegacagffefcWda_ 4 IIIIIHIIIIIHIIIIHIHIIIIIIIHIIIHIIIHIHGIIIIIIHEHHHHHHHHIIHIIHFHHEHHIGHHGHGIHGHHFGAGIEHHGEGHBFIFDBHHHGDFHBDBHGGFGD8EB@
5 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:17449:1584#0/2 5 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:17449:1584 2:N:0:TCCTGA
6 TCTGTGTGTGAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACATGCAGGTACTTGCTCTGCCACCCCTGGCGGGCTGCGTGGTGTGCCTGACGACGTATTCTAATCCTACA 6 TCTGTGTGTGAGCACACACACACACACACACACACACACACACACACATGCAGGTACTTGCTCTGCCACCCCTGGCGGGCTGCGTGGTGTGCCTGACGACGTATTCTAATCCTACA
7 + 7 +
8 fffff^bcbdbdaded`ffafdcfcff]cffccccaffffffedcafaR_BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 8 GGGGG?CDCECEBEFEAGGBGEDGDGG>DGGDDDDBGGGGGGFEDBGB3@##################################################################
9 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:19063:1614#0/2 9 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:19063:1614 2:N:0:TCCTGA
10 TATATATATATATAAACATATATATATATATTTTTTTCTCATTTCAGAACAAAAGTGAGATGAACTTTAATATGGTGGGGTGTATTTTGAGAGACTCTCTAGTTTGGGAGGAGTGA 10 TATATATATATATAAACATATATATATATATTTTTTTCTCATTTCAGAACAAAAGTGAGATGAACTTTAATATGGTGGGGTGTATTTTGAGAGACTCTCTAGTTTGGGAGGAGTGA
11 + 11 +
12 ccccccccccccYc_cJccccccccccccUccccc]`_YT]_BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 12 DDDDDDDDDDDD:D@D+DDDDDDDDDDDD6DDDDD>A@:5>@##########################################################################
13 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:1978:1220#0/2 13 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:1978:1220 2:N:0:TCCTGA
14 TCCTCTGACTAGGCAACAACAGCTTTTTTGCTCCTGGGCAGAGGTGTTCCGAGTGTATATTTTTTATAATTACGGCGCGCATTGGAAATTGATGTTATTTTATTTTGCGTGTGTGT 14 TCCTCTGACTAGGCAACAACAGCTTTTTTGCTCCTGGGCAGAGGTGTTCCGAGTGTATATTTTTTATAATTACGGCGCGCATTGGAAATTGATGTTATTTTATTTTGCGTGTGTGT
15 + 15 +
16 a^N^BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 16 B?/?################################################################################################################
17 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:5626:1554#0/2 17 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:5626:1554 2:N:0:TCCTGA
18 TCTAATATTATATATATCTGTGTGTGTATATATATATATACACACACACACACACATTGACATAAAAGCGAAATATAAACATTAGCAGCTGGGGCTAAAATAAAAGCAGGAAGGTT 18 TCTAATATTATATATATCTGTGTGTGTATATATATATATACACACACACACACACATTGACATAAAAGCGAAATATAAACATTAGCAGCTGGGGCTAAAATAAAAGCAGGAAGGTT
19 + 19 +
20 hhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhhgggghghhghhghghghghhhhhghhfgQeWdQd\URUY^aa[^\\K`JL\\[W``dQ`BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 20 IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIHHHHIHIIHIIHIHIHIHIIIIIHIIGH2F8E2E=636:?BB<?==,A+-==<8AAE2A###################################
21 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:5879:1238#0/2 21 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:5879:1238 2:N:0:TCCTGA
22 TCCCCACCCTGTCATGGTTCTATGTATATATATATAGCCATGTGTGTGGTACCAGGGATAGGTACCTGGGATTGGGGCAGTGACACTTTAGTGCCCCGTACACTACATGATGTTTT 22 TCCCCACCCTGTCATGGTTCTATGTATATATATATAGCCATGTGTGTGGTACCAGGGATAGGTACCTGGGATTGGGGCAGTGACACTTTAGTGCCCCGTACACTACATGATGTTTT
23 + 23 +
24 gggggggggggggggggdggffffecgfgfggggggegggggfgdgdgdadgdeaWdddedc`fdcabdaaa_]adb]_a_cbaaadbaa[`dbaaab]a`]a[Za`_`_BBBBBB 24 HHHHHHHHHHHHHHHHHEHHGGGGFDHGHGHHHHHHFHHHHHGHEHEHEBEHEFB8EEEFEDAGEDBCEBBB@>BEC>@B@DCBBBECBB<AECBBBC>BA>B<;BA@A@######
25 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:6204:1090#0/2 25 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:6204:1090 2:N:0:TCCTGA
26 TGCTTTGGTTCTAAGAGAAAAACAAGTGATGCACAAGCAATTCCTCGCCACCACCCAACTGATGCCCAGCCACCCCCCCAAGCAGTGAAAGAGAGAGAGAGATGAACCCCCTTCAA 26 TGCTTTGGTTCTAAGAGAAAAACAAGTGATGCACAAGCAATTCCTCGCCACCACCCAACTGATGCCCAGCCACCCCCCCAAGCAGTGAAAGAGAGAGAGAGATGAACCCCCTTCAA
27 + 27 +
28 gggcagggdefggggdgegdgccccc_ggdggddgdeedddfcdffffdfda]dab]______aa_edaeaaa_`]```[Z]`]ZR]\^^]]aa]^]_^P^]YXI_BBBBBBBBBB 28 HHHDBHHHEFGHHHHEHFHEHDDDDD@HHEHHEEHEFFEEEGDEGGGGEGEB>EBC>@@@@@@BB@FEBFBBB@A>AAA<;>A>;3>=??>>BB>?>@?1?>:9*@##########
29 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8044:1926#0/2 29 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8044:1926 2:N:0:TCCTGA
30 TCAGGCAAGGTCACTGCCACCACTGGGGAGTGCCTGTTTCTGAAGGGCCCAGCCAACTCTGTCACAAGCTTTAACCATAATAAATCAGGAGGAGAGACAGGAGGATGCTGTGCTTT 30 TCAGGCAAGGTCACTGCCACCACTGGGGAGTGCCTGTTTCTGAAGGGCCCAGCCAACTCTGTCACAAGCTTTAACCATAATAAATCAGGAGGAGAGACAGGAGGATGCTGTGCTTT
31 + 31 +
32 hhhhhhhhhhghhhhhhhhhhhhhhfhhhhehhhhhfgghhhhhffdhgfgfgggffbggbffffffgfgfdfdfdfffcfadbbaffdcfaZW^aaaac`ab_YR\\Z\Y[ROYU 32 IIIIIIIIIIHIIIIIIIIIIIIIIGIIIIFIIIIIGHHIIIIIGGEIHGHGHHHGGCHHCGGGGGGHGHGEGEGEGGGDGBECCBGGEDGB;8?BBBBDABC@:3==;=:<30:6
33 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8157:1636#0/2 33 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8157:1636 2:N:0:TCCTGA
34 TAAACAACCAAATGAAACCATCTTTTCTACACAGCTCAAGTAGCCCTACATACAACACAAGCCACCTACAAATCAGGACTGATGGTAAGGCTGACAATCCAATCCACCACAACAAC 34 TAAACAACCAAATGAAACCATCTTTTCTACACAGCTCAAGTAGCCCTACATACAACACAAGCCACCTACAAATCAGGACTGATGGTAAGGCTGACAATCCAATCCACCACAACAAC
35 + 35 +
36 geggggggggggggcgfggcggggggggggggggggggfffggfgggggggggggfggggg_gggegfgeggdggggggcgaedaageecgd]degadecBBBBBBBBBBBBBBBB 36 HFHHHHHHHHHHHHDHGHHDHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGHHGHHHHHHHHHHHGHHHHH@HHHFHGHFHHEHHHHHHDHBFEBBHFFDHE>EFHBEFD################
37 @ILLUMINA-545855_0049_FC61RLR:2:1:8899:1514#0/2 37 @ILLUMINA-545855:49:FC61RLR:2:1:8899:1514 2:N:0:TCCTGA
38 TATCATTGAAATTTTTATAAAAACTGTGAAGAGAAAAATGTAACACTTCAGAAACGCAATTATTTTGAGATGTCCAGATTTTTTTTTATACTTCCACTGCTGTGTGTGTGTGTAAC 38 TATCATTGAAATTTTTATAAAAACTGTGAAGAGAAAAATGTAACACTTCAGAAACGCAATTATTTTGAGATGTCCAGATTTTTTTTTATACTTCCACTGCTGTGTGTGTGTGTAAC
39 + 39 +
40 hfJfffhhhhhhhhhhchhhhhhfgghhghhhhhdfghghghhghhhhhhhhhhhhhhghhchhhhhdchhhchgfgehhhhhhhhhgheeagfhfaffgacaedfdfbfdhdcda 40 IG+GGGIIIIIIIIIIDIIIIIIGHHIIHIIIIIEGHIHIHIIHIIIIIIIIIIIIIIHIIDIIIIIEDIIIDIHGHFIIIIIIIIIHIFFBHGIGBGGHBDBFEGEGCGEIEDEB