------------------------------------------------------------------------
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ParentA ( 1501 nt) CS/S000089909/Desulfobacterium_catecholicum.(T)
ParentB ( 1424 nt) CS/S001093721/Thiohalocapsa_halophila.(T)

A     1 ------TGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGCGAAAGTTTTCTTCGGAAg 74
Q     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGCGAAAGTTTTCTTCGGAAA 80
B     1 --------------------AttGAACGCTGGCGGCaTGCcTAACACATGCAAGTCGAACGCGAAAG--cTCTTCGG--A 56
Diffs                        AA             A   A                            A         b
Votes                        ++             +   +                                       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    75 aCGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCGTAAGTAATCTgCCCTGGTATCtGGGATAACCcACCGAAAGGTgtGCTA 154
Q    81 GCGAGTAGAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCGTAAGTAATCTACCCTGGTATCCGGGATAACCAACCGAAAGGTTGGCTA 160
B    57 GtGAGTAGAGTGGCGgACGGGTGAGTAACGCGT-gGgAATCTgCCCTGtagTagGGGAcAACCcgggGAAActcgGGCTA 135
Diffs   bA             A                  A A     N     AAA A?    A    NAAA    AAANb    
Votes   !+             +                    +     0     +++ +0    +    0+++    +++0!    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   155 ATACgGGATACGCTGattTAtCAGGAAAGGTGGCCTCTTCATGAAAGCTACTGTACCAGGAGGAGCTTGCGTACCATTAG 234
Q   161 ATACCGGATACGCTG--GTAACAGGAAAGGTGGCCTCTTCATGAAAGCTACTGTACCAGGAGGAGCTTGCGTACCATTAG 238
B   136 ATACCGcATACGtcc--tacgggaGAAAGagGGCC------TtcggGCTctcGctgCAGGAtGAGCccGCGTcCgATTAG 207
Diffs       b A     AAA  NAA?AAA     AA           AAAA   AAA AAA     A    AA    A A     
Votes       ! +     ++    ++0+++     ++           ++++   +++ +++     +    ++    + +     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   235 CTAGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATGGTTAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACACTGGAACTGaAA 314
Q   239 CTAGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATGGTTAGCGGGTCTGAGAGGATGATCCGCCACACTGGAACTGGAA 318
B   208 CTAGTTGGTAGGGTAATGGCCTACCAAGGCGACGATcGgTAGCtGGTCTGAGAGGATGATCaGCCACACTGGgACTGagA 287
Diffs                                       A A    A                 A          A    NA 
Votes                                       + +    +                 +          +    0+ 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   315 CACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGG 394
Q   319 CACGGACCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATATTGCGCAATGGGGGAAACCCTGACGCAGCGACGCCGCGTGG 398
B   288 CACGGcCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGgGGAATATTGgaCAATGGGcGcAAgCCTGAtcCAGCaAtGCCGCGTGt 367
Diffs        A                          A         AA       A A  A     AA    A A        A
Votes        +                          +         ++       + +  +     ++    + +        +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   395 ATGATGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAATCCTGTCAGATGGAAAGAAaTGTAgtatgccTAATACgtgTacTATTTGACGGT 474
Q   399 ATGATGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAATCCTGTCAGATGGAAAGAAGTGTATAGATGTTAATACCATTTATATTTGACGGT 478
B   368 gTGAaGAAGGCCTgCGGGTtGTAAAgcaCTtTCAGtgGGgAAGAAaaGccT-GggGTTAATACCcccgggtcTTGACGtT 446
Diffs   A   A        A     A     AAA  A    AA  A     NA AAb b?Nbb      b??A??AAA      A 
Votes   +   +        +     +     +++  +    ++  +     0+ ++   00!!      !00+00+++      + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   475 ACCATCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTG 554
Q   479 ACCATCAAAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTTCGGAATTACTG 558
B   447 ACCcaCAgAaGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTaaTCGGAATcACTG 526
Diffs      AA  A A                                                        AA       A    
Votes      ++  + +                                                        ++       +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   555 GGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGcTcTATAAGTCAGATGTGAAAGTCCACGGCTCAACCGTGGAAGTGCATTTGAAACTGT 634
Q   559 GGCGTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTTTATAAGTCAGATGTGAAAGTCCACGGCTCAACCGTGGAAGTGCATTTGAAACTGT 638
B   527 GGCGTAAAGCGCaCGTAGGCGGcgaagTcAGTCAGATGTGAAAGcCCtgGGCTCAACCtgGGAAcTGCATTTGAtACTGc 606
Diffs               A         NA?AA A               A  AA         AA    A         A    A
Votes               +         0+0++ +               +  ++         ++    +         +    +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   635 ATggCTTGAGTACTGGAGGGGGTGGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAATACCGGTGGC 714
Q   639 ATTACTTGAGTACTGGAGGGGGTGGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAGGAATACCGGTGGC 718
B   607 tTggCTcGAGTctgGtAGaGGGgGGTGGAATTCCaGGTGTAGcGGTGAAATgCGTAGATATCtGGAGGAAcAtCaGTGGC 686
Diffs   A NN  A    AAA A  A   A           A       A        A          A       A A A     
Votes   + 00  +    +++ +  +   +           +       +        +          +       + + +     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   715 GAAGGCGACCACCTGGCCAGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 794
Q   719 GAAGGCGACCACCTGGCCAGATACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 798
B   687 GAAGGCGgCCcCCTGGaCcaAgACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 766
Diffs          A  A     A AA A                                                          
Votes          +  +     + ++ +                                                          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   795 ACGCCGTAAACGATGTCAACTAGGTGTTGGGaCGGTTAATCGTCTCATTGCCGcAGCTAACGCAaTAAGTTGACCGCCTG 874
Q   799 ACGCCGTAAACGATGTCAACTAGGTGTTGGGGCGGTTAATCGTCTCATTGCCGGAGCTAACGCATTAAGTTGACCGCCTG 878
B   767 ACGCCGTAAACGATGTCgACTAGccGTTGGGctcaTTtAagGgtTtAgTGgCGcAGCaAACGCgaTAAGTcGACCGCCTG 846
Diffs                    A     AA      ?AAA  A AA AA A A  A  N   A     AN     A         
Votes                    +     ++      0+++  + ++ ++ + +  +  0   +     +0     +         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   875 GGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGtATGTGGTTTAATTCGAc 954
Q   879 GGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAT 958
B   847 GGGAGTACGGcCGCAAGgTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAT 926
Diffs             A      A                                            B                B
Votes             +      +                                            +                +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   955 GCAACGCGcAGAACCTTACCtGgtCTTGACATCCcgaGAAtcttTTGGaAacaAgagagTGcctCtTTgaGGAGCtcgGt 1034
Q   959 GCAACGCGAAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCTCGGAA---CTTGGCAGAGATGCCTTGGTGCCTTCGGGAGCCGAGA 1035
B   927 GCAACGCGAAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCTCGGAA---CTTGGCAGAGATGCCTTGGTGCCTTCGGGAGCCGAGA 1003
Diffs           B           B BB          BBB      B    B BBB BBBBB  BBB B  BB     BBB B
Votes           +           + ++          +++           + +++ +++++  +++ +  ++     +++ +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1035 GACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGcAACGAGCGCAACCCTTGTCtTT 1114
Q  1036 GACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTT 1115
B  1004 GACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCTT 1083
Diffs                                                            B                   B  
Votes                                                            +                   +  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1115 AGTTGCCAGC-aTTCaGttGGGcACTCTAAaGAGACTGCCGGTGtcAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCcT 1193
Q  1116 AGTTGCCAGCGGTTCGGCCGGGAACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCAT 1195
B  1084 AGTTGCCAGCGGTTCGGCCGGGAACTCTAAGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCAT 1163
Diffs              B   B BB   B       B             BB                                B 
Votes                  + ++   +       +             ++                                + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1194 CATGGCCtTTATGacCaGGGCTACACACGTaCTACAATGGcataaACAGAGGGCaGCGAcatcGCGAgGtGaAGCgAATC 1273
Q  1196 CATGGCCCTTATGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAGAGGGCTGCGAAGCAGCGATGCGGAGCCAATC 1275
B  1164 CATGGCCCTTATGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAGAGGGCTGCGAAGCAGCGATGtGGAGCCAATC 1243
Diffs          B     BB B             B         BBBBB         B    BBBB    B N B   B    
Votes          +     ++ +             +         +++++         +    ++++    + 0 +   +    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1274 CCA-AAAttatgTCtcAGTCCGGATTGgAGTCTGCAACTCGACTcCATGAAGTtGGAATCGCTAGTAATCGCGgATCAGc 1352
Q  1276 CCAGAAAACCGATCGTAGTCCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGA 1355
B  1244 CCAGAAAACCGATCGTAGTCCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGc 1323
Diffs          BBBBB  BB           B                B        B                   B     N
Votes          +++++  ++           +                +        +                   +     0
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1353 ATGcCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCAcGGGAGTTGGTTGtACCAGAAGcAGtTga 1432
Q  1356 ATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTGCACCAGAAGTAGATAG 1435
B  1324 ATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTGCACCAGAAGTgGATAG 1403
Diffs      B                                               B            B        Ba B BB
Votes      +                                               +            +        +! + ++
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1433 gcTAACCgTaaGGAGGcaGgcTgCCAaGGTaTGaTtggTaACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1497
Q  1436 CTTAACCTTCGGGAGGGCGTTTACCACGGTGTGGTCAATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1500
B  1404 CTTAACCTTCGGGAGGGCGTT-------------------------------------------- 1424
Diffs   BB     B BB     BB BB                                            
Votes   ++     + ++     ++ +                                             
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 91.8%, QB 88.3%, AB 82.6%, QModel 97.7%, Div. +6.4%
Diffs Left 168: N 6, A 21, Y 141 (83.9%); Right 87: N 1, A 2, Y 84 (96.6%), Score 6.9661

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1553 nt) 90769;size=1;
ParentA ( 1552 nt) CS/7000004131501824/Syntrophus_aciditrophicus.SB
ParentB ( 1522 nt) CS/S000388693/Bordetella_hinzii.(T)

A     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTgGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGTACGAGAAAaTCCGtttcggCGG 80
Q     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTAGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTCGTACGAGAAATTCCGAGCAATCGG 80
B     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAttGAACGCTgGCGGgaTGCtTtACACATGCAAGTCGgACG-GcAgcaCgGgcttcggcc 79
Diffs                        AA       N    AA   A A              A     A A?A A ??N??NAAA
Votes                        ++       0    ++   + +              +     + +0+ + 000000+++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    81 AtGAGTAAAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCGTGGaTAAtcTGCCtTtaAGctGGGAATAACtCaTCGAAAGGtGgGCTA 160
Q    81 AAGAGTAAAGTGGCGCACGGGTGAGTAACGCGTGGGTAACTTGCCCTGGAGTCGGGAATAACACCTCGAAAGGGGTGCTA 160
B    80 tgGtGgcgAGTGGCGaACGGGTGAGTAAtGtaTcGG-AACgTGCCCaGtAGcgGGGgATAACtaCgCGAAAGcGtaGCTA 158
Diffs   A? A AAA       A            A AA A b   b?    bAb?  N?   A     NAbA      AbA?    
Votes   +0 + +++       +            + ++ +     !0    !+!0  00   +     0+!+      +!+0    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   161 ATACCcGATaaTGctatGcAG-CTaaGGTTgTataG-TcAAAGagaGCCTCTGCTTGCAAGCcctCaCTtagaGATGaGt 238
Q   161 ATACCTGATGGTGTCCGGGAGACTTCGGTTTTCCGGATTAAAGGTGGCCTCTGCTTGCAAGCTACCGCTCCTGGATGGGC 240
B   159 ATACC---------------GcaTaCGcccTaCgGGggaAAgcGgGGgacCTtCggGC---CTcgCaCTatTGGAgcGGC 220
Diffs                         A Nb AAAbAb?b  A?  AAbNb AAA  A AA      bN? N  ??bb  AAb b
Votes                           0! +++!+!0!   0  ++!0! +++  + ++      !00 0  00!!  ++! !
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   239 CCGCGTACCATTAGCTaGTTGGTaGGGTAAtGGCCtACCAAGGCgaTGATGGTTAGCTGGTCTgAGAGGAtGAtCAGcCA 318
Q   241 CCGCGTACCATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCCACCAAGGCTGTGATGGTTAGCTGGTCTTAGAGGACGACCAGTCA 320
B   221 CgataTcggATTAGCTaGTTGGTGGGGTAACGGCtCACCAAGGCgacGATccgTAGCTGGTtTgAGAGGACGACCAGcCA 300
Diffs    AAAA AAA       N      b      b   Ab        NNA   AAA        A N      b  b   N  
Votes    ++++ +++       0      !      !   +!        00+   +++        + 0      !  !   0  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   319 CACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATaTTGCGCAATGGGGG-aAACCCTGACGC 397
Q   321 CACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATCTTGCGCAATGGGGGGCAACCCTGACGC 400
B   301 CACTGGgACTGAGACACGGcCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGgGGAATtTTGgaCAATGGGGG-CAACCCTGAtcC 379
Diffs         A            A                          A     ?   AA          b        AA 
Votes         +            +                          +     0   ++                   ++ 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   398 AGCAACGCCGCGTGAGTGAgGAAGGttTTCGGaTCGTAAAGCTCTGTCgGgTGGGAaGAAAtgTatGgaGGTtAATAgcC 477
Q   401 AGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTCGGGTCGTAAAGCTCTGTCAGATGGGACGAAAATTCCGATGGTGAATAATC 480
B   380 AGCcAtcCCGCGTGtGcGATGAAGGCCTTCGGGTtGTAAAGCaCTtTtgGcaGGaAaG-AAAcggCGcaGGctAATAtct 458
Diffs      A AA       A A  b     bb     b A       A  A AN ?A  A N    b?A?b ?N  AN    ?NA
Votes      + ++       + +  !     !!     ! +       +  + +0 0+  + 0    !0+0! 00  +0    00+
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   478 tttGtacTtGACGGTACCGcCAaAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGgGGGTGCAAGCGT 557
Q   481 ACCGGGATCGACGGTACCGTCAGAGGAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGT 560
B   459 tgCGcaActGACGGTACCtgCAGAatAAGCACCGGCTAACTaCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGtAGGGTGCAAGCGT 538
Diffs   N?b ?NbAN         A?  b AA               A                        Ab            
Votes   00! 00!+0         +0  ! ++               +                        +!            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   558 TGTTCGGAATCATTGGGCGTAAAGaGCGTGTAGGCGGctGaGCAAGTCAGATGTGAAAtCCCTgGGCTTAACCcAGGAAG 637
Q   561 TGTTCGGAATCATTGGGCGTAAAGCGCGTGTAGGCGGTCGGGCAAGTCAGATGTGAAAGCCCTTGGCTTAACCAAGGAAG 640
B   539 TaaTCGGAATtAcTGGGCGTAAAGCGtGcGcAGGCGGTtcGGaAAGaaAGATGTGAAAtCCCagaGCTTAACtttGGAAc 618
Diffs    AA       A A           b A A A      bNAb A   AA          N   ANA       A?A    A
Votes    ++       + +           ! + + +      !0+! +   ++          0   +0+       +0+    +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   638 TGCATTTGAAACTGttCaGCTTGAGTAaGGaAGaGGGAAGTGGAATTCCtGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCaGG 717
Q   641 TGCATTTGAAACTGCCCGGCTTGAGTACGGGAG-GGGAAGTGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGG 719
B   619 TGCATTTttAACTaCCgGGCTaGAGTgtGtcAGaGGGAgGTGGAATTCCgcGTGTAGcaGTGAAATgCGTAGATATgcGG 698
Diffs          AA    AbbAb   A    A? A?       A          ?A      AA       A         A?  
Votes          ++    +!!+!   +    +0 +0       +          0+      ++       +         +0  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   718 AGGAACACCGGTGGCGAAGGCGaCTTCCTGGtCCtATACTGACGCTGAGACGCGAgAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAG 797
Q   720 AGGAACACCGGTGGCGAAGGCGGCTTCCTGGACCGATACTGACGCTGAGACGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAG 799
B   699 AGGAACACCGaTGGCGAAGGCaGCcTCCTGGgataAcACTGACGCTcAtgCaCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAG 778
Diffs             A          Ab A      ?AA? A         A AA A   b                        
Votes             +          +! +      0++0 +         + ++ +   !                        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   798 ATACCCTGGTAGTCCACGCcGTAAACgaTGttCACTAGGTGTTGaGGGTATTGACCCCTtCAGTGCCGAAGcTAACGCAT 877
Q   800 ATACCCTGGTAGTCCACGCTGTAAACTTTGGGCACTAGGTGTTGCGGGTATTGACCCCTGCAGTGCCGAAGGTAACGCAT 879
B   779 ATACCCTGGTAGTCCACGCccTAAACgaTGtcaACTAGcTGTTGgGGcctTcGggCCtTG--GTagCGcAGcTAACGCgT 856
Diffs                      NA     NN  N?A     A     ?  AAA A AA  A b    AA  A  N      A 
Votes                      0+     00  00+     +     0  +++ + ++  +      ++  +  0      + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   878 TAAGTGaaCCGCCTGGGGAGTACGgtCGCAAGatTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCAT 957
Q   880 TAAGTGCCCCGCCTGGGGAGTACGCCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCAT 959
B   857 gAAGTtgaCCGCCTGGGGAGTACGgtCGCAAGatTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGaCCCGCACAAGCGGTGGAtgAT 936
Diffs   A    A?N                NN      NN                        A                 AA  
Votes   +    +00                00      00                        +                 ++  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   958 GTGGTTtAATTCGAtGCAAC-GCGAAGAACCTTACCTGGGcTTGAcATCCCGgGAATcttCTGGAAACAGGagAGTGCC- 1035
Q   960 GTGGTTCAATTCGACGCAACCGCGAAGAACCTTACCTGGGTTTGAAATCCCGAGAATTCCCTGGAAACAGGGAAGTGCCT 1039
B   937 GTGGaTtAATTCGAtGCAAC-GCGAAaAACCTTACCTacccTTGAcATgtCtgGAATcCCgaaGAgAtttGGgAGTG-CT 1014
Diffs       A N       N           A          AAAN    N  AA AN    NbbAAA  A AAA bN       
Votes       + 0       0           +          +++0    0  ++ +0    0!!+++  + +++ !0       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1036 CTTcGgGGAaCcCGGaGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG 1115
Q  1040 CTTTGAGGAGCTCGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG 1119
B  1015 CgcaagaGAaCcgGaacACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAG 1094
Diffs    AA?ANA  N NA ANA                                                               
Votes    ++0+0+  0 0+ +0+                                                               
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1116 CGCAACCCtTGtCTTTAaTTGCCAtCATTcAGTTGGGCACTtTAAAGaGACTGCCGGcGttAAACCGGAGGAAGGTGGGG 1195
Q  1120 CGCAACCCCTGCCTTTAGTTGCCAGCATTGAGTTGGGCACTCTAAAGGGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGG 1199
B  1095 CGCAACCCtTGtCaTTAGTTGCtAcgA-----aaGGGCACTCTAAtGaGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGG 1169
Diffs           N  N A   b    A ?A      AA       b   A N         B BB                   
Votes           0  0 +   !    + 0+       +       !   + 0         + ++                   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1196 ATGACGTCAAGTCCTCATGGCCtTTATGcccAGGGCTaCACACGTgcTACAATGGgtGGtACAaAGaGcaGCCAACtCGC 1275
Q  1200 ATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGGACAGAGGGTCGCCAACCCGC 1279
B  1170 ATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTATGGGTAGGGCTTCACACGTCATACAATGGTCGGGACAGAGGGTCGCCAACCCGC 1249
Diffs                         B     BBB      B       BB        BB  B   B  B BB      B   
Votes                         +     +++      +       ++        ++  +   +  + ++      +   
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1276 GAGaGtGAGCaAATCtCAaAAAgCCatcCtcAGTtCGGATtGgAGTCTGCAACTCGACTcCaTGAAGTCGGAATCGCTAG 1355
Q  1280 GAGGGGGAGCCAATCCCAGAAACCCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGTCGGAATCGCTAG 1359
B  1250 GAGGGGGAGCCAATCCCAGAAACCCGATCGTAGTCCGGATCGCAGTCTGCAACTCGACTGCGTGAAGTCGGAATCGCTAG 1329
Diffs      B B    B    B  B   B  BBB BB   B     B B                B B                  
Votes      + +    +    +  +   +  +++ ++   +     + +                + +                  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1356 TAATCGCGGATCAGCATGcCGCGGTGAATACGTTCCCGGGcCTTGTACACACCGCCCGTCACACCcgGaaAaTtGaTTgc 1435
Q  1360 TAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTTT 1439
B  1330 TAATCGCGGATCAGCATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTTT 1409
Diffs                     B                     B                        BB BB B B B  BB
Votes                     +                     +                        ++ ++ + + +  ++
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1436 ACCAGAAGTcGTTgagCTAACCcCtattttagAGGaGGcaGgcgcCtACGGTgtGgTTggTaAtcGGGGTGAAGTCGTAA 1515
Q  1440 ACCAGAAGTAGTTAGCCTAACCGC-------AAGGGGGGCGATTACCACGGTAGGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1512
B  1410 ACCAGAAGTAGTTAGCCTAACCGC-------AAGGGGGGCGATTACCACGGTAGGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAA 1482
Diffs            B   BBB      B        B   B  BB BBBB B     BB B  BB B BB               
Votes            +   +++      +            +  ++ ++++ +     ++ +  ++ + ++               
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1516 CAAGGTAGCCGTAggGGAAccTGtGGCTGGATCACCT---- 1552
Q  1513 CAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1553
B  1483 CAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCT- 1522
Diffs                BB    BB  B                 
Votes                ++    ++  +                 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 86.5%, QB 83.0%, AB 78.4%, QModel 91.3%, Div. +5.5%
Diffs Left 307: N 45, A 89, Y 173 (56.4%); Right 72: N 0, A 1, Y 71 (98.6%), Score 2.1878

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1491 nt) 342719;size=1;
ParentA ( 1470 nt) CS/S000351730/Conexibacter_woesei.(T)
ParentB ( 1376 nt) CS/S000404972/Algoriphagus_mannitolivorans.(T)

A     1 --------------------GACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAAtACATGCAAGTGGAGCGACGAACCAGGGCTTGCCCT 60
Q     1 AGGGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAACACATGCAAGTGGAGCGACGAACCAGGGCTTGCCCT 80
B     1 -----------------------------------------------ATGCAAGTcGAGCG--GcAgttGGGgTaGtaaT 31
Diffs                                                          A        A AAA   A A AAA 
Votes                                                          +        + +++   + + +++ 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    61 GGGGCAA----AGCCGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCtGATGAttGGGACAACCCGAGGAAACTCGGG 136
Q    81 GGGGCAA----AGCCGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCCGATGACCGGGACAACCCGAGGAAACTCGGG 156
B    32 acttCAAtgagAGCgGCGcACGGGTGcGTAACgCGTatGcAACCTaCCCtttacAggGGGAtAgCCCGgaGAAAtctGGa 111
Diffs   AAAA          A   A       A     A   AA A     A   NAAAA ??    A A    AA    AAA  A
Votes   ++++          +   +       +     +   ++ +     +   0++++ 00    + +    ++    +++  +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   137 CTAATACCaaATGTgCTCCTCgacttTaAGgtcGttGAGgAAAGGtAGCTTCGGCtaaCCGCaTCaGGAtGGGCCCGcGG 216
Q   157 CTAATACCGGATGTACTCCTCACACATCAGTGTGAGGAGCAAAGGAAGCTTCGGC-CTCCGCTTCGGGAGGGGCCCGTGG 235
B   112 tTAATACCccATG------gCACtatTgAtTGgcAtcAagAgAtagttaaagatt-tatCGgTaaaGGAtGGGCatGcGt 184
Diffs   A       ??         a BB??N ? aBB?aBNa aN a aa?aaaaaaaaa ?Na  aBaaN   N    aa N a
Votes   +       00           ++000 0 !++0!+0! !0 ! !!0!!!!!!!!   0!  !+!!0   0    !! 0 !
Model   AAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   217 CCCATTAGCTtGTTGGtGaGGTAACGGCtCACCAAGGCtcCGATggGTAGctGgTCTGAGAGGAcGaTCagCCACACTGG 296
Q   236 CCCATTAGCTAGTTGGCGGGGTAACGGCCCACCAAGGCGACGATCAGTAGGGGTTCTGAGAGGAAGGTCCCCCACACTGG 315
B   185 CtgATTAGCTAGTTGGCGGtGTAACGGaCCACCAAGGCGACGATCAGTAGGGGTTCTGAGAGGAAGGTCCCCCACACTGG 264
Diffs    aa       B     B Ba       aB         BB    BB    BB B          B B  BB         
Votes    !!       +     + +!       !+         ++    ++    ++ +          + +  ++         
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   297 gACTGAGAcACGGcCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATcTTGcGCAATGcgCGaAAGcgTGACgCAGCaAcG 376
Q   316 CACTGAGATACGGGCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATATTGGGCAATGGTCGCAAGACTGACCCAGCCATG 395
B   265 CACTGAGATACGGGCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATATTGGGCAATGGTCGgAAGACTGACCCArCCATG 344
Diffs   B       B    B                                B   B      BB  ?   BB    B    B B 
Votes   +       +    +                                +   +      ++  0   ++    +    + + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   377 CCGCGTGgAGGAAGACGGtCtTC-GGaTTGTAAACTcCTTTcAgtTGGGAcGAAgcttcGgCgATGaaTaGtcgttcggA 455
Q   396 CCGCGTGCAGGAAGACGGCCCTCTGGGTTGTAAACTGCTTTTATCTGGGAAGAA--AAAGTCCATGCGTGG-----AAAA 468
B   345 CCGCGTGCAGGAAGACGGCCtatTGGGTTGTAAACTGCTTTTATCTGGGAAGAA--AAAGgCCATGCGTGG-----cAAA 417
Diffs          B          B Naa   B         B    B BB     B     BBB N B   BB B      NBB 
Votes          +          + 0!    +         +    + ++     +      ++ 0 +   ++ +       ++ 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   456 gTGaCGGTACCttcaGAAgAAGCcCCGGCTAACTaCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGtAGGGgGCgAGCGTTGTCCGG 535
Q   469 TTGCCGGTACCAGATGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTCCGG 548
B   418 TTGCCGGTACCAGATGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTCCGG 497
Diffs   B  B       BBBB   B    B          B                        B    B  B            
Votes   +  +       ++++   +    +          +                        +    +  +            
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   536 AaTcATTGGGcgTAAAGcGcGtGTAGGCGGCTcgATAAGTCtGCtGTGAAAGtCcagGGCTcAACCctgGaAtgcCgGTg 615
Q   549 ATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCTGAATAAGTCAGCGGTGAAAGACTTCGGCTTAACCGGAGCAGTGCCGTT 628
B   498 ATTTATTGGGTTTAAAGGGTGCGTAGGCGGCTGttTAAGTCAGCGGTGAAAGACTcCGGCTcAACCGGgGCAGTGCCGTT 577
Diffs    B B      BB     B B B          B?a      B  B       B B?B    N    BBN B BBB B  B
Votes    + +      ++     + + +          +0!      +  +       + +0+    0    ++0 + +++ +  +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   616 GATACTGTcgAGCTTGAGTccgGaAGaGGcgagTGGAATTccTGGTGTAGCGGTGAAATGCgcAGATAtCAggAGGAACA 695
Q   629 GATACTGTTTAGCTTGAGTGTTGGAGGGGTACATGGAATTGATGGTGTAGCGGTGAAATGCATAGATACCATCAGGAACA 708
B   578 GATACTGgacAGCTTGAGTGcTGcAGGGGTACATGGAATTGATGaTGTAGCGGTGAAATGCATAGATAtCATCAGGAACA 657
Diffs          a??         BNB ?  B  BBBB       BB  a                BB     N  BB       
Votes          !00         +0+ 0  +  ++++       ++  !                ++     0  ++       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   696 CCaATgGCGAAGGCAgctcgCTGGgacgtgACTGACGCTGAGaCgCGAAAGcGTGGGGAgCaAACAGGATTAGATACCCT 775
Q   709 CCGATAGCGAAGGCATTGTACTGGCCAACAACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGTGGGGATCGAACAGGATTAGATACCCT 788
B   658 CCGATAGCGAAGGCATTGTACTGGgCAgCAACTGACGCTGAGGCACGAAAGTGTGGGGATCGAACAGGATTAGATACCCT 737
Diffs     B  B         BBBBB    NBBNBB            B B      B       B B                  
Votes     +  +         +++++    0++0++            + +      +       + +                  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   776 GGTAGTCCACgCtGTAAACGATGggTACTaGgTGTggggggTG-tcGacTcCctccGtGcCgAcGCtAAcGCaTTAAGTA 854
Q   789 GGTAGTCCACACCGTAAACGATGATTACTCGCTGT----TATG-GTGTATACTGTAGCGGCCAAGCGAAAGCGTTAAGTA 863
B   738 GGTAGTCCACACCGTAAACGATGATTACTCGCTGT----TATGctTaTATAgTGTAGCGGCCAAGCGAAAGCGTTAAGTA 813
Diffs             B B          BB    B B       BB   NBaBB BaBBBB B B B B  B  B  B       
Votes             + +          ++    + +        +    +!++ +!++++ + + + +  +  +  +       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   855 ccCCgCCTGGGGAGTACGgCcGCAAgGcTaAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGcCCGCACAAGCaGcGGAGCATGTGGTT 934
Q   864 ATCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAACGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTT 943
B   814 ATCCACCTGGGGAGTACGCCGGCAACGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTT 893
Diffs   BB  B             B B    B B B                       B          B B             
Votes   ++  +             + +    + + +                       +          + +             
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   935 TAATTCGAcGcaACGCGAaGAACCTTACCTGGGCTtGAcATGTGcctGAccGccgTgGAaAcAcggCttcCcttcggGgC 1014
Q   944 TAATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCTGGGCTAGA-ATGTGAAGGAATGATTTAGAGATAGATCAGTCAGCAATGAC 1022
B   894 TAATTCGATGATACGCGAGGAACCTTACCTGGGCTAGA-ATGTGAAGGAATGATTTAGAGATAGATCAGTCAGCAATGAC 972
Diffs           B BB      B                B        BBB  BB BBB B  B B BBB BBB BBBBBB B 
Votes           + ++      +                +        +++  ++ +++ +  + + +++ +++ ++++++ + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1015 agGttcacAGGTGgTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGtCGTGAGaTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCcg 1094
Q  1023 CTGAAACAAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTA 1102
B   973 CTGAAACAAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTA 1052
Diffs   BB BBBBB     B                       B      B                                 BB
Votes   ++ +++++     +                       +      +                                 ++
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1095 TcgcatGTTGCCAGCAttTA--GTTGGGGACTCatGcgAGACTGCCgGtGacAaaccgGAGGAAGGtGGGGAtGACGTCA 1172
Q  1103 TGTTTAGTTGCCAGCAAGTAATGTTGGGGACTCTAGACAGACTGCCTGCGCAAGCAGAGAGGAAGGAGGGGACGACGTCA 1182
B  1053 TGTTTAGTTGCCAGCAcGTAAaGgTGGGGACTCTAGACAGACTGCCTGCGCAAGCAGAGAGGAAGGAGGGGACGACGTCA 1132
Diffs    BBBBB          ?B     a         BB BB        B B BB BBBBB        B     B       
Votes    +++++          0+     !         ++ ++        + + ++ +++++        +     +       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1173 AGTCATCATGcCCCTTAtGtCCAGGGCtACACACGTGCTACAtTGGCGCgTACAGaGGGctGCGAtaCcGcgAgGtggAG 1252
Q  1183 AGTCATCATGGCCCTTACGCCCAGGGCGACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGCGGGTCGCGAGCCGGTAACGGTCAG 1262
B  1133 AGTCATCATGGCCCTTACGCCCAGGGCGACACACGTGCTACAATGGCGCATACAGCGGGTCGCGAGCCGGTAACGGTaAG 1212
Diffs             B      B B       B              B      B     B   BB    BB B BB B BB?  
Votes             +      + +       +              +      +     +   ++    ++ + ++ + ++0  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1253 CgAAtCcCTtAAAGcGCGTCTCgGTTCGGATTGtaGgCTGaAACTCGcCtaCATGAAGgcGGAgTtGCTAGTAATCGCGg 1332
Q  1263 CCAACCTCTAAAAGTGCGTCTCAGTTCGGATTGAGGTCTGCAACTCGACCTCATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGC 1342
B  1213 CCAACCTCTAAAAGTGCGTCTCAGTTCGGATTGAGGTCTGCAACTCGACCTCATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGC 1292
Diffs    B  B B  B    B       B          BB B   B      B BB       BB   B B             B
Votes    +  + +  +    +       +          ++ +   +      + ++       ++   + +             +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1333 ATCAGCatTGcCGCGGTGAATACGTTCCCGGgCCTTGTACACACCGCCCGTCAcaCCAcGGgAGTgaGcaAcACCcGAAG 1412
Q  1343 ATCAGCCATGGCGCGGTGAATACGTTCCCGGACCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGTCGGGTAGACCTGAAG 1422
B  1293 ATCAGCCATGGCGCGGTGAATACGTTCCCGGACCTTGTACACACCGCCCGTCAAGCCATGGAAGTCGGGTAGACCTGAAG 1372
Diffs         BB  B                    B                     BB   B  B   BB BB B   B    
Votes         ++  +                    +                     ++   +  +   ++ ++ +   +    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1413 cCGGTggCCtaacccgcaagGgAgGGAGCCGTcgAaGGTgGggCtcGTgACTGGGGtg---------------------- 1470
Q  1423 GCGGTAACC-----------GCAAGGAGCCGTTTAGGGTAGAACCGGTAACTGGGGCTAAGTCGTAACAAGGTAGCCGTA 1491
B  1373 GCGG---------------------------------------------------------------------------- 1376
Diffs   B                                                                               
Votes   +                                                                               
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 78.5%, QB 92.2%, AB 74.6%, QModel 94.7%, Div. +2.8%
Diffs Left 38: N 0, A 3, Y 35 (92.1%); Right 323: N 34, A 30, Y 259 (80.2%), Score 2.0383

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1413 nt) 355961;size=1;
ParentA ( 1467 nt) CS/S000594445/Balneola_vulgaris.(T)
ParentB ( 1463 nt) CS/7000004128331608/Candidatus_Pelagibacter.ubique.HTCC1062

A     1 --------------TCAGGACGAACGCT-GCGGCGGGCTTAACACATGCAAGTCGAAGGAGAAGGTgactGCTTGCagTc 65
Q     1 AGTTTGATCATGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGGGCTTAACACATGCAAGTCGAAGGAGAAGGTAGAAGCTTGCTTTT 80
B     3 AGTTTGATCATGGCTCAGaACGtACGCTGGCGGCacGCcTAACACATGCAAGTCGAAcGA------AGtAGC-------- 68
Diffs                     A   A           AA  A                  A        bb?b          
Votes                     +   +           ++  +                  +         !0!          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    66 ACTGGAGACTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGcTAACCTGCCTtTAGCTGGGGGATA-CAtTcCGAAAGgGaTGCTAA 144
Q    81 ACTGGAGACTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAGATAACCTGCCTATAGCTGGGGGATAACACTGCGAAAGTGGTGCTAA 160
B    69 AaTacttAgTGGCaGACGGGTGAGTAACatGTgGgTAtCtacCCTtTgGC-ctGGaATAACACgagGAAAcTtGTGCTAA 147
Diffs    A AAAA A    A              AA  A ?  A AAA   N A   AA  A      bA?A    AbAb      
Votes    + ++++ +    +              ++  + 0  + +++   0 +    +  +      !+0+    +!+!      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   145 TACCGCATAATGCAGC-GGGCCGCATGGCCAcAGTTGTTAAAGGTTTCGaCCGGCTAgAGATGGGgCTGCGTaCTATTAG 223
Q   161 TACCGCATAATGCAGCGGGGCCGCATGGCCATAGTTGTTAAAGGTTTCGGCCGGCTATAGATGGGTCTGCGTGCTATTAG 240
B   148 TACCGgATAA-----------------GtCtTtacgGagAAAGcTTTatG-CacCatTgGATGaGcCcGCacttgATTAG 209
Diffs        A                      A AbAAAA AA    A   AAb  AA AAbA    A ? A  AA?AA     
Votes        +                      + +!++++ ++    +   ++   ++ ++!+    + 0 +  ++0++     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   224 TTAGTTGGTgaGGTAACGGCtcACCAAGGCGATGATAGtTAGGGGGTCTGAGAGGATGATCCCCCACACTGGGACTGAGA 303
Q   241 TTAGTTGGTAGGGTAACGGCCTACCAAGGCGATGATAGCTAGGGGGTCTGAGAGGATGATCCCCCACACTGGGACTGAGA 320
B   210 TTtGTTGGTAGGGTAAtGGCCTACCAAGaCtATGATcaaTAGctGaTtTGAGAGGATGATCagCCACAtTGGGACTGAGA 289
Diffs     A      bb     A   bb      A A     AA?   AA A A             AA     A           
Votes     +      !!     +   !!      + +     ++0   ++ + +             ++     +           
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   304 CACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCCACGCCGCGTGC 383
Q   321 CACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGAGGAATCTTGCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGCAGCCACGCCGCGTGC 400
B   290 CACGGCCCAaACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGgGGAATCTTGCaCAATGGagGAAActCTGAtGCAGCgAtGCCGCGTGa 369
Diffs            A                      A          A      AA    AA    A     A A        A
Votes            +                      +          +      ++    ++    +     + +        +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   384 CGGATGAAGGCCCTATGGGTTGTAAACGGCTTTTgaggaGGAAGAACGActGGaTTTCGATCTggTGTGACGGTACtcct 463
Q   401 CGGATGAAGGCCCTATGGGTTGTAAACGGCTTTTACTAGGGAAGAACGAGAGGGTTTCGATCTTCTGTGACGGTACCTAG 480
B   370 gtGAaGAAGGCC-TtTGGGTTGTAAAgctCTTTcgtcgGGGAAGAA-------------------aaTGACtGTACCcga 429
Diffs   AA  A         A           AAA    AN??Nb                          AA    A    bN??
Votes   ++  +         +           +++    +0000!                           +    +    !000
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   464 TGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGTGTA 543
Q   481 TGAATAAGCACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTGTCCGGAATCATTGGGTGTA 560
B   430 atAAgAAGgtCCGGCTAACTtCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGaAGGGacCtAGCGTaGTtCGGAATtAcTGGGctTA 509
Diffs   AA  A   AA          A                        A    AA A     A  A      A A    AA  
Votes   ++  +   ++          +                        +    ++ +     +  +      + +    ++  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   544 AAGGGTgCGTAGGCGGGctatTAAGTCTGGGGTGAAATCTTGCCGCTTAACGGTAAAATGGCCCTGGATACTGGtagTCT 623
Q   561 AAGGGTACGTAGGCGGGAGCCTAAGTCTGGGGTGAAATCTTGCCGCTTAACGGTAAAATGGCCCTGGATACTGGGTTTCT 640
B   510 AAGaGTtCGTAGGtGGttGaaaAAGTtgGtGGTGAAATCccagaGCTTAACtcTggAActGCCaTcaAaACTtttcagCT 589
Diffs      A  ?      A  A?bN?A    AA A         AAAAA       AA AA  AA   A AA A   AAN??A  
Votes      +  0      +  +0!00+    ++ +         +++++       ++ ++  ++   + ++ +   ++000+  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   624 TGAGTGtAGAAGAGGtAaGTGGAATTCGTaGTGTAGCGGTGAAATGCaTAGATATtACGAAGAACATCAGTGGCGAAGGC 703
Q   641 TGAGTGCAGAAGAGGCAGGTGGAATTCGTGGTGTAGCGGTGAAATGCTTAGATATCACGAAGAACATCAGTGGCGAAGGC 720
B   590 aGAGTatgatAGAGGaAaGcaGAATTtcTaGTGTAGaGGTGAAATtCgTAGATATtAgaAAGAAtAcCAaTtGCGAAGGC 669
Diffs   A    ANAAA     ? N AA     AA N      A        A ?       N AA     A A  A A        
Votes   +    +0+++     0 0 ++     ++ 0      +        + 0       0 ++     + +  + +        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   704 GGCtTaCTGGTCTaCAACTGACGCTGAGGcACGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCtG 783
Q   721 GGCCTGCTGGTCTGCAACTGACGCTGAGGTACGAAAGCGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCG 800
B   670 aGCtTtCTGGatcattACTGACaCTGAGGaACGAAAGCaTGGGtAGCGAAgAGGATTAGATACCCTcGTAGTCCAtGCCG 749
Diffs   A  N ?    AAANAA      A      ?        A    A      A               A        A  b 
Votes   +  0 0    +++0++      +      0        +    +      +               +        +  ! 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   784 TAAACGATGCATACTAGGTGTTGG--CCTTTcgGGGCCAGTGCTGCAGTTAACGCATTAAGTATGCCACCTGGGGAGTAC 861
Q   801 TAAACGATGCATACTAGGTGTTGG--CCTTT--GGGCCAGTGCTGCAGTTAACGCATTAAGTATGCCACCTGGGGAGTAC 876
B   750 TAAACGATGtgTgtTAGacGTTGGaaatTTa--ttttCAGTGtcGCAGggAAacCgaTAAacAcaCCgCCTGGGGAGTAC 827
Diffs            AA AA   AA       AA  A  AAAA     AA    AA  AA AA   AA AA  A            
Votes            ++ ++   ++        +      +++     ++    ++  ++ ++   ++ ++  +            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   862 GTCGGCAACGATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGCTTAATTCGATGCAACGCG 941
Q   877 GTCGGCAACGATGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGCTTAATTCGATGCAACGCG 956
B   828 GaCcGCAAgGtTaAAACTCAAAtGAATTGACGGGGaCCCGCACAAGtaGTGGAGCATGTGGtTTAATTCGAaGatACGCG 907
Diffs    A A    A A A         A            A          AA             A         A AA     
Votes    + +    + + +         +            +          ++             +         + ++     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   942 AGGAACCTTACCTGGGC-TAAATCCACAacGcT-aCcTCTGGAAACAGagGGTttCTTcGGaaCgtTATGGA----AGGT 1015
Q   957 AGGAACCTTACCTGGGC-TAAATCCACAGTGATGTCTTCTGGAAACAGGAGGTCCCTTAGGGGCACTATGGA----AGGT 1031
B   908 caGAACCTTACCaacaCtTgAcatgttcGTcgcGaCTctaaGAgAttaGAGtTttCggttcGGCcggAcGaAacacAGGT 987
Diffs   AA          AAAA   A AAAAAAAbbA?A N bAAAA  A AAAbb A NN AA?AAbb ??A A A         
Votes   ++          ++++   + +++++++!!+0    !++++  + +++!! + 00 ++0++!! 00+ + +         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1016 GCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTaGTTAGTTACC 1095
Q  1032 GCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGCCGTGAGGTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTGTGGTTAGTTACC 1111
B   988 GCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGtCGTGAGaTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCtcacttTTAGTTgCC 1067
Diffs                            A      A                                AAAA?A      A  
Votes                            +      +                                ++++0+      +  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1096 AGCACGTAAtGGTGGGGACTCTAGCtAGACTGCCTACGCAAGTAGTGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCaTCATGGC 1175
Q  1112 AGCACGTAAAGGTGGGGACTCTAGCCAGACTGCCTACGCAAGTAGTGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCCTCATGGC 1191
B  1068 AtCA--TtAAGtTGGGcACTCTgaaagaACTGCCagtGatAagctgGAGGAAGGTGGGGAtGACGTCAAGTCCTCATGGC 1145
Diffs    A     A b A    A     AAA?AA      AAA AA AAAAA              A           b       
Votes    +     + ! +    +     +++0++      +++ ++ +++++              +           !       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1176 CCTTACGTccaGGGCTgCACACGTGCTACAATGGatggTACAgaAGGtcGCcActCaGCGAtGaggAGCAAATCtTTAAA 1255
Q  1192 CCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTATCTACAACAGGAAGCAAGACTGCGAGGTCAAGCAAATCCTTAAA 1271
B  1146 CCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcATCTACAACAGGAAGCAAaACgGCaAcGTtAAGCAAATCCcgAAA 1225
Diffs           bbb     b                 ?bbb    bb   bb  b ?b ?  A ? b?b        bAA   
Votes           !!!     !                 0!!!    !!   !!  ! 0! 0  + 0 !0!        !++   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAx

A  1256 AccattCTCAGTTCGGATcGgAgTCTGCAACTCGAcTcCgTGAAGtTGGAATcgCTAGTAATCGcGtATCAGCaacGaCg 1335
Q  1272 AGATACCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGC-GTGCCA 1350
B  1226 AGATgCCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGC-GTGCCA 1304
Diffs    BBB?B            B B B            B B B     B      BB          B B       BB B B
Votes    +++0+            + + +            + + +     +      ++          + +        + + +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1336 CGGTGAATaCGTTCCCGGGcCTTGTACACACCGCCCGTCAagCgATGGaAGTcaGgagTACCT 1398
Q  1351 CGGTGAATGCGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCT 1413
B  1305 CGGTGAATGCGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCT 1367
Diffs           B          B                    BB B    B   BB BBB     
Votes           +          +                    ++ +    +   ++ +++     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 91.2%, QB 77.3%, AB 73.1%, QModel 93.4%, Div. +2.5%
Diffs Left 343: N 43, A 44, Y 256 (74.6%); Right 31: N 0, A 1, Y 30 (96.8%), Score 1.5769

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1451 nt) 168354;size=1;
ParentA ( 1474 nt) CS/7000004131501900/Synechococcus_sp..CC9605
ParentB ( 1551 nt) CS/S000009676/Pelobacter_acetylenicus.(T)

A     1 AGAGTTTGATCcTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACG-------------AACCTT 67
Q     1 AGAGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACG-------------AACCTT 67
B     1 AGAGTTTGATnnTGGCTCAGaAcGAACGCTGGCGGCGTGCTTAACACATGCAAGTCGAACGtgaaagggacttcggtCcT 80
Diffs                       A A                                                   AAA A 
Votes                       + +                                                    ++ + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    68 CGGGTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGT-GAGAATCTGCCCTCAGGAGGGGGACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAAT 146
Q    68 CGGGTTAGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGT-GAGAATCTGCCCTCAGGAGGGGGACAACAGCTGGAAACGGCTGCTAAT 146
B    81 gaGtaaAGTGGCGcACGGGTGAGTAACaCGTgGAtAATCTaCCCgatGGAccGGGAtAACActTcGAAAgGGgTGCTAAT 160
Diffs   AA AAA       A             A      A     A   AAA   AA    A    AA A    A  A       
Votes   ++ +++       +             +      +     +   +++   ++    +    ++ +    +  +       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   147 ACCCCATATGCCGCGAGGTGAAATGAATTTCGCCTGA-------------------------------GGATGAGCTCGC 195
Q   147 ACCCCATATGCCGCGAGGTGAAATGAATTTCGCCTGA-------------------------------GGATGAGCTCGC 195
B   161 ACCggATAaGCCcacAGGctcccTGgAgcTtGCggGAaaaggtggggaccttcgggcctactgtcatcGGATGAGtcCGC 240
Diffs      AA   A   AAA   AAAAA  A AA A  AA                                        AA   
Votes      ++   +   +++   +++++  + ++ +  ++                                        ++   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   196 GTCTGATTAGCTAGTTGGTGtaGGTAAtgGCtcACCAAGGCATCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACAC 275
Q   196 GTCTGATTAGCTAGTTGGTG-GGGTAAGAGCCTACCAAGGCATCGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACAC 274
B   241 GgCccATTAGCTAGTTGGTa-GGGTAAtgGCCTACCAAGGCAaCGATggGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACAC 319
Diffs    A AA              A b     NN  bb         A    AA                               
Votes    + ++                      00  !!         +    ++                               
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   276 TGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCA 355
Q   275 TGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTCCGCAATGGGCGAAAGCCTGACGGAGCA 354
B   320 TGGaACTGAGACACGGtCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATTTTgCGCAATGGGgGAAAcCCTGACGcAGCA 399
Diffs      A            A                                   A         A    A       A    
Votes      +            +                                   +         +    +       +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   356 ACGCCGCGTGAGGGATGAAGGCCTCTGGGCTGTAAACCTCTTTTaTCAAGGAAGA------------------------A 411
Q   355 ACGCCGCGTGAGGGATGAAGGCCTCTGGGCTGTAAACCTCTTTTCTCAAGGAAGA------------------------A 410
B   400 ACGCCGCGTGAGtGATGAAGGCtTtcGGGtcGTAAAgCTCTgTcagaggGGAAGAaacccctgcaggataacaccctgcA 479
Diffs               A         A AA   AA     A    A ANAAAA                               
Votes               +         + ++   ++     +    + +0++++                               
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   412 GATCTGACGGTACTTGAtGAATAAGCCACGGCTAATTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGAGTGGCAAGCGTTATC 491
Q   411 GATCTGACGGTACTTGAGGAATAAGCCACGGCTAATTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGGAGTGGCAAGCGTTATC 490
B   480 GgatTGACGGTACcctcaaAggAAGCacCGGCTAAcTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGagGgtGCAAGCGTTgTt 559
Diffs    AAA         AAAA?A AA    AA       A                           AA AA         A A
Votes    +++         ++++0+ ++    ++       +                           ++ ++         + +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   492 CGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGCAGGCGGCCCTTCAAGTCTGCTGTTAAAAAGTGGAGCTTAACTCCATCaTGGCA 571
Q   491 CGGAATTATTGGGCGTAAAGCGTCCGCAGGCGGCCCTTCAAGTCTGCTGTTAAAAAGTGGAGCTTAACTCCATCGTGGCA 570
B   560 CGGAATTATTGGGCGTAAAGCGcgtGtAGGCGGtCtgTtAAGTCTGaTGTgAAAgccccGgGCTcAACcCgggaagtGCA 639
Diffs                         AAA A      A AA A       A   A   AAAAA A   A   A AAAANAA   
Votes                         +++ +      + ++ +       +   +   +++++ +   +   + ++++0++   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   572 GTGGAAACTGTTGGGCTtGAGTGTGGTAGGGGCAGAGGGAATTCCCGGTGTAGcGGTGAAATgCGTAGATATCGGGAAGA 651
Q   571 GTGGAAACTGTTGGGCTAGAGTGTGGTAGGGGCAGAGGGAATTCCCGGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATCGGGAAGA 650
B   640 tTGGAtACTGgcaGaCTtGAGTacGGgAGaGGgAagtGGAATTCCgGaTGTAGgGGTGAAATcCGTAGATATtcGGAgGA 719
Diffs   A    A    AAA A  N    AA  A  A  A AAA        A A     ?        ?         AA      
Votes   +    +    +++ +  0    ++  +  +  + +++        + +     0        0         ++      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBB

A   652 ACACCaGTGGCGAAGGCGctctgCTGGgCCatcACTGACGCTcatggaCGAAAGCcaGGGGAGCgAAagGGATTAGATAC 731
Q   651 ACACCGGTGGCGAAGGCGGCTCTCTGGACCGATACTGACGCTGTGACGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATAC 730
B   720 ACACCGGTGGCGAAGGCGGCTtcCTGGACCGATACTGACGCTGaGACGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATAC 799
Diffs        B            BBBN?    B  BBB         BNBBBB       BB       B  BB           
Votes        +            +++00    +  +++         +0++++       ++       +  ++           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   732 CCctGTAGTCCtgGCcGTAAACGATGaaCACTAGGTGTcGgGGGaATcGACCCCcTCgGTGtCGtAGCcAACGCgTTAAG 811
Q   731 CCTGGTAGTCCACGCTGTAAACGATGGGCACTAGGTGTGGAGGGTATTGACCCCTTCTGTGCCGCAGCTAACGCATTAAG 810
B   800 CCTGGTAGTCCACGCcGTAAACGATGGGCACTAGGTGTcGcGGGTATTGACCCCTgCgGTGCCGaAGCTAACGCATTAAG 879
Diffs     BB       BB  N          BB          N ?   B  B      Ba N   B  ?   B     B     
Votes     ++       ++  0          ++          0 0   +  +      +! 0   +  0   +     +     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   812 TGttCCGCCTGGGgAGTACGcaCGCAAGtgTgAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGtATGTGG 891
Q   811 TGCCCCGCCTGGGAAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGG 890
B   880 TGCCCCGCCTGGGgAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGG 959
Diffs     BB         N      BB      BB B                                         B      
Votes     ++         0      ++      ++ +                                         +      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   892 TTtAATTCGAtGCAACGCGaAGAACCTTACCaGGGtTTGACATCCt--gcGAatctCtTGGAAACAgGagagTgCCTTCG 969
Q   891 TTCAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGGCTTGACATCCC--CTGACCACCATGGAAACATGGTTTTCCCTTCG 968
B   960 TTtAATTCGACGCAACGCGCAGAACCTTACCTGGGCTTGACATCCCgatcGtaCttgcTGGAAACAgtGaggTCagTTCG 1039
Diffs     N       B        B           B   B         B  ?N aNB?Na?        NaB??N Baa    
Votes     0       +        +           +   +             0 !0+00!0        0!+000 +!!    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   970 G-GaACgcaGTGACAGGTGgTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA 1048
Q   969 G-GGACAGGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA 1047
B  1040 GctGgatcGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAA 1119
Diffs     aBaa?NB          B                                                            
Votes      +!!00+          +                                                            
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1049 CCCacGtCtTTAGTTGCcAgCA--TTtaGtTGgGcACtCTAgaGagACTGcCGGtGAtAAaCCGGAGGAAGGTGtGGATG 1126
Q  1048 CCCTTGCCCTTAGTTGCTACCAGGTTATGCTGAGAACCCTAAGGGAACTGTCGGCGAAAAGCCGGAGGAAGGTGGGGATG 1127
B  1120 CCCTTGtCCTTAGTTGCcAgCA--TTtgGtTGgGcACtCTAAGGagACTGcCGGtGttAAaCCGGAGGAAGGTGGGGATG 1197
Diffs      BB N B        N N      N? N  N N  N   BB NN    N   N aN  N             B     
Votes      ++ 0 +        0 0      00 0  0 0  0   ++ 00    0   0 !0  0             +     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1127 ACGTCAAGTCaTCATGcCCCTTACaTCCtGGGCTACACACGTaCTACAATGcTacGgACAAAGGGctGCaAgttCGCGAG 1206
Q  1128 ACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGTCCCGGGCTACACACGTGCTACAATGGTCGGTACAAAGGGTCGCCAACCCGCGAG 1207
B  1198 ACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTAtGTCCaGGGCTACACACGTGCTACAATGGcCGGTACAAAGGGcaGCaAtaCCGCaAG 1277
Diffs             B     B      aB   ?             B        BaBB B        N?  N ??B   a  
Votes             +     +      !+   0             +        +!++ +        00  0 00+   !  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1207 GacaAGCaAATCCCAtAAAcCgtggCTCAGTTCaGATcGtAGgCTGCAACTCGcCTaCgTGAAGgcGGAATCGCTAGTAA 1286
Q  1208 GGGGAGCTAATCCCAAAAAGCCGATCTCAGTTCGGATTGCAGTCTGCAACTCGACTGCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAA 1287
B  1278 GtGGAGCgAAcCCCAAAAAGCCGgTCTCAGTTCGGATTGgAGTCTGCAACTCGACTcCATGAAGTTGGAATCGCTAGTAA 1357
Diffs    ?BB   ?  a    B   B BBNB        B   B ?  B          B  ? B     BB              
Votes    0++   0  !    +   + ++0+        +   + 0  +          +  0 +     ++              
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1287 TCGCAGgTCAGcAtaCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACAcCAtGgAAGTtGGccacgCc 1366
Q  1288 TCGCAGATCAGAACGCTGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACATCACGAAAGTGGGTTGTACT 1367
B  1358 TCGCgGATCAGcAtGCcGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACAcCACGggAGTtGaTTGTACc 1437
Diffs       a B    N NB a                                           N  B Na   N aBBBBB N
Votes       ! +    0 0+ !                                           0  + 0!   0 !+++++ 0
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1367 cGAAgcCGttactCcAACC---CttGtGGAGGaggaCGtcgAAGGTggGgcTgATGAcTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGT 1443
Q  1368 AGAAATCGCCGAGCTAACCTCGCAAGAGGAGGCAAGCGCTTAAGGTATGATTCATGATTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGT 1447
B  1438 tGAAATCGgtGgGCTAACCT----tcgGGAGGCAgcCGCTTAtGGTATGgTcggTaAcTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGT 1513
Diffs   ?   BB  ?NB?B B         Na?     BBN?  BBB a   BB NBaNa a N                      
Votes   0   ++  00+0+ +          !0     ++00  +++ !   ++ 0+!0! ! 0                      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1444 AtCC 1447
Q  1448 AACC 1451
B  1514 AgCC 1517
Diffs    ?  
Votes    0  
Model   BBBB

Ids.  QA 87.8%, QB 84.0%, AB 80.2%, QModel 93.1%, Div. +6.0%
Diffs Left 142: N 3, A 8, Y 131 (92.3%); Right 185: N 23, A 64, Y 98 (53.0%), Score 1.1465

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1473 nt) 115017;size=1;
ParentA ( 1430 nt) CS/S000089782/Blastomonas_ursincola.(T)
ParentB ( 1478 nt) CS/S000395050/Devosia_neptuniae.(T)

A     1 -------------------------ACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGGCTTCGGCCTTAGTGG 55
Q     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGGCTTCGGCCTTAGTGG 80
B     2 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAgGCtTAACACATGCAAGTCGAACGgtctCTTCGGaggcAGTGG 81
Diffs                                        A  A                    AAAA      AAAA     
Votes                                        +  +                    ++++      ++++     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    56 CGCACGGGTGCGTAACGCGTGGGAATCTGCCCTTGGGTTCGGAATAACAGTGAGAAATTACTGCTAATACCGGATGATGA 135
Q    81 CGCACGGGTGCGTAACGCGTGGGAATCTGCCCTTGGGTTCGGAATAACAGTGAGAAATTACTGCTAATACCGGATGATGA 160
B    82 CagACGGGTGaGTAACGCGTGGGAATCTaCCtagttcTaCGGAAcAACAGaGgGAAAcTtCTGCTAATACCGtATacgcc 161
Diffs    AA       A                 A  AAAAAA A     A     A A    A A            A  AAAAA
Votes    ++       +                 +  ++++++ +     +     + +    + +            +  +++++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   136 CTTCGGTCCAAAGATTTATCGCCCAAGGATGAGCCCGCGTAAGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGA 215
Q   161 CTTCGGTCCAAAGATTTATCGCCCAAGGATGAGCCCGCGTAAGATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGA 240
B   162 CTcCGGgggAAAGATTTATCGgaattaGATGAGCCCGCGTAAGATTAGCTAGTTGGTGgGGTAAtGGCctACCAAGGCGA 241
Diffs     A   AAA            AAAAAA                               A     A   AA          
Votes     +   +++            ++++++                               +     +   ++          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   216 CGATCTTTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 295
Q   241 CGATCTTTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 320
B   242 CGATCTTTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAanAGTG 321
Diffs                                                                             A     
Votes                                                                             +     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   296 GGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTT 375
Q   321 GGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTT 400
B   322 GGGAATATTGGACAATGGGCGcAAGCCTGATCCAGCcATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTT 401
Diffs                        A              A                                           
Votes                        +              +                                           
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   376 TACCAGGGATGATAATGACAGTACCTGGAGAATAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGAG 455
Q   401 TACCAGGGATGATAATGACAGTACCTGGAGAATAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGAG 480
B   402 cAgtgGGGAaGATAATGACgGTACCcacAGAAgAAGCcCCGGCTAACTtCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGaAGGGgG 481
Diffs   A AAA    A         A     AAA    A    A          A                        A    A 
Votes   + +++    +         +     +++    +    +          +                        +    + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   456 CTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCCATTCAAGTCAGAGGTGAAAGCCCGGGGCTCAACC 535
Q   481 CTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCCATTCAAGTCAGAGGTGAAAGCCCGGGGCTCAACC 560
B   482 CTAGCGTTGTTCGGAtTTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGattggtcAGTtAGAGGTGAAAtCCCGaaGCTCAACt 561
Diffs                  A                            AAAAAAA   A          A    AA       A
Votes                  +                            +++++++   +          +    ++       +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   536 CCGGAACTGCCTTTGAAACTAGATGGCTTGAATCTTGGAGAGGCGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 615
Q   561 CCGGAACTGCCTTTGAAACTAGATGGCTTGAATCTTGGAGAGGCGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 640
B   562 tCGGAACTGCCTTTaAtACTgccaatCTaGAgTCcgGaAGAGGtGAGTGGAAcTCCtAGTGTAGAGGTGgAATTCGTAGA 641
Diffs   A             A A   AAAAAA  A  A  AA A     A        A   A            A          
Votes   +             + +   ++++++  +  +  ++ +     +        +   +            +          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   616 TATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCGCTGGACAAGTATTGACGCTGAtGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 695
Q   641 TATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCGCTGGACAAGTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 720
B   642 TATTaGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGgCTCaCTGGtCcgGTAcTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 721
Diffs       A                        A   A    A AA   A         b                        
Votes       +                        +   +    + ++   +         !                        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   696 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTCCGGGTTCATGGAACTTGGGTGGCGCAGCTA 775
Q   721 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTCCGGGTTCATGGAACTTGGGTGGCGCAGCTA 800
B   722 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACtATGAgAgCTAGCcGT-tGGGTggtTtaccacTcaGTGGCGCAGCTA 800
Diffs                                    A    A A     A   A    AAA AAAAAA AA            
Votes                                    +    + +     +        +++ ++++++ ++            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   776 ACGCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGgCCtGCACAAGCGGTG 855
Q   801 ACGCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGACCCGCACAAGCGGTG 880
B   801 ACGCATTAAGcTcTCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGgCCCGCACAAGCGGTG 880
Diffs             A A                                                   N  B            
Votes             + +                                                   0  +            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBB

A   856 GAGCATGTGGTTTAATTCGAaGCAACGCGcAGAACCTTACCAGcgtTTGACATGTCtAGTaTGtTTcCCAGAGATGGgTT 935
Q   881 GAGCATGTGGTTTAATTCGAGGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGCCTTGACATGTCCAGTTTGATTACCAGAGATGGTTT 960
B   881 GAGCATGTGGTTTAATTCGAaGCAACGCGAAGAACCTTACCAGcCCTTGACATG-gCAGgacGATTtCCgGAGAcGGaTT 959
Diffs                       N        B             NBB         aB  aNa B  ?  a    a  ?  
Votes                       0        +             0++          +  !0! +  0  !    !  0  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   936 aCTTCAgTTCGGcTGGCTaGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1015
Q   961 TCTTCACTTCGGGTGGCTGGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1040
B   960 TCTTCACTTC-GGTGaCctGcACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1038
Diffs   B     B     B  a a? a                                                           
Votes   +     +     +  ! !0 !                                                           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1016 AACGAGCGCAACCCTCGTCtTTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGcACTCTAAaGAAACcGCCggTGATAAGccGGAGGAAG 1095
Q  1041 AACGAGCGCAACCCTCGTCCTTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGAACTCTAAGGAAACTGCCTATGATAAGTAGGAGGAAG 1120
B  1039 AACGAGCGCAACCCTCGTtCcTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGcACTCTAgGGAgACTGCCggTGATAAGccGGAGGAAG 1118
Diffs                     aBa                      N      aB  a  B   NN       NN        
Votes                     !+!                      0      !+  !  +   00       00        
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1096 GTGGGGAtGACGTCAAGTCcTCATGGCCCTTACacgCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcgGTGACAgTGaGCAGCtA 1175
Q  1121 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTAGTGACAATGGGCAGCGA 1200
B  1119 GTGGGGAtGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTAtGGgCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTgGTGACAgaGGGCAGCtA 1198
Diffs          N           B            aBBN                         BN      Na B     N 
Votes          0           +            !++0                         +0      0! +     0 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1176 gatCGCgAGatcatGCTAATCtCaAAAAgCcgTCTCAGTTCGGATTGTtCTCTGCAACTCGAGaGCATGAAGgcGGAATC 1255
Q  1201 CCCCGCAAGGGTGAGCTAATCCCCAAAAACTATCTCAGTTCGGATTGTCCTCTGCAACTCGAGGGCATGAAGTTGGAATC 1280
B  1199 gtCCGCgAGGacGtGCTAATCCCaAAAAgCcATCTCAGTTCGGATTGcaCTCTGCAACTCGAGtGCATGAAGTTGGAATC 1278
Diffs   N?B   N  B?NBN       B N    N NB               a?              ?        BB      
Votes   00+   0  +00+0       + 0    0 0+               !0              0        ++      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1256 GCTAGTAATCGcgGATCAGCATGCcgCGGTGAATACGTTCCCaGGcCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1335
Q  1281 GCTAGTAATCGTAGATCAGCATGCTACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1360
B  1279 GCTAGTAATCGcAGATCAGCATGCTgCGGTGAATACGTTCCCGGGcCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1358
Diffs              NB           BN                B  N                                  
Votes              0+           +0                +  0                                  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1336 gaTtcaCCcgAAGgCGcTGcGC------tAAcCcgcaagggaGGCAGgCGaCCACGGtgGGttcagcGACTGGGGTGAAG 1409
Q  1361 TTTCTGCCTTAAGTCGGTGAGC------CAATC--------TGGCAGCCGCCCACGGCAGGGATGATGACTGGGGTGAAG 1426
B  1359 gTTCTaCCcgAAGcCGGTGcGCtaaccgCAAgg--------aaGCAGCCGaCCACGGtAGGGtcancGACTGGGGTGAAG 1430
Diffs   NB BBN  NN   ?  B  N        B  ?a        Na    B  N      NB  BNNN N             
Votes   0+ ++0  00   0  +  0           0          !    +  0      0+  +000 0             
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1410 TCGTAACAAGGTAGCCGTAgg-------------------------- 1430
Q  1427 TCGTAACAAGGTAGCCGTATCGGAAGGTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1473
B  1431 TCGTAACAAGGTAGCCGTAggGGAAccTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1477
Diffs                      NN                          
Votes                      0                           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 94.1%, QB 87.1%, AB 87.2%, QModel 95.4%, Div. +1.3%
Diffs Left 120: N 1, A 0, Y 119 (99.2%); Right 96: N 17, A 45, Y 34 (35.4%), Score 1.0964

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1481 nt) 153164;size=1;
ParentA ( 1463 nt) CS/7000004128331608/Candidatus_Pelagibacter.ubique.HTCC1062
ParentB ( 1474 nt) CS/7000004129372587/Erythrobacter_litoralis.HTCC2594

A     2 GAGTTTGATCaTGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGaAGTAGCAATACTtAGTGGC 81
Q     1 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGCAGTAGCAATACTGAGTGGC 80
B     2 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGaACGCTGGCGGCAtGCCTAACACATGCAAGTCGAACGaAcccttcggggTtAGTGGC 81
Diffs             b            A            A                       N AAAAAAAAAA N      
Votes             !            +            +                       0 ++++++++++ 0      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    82 agACGGGTGAGTAacATGTGGGTATCTaCCcTTTGGccTGGAATAACACGaGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGtCT 161
Q    81 GAACGGGTGAGTATAATGTGGGTATCTGCCTTTTGGTTTGGAATAACACGGGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGCCT 160
B    82 GcACGGGTGcGTAacgcGTGGGaAcCTGCCTTTaGGTTcGGAATAACtCaGaGAAAtTTGaGCTAATACCGGATAAtgtc 161
Diffs   b?       A   NNAA     A A  b  b  A  bbA        A AbA    A   A               A?AA
Votes   !0       +   00++     + +  !  !  +  !!+        + +!+    +   +               +0++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   162 TtACgGaGAAAGcTTTATgCaCCAttgGATGAGCCCGCACTTGATTAGtTtGTTGGTAgGGTAATGGCcTACCAAGaCTa 241
Q   161 TAACAGGGAAAGTTTTATACGCCAAAAGATGAGCCCGCACTTGATTAGCTAGTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCTT 240
B   162 TtcggaccAAAGaTTTAT-CGCCtttAGATGgGCCCGCgtTaGATTAGaTAGTTGGTggGGTAATGGCcTACCAAGtCga 240
Diffs    NAANA?A    ?       b  ANNb    A      AA A      ? b      AN         N       ? AN
Votes    0++0+0+    0       !  +00!    +      ++ +      0 !      +0         0       0 +0
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   242 tGATCAATAGCTGATtTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 321
Q   241 CGATCAATAGCTGATCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 320
B   241 CGATCtATAGCTGgTCTGAGAGGATGATCAGCCACAcTGGGACTGAGACACGGCCCAgACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 320
Diffs   b    A       A b                    A                    A                      
Votes   !    +       + !                    +                    +                      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   322 GGGAATCTTGCACAATGGaGGAAACtCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGGTTGTAAAGCTCTTT 401
Q   321 GGGAATCTTGCACAATGGGGGAAACCCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGGTTGTAAAGCTCTTT 400
B   321 GGGAATaTTGgACAATGcGGGAAACCgTGATcCAGCaATGCCGCGTGAGTGAtGAAGGCCTTaGGGTTGTAAAGCTCTTT 400
Diffs         A   A      Ab      bA    A    A               A         A                 
Votes         +   +      +!      !+    +    +               +         +                 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   402 CGTCGGGGAAGAAAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGAC 481
Q   401 CGTCGGGGAAGAAAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGAC 480
B   401 tacCaGGGAtGAtAATGACaGTACCtGgAgAAtAAGcTCCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGgAGGGAg 480
Diffs   AAA A    A  A      A     A A A  A   A           A                        A     A
Votes   +++ +    +  +      +     + + +  +   +           +                        +     +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   482 CTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGtTCGTAGGTGGTTgAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAgaGCTTAACt 561
Q   481 CTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGCTCGTAGGTGGTTAAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAAGGCTTAACC 560
B   481 CTAGCGTtGTTCGGAATTACTGGGCgTAAAGcGCgCGTAGGcGGcTAtttAAGTcaGgGGTGAAATCCCggGGCTcAACC 560
Diffs          A                 A     A bA      A  A bAAA    AA A           ANb   A   b
Votes          +                 +     + !+      +  + !+++    ++ +           +0!   +   !
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   562 cTGGAACTGCCatCAAAACTTTTcagCTAGAGTATGATAGAGGAAAGcaGAATTTCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 641
Q   561 TTGGAACTGCCCCCAAAACTTTTTGACTAGAGTATGATAGAGGAAAGTGGAATTTCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 640
B   561 ccGGAACTGCCtttgAAACTggaTagCTAGAaTcctggAGAGGcgAGTGGAATTcCgAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 640
Diffs   NA         ?NAA     AAAbNN     A AAAAA     AA  bb     A A                       
Votes   0+         00++     +++!00     + +++++     ++  !!     + +                       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   642 TATTAGAAAGAAtACCaAtTGCGAAGGCAgCTTTCTGGATCATtACTGACACTGAGGAaCGAAAGCATGGGTAGCGAAGA 721
Q   641 TATTAGAAAGAACACCGAATGCGAAGGCAACTTTCTGGATCATAACTGACACTGAGGAGCGAAAGCATGGGTAGCGAAGA 720
B   641 TATTcGgAAGAACACCagtgGCGAAGGCgACTcgCTGGAcaggtAtTGACgCTGAGGtGCGAAAGCgTGGGgAGCaAAcA 720
Diffs       A A     b   NANA        Ab  AA     AAAAN A    A      Ab       A    A   A  A 
Votes       + +     !   0+0+        +!  ++     ++++0 +    +      +!       +    +   +  + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   722 GGATTAGATACCCTCGTAGTCCATGCCGTAAACGATGTGTGtTAGACGTTGGaAAT--TTATTT-TCAGTGTCGCAGggA 798
Q   721 GGATTAGATACCCTCGTAGTCCATGCCGTAAACGATGTGTGCTAGACGTTGGGAAT--TTATTTCTCAGTGTCGCAGCAA 798
B   721 GGATTAGATACCCTgGTAGTCCAcGCCGTAAACGATGataaCTAGctGTccGGgcTcaTagagctTggGTGgCGCAGCtA 800
Diffs                 A        A             AAAAb   AA  AA bAA    AAAAA  AA   A     b? 
Votes                 +        +             ++++!   ++  ++ !++    ++++   ++   +     !0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   799 AAcCGaTAAaCACACCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGACCCGCACAaGTAGTG 878
Q   799 AAGCGTTAAGCACACCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGACCCGCACAGGTAGTG 878
B   801 AcGCaTTAAGttatCCGCCTGGGGAGTACGgtCGCAAGaTTAAAACTCAAAgGAATTGACGGGGgCCtGCACAaGcgGTG 880
Diffs    Ab Ab   bAAAA                AA      A            A            A  A     N AA   
Votes    +! +!   !++++                ++      +            +            +  +     0 ++   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   879 GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGCAGAACCTTACCAACACTTGACATGTTCGTCGCGACTCTAAGAGATTAGAG 958
Q   879 GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGATACGCGCAGAACCTTACCAACACTTGACATGTTCGTCGCGACTCTAAGAGATTAGAG 958
B   881 GAGCATGTGGTTTAATTCGAAGcaACGCGCAGAACCTTACCAgCctTTGACATccTaGgacgGttTCT-gGAGAcagatt 959
Diffs                         AA                  A AA       AA A AAAA AA    A    AAAAAA
Votes                         ++                  + ++       ++ + ++++ ++         ++++++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   959 TtTTCGGTTCGGCCGGACGAAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1038
Q   959 TCTTCGGTTCGGCCGGACGAAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1038
B   960 cCTTCccTTCGG-gGacCtAgtgACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGC 1038
Diffs   Ab   AA      A AA A AAA                                                         
Votes   +!   ++        ++ + +++                                                         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1039 AACGAGCGCAACCCTCACTTTTAGTTGCcAtCATTaAGTTGGGCACTCTgAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGAGGAAG 1118
Q  1039 AACGAGCGCAACCCTCACTTTTAGTTGCTACCATTTAGTTGGGCACTCTAAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGAGGAAG 1118
B  1039 AACGAGCGCAACCCTCgtccTTAGTTGCcAtCATTcAGTTGGGCACTtTAAggaAACTGCCgGTGATAAGCcGGAGGAAG 1118
Diffs                   AAAA        N N    ?           A b AAA       A         A        
Votes                   ++++        0 0    0           + ! +++       +         +        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1119 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcAtCTACAAcagGAAGCaA 1198
Q  1119 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTACCTACAATGAGAAGCTA 1198
B  1119 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACagGcTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcAtCTACAgTGAGcAGCgA 1198
Diffs                                    AA A                        N N     Abbb A   ? 
Votes                                    ++ +                        0 0     +!!! +   0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1199 AacGGCAACgtTAAGCAAATCCCgAAAAGaTgCCTCAGTTCGGATTGcACTCTGCAACTCGAGTgCATGAAGCTGGAATT 1278
Q  1199 AGAGGCAACTCTAAGCAAATCCCAAAAAGGTACCTCAGTTCGGATTGTACTCTGCAACTCGAGTACATGAAGCTGGAATT 1278
B  1199 tcccGCgAgggTtAGCtAATCtCcAAAAGaTgtCTCAGTTCGGATTGTtCTCTGCAACTCGAGagCATGAAGgcGGAATc 1278
Diffs   A?NA  A AN? A   A    A ?     N NA              bA              AN       AA     A
Votes   +00+  + +00 +   +    + 0     0 0+              !+              +0       ++     +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1279 ACTAGTAATCGTGGATCAGCGtGCCACGGTGAATgCGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1358
Q  1279 ACTAGTAATCGTGGATCAGCGCGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1358
B  1279 gCTAGTAATCGcGGATCAGCatGCCgCGGTGAATACGTTCCCaGGcCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1358
Diffs   A          A        AN   A        b       A  A                                  
Votes   +          +        +0   +        !       +  +                                  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAx

A  1359 GtTctACCttAAGGcaagGtttTAAaCccTT-----------gACCACGGTatagTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAAC 1427
Q  1359 GATTCACCCGAAGGTGGTGCGCTAACCTTTTAGGAGGCAGCCAACCACGGTGGGTTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAAC 1438
B  1359 GATTCACCCGAAGGTGGTGCGCTAACCTTTTAGGAGGCAGCCAACCACGGTGGGTTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGTAAC 1438
Diffs    B BB   BB    BBBB BBB   B BB             B        BBBB                         
Votes    + ++   ++    ++++ +++   + ++                      ++++                         
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1428 AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATtACCT------- 1463
Q  1439 AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT 1481
B  1439 AAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCT------- 1474
Diffs                                  B           
Votes                                  +           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 93.1%, QB 82.5%, AB 80.6%, QModel 94.5%, Div. +1.5%
Diffs Left 293: N 37, A 45, Y 211 (72.0%); Right 20: N 0, A 0, Y 20 (100.0%), Score 1.0698

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1456 nt) 335598;size=1;
ParentA ( 1463 nt) CS/7000004128331608/Candidatus_Pelagibacter.ubique.HTCC1062
ParentB ( 1474 nt) CS/7000004129372587/Erythrobacter_litoralis.HTCC2594

A     1 AGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGTAGCAATACTTAGTGG 80
Q     1 AGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAGTAGCAATACTTAGTGG 80
B     1 AGAGTTTGATCcTGGCTCAGAACGaACGCTGGCGGCAtGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAAcccttcggggTTAGTGG 80
Diffs              A            A            A                         AAAAAAAAAA       
Votes              +            +            +                         ++++++++++       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    81 CAGACGGGTGAGTAACATGTGGGTATCTaCCCTTTGGCCTGGAATAACACGAGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGTC 160
Q    81 CAGACGGGTGAGTAACATGTGGGTATCTGCCCTTTGGCCTGGAATAACACGAGGAAACTTGTGCTAATACCGGATAAGTC 160
B    81 CgcACGGGTGcGTAACgcGTGGGaAcCTGCCtTTaGGttcGGAATAACtCagaGAAAtTTGaGCTAATACCGGATAAtgt 160
Diffs    AA       A     AA     A A  b  A  A  AAA        A AAA    A   A               AAA
Votes    ++       +     ++     + +  !  +  +  +++        + +++    +   +               +++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   161 TTTACGGAGAAAGCTTTATGCACCATTGGATGAGCCcGCACTTGATTAGTTtGTTGGTAGGGTAAtgGCCTACCAAGACT 240
Q   161 TTTACGGAGAAAGCTTTATGCACCATTGGATGAGCCTGCACTTGATTAGTTAGTTGGTAGGGTAAAAGCCTACCAAGACT 240
B   161 cTTcgGaccAAAGaTTTAT-CgCCtTTaGATGgGCCcGCgtTaGATTAGaTAGTTGGTgGGGTAAtgGCCTACCAAGtCg 239
Diffs   A  AA AAA    A       A  A  A    A   N  AA A      A b      A      NN          A A
Votes   +  ++ +++    +       +  +  +    +   0  ++ +      + !      +      00          + +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   241 aTGATCAATAGCTGATTTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGT 320
Q   241 TTGATCAATAGCTGATTTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGT 320
B   240 acGATCtATAGCTGgTcTGAGAGGATGATCAGCCACAcTGGGACTGAGACACGGCCCAgACTCCTACGGGAGGCAGCAGT 319
Diffs   NA    A       A A                    A                    A                     
Votes   0+    +       + +                    +                    +                     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   321 GGGGAATCTTGCACAATGGAGGAAACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCtTTGGGTTGTAAAGCTCTT 400
Q   321 GGGGAATCTTGCACAATGGAGGAAACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCCTTGGGTTGTAAAGCTCTT 400
B   320 GGGGAATaTTGgACAATGcgGGAAACcgTGATcCAGCaATGCCGCGTGAGTGAtGAAGGCCtTaGGGTTGTAAAGCTCTT 399
Diffs          A   A      AA      AA    A    A               A       N A                
Votes          +   +      ++      ++    +    +               +       0 +                
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   401 TCGTCGGGGAAGAAAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGA 480
Q   401 TCGTCGGGGAAGAAAATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGA 480
B   400 TtacCaGGGAtGAtAATGACaGTACCtGgAgAAtAAGcTCCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGgAGGGA 479
Diffs    AAA A    A  A      A     A A A  A   A           A                        A     
Votes    +++ +    +  +      +     + + +  +   +           +                        +     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   481 CCTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCtTAAAGAGTtcGTAGGtGGtTgaAaAAGTTggTgGTGAAAtCCCAgAGCTTAAC 560
Q   481 CCTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGAGTATGTAGGCGGCTAGATAAGTTAATTGTGAAAGCCCAAAGCTTAAC 560
B   480 gCTAGCGTtGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGcGcgcGTAGGCGGCTAttTAAGTcAgggGTGAAAtCCCgggGCTcAAC 559
Diffs   A                         B     a a?N     B  B B?aB    aBNaN      N   aNa   a   
Votes   +                         +     ! !00     +  + +0!+    !+0!0      0   !0!   !   
Model   AAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   561 TcTGGAAcTGCcATcAAAACTtTTcAGCTAGAGTATGATAGAGGAAAGCaGAATttcTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAG 640
Q   561 TTTGGAATTGCAATTAAAACTATTTAGCTAGAGTATGATAGAGGAAAGCGGAATACATAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAG 640
B   560 cccGGAAcTGCctTTgAAACTggaTAGCTAGAaTcctggAGAGGcgAGtGGAATtCcgAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAG 639
Diffs   aNa    N   Na Ba     ?aaB       a aaaaa     aa  aB    NBNa                      
Votes   !0!    0   0! +!     0!!+       ! !!!!!     !!  !+    0+0!                      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   641 ATATTaGaAAGAAtACCAaTtGCGAAGGCagCTttCTGGAtcatTAcTGACaCTGAGGaaCGAAAGCaTGGGtAGCgAAg 720
Q   641 ATATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCACTGGACAGGTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAAC 720
B   640 ATATTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCgCTGGACAGGTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAAC 719
Diffs        B B     B    B B        BB  B?     BBBB  B    B      BB       B    B   B  B
Votes        + +     +    + +        ++  +0     ++++  +    +      ++       +    +   +  +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   721 AGGATTAGATACCCTcGTAGTCCAtGCCGTAAACGATGtgtgtTAGacGTT---GgaaATttAttTTcAGTGtCGCAGgg 797
Q   721 AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTTCGGGTTCATAGAACTTGAGTGGCGCAGCT 800
B   720 AGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTcCGGGcTCATAGAgCTTGgGTGGCGCAGCT 799
Diffs                  B        B             BBBBB   BB  a    ?BB  BB ?B  Ba   B     BB
Votes                  +        +             +++++   ++       0++  ++ 0+  +!   +     ++
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   798 AAacCgaTAAacacaCCGCCTGGGGAGTACGacCGCAAGgTTAAAACTCAAAtGAATTGACGGGGaCCcGCACAAGtaGT 877
Q   801 AACGCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGT 880
B   800 AACGCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGT 879
Diffs     BB BB   BBBBB                BB      B            B            B  B       BB  
Votes     ++ ++   +++++                ++      +            +            +  +       ++  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   878 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGatACGCGCAGAACCTTACCAaCacTTGACATgttcgTCGCGAcTctaAGAGATtaga 957
Q   881 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCGTTTGACATCCCGATCGCGATTACCAGAGATGGTT 960
B   880 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCcTTTGACATCC-tAggaCGgTTtCtgGAGAcaGaT 958
Diffs                          BB                  B ?B       BB ?Baaa  aB ?B?a    a?B?B
Votes                          ++                  + 0+       +   +!!!  !+ 0+0!    !0+0+
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   958 gTtTTCgGTTcGGCcGGAcgaaacACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1037
Q   961 TTCTTCAGTTAGGCTGGATCGGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1040
B   959 TcCTTCccTTcGG-gGacctaGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1037
Diffs   BaB   ?a  N   ? aaN?NBBB                                                        
Votes   +!+   0!  0     !!000+++                                                        
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1038 CAACGAGCGCAACCCTCacttTTAGTTgCCATCATTaAGTTGGGcACTCTgAaagAACtGCCaGTGATAAGCtGGAGGAA 1117
Q  1041 CAACGAGCGCAACCCTCGTCCTTAGTTACCATCATTTAGTTGGGAACTCTAAGGAAACCGCCGGTGATAAGCCGGAGGAA 1120
B  1038 CAACGAGCGCAACCCTCGTCCTTAGTTgCCATCATTcAGTTGGGcACTtTAAGGAAACtGCCGGTGATAAGCCGGAGGAA 1117
Diffs                    BBBB      N        ?       N   a B BBB   N   B         B       
Votes                    ++++      0        0       0   ! + +++   0   +         +       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1118 GGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACgtGtTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAtCTACAacagGaAGCa 1197
Q  1121 GGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACACGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAACTACAGTGAGCAGCG 1200
B  1118 GGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACAgGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCAtCTACAGTGAGCAGCG 1197
Diffs                                     B? B                          N     BBBB B   B
Votes                                     +0 +                          0     ++++ +   +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1198 AaaCgGCaAcGttaAGCaAATCcCgAAAAGaTGcCTCAGTTCGGATTGcaCTCTGCAACTCGAGtGCATGAAGctGGAAT 1277
Q  1201 ATCCCGCGAGGGCTAGCTAATCTCCAAAAGTTGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGCGGAAT 1280
B  1198 ATCCCGCGAGGGtTAGCTAATCTCCAAAAGaTGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGCGGAAT 1277
Diffs    BB B  B B BNB   B    B B     N  B              BB              B        BB     
Votes    ++ +  + + +0+   +    + +     0  +              ++              +        ++     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1278 taCTAGTAATCGtGGATCAGCgTGCCaCGGTGAATgCGTTCCCgGGtCTTGTACACACCGCCCGTCACaCCATGGGAGTT 1357
Q  1281 CGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACGCCATGGGAGTT 1360
B  1278 CGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACaCCATGGGAGTT 1357
Diffs   BB          B        B    B        B       B  B                     N           
Votes   ++          +        +    +        +       +  +                     0           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1358 GGTTctACCttAAGGcaagGtttTAA--------------aCccttgACCACGGTatagTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG 1423
Q  1361 GGTTTCACCCGAAGGTGGTGCGCTAACCTAGCAATAGGAGGCAGCCAACCACGGTGGGATCAGCGACTGGGGTGAAGTCG 1440
B  1358 GGaTTCACCCGAAGGTGGTGCGCTAACCT---ttTAGGAGGCAGCCAACCACGGTGGGtTCAGCGACTGGGGTGAAGTCG 1434
Diffs     a BB   BB    BBBB BBB                 B BBBBB        BBB?                     
Votes     ! ++   ++    ++++ +++                   +++++        +++0                     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1424 TAACAAGGTAgCCGTA 1439
Q  1441 TAACAAGGTAACCGTA 1456
B  1435 TAACAAGGTAgCCGTA 1450
Diffs             N     
Votes             0     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 86.8%, QB 88.4%, AB 80.1%, QModel 94.1%, Div. +6.5%
Diffs Left 91: N 2, A 5, Y 84 (92.3%); Right 217: N 38, A 38, Y 141 (65.0%), Score 1.0414

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1358 nt) 206567;size=1;
ParentA ( 1534 nt) CS/7000004128331637/Candidatus_Ruthia.magnifica.str..Cm.(Calyptogena.magnifica)
ParentB ( 1466 nt) CS/S000000445/Photobacterium_leiognathi.(T)

A     2 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAtTGAACGCTggcgGTATGCTTaACACATGCaAGTcGaacggaaACGATActAgTTTAcTa 81
Q     1 GAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTATTAGTATGCTTTACACATGCGAGTTG------TACGATAAAATTTTAATT 74
B     7 GAGTTTGATCaTGGCTCAGAtTGAACGCTggcgGcAgGCcTaACACATGCaAGTcG------agCGgcAgcgacTTAAcT 80
Diffs             A         N        NNNN A A  A N        N   N       NA  AA ??A?A   bAb
Votes             +         0        0000 + +  + 0        0   0        +  ++ 00+0+   !+!
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    82 gTAggcgtcga------------------------GTgGCGgACGGGTGAgcAAcgCGTAggAatcTgCCTgataagtgg 137
Q    75 TTA------TC------------------------GTAGCGAACGGGTGAAAAAAACGTAAAACGTTACCT--------- 115
B    81 gaA------cCttcggggaacgttaagggcggcgaGcgGCGgACGGGTGAgtAAtgCcTgggAataTgCCc--------- 145
Diffs   NA       ?b                         AN   N        N?  ?N A ANN NN? N  A         
Votes   0+                                  +0   0        00  00 + +00 000 0            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   138 gggatagcccgaagaaaTTcgGATTAaTAcc---------------gcatAATcTctAcggAgcaaagGaGgccTcTaTT 202
Q   116 -----------------TTTAGATTAGTATA---------------AACAAATATAAAATTATTTTTTGTGAAATTTGTT 163
B   146 -----------------TgatGtgggGgATAactattggaaacgatAgCtAATAccgcATaATcTcTTcgGAgcaaaGag 208
Diffs                     A?? AAAAbA bb               b?bN   bAN?Abb? bNb?bbA? b?NA?AbAA
Votes                     +00 ++++!+ !                 0!0   !+00+!!0 !0!0!!+0 !00+0+!++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   203 tATAtgctttcgCTAtcAGATgagccTGCGTAA----------------GATTAGcTaGTTGGTgAggTaAaAGcTTACC 266
Q   164 AATA--------CTAAAAGATACTTTTGCGTAA----------------GATTAGGTTGTTGGTAATTTTATAGATTACC 219
B   209 gggg--------accttcGggcCTcTcGCGTcAggattagcccaggtggGATTAGcTTGTTGGTgAggTaATgGcTcACC 280
Diffs   ?AAA        AAAN?A AA?bbNbA    A                       N b      N NN N bA N A   
Votes   0++          ++00+ ++0!!0!+    +                       0 !      0 00 0 !+ 0 +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   267 AAGgCaACGATCTTTAGcTGGTCTgAGAGGATGATCAgCCACACTGGAACTGAGACAcGGTcCAGaCTccTacgggAGgC 346
Q   220 AAGCCGACGATCTTTAGTTGGTCTTAGAGGATGATCAACCACACTGGAACTGAGACAAGGTTCAGGCTATT-----AGCC 294
B   281 AAGgCaACGATCccTAGcTGGTCTgAGAGGATGATCAgCCACACTGGAACTGAGACAcGGTcCAGaCTccTacgggAGgC 360
Diffs      N N      AA   N      N            N                   N   N   N  NN        N 
Votes      0 0      ++   0      0            0                   0   0   0  00        0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   347 AGCAGTGgGGAATATTGGACAATGggCGCAAGccTGATCCAGCAATACcgcgTGtgTGAaGAaGGcCTgagGGTTGTAAA 426
Q   295 AGCAGTGAGGAATATTGGACAATGAACGCAAGTTTGATCCAGCAATACTAGTTGAATGATGACGG-CTTTTGGTTGTAAA 373
B   361 AGCAGTGgGGAATATTGcACAATGgggGaAAcccTGATgCAGCcATgCcgcgTGtATGAaGAaGGcCTTcgGGTTGTAAA 440
Diffs          N         A      NNA A  ANN    A    A  A NNNN  Nb   N  N     b?N         
Votes          0         +      00+ +  +00    +    +  + 0000  0!   0  0     !00         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   427 GcaCTTTCaaTtAggAaGA-------------------------aAAactaatggttaatacccattagtctTGACgTTA 481
Q   374 GTTCTTTCGTTAAAAATGA-------------------------TAA-------------------------TGACATTA 403
B   441 GTaCTTTCagTAgggAgGAaggcagtgtcgttaatagcggcattgtt-------------------------TGACgTTA 495
Diffs    bN     N? bANN ?                           ?AA                             N   
Votes    !0     00 !+00 0                            +                              0   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   482 cTTttAGAAGaAGcaCCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCaAGCGTTAATCGGAATTACTGG 561
Q   404 TTTAAAGAAG-AGTCCCGGCTAACT-CGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGG 481
B   496 ccTAcAGAAGaAGcaCCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCGAGCGTTAATCGGAATTACTGG 575
Diffs   NA b?         N                                           B                     
Votes   0+ !0         0                                           +                     
Model   AAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   562 GCGTAAAGCGtgcGtAGGtGGTtTGTTAAGttAGATGTGAAAGCCCcGGGCTCAACCTgGGAACtGCATTTgaAACTGGC 641
Q   482 GCGTAAAGCGCATGCAGGCGGTCTGTTAAGCAAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGGAACAGCATTTTGAACTGGC 561
B   576 GCGTAAAGCGCATGCAGGCGGTCTGTTAAGCAAGATGTGAAAGCCCGGGGCTCAACCTCGGAACAGCATTTTGAACTGGC 655
Diffs             BBB B   B   B       BB              B           B     B      BB       
Votes             +++ +   +   +       ++              +           +     +      ++       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   642 AaACTAGAGTaTaGgAGgGGaaaGTgGAATTTCtGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAtATCaGAAGGAAcAtCaaTGGCG 721
Q   562 AGACTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCG 641
B   656 AGACTAGAGTCTTGTAGAGGGGGGTAGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATCTGAAGGAATACCGGTGGCG 735
Diffs    B        B B B  B  BBB  B       B                       B   B       B B BB     
Votes    +        + + +  +  +++  +       +                       +   +       + + ++     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   722 AAGGCaGCtttCTGGAC-AAatACTGACaCTgAGgTaCGAAAGCGTGGGtAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 800
Q   642 AAGGCGGCCCCCTGGAC-AA-GACTGACGCTCAGATGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 719
B   736 AAGGCGGCCCCCTGGACaAA-GACTGACGCTCAGATGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCC 814
Diffs        B  BBB          B      B  B  B B            B                              
Votes        +  +++                 +  +  + +            +                              
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   801 ACGCCGTAAACGATGataACTaGccGtTgGgGGgaagtgcCCtTtagTggCGaAGCTAACGCGTTAAGTtatCCGCCTGG 880
Q   720 ACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGG 799
B   815 ACGCCGTAAACGATGTCTACTTGGAGGTTGTGGCCTTGAGCCGTGGCTTTCGGAGCTAACGCGTTAAGTAGACCGCCTGG 894
Diffs                  BBB   B BB B B B  BBBBBBB  B BBB BB  B                BBB        
Votes                  +++   + ++ + + +  +++++++  + +++ ++  +                +++        
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   881 GGAGTACGacCGCAAGgTTAAAACTCAAAgGAATTGACGGGGaCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATG 960
Q   800 GGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATG 879
B   895 GGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGnCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAnG 974
Diffs           BB      B            B            B                                     
Votes           ++      +            +            +                                     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   961 CAACGCGAAGAACCTTACCTggTCTTGACATatcGcaAACTTttCAGAGATGgagaGGTGCCTTCGGGAAtgCgaAtACA 1040
Q   880 CAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTAGCAGAGATGCTTTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACA 959
B   975 CAACGCGAAGAACCTTACCTACTCTTGACATCCAGAGAACTTtcCAGAGATGCaTTGGTGCCTTCGGGAACTCTGAGACA 1054
Diffs                       BB         BBB BB     N?        BNBB              BB BB B   
Votes                       ++         +++ ++     00        +0++              ++ ++ +   
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1041 GGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTcGTGAgATGTTGGGTTAAGTCCCGtAACGAGCGCAACCCTTATCCTTaTTT 1120
Q   960 GGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTGTTT 1039
B  1055 GGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTGTTT 1134
Diffs                                B    B                  B                      B   
Votes                                +    +                  +                      +   
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1121 GCCAGtACgTCatGGTGGGAACTatAaGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGcGGGGACGACGTCAAGTCATCAT 1200
Q  1040 GCCAGCACTTC-GGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCAT 1118
B  1135 GCCAGCACTTC-GGGTGGGAACTCCAGGGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTCATCAT 1213
Diffs        B  B   B          BB B                              B                      
Votes        +  +              ++ +                              +                      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1201 GGCCCTTACGAccAGGGCTACACACGTGCTACAATGGgaaggACAaAGGGtcGCtAAgcCGtGAGgtaGtGCtAATCtCA 1280
Q  1119 GGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAGGGCTGCCAACTCGCGAGAGTGAGCGAATCCCA 1198
B  1214 GGCCCTTACGAGTAGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGTATACAGAGGGCTGCCAACTCGCGAGAGTGAGCGAATCCCA 1293
Diffs              BB                        BBBBB   B    BB  B  BB  B   BBB B  B    B  
Votes              ++                        +++++   +    ++  +  ++  +   +++ +  +    +  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1281 cAAAtctttTCGTAGTCCGGATcGGAGTCTGCAACTCGACTCCgTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTagATCAGAAcG 1360
Q  1199 GAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATG 1278
B  1294 GAAAGTACGTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGTGAATCAGAATG 1373
Diffs   B   BBBBB             B                    B                         BB       B 
Votes   +   +++++             +                    +                         ++       + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1361 ctACGGTGAATACGTTCCCGGGtCTTGTACACACCGCCCGTCAtACCATGGGAGTGGGtTGCACCAGAAGTAGcTAGtcT 1440
Q  1279 TCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCACCAGAAGTAGATAGCTT 1358
B  1374 TCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGCTGCACCAGAAGTAGATAGCTT 1453
Diffs   BB                    B                    B              B              B   BB 
Votes   ++                    +                    +              +              +   ++ 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 81.3%, QB 89.4%, AB 82.2%, QModel 91.4%, Div. +2.2%
Diffs Left 158: N 24, A 84, Y 50 (31.6%); Right 142: N 1, A 5, Y 136 (95.8%), Score 0.9784

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1479 nt) 152590;size=1;
ParentA ( 1444 nt) CS/S000429252/Erythrobacter_citreus.(T)
ParentB ( 1472 nt) CS/7000004131495658/Magnetospirillum_magneticum.AMB-1

A     1 ------------------AACGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAACCCTTCGGGGTgAGTGGCG 62
Q     1 AGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAACCCTTCGGGGTTAGTGGCG 80
B     3 AGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAgGCtTAACACATGCAAGTCGAACGAAgtCTTCGGacTTAGTGGCG 82
Diffs                                      A  A                      AA      AA b       
Votes                                      +  +                      ++      ++ !       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    63 CACGGGTGCGTAACGCGTGGGAACCTGCCTTTAGGTTCGGAATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATACCGGATAATGTyT 142
Q    81 CACGGGTGCGTAACGCGTGGGAACCTGCCTTTAGGTTCGGAATAACAGTTAGAAATGACTGCTAATACCGGATAATGTCT 160
B    83 CACGGGTGaGTAACaCGTGGGAAtaTaCCTcTtGGTggGGAATAACAtcggGAAActgaTGCTAATACCGcATAcgccCT 162
Diffs           A     A        AA A   A A   AA         AAAA    AAAA           A   AAAA  
Votes           +     +        ++ +   + +   ++         ++++    ++++           +   ++++  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   143 TCGGACCAAAGATTTATcGCCTTTAGATGGGCCCGCGTTaGATTAGATAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGTCGACG 222
Q   161 TCGGACCAAAGATTTATTGCCTTTAGATGGGCCCGCGTTGGATTAGATAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGTCGACG 240
B   163 TCGGgggAAAGATTTATcGCCgagAGATtaGCCCGCGTccGATTAGcTAGTTGGTGaGGTAATGGCtcACCAAGgCGACG 242
Diffs       AAA          N   AAA    AA        A?      A         A         AA      A     
Votes       +++          0   +++    ++        +0      +         +         ++      +     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   223 ATytATAGCTGGTyTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGG 302
Q   241 ATCCATAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGG 320
B   243 ATCggTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGG 322
Diffs      ?A                                                                           
Votes      0+                                                                           
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   303 GAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTA 382
Q   321 GAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTTA 400
B   323 GAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCcATGCCGCGTGAGTGATGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCTCTTTcA 402
Diffs                                     A                                           A 
Votes                                     +                                           + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   383 CCAGGGATGATAATGACAGTACCTGGAGAATAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGAGCT 462
Q   401 CCAGGGATGATAATGACAGTACCTGGAGAATAAGCTCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGAGCT 480
B   403 CCcacGAcGATgATGACgGTAgtgGGAGAAgAAGCcCCGGCTAACTtCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGaAGGGgGCT 482
Diffs     AAA  A   A     A   AAA      A    A          A                        A    A   
Votes     +++  +   +     +   +++      +    +          +                        +    +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   463 AGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCtTTTCAAGTCAGGGGTGAAATCCCGGGGCTCAACCCC 542
Q   481 AGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGTAGGCGGCCTTTCAAGTCAGGGGTGAAATCCCGGGGCTCAACCCC 560
B   483 AGCGTTGTTCGGAATTACTGGGCGTAAAGCGCACGcAGGCGGtggTcatAGTCAGaaGTGAAAgCCCtGGGCTCAACCCg 562
Diffs                                      A      A?A AAA      AA      A   A           A
Votes                                      +      +0+ +++      ++      +   +           +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   543 GGAACTGCCCTTGAAACTGGATGGCTAGAATACTGGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATA 622
Q   561 GGAACTGCCCTTGAAACTGGATGGCTAGAATACTGGAGAGGTGAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATA 640
B   563 GGAAtTGCttTTGAtACTGGAccGCTAGAATcacGGAGAGGgtAGTGGAATTCCGAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATA 642
Diffs       A   AA    A      AA        AAA       AA                                     
Votes       +   ++    +      ++        +++       ++                                     
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   623 TTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCACTGGACAGTTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG 702
Q   641 TTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTCACTGGACAGTTATTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG 720
B   643 TTCGGAAGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTacCTGGcCgtcgATTGACGCTcAtGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGG 722
Diffs                                 AA    A AAAA         A A                          
Votes                                 ++    + ++++         + +                          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   703 ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTCCGGGCTCATGGAGCTTGGGTGGCGCAGCTAAC 782
Q   721 ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGATAACTAGCTGTCCGGGCTCATGGAGCTTGGGTGGCGCAGCTAAC 800
B   723 ATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAgtgCTAGtTGTtgGGGtgCATGcA-CcTcaGTGaCGCAGCTAAC 801
Diffs                                       AAA    A   AA   AA    A   A AA   A          
Votes                                       +++    +   ++   ++    +   + ++   +          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   783 GCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGA 862
Q   801 GCATTAAGTTATCCGCCTGGGGAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCTGCACAAGCGGTGGA 880
B   802 GCgTTAAGcacTCCGCCTGGGGAGTACGGcCGCAAGgTTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCcGCACAAGCGGTGGA 881
Diffs     A     AAA                  A      A                            A              
Votes     +     +++                  +      +                            +              
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   863 GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCTTTGACATCCTAGGACGgtTTCTGGAGACAGA---TT 939
Q   881 GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCTTTGACATCCTAGGACGACTTCTGGAGACAGA---TT 957
B   882 GCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCCcTTGACAT---gGGACGtaTgtTtGccAgAGAtggTg 958
Diffs                                              A          A     ?? AA A AA A       A
Votes                                              +                00 ++ + ++ +       +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   940 cCTTCCCTTCGGGGACCTAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCA 1019
Q   958 TCTTCCCTTCGGGGACCTAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCA 1037
B   959 aCTTgtCTTCGGacgCgTccacACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCA 1038
Diffs   ?   AA      AAA A AAAA                                                          
Votes   0   ++      +++ + ++++                                                          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A  1020 ACGAGCGCAACCCTCGTCCTTAGTTGCCAtCA-TTCaGtTGGGCACTtTAAGGAAACTGCCGGTGATAAGCcGGAGGAAG 1098
Q  1038 ACGAGCGCAACCCTCGTCCTTAGTTGCCAGCAGTTCGGCTGGGCACTCTAAGGAAACTGCCGGTGATAAGCTGGAGGAAG 1117
B  1039 ACGAGCGCAACCCTCaTCtTcAGTTGCCAtCA-TTtaGtTGGGCACTCTgAaGAAACTGCCGGTGAcAAGCcGGAGGAAG 1117
Diffs                  A  A A        N      N N        B a a              a    N        
Votes                  +  + +        0      0 0        + ! !              !    0        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1099 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACaGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCatcTACAgTGaGcaGCGA 1178
Q  1118 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTTACAATGGGACGCGA 1197
B  1118 GTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGtGGTgACAgTGGGtCGCtA 1197
Diffs                                    B                           aBBBa   N  B ?B  a 
Votes                                    +                           !+++!   0  + 0+  ! 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1179 tcccGCgAgggttAGCTAATCtCCAAAAgatGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGgCGGAATC 1258
Q  1198 ATGGGCAACCTGGAGCTAATCCCCAAAAACCGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGTCGGAATC 1277
B  1198 ActcGCgAgagtatGCTAATCCCtAAAAgCCaTCTCAGTTCGGATTGcaCTCTGCAACTCGAGtGCATGAAGTCGGAATC 1277
Diffs   BN?N  N N?NN?a       B a    NBBa               aa              a        B       
Votes   +000  0 00000!       + !    0++!               !!              !        +       
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1259 GCTAGTAATCGcGGATCAGCATGCCgCGGTGAATACGTTCCCaGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1338
Q  1278 GCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1357
B  1278 GCTAGTAATCGTGGATCAGCATGCCACGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTG 1357
Diffs              B             B                B                                     
Votes              +             +                +                                     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1339 GaTtcACCCGAAGgtGGTGCGCTAACCagtttactGGAGGCAGCCaACCACGGTgGGtTcAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1418
Q  1358 GTTCTACCCGAAGCCGGTGCGCTAACC----GCAAGGAGGCAGCCGACCACGGTAGGATTAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1433
B  1358 GcTtTACCCGAAGCCGGTGCGCTAACC----GCAAGGAGGCAGCCGACCACGGTAaGgTcAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1433
Diffs    ? NB        BB                BBBB          B        Ba ? N                    
Votes    0 0+        ++                 +++          +        +! 0 0                    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1419 AACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGC-------------------- 1444
Q  1434 AACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCTCCTTTCT 1479
B  1434 AACAAGGTAGCCGTAGGGGAACCTGCGGCTGGATCACCT------- 1472
Diffs                                                 
Votes                                                 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 96.4%, QB 87.9%, AB 87.2%, QModel 97.1%, Div. +0.8%
Diffs Left 142: N 1, A 9, Y 132 (93.0%); Right 55: N 13, A 19, Y 23 (41.8%), Score 0.8022

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1478 nt) 337387;size=1;
ParentA ( 1399 nt) CS/S000383917/Reichenbachiella_agariperforans.(T)
ParentB ( 1463 nt) CS/7000004128331608/Candidatus_Pelagibacter.ubique.HTCC1062

A     1 ------------------------------------------aATACATGCAAGTCGA--GGGGCAGCAcgagtactTgT 36
Q     1 AGGGTTTGATCATGGCTCAGGATGAACGCTAGCGGCAGGCCTTATACATGCAAGTCGA--GGGGCAGCA--------TTT 70
B     1 AGaGTTTGATCATGGCTCAGaAcGtACGCTgGCGGCAcGCCTaAcACATGCAAGTCGAacGaaGtAGC------------ 68
Diffs                                             N A                AA A               
Votes                                               +                ++ +               
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    37 ACTTgG-----TGGCGACCGGCGcACGGGTGCGTAACGCGTATGCAACCTACCcaTtACTGGGagATAGCcCGAgGAAAc 111
Q    71 ACTTCGGTAAATGGCGACCGGCGAACGGGTGCGTAACGCGTATGCAACCTACCTTTAACTGGGGCATAGCTCGAAGAAAT 150
B    69 ---------AATacttAgtGGCagACGGGTGaGTAACatGT-gGgtAtCTACCcTTtggcctGGaATAaCaCGAgGAAAc 138
Diffs               AAAA AA   A?       A     AA   A AA A     Nb NAAAAA b?   A ?   N    N
Votes               ++++ ++   +0       +     ++     ++ +     0! 0+++++ !0   + 0   0    0
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   112 TCGgATTAATaCCCCATAGTAttATAgatTCGCATGATgaAATaaTTAAAGATTTAT-tGGTaAtgGATGGGCATGCGTa 190
Q   151 TCGAATTAATTCCCCATAGTACAATATTATCGCATGATATAATTGTTAAAGATTTAT-CGGTTAAAGATGGGCATGCGTC 229
B   139 TtGtgcTAATaCCggAT----------------AaGtctTtAcgGagAAAGcTTTATgCaccattgGATGaGCccGCact 202
Diffs    A ?AA    N  AA                   A AA?bA A?bAA    A      bAAANANN    A  AA  AA?
Votes    + 0++    0  ++                   + ++0!+ +0!++    +       +++0+00    +  ++  ++0
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   191 ccATTAGTTaGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGaCtACGATggtTAGGGGgcCTGAGAGGgTGATCCCCCACAcTGGT 270
Q   230 TGATTAGTTTGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCCACGATCAGTAGGGGTTCTGAGAGGATGATCCCCCACATTGGT 309
B   203 TGATTAGTTTGTTGGTagGGTAAtGGCctACCAAGaCtAtGATCAaTAGctGaTtTGAGAGGATGATCagCCACATTGGg 282
Diffs   bb       b      AA     A   AA      N N A   bb?   AA ?bA       b     AA     b   A
Votes   !!       !      ++     +   ++      0 0 +   !!0   ++ 0!+       !     ++     !   +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   271 ACTGAGAtACGGACCAGACTcCTACGGgAGGCAGCAGTAgGGAATATTGGtCAATGGagGAgActCTGAaCCAGCCATGC 350
Q   310 ACTGAGACACGGACCAGACTTCTACGGAAGGCAGCAGTAAGGAATATTGGGCAATGGGCGAAAGCCTGACCCAGCCATGC 389
B   283 ACTGAGACACGGcCCAaACTcCTACGGgAGGCAGCAGTggGGAATcTTGcaCAATGGagGAAActCTGAtgCAGCgATGC 362
Diffs          b    A   A   N      N          AN     A   A?      NN  b NN    ?A    A    
Votes          !    +   +   0      0          +0     +   +0      00  ! 00    0+    +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   351 CGCGTGCAGGA-aGAcGgCCTTcTGGGTTGTAAACTGCTTTTgacagGGAAGAAAAcggctaTGCGtagcTAAtTGACGG 429
Q   390 CGCGTGCAGGATTGAAGACCTTATGGGTTGTAAACTGCTTTTATATAGGAAGAAAAAACTCTTGCGAGAGTAACTGACGG 469
B   363 CGCGTG-AGtgaaGAAGgCCTT-TGGGTTGTAAAgctCTTTcgTcggGGAAGAAAA------------------TGACtG 422
Diffs            AA N  b N                AAA    ANbN?N                               A 
Votes            +     ! 0                +++    +0!000                               + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   430 TACctgtaGAATAAGcACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTgCAAGCGTTgTCCGGATTTATT 509
Q   470 TACTATATGAATAAGGACCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTTCAAGCGTTATCCGGATTTATT 549
B   423 TACccgAatAAgAAGGtCCGGCTAACTtCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGaAGGGacCtAGCGTagTtCGGAaTTAcT 502
Diffs      N?NbNA  A   bA          A                        A    A? A     AN A    A   A 
Votes      000!0+  +   !+          +                        +    +0 +     +0 +    +   + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   510 GGGTTTAAAGgGTGCGTAGGTGGcccATTAAGTCAGTGGTGAAATttTGCAGCTtAACTGTAaAACTGCCATTGATACTG 589
Q   550 GGGTTTAAAGAGTGCGTAGGTGGTTTATTAAGTCAGTGGTGAAATCCTGCAGCTCAACTGTAGAACTGCCATTGATACTG 629
B   503 GGGcTTAAAGAGTtCGTAGGTGGTTgAaaAAGTtgGTGGTGAAATCCcagAGCTtAACTcTgGAACTGCCATcaAaACTt 582
Diffs      A      b  A         bb? AA    AA          bbAAA    N    A Ab         AA A   A
Votes      +      !  +         !!0 ++    ++          !!+++    0    + +!         ++ +   +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   590 GTgggCTTGAGTaTtGtTGAGGcAgGCGGAATTTATGATGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCATAAaGAACACCgATAG 669
Q   630 GTAAACTTGAGTTTGGCTGAGGTAAGCGGAATTTATGATGTAGCGGTGAAATGCATAGATATCATAAGGAACACCAATAG 709
B   583 tTcAgCTaGAGTaTGataGAGGaAAGCaGAATTTcTagTGTAGaGGTGAAATtCgTAGATATtAgAAaGAAtACCAATtG 662
Diffs   A ?bN  A    N bANA    ? b  A      A AA     A        A A       A A  N   A   b  A 
Votes   + 0!0  +    0 !+0+    0 !  +      + ++     +        + +       + +  0   +   !  + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   670 CGaAGGCAGCTTgCTAagCgAtaACTGACACTaAGGCACGAAAGCGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 749
Q   710 CGTAGGCAGCTTACTAGACCAATACTGACACTGAGGCACGAAAGCGTGGGTAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTC 789
B   663 CGaAGGCAGCTTtCTgGAtCAtTACTGACACTGAGGaACGAAAGCaTGGGTAGCGAAgAGGATTAGATACCCTcGTAGTC 742
Diffs     N         ?  AbbAb Nb         b   A        A           A               A      
Votes     0         0  +!!+! 0!         !   +        +           +               +      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   750 CACGCCGTAAACGATGCTCACTCGATGTatGCGATATtACTGTatGCGTCCAAGCgAAAGCGTTAAGTGAGCCACCTGGG 829
Q   790 CACGCCGTAAACGATGCTCACTCGATGTTAGCGATAT-ACTGTTAGCGTCCAAGCTAAAGCGTTAAGTGAGCCACCTGGG 868
B   743 CAtGCCGTAAACGATGtgtgtTaGAcGTTgGaaATtT-AtTtTcAGtGTCgcAGggAAAcCGaTAAacacaCCgCCTGGG 821
Diffs     A             AAAAA A  A  b? AA  A   A A ?b A   AA  AN   A  A   AAAAA  A      
Votes     +             +++++ +  +  !0 ++  +   + + 0! +   ++  +0   +  +   +++++  +      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   830 gAGTACGCtGGCAACaGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATgA 909
Q   869 TAGTACGCCGGCAACGGTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGTCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATAA 948
B   822 gAGTACGaCcGCAAgGtTaAAACTCAAAtGAATTGACGGGGacCCGCACAAGtaGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAagA 901
Diffs   N      AbA    AbA A         A            AA         AA                       AN 
Votes   0      +!+    +!+ +         +            ++         ++                       +0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   910 TACGCGAGGAACCTTACCTgGGCTcGA----ATGtGaGcGctAgatttAGA----gATagatcgTTCTTCGGACgtgAAa 981
Q   949 TACGCGAGGAACCTTACCTAGGCTAGA----ATGCGCGAGACATCCAAAGA----AATTTGGACTTCTTCGGACTCAAAG 1020
B   902 TACGCGcaGAACCTTACCaAcaCTtGAcatgtTcgtCGcGACtctaAgAGAttagAgTTTtcggTTCggCcGgacgAAAc 981
Diffs         AA          AbAA  ?      A A?Ab N bbA???b?       bA bb???N   AA A AA??b  ?
Votes         ++          +!++  0        +0+! 0 !!+000!0        + !!0000   ++ + ++00!  0
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   982 CAAGGTGCTGCATGGcTGTCGTCAGCTCGTGcCGTGAGgTGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCctACTgTTA 1061
Q  1021 CAAGGTGCTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCACTTTTA 1100
B   982 acAGGTGCTGCATGGcTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTCACTTTTA 1061
Diffs   AA             N               B      B                                BB   B   
Votes   ++             0               +      +                                ++   +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1062 GTTGCCATCAggTTatGcTGGGgACTCTaAcAGgACTGCCtacGcaAgtagaGAGGAAGGTGGGGAcGACGTCAAGTCaT 1141
Q  1101 GTTGCCATCA--TTTAGTTGGGCACTCTGAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCT 1178
B  1062 GTTGCCATCA--TTaAGTTGGGCACTCTGAAAGAACTGCCAGTGATAAGCTGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCCT 1139
Diffs                 NB B    B     B B  B      BBB BB BBBBB              B           B 
Votes                 0+ +    +     + +  +      +++ ++ +++++              +           + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1142 CATGGCCCTTACGcccaGGGCTACACACGTGCTACAATGGTgcaTACAgagGGtcGCaAgctgGCaAcagcAAGCcAATC 1221
Q  1179 CATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGTATCTACAACAGGAAGCGAAACAGCGATGTTAAGCAAATC 1258
B  1140 CATGGCCCTTACGTGTTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcATCTACAACAGGAAGCaAAACgGCaAcGTTAAGCAAATC 1219
Diffs                BBBB                       aBBB    BBB  BB  N BBBN  N NBBB    B    
Votes                ++++                       !+++    +++  ++  0 +++0  0 0+++    +    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1222 tcaAAAAGtgcAtCTCAGTTCGGATTGgggTCTGCAACTCGAcccCATGAAGtTGGAATcgCTAGTAATCGcGtATCAGC 1301
Q  1259 CTTAAAAG-ATACCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGC 1337
B  1220 CcgAAAAG-ATgCCTCAGTTCGGATTGCACTCTGCAACTCGAGTGCATGAAGCTGGAATTACTAGTAATCGTGGATCAGC 1298
Diffs   BN?      BBaB              BBB            BBB       B      BB          B B      
Votes   +00       +!+              +++            +++       +      ++          + +      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1302 aaTGaCgCGGTGAATaCGTTCCCGGacCTTGTACACACCGCCCGTCAagCCATGGaAGTTGGgaggACCTgAAGacGgtA 1381
Q  1338 -GTGCCACGGTGAATGCGTTCCCGGGACTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTTAAG--GCAA 1414
B  1299 -GTGCCACGGTGAATGCGTTCCCGGGtCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTTGGTTCTACCTTAAG--GCAA 1375
Diffs    B  B B        B         B?                    BB      B      BBBB    B      BB 
Votes       + +        +         +0                    ++      +      ++++    +      ++ 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1382 GcTgTAAggCgCTgttta---------------------------------------------- 1399
Q  1415 GGTTTAATACCCTTGACCACGGTATAGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCATAACAAGGTAACCGTA 1478
B  1376 GGTTTtAaACCCTTGACCACGGTATAGTCAGCGACTGGGGTGAAGTCgTAACAAGGTAgCCGTA 1439
Diffs    B B a ?B B  BBBBB                                              
Votes    + + ! 0+ +  ++++                                               
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 84.4%, QB 80.9%, AB 74.7%, QModel 90.2%, Div. +6.9%
Diffs Left 289: N 46, A 71, Y 172 (59.5%); Right 93: N 3, A 10, Y 80 (86.0%), Score 0.6762

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1483 nt) 148427;size=1;
ParentA ( 1418 nt) CS/S000428856/Roseovarius_nubinhibens.(T)
ParentB ( 1523 nt) CS/7000004130717091/Hahella_chejuensis.KCTC.2396

A     1 ------------------cTGGtTCAGAgCGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCG------CACCTT 56
Q     1 CAAGCTTAGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCG------CACCTT 74
B     1 -------AGAGTTTGATCATGGCTCAGAttGAACGCTGGCGGCAGGCtTAACACATGCAAGTCGAGCGgtaacagtCCTT 73
Diffs                     b   b     ?A                 A                          AA    
Votes                         !     0+                 +                           +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    57 CGGG------TGAGCGGCGGACGGGTTAGTAACGCGTGGGAACGTaCCCAGATCTaaGGAATAGCCACTGGAAACGGTGA 130
Q    75 CGGG------TGAGCGGCGGACGGGTTAGTAACGCGTGGGAACGTGCCCAGATCTGCGGAATAGCCACTGGAAACGGTGA 148
B    74 CGGGagctgacGAGCGGCGGACGGGTgAGTAAaGCaTaGGAAtcTGCCtgttagaGgGGgATAGCCcggGGAAACtcgGA 153
Diffs             A               A     A  A A    AA b  AAAAAAAb?  A      AAA      AAA  
Votes                             +     +  + +    ++ !  +++++++!0  +      +++      +++  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   131 GTAATACCttATACGCCCTTCGGGGGAAAG--------------ATTTATCGGATTTGGATCGGCCCGCGTTAGATTAGG 196
Q   149 GTAATACCGCATACGCCCTTCGGGGGAAAG--------------ATTTATCGGATTTGGATCGGCCCGCGTTAGATTAGG 214
B   154 tTAATACCGCATACGCCCTaCGGGGGAAAGcaggggatcttcggAccTtgCGctaacaGATgaGCCtatGTcgGATTAGc 233
Diffs   A       bb         A                         AA AA  AAAAAA   AA   AAA  AA      A
Votes   +       !!         +                         ++ ++  ++++++   ++   +++  ++      +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   197 TAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCTACGATCTATAGCTGGTTTTAGAGGATGATCAGCAACACTGGGACTGAGAC 276
Q   215 TAGTTGGTGGGGTAATGGCCTACCAAGCCTACGATCTATAGCTGGTTTTAGAGGATGATCAGCAACACTGGGACTGAGAC 294
B   234 TAGTTGGTaGGGTAAgaGCCTACCAAGgCgACGATCcgTAaCTGGTcTgAGAGGATGATCAGtcACACTGGaACTGAGAC 313
Diffs           A      AA          A A      AA  A     A A             AA       A        
Votes           +      ++          + +      ++  +     + +             ++       +        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   277 ACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGGGCAACCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGAG 356
Q   295 ACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATCTTAGACAATGGGGGCAACCCTGATCTAGCCATGCCGCGTGAG 374
B   314 ACGGtCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATaTTgGACAATGGGGGCAACCCTGATCcAGCCATGCCGCGTGtG 393
Diffs       A                                A  A                      A              A 
Votes       +                                +  +                      +              + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   357 TGAaGAAGGtCtTAGGaTCGTAAAGCTCTTTCGCCaGgGA------------TGATAATGACAGTAcCtGGT-------- 416
Q   375 TGATGAAGGCCCTAGGGTCGTAAAGCTCTTTCGCCTGTGA------------TGATAATGACAGTAGCAGGT-------- 434
B   394 TGAaGAAGGCCtTcGGGTtGTAAAGCaCTTTCagtgGgGAggaaagggcagtTGcTAATatCAGctGCAGtTgacgttac 473
Diffs      N     b N A  b A       A     AAA? N                A    AA   AAb b A         
Votes      0     ! 0 +  ! +       +     +++0 0                +    ++   ++! ! +         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   417 -----AAAGAAACCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGTTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGG 491
Q   435 -----AAAGAAACCCCGGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGGGTTAGCGTTGTTCGGAATTACTGGG 509
B   474 ccacagAAGAAgCaCCGGCaAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGtGcgAGCGTTaaTCGGAATTACTGGG 553
Diffs        A     A A     A                                  A AA      AA              
Votes              + +     +                                  + ++      ++              
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   492 CGTAAAGCGcgCGTAGGCGGATcAGaaAGTtgGgGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGAACTGCCTccaAaACTcCTg 571
Q   510 CGTAAAGCGTACGTAGGCGGATTAGTCAGTCAGAGGTGAAATCCCAGGGCTCAACCCTGGAACTGCCTTTGATACTGCTA 589
B   554 CGTAAAGCGcgCGTAGGCGGtTgctTaAGctAGgtGTGAAATCCCcGGGCTCAACCtgGGAACTGCacTTagaACTGggc 633
Diffs            NN         A ?AAbN  ANb NA          A          AA        AAbbNAN   bAA?
Votes            00         + 0++!0  +0! 0+          +          ++        ++!!0+0   !++0
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   572 GTCTTGAGTTCGAGAGAGGTGAGTGGAAcTCCgAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTcGGAaGAACACCAGTGGCGA 651
Q   590 GTCTTGAGTTCGAGAGAGGTGAGTGGAATTCCAAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTTGGAGGAACACCAGTGGCGA 669
B   634 GaCTaGAGTTttgGAGAGGaGgGTaGAATTCCAgGTGTAGcGGTGAAATgCGTAGAgATcTGGAGGAAtACCAGTGGCGA 713
Diffs    A  A     AAA      A A  A   b   bA      A        A      A  Ab   b   A           
Votes    +  +     +++      + +  +   !   !+      +        +      +  +!   !   +           
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   652 AGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTgCGAAAGTGTGGGGAGCaAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCAC 731
Q   670 AGGCGGCTCACTGGCTCGATACTGACGCTGAGGTACGAAAGTGTGGGGAGCGAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCAC 749
B   714 AGGCGGCcCtCTGGCcaaAaACTGACGCTGAGGTgCGAAAGcGTGGGGAGCaAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCAC 793
Diffs          A A     AAA A              N      A         N                            
Votes          + +     +++ +              0      +         0                            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   732 aCCGTAAACGATGaatgCcAGtCGTcGG-GTagTa-tActaTTcgGTGaCaCAcCTAACGgatTAAGcattCCGCCTGGG 809
Q   750 GCCGTAAACGATGTCAACTAGCCGTTGGAGTCCTT-GAGGCTTTAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTTGACCGCCTGGG 828
B   794 GCCGTAAACGATGagAACTAGCCGTTGGgGTCCTTaGAGaCTTTAGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTTctCCGCCTGGG 873
Diffs   B            N?BB B  B   B     BB B B B?B  BB   B B  B      BBB    BB?N         
Votes   +            00++ +  +   +     ++     +0+  ++   + +  +      +++    ++00         
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   810 GAGTACGGtCGCAAGaTTAAAACTCAAAgGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAaGC 889
Q   829 GAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGC 908
B   874 GAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAaGC 953
Diffs           B      B            B                                                N  
Votes           +      +            +                                                0  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   890 AACGCGcAGAACCTTACCAaccCTTGACATCCtGAtcgCggatCgtAGA--GATactTtCCTTCagttcgGctgGaTCaG 967
Q   909 AACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTC------GGGAGCTCTG 982
B   954 AACGCGAAGAACCTTACCtGGcCTTGACATCCAGAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTC------GGGAaCTCTG 1027
Diffs         B           aBBN          B  BBB BBBB BB        BBB B            BBBaB  B 
Votes         +           !++0          +  +++ ++++ ++        +++ +            +++!+  + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   968 TGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTcGGTTAAGTCCgGcAACGAGCGCAACCCacaTCCc 1047
Q   983 TGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCT 1062
B  1028 aGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTtGTGAaATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCc 1107
Diffs   a                                 a    a     B          B B              BBB   N
Votes   !                                 !    !     +          + +              +++   0
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1048 TAgTTGCCAGCA-GTtcgGcTGGGcACTCTAtGGAaACTGCCcGTGAtAAgCgGGAGGAAGGTGtGGAtGACGTCAAGTC 1126
Q  1063 TATTTGCCAGCACGTAATGGTGGGAACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTC 1142
B  1108 TATTTGCCAGCAC-TtcgGGTGGGAACTtTAgGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGACGACGTCAAGTC 1186
Diffs     B            NNN B    B   a  ?   B      B    B  B B           B   B           
Votes     +            000 +    +   !  0   +      +    +  + +           +   +           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1127 cTCATGGCCCTTACGggtTGGGCTACACACGTGCTACAATGGcagtgACAatGGGT---------------------TAA 1185
Q  1143 ATCATGGCCCTTACGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGGGCGTACAGAGGGTTGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCTAA 1222
B  1187 ATCATGGCCCTTACGgCCaGGGCTACACACGTGCTACAATGGGGCGTACAGAGGGTTGCGAAGCCGCGAGGTGGAGCTAA 1266
Diffs   B              NBBa                       BBBBB   BB                            
Votes   +              0++!                       +++++   ++                            
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1186 TCCCaaAAAAC-TgTCtcAGTtCGGATTGGgGTCTGCAACTCGACcCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGtAaCA 1264
Q  1223 TCCCTTAAAACGTCTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCA 1302
B  1267 TCtCTTAAAgCGTCTCGTAGTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCA 1346
Diffs     a BB   a   B  BB   B        B              B                             B B  
Votes     ! ++   !   +  ++   +        +              +                             + +  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1265 GcATGaCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTtGGgTttAcccGAAGgccgT 1344
Q  1303 GAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTGGCT 1382
B  1347 GAATGTCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAccAGAAGTaGCT 1426
Diffs    B   B                                                      B  B BB NNB    B?BB 
Votes    +   +                                                      +  + ++ 00+    +0++ 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1345 gcgCcAACCTTtcgaGGgGGcaGcggACCACggTGaGcTcagcGACTGGGGTGaAAGTCGTAACAAGGTAGCCC------ 1418
Q  1383 AGTCTAACCTT--CGGGAGGACGGTCACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTG-AAGTCGTAACAAGGTAGCCCTAGGGG 1459
B  1427 AGTCTAACCTT--CGGGgGGACGGTtACCACggTGTGATTCATGACTGGGGTG-AAGTCGTAACAAGGTAGCCgTAGGGG 1503
Diffs   BBB B        BB  N  BB BB?     NN  B B BBBB                              a      
Votes   +++ +         +  0  ++ ++0     00  + + ++++                                     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1419 ------------------------ 1418
Q  1460 AACCTGCGGCTGGATCACCTCCTT 1483
B  1504 AACCTGCGGCTGGATCACCT---- 1523
Diffs                           
Votes                           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 88.3%, QB 88.3%, AB 81.0%, QModel 95.3%, Div. +8.0%
Diffs Left 149: N 18, A 16, Y 115 (77.2%); Right 140: N 10, A 22, Y 108 (77.1%), Score 0.6409

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1452 nt) 329476;size=1;
ParentA ( 1463 nt) CS/7000004128331608/Candidatus_Pelagibacter.ubique.HTCC1062
ParentB ( 1448 nt) CS/S000255073/Shewanella_decolorationis.(T)

A     1 AGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTaAcACATGCAAGTCGAACGAAGTAGCAATACTTAGTGG 80
Q     1 AGAGTTTGATCATGGCTCAGAACGTACGCTGGCGGCACGCCTTATACATGCAAGTCGAACGAAGTAGCAATACTTAGTGG 80
B     1 ---------gCAgGcCT---AACacAtGCaaGtcGagCGgC-agcACAaGtgAGTttActcAtGagG---TggcgAGcGG 64
Diffs            A  A A        AA A  AA AA AA  A  NAN   A AA   AA AAA A AA     AAAA  A  
Votes               + +        ++ +  ++ ++ ++  +   +0   + ++   ++ +++ + ++     ++++  +  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    81 CAGACGGGTGAGTAACATGTgGGTATCTaCCCTTTGGcctGGAATAACACGAGGAAACTTGTGCTAATACCggATAAGTC 160
Q    81 CAGACGGGTGAGTAACATGTAGGTATCTTCCCTTTGGTGAGGAATAACACGAGGAAACTTGTGCTAATACCTCATAAGTC 160
B    65 CgGACGGGTGAGTAAtgccTAGGgATCTgCCCagTcGaGgGGgATAACAgttGGAAACgacTGCTAATACCgCATAcGcC 144
Diffs    A             AAAA b  A    ?   AA A ?b?  A      AAA      AAA          Nb   A A 
Votes    +             ++++ !  +    0   ++ + 0!0  +      +++      +++          0!   + + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   161 TTtACGGAGAAAG--------CTTT-----ATGCaCCattGGATGAGCCcGCACTTGATTAGTTTGTTGGTaGGGTAATG 227
Q   161 TTCACGGAGAAAG--------CTTT-----ATGCGCCGAAGGATGAGCCTGCACTTGATTAGTTTGTTGGTGGGGTAATG 227
B   145 cTacgGGgGAAAGgaggggacCTTTtggcctTcCGCgattGGATGAaCCTaggtggGATTAGcTaGTTGGTGaGGTAATG 224
Diffs   A ?AA  A                      A A b ANNN      A  bAAAAAA      A A      bA       
Votes   + 0++  +                        + ! +000      +  !++++++      + +      !+       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   228 GCCTACCAAGACTaTGATCAATAGCTGATtTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTAC 307
Q   228 GCCTACCAAGACTTTGATCAATAGCTGATCTGAGAGGATGATCAGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTAC 307
B   225 GCtcACCAAGgCgacGATCccTAGCTGtTCTGAGAGGATGATCAGCCACAcTGGGACTGAGACACGGCCCAgACTCCTAC 304
Diffs     AA      A ANA    AA      A b                    A                    A        
Votes     ++      + +0+    ++      + !                    +                    +        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   308 GGGAGGCAGCAGTgGGGAATcTTGCACAATGGAGGAAACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGG 387
Q   308 GGGAGGCAGCAGTAGGGAATATTGCACAATGGAGGAAACTCTGATGCAGCGATGCCGCGTGAGTGAAGAAGGCCTTTGGG 387
B   305 GGGAGGCAGCAGTgGGGAATATTGCACAATGGgGGAAACcCTGATGCAGCcATGCCGCGTGtGTGAAGAAGGCCTTcGGG 384
Diffs                N      b           A      A          A          A              A   
Votes                0      !           +      +          +          +              +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   388 TTGTAAAGCTCTTTCGTCGGGGAAGAAA-------------------------ATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCG 442
Q   388 TTGTAAAGCTCTTTCGTCGGGGAAGAAA-------------------------ATGACTGTACCCGAATAAGAAGGTCCG 442
B   385 TTGTAAAGCaCTTTCagtaGGGAgGAAAggttgtaagttaataccttgcagctgTGACgtTACCtacAgAAGAAGGaCCG 464
Diffs            A     AAAA    A                             A    AA    AAA A       A   
Votes            +     ++++    +                                  ++    +++ +       +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   443 GCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGACCTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGTTCGTAGG 522
Q   443 GCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGACCTAGCGTAGTTCGGAATTACTGGGCTTAAAGAGTTCGTAGG 522
B   465 GCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGgAGGGtCCaAGCGTtaaTCGGAATTACTGGGCgTAAAGcGTgCGcAGG 544
Diffs          A                        A    A  A     AAA               A     A  A  A   
Votes          +                        +    +  +     +++               +     +  +  +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   523 TgGTTgAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAGAGCTTAACTCTGGAACTGCCATCAAAACTTTTcAGCTAGAGTATGATAGA 602
Q   523 TTGTTAAAAAAGTTGGTGGTGAAATCCCAGAGCTTAACTCTGGAACTGCCATCAAAACTTTTTAGCTAGAGTATGATAGA 602
B   545 cgGTTtgttAAGcgaGatGTGAAAgCCCcGgGCTcAACctgGGAAtTGCatTtcgAACTggcaAaCTAGAGTcTtgTAGA 624
Diffs   AN   ?AAA   AAA AA      A   A A   A   AAA    A   AA AAA    AAA? A       A AA    
Votes   +0   0+++   +++ ++      +   + +   +   +++    +   ++ +++    +++0 +       + ++    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   603 GGAAAGCAGAATTTCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGAAAGAATACCAATTGCGAAGGCAGCTTTCTGGATC 682
Q   603 GGAAAGCAGAATTTCTAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGATATTAGAAAGAATACCAATTGCGAAGGCAGCTTTCTGGATC 682
B   625 GGgggGtAGAATTcCagGTGTAGcGGTGAAATgCGTAGAgATctGgAgGAATACCggTgGCGAAGGCgGCcccCTGGAca 704
Diffs     AAA A      A AA      A        A      A  AA A A       AA A        A  AAA     AA
Votes     +++ +      + ++      +        +      +  ++ + +       ++ +        +  +++     ++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   683 ATTACTGACACTGAGGAACGAAAGCATGGGTAGCGAAGAGGATTAGATACCCTcGTAGTCCAtGCCGTAAACGATGtgtg 762
Q   683 ATTACTGACACTGAGGAACGAAAGCATGGGTAGCGAAGAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGACAA 762
B   705 AagACTGACgCTcAGGcACGAAAGCgTGGGgAGCaAAcAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGtCtA 784
Diffs    AA      A  A   A        A    A   A  A               B        B             NBNB
Votes    ++      +  +   +        +    +   +  +               +        +             0+0+
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   763 tTAGaCGTTGG--AaATTTA--TtTTCAGTGtCgCAGggAAacCgaTAAacacaCCGCCTGGGGAGTACGaCCGCAAGGt 838
Q   763 CTAGCCGTTGGGCAGATTTAACTGTTCAGTGGCACAGCTAACGCATTAAGTTGTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGC 842
B   785 CTcGgaGTTtGGtgtcTTgAACacTgggcTctCA-AGCTAACGCATTAAGTaGaCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGt 863
Diffs   B a ?a   a   a?a  a   a? aaaa aN B   BB  BB BB   BBNBN                B        N
Votes   + ! 0!   !    0!  !    0 !!!! !0     ++  ++ ++   ++0+0                +        0
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   839 TAAAACTCAAATGAATTGACGGGGaCCCGCACAAGTaGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAaGatACGCGcAGAACCTTAC 918
Q   843 TAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGTGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC 922
B   864 TAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGcGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTAC 943
Diffs                           B          aB                       B BB     B          
Votes                           +          !+                       + ++     +          
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   919 CAAcaCTTGAcATgTtcgtCGcgaCTCtaAGAGATtaGAgTtTtCggTtcGGccgGacgaAacACAGGTGcTGCATGGCT 998
Q   923 CAATCCTTGAAATCT--AGCGAAGCTCGCAGAGATGTGAATGTGCCTTCGGGAACG--CTATGACAGGTGTTGCATGGCT 998
B   944 CtActCTTGAcATCc--AGaGAActTtcnAGAGATGgattgGTGCCTTCGGGAACt--CTgaGACAGGTGcTGCATGGCT 1019
Diffs    a N?     N  Ba  BBa BB?a a?       B?aa?aB B BB BB  BBBa  BBaNB       N         
Votes    ! 00     0  +    +! ++0! !0       +0!!0!+ + ++ ++  +++    +!0+       0         
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   999 GTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTtgGGTTAAGTCCcGcAACGAGCGCAACCCtcActtTTAgTTGCCA--tCaTtAaG 1076
Q   999 GTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTATGGTTAAGTCCAGTAACGAGCGCAACCCCTATCCTTATTTGCCAGCGCGTAATG 1078
B  1020 GTCGTCAGCTCGTGTtGTGAaATGTtgGGTTAAGTCCcGcAACGAGCGCAACCCCTATCCTTATTTGCCAGCGCGTAATG 1099
Diffs                  a    a    NN          N N              BB BBB   B        B B B B 
Votes                  !    !    00          0 0              ++ +++   +          + + + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1077 ttGGGcACTcTgaaagaACTGCCaGtgatAAgCtGGAGGAAGGtGGGGAtGAcGTCAAGTCcTCATGGCCCTTACGtGTt 1156
Q  1079 GCGGGAACTATAGGGAGACTGCCGGGTGAAACCCGGAGGAAGGCGGGGACGAGGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTA 1158
B  1100 GCGGGAACTcTAGGGAGACTGCCGGtgatAAaCCGGAGGAAGGtGGGGACGAcGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGAGTA 1179
Diffs   BB   B   N BBBBBB      B NNNN  ? B         N     B  N        B              B  B
Votes   ++   +   0 ++++++      + 0000  0 +         0     +  0        +              +  +
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1157 GGGCTACACACGTGCTACAATGGcatcTACAacaGGAaGCaAAaCgGCaAcGTtaaGCaAATCCcgaAAAGaT-gcCtcA 1235
Q  1159 GGGCTACACACGTGCTACAATGGGGAATACAGACGGACGCTAAGCCGCGAGGTGGTGCTAATCCTATAAAGTTCTTCGTA 1238
B  1180 GGGCTACACACGTGCTACAATGGcGAgTACAGAgGGttGCaAAGCCGCGAGGTGGaGCTAATCtcAcAAAGcTCgTCGTA 1259
Diffs                          NBB?    BB?  a?  N  B B  B B  BBN  B    aNB?    ?  NB BB 
Votes                          0++0    ++0  !0  0  + +  + +  ++0  +    !0+0    0   + ++ 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1236 GTtCGGATTGcAcTCTGCAACTCGAgTgCATGAAGctGGAATtaCTAGTAATCGtGgATCAGCgTGcCaCGGTGAATgCG 1315
Q  1239 GTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGAATCAGCATGTCGCGGTGAATACG 1318
B  1260 GTCCGGATTGGAGTCTGCAACTCGACTCCATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGtGAATCAGaATGTCaCGGTGAATACG 1339
Diffs     B       B B            B B       BB     BB          N B     aB  B N        B  
Votes     +       + +            + +       ++     ++          0 +     !+  + 0        +  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1316 TTCcCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGgAGTtGgTTctACCttAAGgcaAggtTtTAAaC---------- 1385
Q  1319 TTCTCGGGTCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGAAGTGGATTGCACCAGAAGTAGATAGTCTAACCTTCGGGAGGG 1398
B  1340 TTCcCGGGcCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGgAGTGGgcTGCAaaAGAAGTgGgTAGctTAACCTTCGGGAGGG 1419
Diffs      N    a                            N   B Na BB aaBB   B?BaBBBaN   B           
Votes      0    !                            0   + 0! ++ !!++   +0+!+++!0   +           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1386 CcTTgACCACGGTaTagTcagcGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAgCCGTA 1439
Q  1399 CGTTTACCACGGTGTGCTTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTA 1452
B  1420 CGcTcACCACttTGTGgTTCATGACTGGG------------------------- 1448
Diffs    Ba ?     aa B BN BBBB                                
Votes    +! 0     !! + +0 ++++                                
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 86.9%, QB 80.8%, AB 75.3%, QModel 92.2%, Div. +6.1%
Diffs Left 186: N 8, A 14, Y 164 (88.2%); Right 190: N 34, A 48, Y 108 (56.8%), Score 0.5995

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1452 nt) 227866;size=1;
ParentA ( 1449 nt) CS/S000628776/Hoeflea_alexandrii.(T)
ParentB ( 1430 nt) CS/S000089782/Blastomonas_ursincola.(T)

A     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAAcGAACGCTGGCGGCAgGCtTAACACATGCAAGTCGAgCGccccgcaaGG--ggAGcGG 78
Q     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGAATGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAGATTTTCGGATCTAGTGG 80
B     1 -------------------------ACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGAaggcTTCGGcctTAGTGG 55
Diffs                                        b  b                 b  b????bbb    ?b  b  
Votes                                        !  !                 !  !0000!!!     !  !  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    79 CagACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAtCTACCcaTctcTAcGGaAtAACtcagGGAAACttgtGCTAATACCGTATACGCC 158
Q    81 CGCACGGGTGAGTAACGCGTGGGAACCTACCTTTTAGTATGGGACAACGTTTGGAAACGAACGCTAATACCGTATACGCC 160
B    56 CGCACGGGTGcGTAACGCGTGGGAAtCTgCCcTTggGTtcGGaAtAACagTgaGAAAttActGCTAATACCGgATgatga 135
Diffs    bb       A              N  A  Nb ??b AN  N N   ??bNA    ANb?N          A  AAAAA
Votes    !!       +              0  +  0! 00! +0  0 0   00!0+    +0!00          +  +++++
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   159 CTtCGGGGGAAAGaTttatCGgaGAtgGAtGaGCCCGCGTtgGATTAGCTaGTTGGTggGGTAAaGGCcTACCAAGGCgA 238
Q   161 CTCCGGGGGAAAGGTCAGCCGCTGAAAGAGGGGCCCGCGTCTGATTAGCTTGTTGGTAAGGTAATGGCTTACCAAGGCTA 240
B   136 CTtCGGtccAAAGaTttatCGCccAAgGAtGaGCCCGCGTaaGATTAGCTaGTTGGTgAGGTAAaGGCTcACCAAGGCgA 215
Diffs     N   AAA    N NNNN  b?A bN  N N        ??        N      Nb     N   bA        N 
Votes     0   +++    0 0000  !0+ !0  0 0        00        0      0!     0   !+        0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   239 CGATCcaTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 318
Q   241 CGATCAGTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 320
B   216 CGATCttTAGCTGGTCTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTG 295
Diffs        ??                                                                         
Votes        00                                                                         
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   319 GGGAATATTGGACAATGGgcGCAAgcCTGATCCAGCcATGCCGCGTGTGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCACTTT 398
Q   321 GGGAATATTGGACAATGGAGGCAACTCTGATCCAGCAATGCCGCGTGTGTGATGAAGGCCCTAGGGTTGTAAAGCACTTT 400
B   296 GGGAATATTGGACAATGGgcGaAAgcCTGATCCAGCAATGCCGCGTGaGTGATGAAGGCCtTAGGGTTGTAAAGCtCTTT 375
Diffs                     NN A  NN          b          A            A              A    
Votes                     00 +  00          !          +            +              +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   399 CAACGGTGAAGATaATGACGGTAaCCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGG 478
Q   401 CAACGGTGAAGATGATGACGGTAGCCGTAGAAGAAGCCCCGGCTAACTTCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGAAGGGGG 480
B   376 tAcCaGgGAtGATaATGACaGTAcCtGgAGAAtAAGCtCCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGgAGGGaG 455
Diffs   A A A A  A   N     A   ? A A    A    A          A                        A    A 
Votes   + + + +  +   0     +   0 + +    +    +          +                        +    + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   479 CtAGCGTTgTTCGGAATTAcTGGGCGTAAAGcGCaCGtAGGCgGaTcGttaAGTgAGggGTGAAATCCCaGGGCTCAACC 558
Q   481 CGAGCGTTATTCGGAATTATTGGGCGTAAAGGGCTCGCAGGCTGCTTGAACAGTTAGACGTGAAATCCCCGGGCTCAACC 560
B   456 CtAGCGTTgTTCGGAATTAcTGGGCGTAAAGcGCaCGtAGGCgGCcattcaAGTcAGAgGTGAAAgCCCgGGGCTCAACC 535
Diffs    N      N          N           N  N  N    N bA?AN?N   ?  bN      A   ?          
Votes    0      0          0           0  0  0    0 !+0+000   0  !0      +   0          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   559 ctGGAACTGCcTTTcATACTgGCgAtCTtGAGttcgAGAGAGGtgAGTGGAAtTCCgAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 638
Q   561 TGGGAACTGCGTTTAATACTAGCAAGCTAGAGAGATAGAGAGGAAAGTGGAACTCCCAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 640
B   536 ccGGAACTGCcTTTgAaACTAGatgGCTtGAatctTgGAGAGGcgAGTGGAAtTCCgAGTGTAGAGGTGAAATTCGTAGA 615
Diffs   N?        N   ? A   b A?Ab  N  AN??bA      ?N       N   N                       
Votes   00        0   0 +   ! +0+!  0  +000!+      00       0   0                       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   639 TATTcGGAgGAACACCAGTGGCGAAgGCGgCTcaCTGGCTcgaTaCTGACGCTgAGGtGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 718
Q   641 TATTGGGAAGAACACCAGTGGCGAAAGCGACTTTCTGGCTATTTTCTGACGCTCAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 720
B   616 TATTcGGAAGAACACCAGTGGCGAAgGCGACTcgCTGGacAagTatTGACGCTgAtGtGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACA 695
Diffs       N   b                N   b  N?    AAb?? NA       N A N                      
Votes       0   !                0   !  00    ++!00 0+       0 + 0                      
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   719 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA-CGATGaaTGtTAGccGTc-gGGcAGttTACtgTTCgGTGgCGCAGCT 796
Q   721 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAAACGATGTGTGCTAGATGT--TGGAAGGATACCTTTCAGTGTCGCAGCT 798
B   696 GGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAA-CGATGataaCTAGcTGTccgGGttcatggaacTTggGTGgCGCAGCT 774
Diffs                                         N?AAb   Nb    N  ?AA?NAAA??  AN   N       
Votes                                         00++!   0!       0++00+++00  +0   0       
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   797 AACGCAtTAAaCAttCCGCCTGGGgAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGT 876
Q   799 AACGCACTAAGCACACCGCCTGGGAAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGT 878
B   775 AACGCAtTAAGttatCCGCCTGGGgAGTACGGTCGCAAGATTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCtGCACAAGCGGT 854
Diffs         N   bAA?N         N                                           A           
Votes         0   !++00         0                                           +           
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   877 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCccTTGACATccCggtcgcGgTTtCCAGAGATGGaT 956
Q   879 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCGTTTGACATGTCTAGTATGTTTCCCAGAGATGGGT 958
B   855 GGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGCAGAACCTTACCAGCGTTTGACATGTCTAGTATGTTTCCCAGAGATGGGT 934
Diffs                                                BB       BB BBBBBB B  B          B 
Votes                                                ++       ++ ++++++ +  +          + 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   957 TcCTTCAGTTCGGCTGGaccGgtgACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1036
Q   959 TACTTCAGTTCGGCTGGCTAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1038
B   935 TACTTCAGTTCGGCTGGCTAGAACACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCG 1014
Diffs    B               BBB BBB                                                        
Votes    +               +++ +++                                                        
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1037 CAACGAGCGCAACCCTCGcCcTTAGTTGCCAgCATTcAGTTGGGCACTCTAAgGggACtGCCGGTGATAAGCCGaGAGGA 1116
Q  1039 CAACGAGCGCAACCCTCGTCTTTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGCACTCTAAAGAAACCGCCGGTGATAAGCCG-GAGGA 1117
B  1015 CAACGAGCGCAACCCTCGTCTTTAGTTGCCATCATTTAGTTGGGCACTCTAAAGAAACCGCCGGTGATAAGCCG-GAGGA 1093
Diffs                     B B          B    B               B BB  B                     
Votes                     + +          +    +               + ++  +                     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1117 AGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACggGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGtGGTGACAGTGgGCAGC 1196
Q  1118 AGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACACGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGAGCAGC 1197
B  1094 AGGTGGGGATGACGTCAAGTCCTCATGGCCCTTACACGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCGGTGACAGTGAGCAGC 1173
Diffs                                      BB                          B          B     
Votes                                      ++                          +          +     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1197 gAGAcgGCaAcgTCgaGCTAATCTCcAAAAaCCaTCTCAGTTCGGATTGgggTCTGCAACTCGAcccCATGAAGttGGAA 1276
Q  1198 TAGATCGCGAGATCATGCTAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGCGGAA 1277
B  1174 TAGATCGCGAGATCATGCTAATCTCAAAAAGCCGTCTCAGTTCGGATTGTTCTCTGCAACTCGAGAGCATGAAGGCGGAA 1253
Diffs   B   BB  B BB  BB         B    B  B               BBB            BBB       BB    
Votes   +   ++  + ++  ++         +    +  +               +++            +++       ++    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1277 TCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCgGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGT 1356
Q  1278 TCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGT 1357
B  1254 TCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGCGGTGAATACGTTCCCAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGT 1333
Diffs                                               B                                   
Votes                                               +                                   
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1357 TGGtTctACCCGAAGGCGaTGCGCTAACC--gcAaGGAGGCAGtCGACCACGGTaGGgTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1434
Q  1358 TGGATTCACCCGAAGGCGCTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGGCGACCACGGTGGGTTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1437
B  1334 TGGATTCACCCGAAGGCGCTGCGCTAACCCGCAAGGGAGGCAGGCGACCACGGTGGGTTCAGCGACTGGGGTGAAGTCGT 1413
Diffs      B BB           B            BB B        B          B  B                      
Votes      + ++           +             + +        +          +  +                      
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1435 AACAAGGTAACCGTA 1449
Q  1438 AACAAGGTAACCGTA 1452
B  1414 AACAAGGTAgCCGTA 1428
Diffs            a     
Votes            !     
Model   BBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 86.9%, QB 89.5%, AB 87.0%, QModel 91.2%, Div. +2.0%
Diffs Left 179: N 31, A 92, Y 56 (31.3%); Right 63: N 1, A 0, Y 62 (98.4%), Score 0.5149

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1499 nt) 313572;size=1;
ParentA ( 1494 nt) CS/S000437123/Cycloclasticus_pugetii.(T)
ParentB ( 1532 nt) CS/S000391690/Alcanivorax_venustensis.(T)

A     1 --AGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGAAACGATGCTAGCTTGCT 78
Q     1 AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCATGCCTAACACATGCAAGTCGAACGGAAACGATGCTAGCTTGCT 80
B     1 AGAGTTTGATCaTGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAgGCCTAACACATGCAAGTCGAgCGGAAACGATcCTAGCTTGCT 80
Diffs              A                         A                    A          A          
Votes              +                         +                    +          +          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A    79 AGCAGGCGTCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTACCTAaTAGtGGGGGACAACCTGGTGwAAACCAGGC 158
Q    81 AGCAGGCGTCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGCATAGGAATCTACCTAGTAGCGGGGGACAACCTGGTGAAAACCAGGC 160
B    81 AGgAGGCGTCGAGcGGCGGACGGGTGAGTAAcGCgTgaGAATCTACCcAtgAGtGGGGGACAACCcGGgGAAActCgGGC 160
Diffs     A          A                 A  A AA         A ?A  N           A  A    AA A   
Votes     +          +                 +  + ++         + 0+  0           +  +    ++ +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   159 TAATACCGCATAATCCCTACGGGGCAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCgCTAaTAGATGAGCCTATGTCGGATTAGCT 238
Q   161 TAATACCGCATAATCCCTACGGGGCAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCACTATTAGATGAGCCTATGTCGGATTAGCT 240
B   161 TAATACCGCATAcgCCCTACGGGGtAAAGCAGGGGACCTTCGGGCCTTGCgCTgaTgGATGAGCtcgcGTCGGATTAGCT 240
Diffs               AA          A                         N  AN A       AAAA            
Votes               ++          +                         0  +0 +       ++++            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   239 AGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACw 318
Q   241 AGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCAACGATCCGTAGCTGGTTTGAGAGGATGATCAGCCACACTGGGACTGAGACA 320
B   241 tGTTGGTGAGGTAAaGGCTCACCAAGGCgACGATCCGTAGCTGGTcTGAGAGGATGATCAGCCACACcGGGACTGAGACA 320
Diffs   A             A             A                A                     A            
Votes   +             +             +                +                     +            
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   319 CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGAgGaAAcTCTGATGCAGCAATGCCGCGTGTGT 398
Q   321 CGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGACGCAAGTCTGATGCAGCAATGCCGCGTGTGT 400
B   321 CGGCCCgGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATcTTGgACAATGGggGCAAccCTGATcCAGCcATGCCGCGTGTGT 400
Diffs         A                             A   A       AN b  NA     A    A             
Votes         +                             +   +       +0 !  0+     +    +             
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   399 GAAGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAAAGTTtAAGGTTAATAACCTTaGGCCCTGACGTTACC 478
Q   401 GAAGAAGGCCTTAGGGTTGTAAAGCACTTTCAGTAGGGAGGAAAAGTTCAAGGTTAATAACCTTGGGCCCTGACGTTACC 480
B   401 GAAGAAGGCCTTcGGGTTGTAAAGCACTTTCAGcAGGGAGGAAggcTTaccccTaAtacgggTgaGtaCtTGACGTTACC 480
Diffs               A                    A         AAA  ?AAAA A AAAAAA AN AA A          
Votes               +                    +         +++  0++++ + ++++++ +0 ++ +          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   479 TACAGAAGAAGCACCgGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGcGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGC 558
Q   481 TACAGAAGAAGCACCAGCTAACTCCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGGAGGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGC 560
B   481 TgCAGAAGAAGCACCgGCTAAtTtCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGaAaGGTGCAAGCGTTAATCGGAATTACTGGGC 560
Diffs    A             N     A A                        A A  B                          
Votes    +             0     + +                        + +  +                          
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   559 GTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAaacAAGTcAGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTTgAAACTGttTA 638
Q   561 GTAAAGCGCGCGTAGGCGGTTAGTTAAGTTAGATGTGAAAGCCCCGGGCTCAACCTGGGAACTGCATTTAAAACTGGCTA 640
B   561 GTAAAGCGCGCGTAGGCGGTgtGTTAAGTcgGATGTGAAAGCCCaGGGCTCAACCTtGGAAtTGCATccgAtACTGGCac 640
Diffs                       aaBBB    Na             a           a    a     aaN a    BBaa
Votes                       !!+++    0!             !           !    !     !!0 !    ++!!
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   639 gCTAGAGTgTGGTAGAGGAGAGTGGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCTGAAGGAACACCAGTGGCGAA 718
Q   641 ACTAGAGTATGGTAGAGGAGAGTGGAATTTCAGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATCTGAAGGAACACCAGTGGCGAA 720
B   641 gCTAGAGTgcaGTAGAGGgagGTGGAATTTCcGGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAgATCgGAAGGAACACCAGTGGCGAA 720
Diffs   N       Naa       aaa          a                       a   a                    
Votes   0       0!!       !!!          !                       !   !                    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   719 GGCGGCtctCTGGACcaACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGtAGCAAACgGGATTAGATACCCcGGTAGTCCACG 798
Q   721 GGCGGCCTCCTGGACTGACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG 800
B   721 GGCGGCCTCCTGGACTGACACTGACGCTGAGGTGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACG 800
Diffs         BBB      BB                             B       B             B           
Votes         +++      ++                             +       +             +           
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   799 CCGTAAACGATGtcAaCTAaCtGTTGGGcGggTT--tcCgcTTaGTGGtGCAGCTAACGCaATAAGTTgaCCGCCTGGGG 876
Q   801 CCGTAAACGATGAGAGCTAGCCGTTGGGGGCCTT-GAGCCTTTGGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTTCTCCGCCTGGGG 879
B   801 CtGTAAACGATGtctaCTAGCCGTcGGGGtCCTTaGtGaCTTTGGTGGCGCAGCTAACGCGATAAGTagaCCGCCTGGGG 880
Diffs    a          NNaN   B B  a   BaBB    NBaBB  B    B           B      aNN          
Votes    !          00!0   + +  !   +!++     +!++  +    +           +      !00          
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   877 AGTACGGCCGCAAGGcTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCA 956
Q   880 AGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCA 959
B   881 AGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCA 960
Diffs                  B                                                                
Votes                  +                                                                
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   957 ACGCGAAGAACCTTACCtaCCCTTGACATaCagaGAActtTctaGAGAtagattgGTGCCTTCGGGAACtctGAtACAGG 1036
Q   960 ACGCGAAGAACCTTACCAGCCCTTGACATCCTCGGAATCCTGCGGAGACGCGGGAGTGCCTTCGGGAACCGAGAGACAGG 1039
B   961 ACGCGAAGAACCTTACCAGgtCTTGACATCCTCGGAActtgGCaGAGAtGCcttgGTGCCTTCGGGAgCCGAGtGACAGG 1040
Diffs                    BBaa        B BBB   NNNaBBN    NBB?NNN            a BBB aB     
Votes                    ++!!        + +++   000!++0    0++0000            ! +++ !+     
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1037 TGcTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTaTCCtTAgTTGC 1116
Q  1040 TGTTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCCTATTTGC 1119
B  1041 TGcTGCATGGCcGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAACGAGCGCAACCCTTGTCCtTAgTTGC 1120
Diffs     N        a                                                        B   N  N    
Votes     0        !                                                        +   0  0    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1117 tAcCAttTA--GtTGGGcACTCTAaGGAGACTGCCGGTGAtAAACCGGAGGAAGGTGGGGAcGACGTCAAGTCATCATGG 1194
Q  1120 CAGCACATAATGGTGGGAACTCTAGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAGTCATCATGG 1199
B  1121 CAGCACgTcATGGTGGGAACTCTAGGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGAcGACGTCAgGTCATCATGG 1200
Diffs   B B  B? a   B    B      B               B                    N       a          
Votes   + +  +0     +    +      +               +                    0       !          
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1195 CCCTTAtGGGtaGGGCTACACAC-TGCTACAATGGccgGTACAGAGGGCcGCaAActcGCGAgagtaAGCtAAtCCCttA 1273
Q  1200 CCCTTACGGGCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGGGCGTACAGAGGGCAGCGAAGCGGCGACGTGGAGCCAACCCCAGA 1279
B  1201 CCCTTACGacCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGctgGTACAGAGGGttGCGAAGtcGCGAgGcGaAGCtAAtCCCttA 1280
Diffs         B aaBB                       N?N          a?  B  BNN    NB?BN   N  N   NN 
Votes         + !!++                       000          !0  +  +00    0+0+0   0  0   00 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1274 AAGCcggTCcTAGTCCGGATtGcAGTCTGCAACTCGACTgCaTGAAGctGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGAATGCC 1353
Q  1280 AAGCGTCTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGAATGCC 1359
B  1281 AAGCcagTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGAATGCC 1360
Diffs       N?N  B          B B                B B     BB                               
Votes       000  +          + +                + +     ++                               
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1354 GCGGTGAATtCGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCAaaAGAAGTGGgTAGgCTAA 1433
Q  1360 GCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGGTTGCACCAGAAGTGGCTAGTCTAA 1439
B  1361 GCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCATGGGAGTGGaTTGCACCAGAAGTGGCTAGTCTAA 1440
Diffs            B                                             a     BB        B   B    
Votes            +                                             !     ++        +   +    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1434 CCTTCGGGAGGcCGcTCACCACttTGTGaTtCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1493
Q  1440 CCTTCGGGAGGACGGTCACCACGGTGTGGTCCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1499
B  1441 C--TacGGAGGACGGTCACCACGGTGTGGTtCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA 1498
Diffs       aa     B  B       BB    B N                             
Votes       !!     +  +       ++    + 0                             
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 91.7%, QB 89.8%, AB 87.7%, QModel 94.0%, Div. +2.4%
Diffs Left 73: N 1, A 9, Y 63 (86.3%); Right 151: N 38, A 40, Y 73 (48.3%), Score 0.4591

------------------------------------------------------------------------
Query   ( 1306 nt) 329518;size=1;
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A    37 GAACGATGAAGCTGGAGCTTGCTCtGGTGGATTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGtAACCTGCCCTTCACTCTG 116
Q     1 GAACGATGAAGCTGGAGCTTGCTCCGGTGGATTAGTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGAGCAACCTGCCCTTCACTCTG 80
B    37 GAgCGAgaAAGC-----CcTtCgggGtgaGtacAGcGGCGgACGGGTGAGTAACgCGTG-GgAAtCTGCCCagtAgTggG 110
Diffs     A   AA          A A AA? AAA AAA  A    A             A      ?  A      AAA A AA 
Votes     +   ++          + + ++0 +++ +++  +    +             +      0  +      +++ + ++ 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   117 GGATAAgcGCtGGAAACgGcgtCTAATACCGGATATgAGtccCTGccGCATggtgGgggTTGGAAAGAATTTCGGTGAAG 196
Q    81 GGATAACTGCGGGAAACTGTAGCTAATACCGGATATTAGGATCTGAGGCATCTCAGATCTTGGAAAGAATTTCGGTGAAG 160
B   111 GGAcAACaGCcGGAAACgGctGCTAATACCGcATAcgccctaCgGgGGaAagcagGggaTcttcggaccTTgtGcTattG 190
Diffs      A  b?  ?      N N?b         A   ANAA??? A ?b A AN??N NN? AAAAAAAAA  AA A AAA 
Votes      +  !0  0      0 00!         +   +0++000 + 0! + +0000 000 +++++++++  ++ + +++ 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   197 GATGGACTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGA 276
Q   161 GATGGACTCGCGGCCTATCAGCTTGTTGGTGAGGTAATGGCTCACCAAGGCGACGACGGGTAGCCGGCCTGAGAGGGTGA 240
B   191 GATGagCcCGCGtCagATtAGCTTGTTGGTGgGGTAATGGCctACCAAGGCGACGAtctGTAGCtGGtCTGAGAGGaTGA 270
Diffs       AA A    A AA  A            A         AA             AAA     A  A        A   
Votes       ++ +    + ++  +            +         ++             +++     +  +        +   
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   277 CCGGCCACACTGGgACTGAGACACGGcCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCC 356
Q   241 CCGGCCACACTGGAACTGAGACACGGTCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGCACAATGGGCGCAAGCC 320
B   271 tCaGCCACAtcGGgACTGAGACACGGcCCgaACTCCTACGGGAGGCAGCAGTGGGGAATATTGgACAATGGGgGCAAcCC 350
Diffs   A A      AA  N            N  AA                                A        A    A  
Votes   + +      ++  0            0  ++                                +        +    +  
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   357 TGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGAtGAcGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGtAGGGAAGA--------------- 421
Q   321 TGATGCAGCAACGCCGCGTGAGGGACGAAGGCCTTCGGGTTGTAAACCTCTTTTAGCAGGGAAGA--------------- 385
B   351 TGATcCAGCcAtGCCGCGTGtGtGAaGAAGGCCTTCGGGTTGTAAAgCaCTTTcAGCgaGGAgGAaagcctgatggctaa 430
Diffs       A    A A        A A  ?  b                 A A    A  bAA   A                 
Votes       +    + +        + +  0  !                 + +    +  !++   +                 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   422 -----AGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCA 496
Q   386 -----AGCGAAAGTGACGGTACCTGCAGAAAAAGCACCGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGGTGCA 460
B   431 tacccAtCGgggGTGACGtTACtcGCAGAAgAAGCACCGGCTAACTcCGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGgAGGGTGCA 510
Diffs         A  AAA      A   AA      A               A                        A        
Votes         +  +++      +   ++      +               +                        +        
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   497 AGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAAt-CccGAgGCTCAACcT 575
Q   461 AGCGTTGTCCGGAATTATTGGGCGTAAAGAGCTCGTAGGCGGTTTGTCGCGTCTGCTGTGAAAA-CTGGAAGCTCAACTT 539
B   511 AGCGTTaatCGGAATTAcTGGGCGTAAAGcGCaCGTAGGCGGcgaGTtaaGctaGCTGTGAAAAgCcccggGCTCAACcT 590
Diffs         AAA        A           A  A         AAA  AAA AAA         b  NNAAN       N 
Votes         +++        +           +  +         +++  +++ +++            00++0       0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   576 CggGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGGGAGAttGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGAT 655
Q   540 CCAGCCTGCAGTGGGTACGGGCAGACTAGAGTGCGGTAGGGGAGAACGGAATTCCTGGTGTAGCGGTGGAATGCGCAGAT 619
B   591 gggaaCTGCAGTtaGaACtGGCtagCTAGAGTaCGGTAGaGGAGtgtGGAATTtCctGTGTAGCGGTGaAATGCGtAGAT 670
Diffs   ANNAA       AA A  A   AAA       A      A    A?N      A AA           A      A    
Votes   +00++       ++ +  +   +++       +      +    +00      + ++           +      +    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   656 ATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGaTCTCTGGGCCGTaACTGACGCTGAGGAGCGAAAGgGTGGGGAGCaAACAG 735
Q   620 ATCAGGAGGAACACCGATGGCGAAGGCAGTTCTCTGGGCCGTTACTGACGCTGAGGAGCGAAAGCGTGGGGAGCGAACAG 699
B   671 ATagGaAGGAACAtCagTGGCGAAGGCgacaCTCTGGaCtGaTACTGACGCTGAGGcGCGAAAGCGTGGGGAGC-AACAG 749
Diffs     AA A       A AA          AA?A      A A Ab             A       b               
Votes     ++ +       + ++          ++0+      + + +!             +       !               
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   736 GcTTAGATACCCTGGTAGTCCACcCCGTAAACGtTGGGaaCTAGaTGTaGGgtcCATTCCACGgatTCtGTGtCGcAGcT 815
Q   700 GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGGTGGGTGCTAGCTGTGGGCCACATTCCACGTGGTCCGTGACGAAGTT 779
B   750 GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGaTGtcTaCTAGCcGTtGGgagCcTT--gaGctcTtaGTGgCGcAGcT 827
Diffs    b                     b         ?  AAbN    bA  ?  N?? A    AA ??? A?   ?  N  N 
Votes    !                     !         0  ++!0    !+  0  000 +     + 000 +0   0  0  0 
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   816 AACgCATTAAGttCCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGC 895
Q   780 AACACATTAAGCACCCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTAAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGC 859
B   828 AACgCAcTAAGtAgaCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGtTAAAACTCAAAtGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGt 907
Diffs      N  A    NbAA                         A           A                          A
Votes      0  +    0!++                         +           +                          +
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

A   896 GGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAaGgCTTGACATatacCGGAAacgTCcAGAGATgG--T 973
Q   860 GGAGCATGCGGATTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGCCTTGACAT-CCTCGGAACTTTCTAGAGATAGATT 938
B   908 GGAGCATGtGGtTTAATTCGAcGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGCCTTGACAT-CCTtGGAACTTagcAGAGATgctTT 986
Diffs           A  A         A                     B B         BBBa    BBBaaN      Na   
Votes           +  +         +                     + +          ++!    +++!!0      0    
Model   AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAxBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A   974 cGccCCgTaaGG--tCGgtatACAGGTGgTGCATGGtTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGcAA 1051
Q   939 GGTGCCTTCGGGAACCGAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAA 1018
B   987 GGTGCCTTCGGGAgCCaAGTGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGTAA 1066
Diffs   B BB  B BB    B aBBBB       B       B                                        B  
Votes   + ++  + ++      !++++       +       +                                        +  
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1052 CGAGCGCAACCCTcGTtCTatGTTGCCAGCACgTaATGGTGGGAACTCatgGGAtACTGCCGGgGtCAActCGGAGGAAG 1131
Q  1019 CGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCACATTATGGTGGGAACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAG 1098
B  1067 CGAGCGCAACCCTTGTCCTTAGTTGCCAGCACgTaATGGTGGGAACTCTAAGGAGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAG 1146
Diffs                B  B  BB           N N             BBB   B        B B   BB         
Votes                +  +  ++           0 0             +++   +        + +   ++         
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1132 GTGGGGAtGACGTCAAaTCATCATGcCCCTTAtGtCtTGGGCTtCACgCaTGCTACAATGGCcAGtACAatgGGCtGCgA 1211
Q  1099 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGCTAGGACAGACGGCCGCAA 1178
B  1147 GTGGGGACGACGTCAAGTCATCATGGCCCTTACGGCCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGgcgGtACAaAgGGttGCcA 1226
Diffs          B        B        B      B B B      B   B B           aNa N   NBN  aN  ? 
Votes          +        +        +      + + +      +   + +           !0! 0   0+0  !0  0 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1212 taCCGCaAGGtGGAGCgAATCCcAaAAAgCTgGTCccAGTtCGGATtGagGTCTGCAACTCGACctCaTGAAGtcGGAgT 1291
Q  1179 ACCCGCGAGGGGGAGCCAATCCGACAAACCTAGTCGTAGTCCGGATCGGAGTCTGCAACTCGACTCCGTGAAGCTGGAAT 1258
B  1227 AtCCGCGAGGtGGAGCtAATCCcgaAAAaCcgtTCGTAGTCCGGATtGGAGTCTGCAACTCGACTCCaTGAAGtcGGAAT 1306
Diffs   B?    B   N     ?     NaN   ? aNa  BB   B     N BB              BB N     NN   B 
Votes   +0    +   0     0     0!0   0 !0!  ++   +     0 ++              ++ 0     00   + 
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

A  1292 CGCTAGTAATCGcAgATCAGCaAcGcTgCGGTGAATACGTTCCCGGGC 1339
Q  1259 CGCTAGTAATCGGATATCAGCCATGATCCGGTGAATACGTTCCCGGGC 1306
B  1307 CGCTAGTAATCGtgaATCAG-aATGtcaCGGTGAATACGTTCCCGGGC 1353
Diffs               ?a?      N B ?a?                    
Votes               0!0        + 0!0                    
Model   BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

Ids.  QA 89.2%, QB 81.3%, AB 79.2%, QModel 92.4%, Div. +3.6%
Diffs Left 216: N 12, A 47, Y 157 (72.7%); Right 92: N 13, A 25, Y 54 (58.7%), Score 0.3922