--- a/test-data/tRNA_2.bmprobs	Mon Dec 05 13:58:16 2022 +0000
+++ b/test-data/tRNA_2.bmprobs	Mon Aug 19 18:53:00 2024 +0000
@@ -1,172 +1,204 @@
-1 1 0.247253
-2 2 0.247252
-3 3 0.127121
-4 4 0.0367335
-5 5 0.0369676
-6 6 0.129988
-7 7 0.156077
-8 8 0.835935
-8 9 0.012729
-9 8 0.010632
-9 9 0.727258
-9 10 0.0549287
-10 9 0.04195
-10 10 0.0853335
-10 11 0.0115868
-11 10 0.0364601
-11 11 0.112239
-12 10 0.011935
-12 11 0.0436248
-12 12 0.0614308
-13 11 0.0645154
-13 12 0.028434
-14 12 0.133445
-14 13 0.0169358
-15 13 0.260167
-15 14 0.0172799
-15 16 0.0124747
-16 14 0.271834
-16 15 0.0178714
-16 17 0.0141486
-17 15 0.185722
-17 16 0.0202801
-17 18 0.0184277
-18 16 0.300704
-18 17 0.0355582
-18 19 0.0165149
-19 17 0.700705
-19 18 0.0610097
-19 20 0.0138794
-20 18 0.193762
-20 19 0.11731
-20 21 0.012503
-21 19 0.633061
-21 20 0.119843
-22 20 0.625797
-22 21 0.127468
-23 20 0.0117929
-23 21 0.621337
-23 22 0.0118595
-23 24 0.0104834
-24 21 0.0184503
-24 22 0.0481581
-24 23 0.0441549
-24 25 0.0420745
-25 23 0.68405
-25 24 0.0269372
-25 26 0.0420693
-26 24 0.53624
-27 25 0.0346266
-27 26 0.120675
-28 26 0.681355
-28 27 0.0199945
-28 29 0.0196255
-29 27 0.0227404
-30 28 0.0396584
-30 29 0.0227396
-30 31 0.0165441
-31 29 0.121498
-31 32 0.114327
-32 30 0.351807
-32 31 0.0703916
-32 33 0.0332191
-33 31 0.0980398
-33 32 0.0266787
-33 34 0.0331979
-34 31 0.0122885
-34 32 0.400684
-34 33 0.0116529
-34 35 0.0331958
-35 32 0.0101403
-35 33 0.22599
-35 36 0.0332106
-36 33 0.0136772
-36 34 0.156117
-36 37 0.0332566
-37 34 0.0427905
-37 35 0.113127
-37 38 0.0933967
-38 35 0.0723242
-38 36 0.0618818
-39 34 0.0149807
-39 36 0.0997152
-39 37 0.0299675
-40 34 0.0108419
-40 35 0.01547
-40 37 0.111326
-40 38 0.0203761
-40 41 0.0196142
-41 35 0.0159003
-41 36 0.0127203
-41 38 0.149756
-42 34 0.0119499
-42 36 0.0189085
-42 37 0.010129
-42 39 0.0145996
-43 34 0.010789
-43 35 0.013731
-43 37 0.0170711
-43 38 0.0146016
-43 44 0.0354944
-44 35 0.0181452
-44 36 0.0122707
-44 38 0.0248855
-44 39 0.0183418
-44 45 0.0336616
-45 36 0.0423026
-45 39 0.0300877
-45 40 0.013096
-45 46 0.0286025
-46 37 0.0702926
-46 38 0.0130327
-46 40 0.0113529
-47 38 0.119444
-48 39 0.0264015
-48 40 0.0166626
-49 39 0.0133557
-49 40 0.309884
-50 41 0.109972
-51 41 0.0223073
-51 42 0.0365047
-52 43 0.0228365
-53 43 0.02009
-53 44 0.683193
-54 44 0.121387
-54 45 0.035521
-55 46 0.681952
-56 46 0.0343041
-56 47 0.536468
-56 48 0.0112514
-57 47 0.0531432
-57 48 0.0486503
-58 48 0.0521922
-58 49 0.632028
-59 49 0.117956
-59 50 0.628217
-60 50 0.0252284
-60 51 0.104879
-61 51 0.0460576
-61 52 0.573747
-62 52 0.165836
-62 53 0.0472354
-63 53 0.382375
-64 54 0.2672
-65 55 0.320519
-66 56 0.818192
-67 57 0.355528
-68 58 0.282881
-69 59 0.27801
-70 60 0.464549
-71 61 0.857675
-72 62 0.497193
-73 63 0.7313
-74 64 0.734773
-75 65 0.881053
-76 66 0.139472
-77 67 0.130956
-78 68 0.0370464
-79 69 0.0367371
-80 70 0.127122
-81 71 0.247251
-82 72 0.247251
-83 73 0.999955
+1 1 0.366252
+2 2 0.365091
+3 3 0.27684
+4 4 0.164336
+5 5 0.164496
+6 6 0.275403
+6 7 0.0150333
+7 7 0.312158
+7 8 0.041509
+8 7 0.0147566
+8 8 0.537633
+8 9 0.0515355
+9 8 0.029658
+9 9 0.340577
+9 10 0.155798
+10 9 0.0624269
+10 10 0.1087
+10 11 0.0817069
+11 9 0.0153131
+11 10 0.0586114
+11 11 0.0692688
+11 12 0.0603811
+12 10 0.0279601
+12 11 0.0560559
+12 12 0.0638994
+12 13 0.0516385
+13 11 0.0476271
+13 12 0.0400538
+13 13 0.0236597
+13 14 0.0429642
+14 12 0.0692335
+14 13 0.0256176
+14 14 0.0136384
+14 15 0.0315447
+15 13 0.117035
+15 14 0.0251312
+15 16 0.097924
+16 14 0.143556
+16 15 0.0257794
+16 17 0.0661332
+16 18 0.0114245
+17 15 0.115644
+17 16 0.0290074
+17 18 0.110305
+17 19 0.0179278
+18 16 0.145455
+18 17 0.0433537
+18 19 0.0938817
+18 20 0.014589
+19 17 0.225382
+19 18 0.0699153
+19 19 0.0108711
+19 20 0.0748197
+19 21 0.0129644
+20 17 0.0271947
+20 18 0.124659
+20 19 0.126635
+20 21 0.0658208
+21 18 0.0358134
+21 19 0.0923461
+21 20 0.144193
+21 22 0.046438
+22 19 0.0286916
+22 20 0.0788485
+22 21 0.161012
+22 23 0.0344135
+23 20 0.033323
+23 21 0.0774252
+23 22 0.0462986
+23 24 0.02822
+24 21 0.0448704
+24 22 0.038983
+24 23 0.0914385
+24 25 0.0264846
+25 22 0.0255459
+25 23 0.152178
+25 24 0.0517826
+25 26 0.0264143
+26 23 0.0114342
+26 24 0.107608
+26 25 0.0104744
+27 24 0.0171665
+27 25 0.0254544
+27 26 0.105359
+28 26 0.147377
+28 27 0.0361346
+28 29 0.0332037
+29 26 0.0250025
+29 27 0.0304826
+30 27 0.0199978
+30 28 0.0405605
+30 29 0.0383873
+30 31 0.0415247
+31 28 0.0116663
+31 29 0.0606234
+31 30 0.0115163
+31 32 0.0169077
+32 29 0.0983364
+32 30 0.0341299
+33 30 0.0418556
+33 31 0.0175872
+34 31 0.0311096
+34 32 0.0137121
+35 32 0.0168319
+37 38 0.0130611
+38 39 0.0191599
+40 41 0.0323542
+45 40 0.015565
+46 40 0.0110929
+46 41 0.0149779
+47 39 0.0105212
+47 41 0.0109433
+48 40 0.0266892
+48 41 0.0140021
+49 40 0.0261797
+49 41 0.0748955
+50 41 0.0525148
+51 41 0.0372709
+51 42 0.0377785
+51 43 0.0120601
+52 43 0.0338294
+52 44 0.0188302
+52 47 0.011994
+52 48 0.0100314
+53 43 0.0376898
+53 44 0.150707
+53 45 0.0139785
+53 48 0.0201243
+53 49 0.0195735
+54 44 0.109801
+54 45 0.030891
+54 46 0.0253539
+54 49 0.0245344
+54 50 0.0145876
+55 45 0.0248296
+55 46 0.0970525
+55 47 0.0256489
+55 48 0.0114306
+55 50 0.0321933
+56 46 0.0638499
+56 47 0.102833
+56 48 0.0362092
+56 51 0.0435195
+57 47 0.088865
+57 48 0.0422988
+57 49 0.0220075
+57 52 0.0112409
+58 48 0.112294
+58 49 0.0962222
+58 50 0.0168976
+58 53 0.0461357
+59 49 0.177376
+59 50 0.0822895
+60 50 0.133033
+60 51 0.0614758
+61 51 0.141414
+61 52 0.149188
+62 52 0.20773
+62 53 0.0371771
+63 53 0.276067
+63 54 0.0140229
+64 54 0.287741
+64 55 0.0108699
+65 55 0.461596
+65 60 0.011126
+66 56 0.627243
+66 60 0.0157815
+66 61 0.0122127
+67 57 0.488199
+67 61 0.0177159
+68 58 0.479821
+68 62 0.0121482
+69 59 0.303654
+69 60 0.0105558
+70 59 0.0113422
+70 60 0.405517
+70 61 0.0163693
+70 62 0.010016
+70 64 0.0114747
+71 60 0.0202893
+71 61 0.417286
+71 62 0.0265025
+71 63 0.0118155
+72 61 0.0240496
+72 62 0.323048
+72 63 0.0244174
+72 64 0.0151525
+73 62 0.0325948
+73 63 0.417022
+73 64 0.0213962
+73 65 0.01446
+74 63 0.0220079
+74 64 0.398229
+74 65 0.0218064
+75 64 0.0224602
+75 65 0.650758
+76 66 0.286689
+77 67 0.293382
+78 68 0.169285
+79 69 0.165512
+80 70 0.276995
+81 71 0.364451
+82 72 0.363923
+83 73 0.988123