diff test-data/hsa_chrM_shapes_positive.txt @ 0:4b01f0d7b350 draft default tip

planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/sshmm/ commit b578a90031fd7061fbdaef48b6a66d895ac077c3
author rnateam
date Fri, 06 Jul 2018 09:01:40 -0400
parents
children
line wrap: on
line diff
--- /dev/null	Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000
+++ b/test-data/hsa_chrM_shapes_positive.txt	Fri Jul 06 09:01:40 2018 -0400
@@ -0,0 +1,38 @@
+>chrM:554-615(+)
+EEEEEEEEEEEEEEEEEEEESSSSISSSIIISSSSHHHHHHHHHSSSSISSSISSSSEEEE 0.62376
+>chrM:583-644(+)
+EESSSSHHHHHHHHHSSSSMMMMMMSSSSSHHHHSSSSSMMSSSHHHHHHHHHHSSSEEEE 0.3152474
+>chrM:888-949(+)
+SSSISSHHHHSSSSSMSSSSIISSISSSSIIISSHHHHSSIIIISSISSISSIISSSSEEE 0.2931414
+SSSMSSSHHHHHSSSMMMMMSSSSHHHHHHSSSSMMMMMMMMMMSSSEEEEEEEEEEEEEE 0.0800483
+>chrM:1492-1553(+)
+EEESSSSSIISSSSSIIIIIISSSHHHHHHHHHHHHHHHHSSSIIIIIIISSSSSISSSSS 0.1828745
+>chrM:2377-2438(+)
+EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEESSSSHHHHHHHHHSSSSEEE 0.4065502
+>chrM:2492-2553(+)
+EESSSSSHHHHHSSSSSMMMSSSSSSSISSHHHHHSSISSSSSSSEEEEEEEEEEEEEEEE 0.1278867
+EESSSSSHHHHHSSSSSMMMSSSSSSSISSHHHHHSSISSSSSSSMMMSSSHHHHHHHSSS 0.0410739
+>chrM:3151-3212(+)
+EEEEEEEEESSSHHHHHHHHSSSMMSSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSEEEEEEEEEE 0.2376765
+>chrM:3167-3228(+)
+EEEEEEEEESSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSSMMMMMMMMMMSSSSHHHHHHHSSSSE 0.1810531
+>chrM:4269-4330(+)
+EESSSHHHHHHSSSMSSSSSSHHHHHSSSSSSMMSSSSSSHHHHHHHHHHHHSSSSSSEEE 0.0392731
+EESSSSIIISSSSHHHHHSSSSIISSSSMMSSSSSSIISSHHHHHHHHHSSIISSSSSSEE 0.0283899
+>chrM:4370-4431(+)
+EEEEESSSHHHHHHHHSSSMMSSSMMSSSHHHHHHSSSMMSSSSHHHHHSSSSMMMSSSEE 0.370664
+>chrM:4387-4448(+)
+EEEEEEEEESSSHHHHHHSSSMMSSSSHHHHHSSSSMSSSSSHHHHHHHSSSSSEEEEEEE 0.2173924
+SSSMMMMMMSSSHHHHHHSSSMMSSSSHHHHHSSSSMSSSSSHHHHHHHSSSSSMMMSSSE 0.0593635
+>chrM:4403-4464(+)
+ESSSSMMSSSSHHHHHSSSSMSSSSSHHHHHHHSSSSSMMMMMMMMMMMMMMMSSSSEEEE 0.1334685
+EEESSSISSSSSSIIIIIIIISSSSSHHHHHHHSSSSSIIIIISSSSSSIISSSEEEEEEE 0.0720459
+EEESSMMSSSSHHHHHSSSSMSSSSSHHHHHHHSSSSSMMMMMMMSSHHHHHSSMMMMSSE 0.0309876
+>chrM:15958-16019(-)
+SSSISSSSSISSSSIIISSSSSSSSHHHHHHHSSSSSISSSIISSSSIISSSSSIISSSEE 0.2243046
+>chrM:14470-14531(-)
+EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEESSSSSSISSSHHHHSSSISSSSSSE 0.0283177
+EEESSSSHHHHHHHHSSSSMMMMMMMMMMMMMMMMMSSSSSSISSSHHHHSSSISSSSSSE 0.0174045
+>chrM:5828-5889(-)
+EEEEEEESSSHHHHHHSSSMSSSSSHHHHHHHSSSSSMMMMSSSSSHHHHHSSSSSEEEEE 0.0497615
+EEEEEEESSSHHHHHHSSSMMMMMMMMMMMMMMMMMMSSSISSSSSHHHHHSSSSSISSSE 0.0423085