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planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/vienna_rna commit 36681a08c6e44c663169caaefd964781c43d0d29
author rnateam
date Wed, 20 Dec 2017 08:33:05 -0500
parents 93c94bf87a04
children
comparison
equal deleted inserted replaced
6:93c94bf87a04 7:42b7c0fd4370
1 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343590.trna2-A 1 >Anolis_caro_chrUn_GL343590.trna2_AlaAGC
2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA 2 UGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGUGAGAGGUAGUGGGAUCGAUGCCCACAUUCUCCA
3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00) 3 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))))).. (-22.00)
4 ,((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))),)), [-23.20] 4 >Anolis_caro_chrUn_GL343207.trna3_AlaAGC
5 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 d=9.72}
6 .((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......))))))))).)). {-21.90 MEA=58.88}
7 frequency of mfe structure in ensemble 0.142309; ensemble diversity 14.51
8 >Anolis_carolinensis_chrUn_GL343207.trna3-A
9 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA 5 GGGGAAUUAGCUCAAAUGGUAGAGCGCUCGCUUAGCAUGCGAGAGGUAGCGGGAUUGAUGCCCGCAUUCUCCA
10 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60) 6 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). (-29.60)
11 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). [-29.88]
12 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 d=0.64}
13 (((((((..((((........)))).(((((.......))))).....(((((.......)))))))))))). {-29.60 MEA=71.81}
14 frequency of mfe structure in ensemble 0.63265; ensemble diversity 1.15