Mercurial > repos > rnateam > viennarna_rnaduplex
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author | rnateam |
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date | Wed, 20 Dec 2017 08:33:26 -0500 |
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--- a/test-data/sample_3_result.txt Thu Sep 28 16:23:01 2017 -0400 +++ b/test-data/sample_3_result.txt Wed Dec 20 08:33:26 2017 -0500 @@ -1,21 +1,9 @@ >SECIS_1 AUUUUAUCCAUGAAAGUGUUUCCUCUAAACCUAUGUGGAGGAACACCUGAUGUCCAGGAAAAU .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. (-27.97) -.((((...(((.{..(((.((((((((........))))))))))).}.))).....)))}.. [-29.13] -..(((...(((....(((.((((((((........)))))))))))...))).....)))... {-26.59 d=5.82} -.((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. {-27.97 MEA=54.87} - frequency of mfe structure in ensemble 0.151171; ensemble diversity 8.50 >6S_1 GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU (((((((...(((((.((.....((((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((.(.((((.....))))).))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))))......)))))))....))))))). (-110.38) -(((((((,,{(((((,((.....{(((((....(((((((((({{{....,},.........(((.((((.....((.((((.(..((((.{.((((.....)))),.))))...))))).))}.)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))),......))))))).}.,))))))). [-115.12] -(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 d=10.73} -(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 MEA=177.59} - frequency of mfe structure in ensemble 0.000456946; ensemble diversity 17.02 >6S_2 UUGUCCCUGCCGUGCUCGUGACUUGGCCAUACAUUCUCUGAACCUAUGUCUUACGGCAUAUGGGUUGCGGGAGUGUAGAGCUGGAGUGAUCGUCUACUCGUAGACGAACCCGAUGCUCUUCGGAUCGCGACCACCUUGAACCUCAGGGUUCGAGAUGCCGGCCUUGACGGCACAGGCGGGGCAUC .((.(((((((((((.(((.(...((((...((.((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))))..)))).).))))))).))))))))).. (-129.27) -.((,(((((((((((.(((.{...((((...,,.((((.((((((..(((....))).....((((((((...{(.(((((.((.((..((((((,....,))))))))))...))))).)}..)))))))).....,,...,,.)))))))))),}..)))).}.))))))).))))))))).. [-132.48] -.((.(((((((((((.(((.(...((((......((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))....)))).).))))))).))))))))).. {-129.23 d=10.34} -.((.(((((((((((.(((.(...((((...(..((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............)))))))))).)..)))).).))))))).))))))))).. {-128.23 MEA=168.16} - frequency of mfe structure in ensemble 0.00547171; ensemble diversity 14.91