Mercurial > repos > rnateam > viennarna_rnaeval

diff test-data/sample_3_result.txt @ 6:f430d419b19f draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/vienna_rna commit d9f13fd859165e4280412ec73f8f3f8b258d351d-dirty
author rnateam
date Thu, 28 Sep 2017 16:21:23 -0400
parents f9fdedb38919
children 4f1a37b08904
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/sample_3_result.txt	Fri Sep 22 09:49:20 2017 -0400
+++ b/test-data/sample_3_result.txt	Thu Sep 28 16:21:23 2017 -0400
@@ -1,9 +1,21 @@
 >SECIS_1
 AUUUUAUCCAUGAAAGUGUUUCCUCUAAACCUAUGUGGAGGAACACCUGAUGUCCAGGAAAAU
 .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. (-27.97)
+.((((...(((.{..(((.((((((((........))))))))))).}.))).....)))}.. [-29.13]
+..(((...(((....(((.((((((((........)))))))))))...))).....)))... {-26.59 d=5.82}
+.((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. {-27.97 MEA=54.87}
+ frequency of mfe structure in ensemble 0.151171; ensemble diversity 8.50
 >6S_1
 GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU
 (((((((...(((((.((.....((((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((.(.((((.....))))).))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))))......)))))))....))))))). (-110.38)
+(((((((,,{(((((,((.....{(((((....(((((((((({{{....,},.........(((.((((.....((.((((.(..((((.{.((((.....)))),.))))...))))).))}.)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))),......))))))).}.,))))))). [-115.12]
+(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 d=10.73}
+(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 MEA=177.59}
+ frequency of mfe structure in ensemble 0.000456946; ensemble diversity 17.02
 >6S_2
 UUGUCCCUGCCGUGCUCGUGACUUGGCCAUACAUUCUCUGAACCUAUGUCUUACGGCAUAUGGGUUGCGGGAGUGUAGAGCUGGAGUGAUCGUCUACUCGUAGACGAACCCGAUGCUCUUCGGAUCGCGACCACCUUGAACCUCAGGGUUCGAGAUGCCGGCCUUGACGGCACAGGCGGGGCAUC
 .((.(((((((((((.(((.(...((((...((.((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))))..)))).).))))))).))))))))).. (-129.27)
+.((,(((((((((((.(((.{...((((...,,.((((.((((((..(((....))).....((((((((...{(.(((((.((.((..((((((,....,))))))))))...))))).)}..)))))))).....,,...,,.)))))))))),}..)))).}.))))))).))))))))).. [-132.48]
+.((.(((((((((((.(((.(...((((......((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))....)))).).))))))).))))))))).. {-129.23 d=10.34}
+.((.(((((((((((.(((.(...((((...(..((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............)))))))))).)..)))).).))))))).))))))))).. {-128.23 MEA=168.16}
+ frequency of mfe structure in ensemble 0.00547171; ensemble diversity 14.91