diff test-data/sample_3_result.txt @ 6:fb69ae544451 draft default tip

planemo upload for repository https://github.com/bgruening/galaxytools/tree/master/tools/rna_tools/vienna_rna commit 36681a08c6e44c663169caaefd964781c43d0d29
author rnateam
date Wed, 20 Dec 2017 08:36:19 -0500
parents e6314cf1d9c6
children
line wrap: on
line diff
--- a/test-data/sample_3_result.txt	Thu Sep 28 16:25:57 2017 -0400
+++ b/test-data/sample_3_result.txt	Wed Dec 20 08:36:19 2017 -0500
@@ -1,21 +1,9 @@
 >SECIS_1
 AUUUUAUCCAUGAAAGUGUUUCCUCUAAACCUAUGUGGAGGAACACCUGAUGUCCAGGAAAAU
 .((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. (-27.97)
-.((((...(((.{..(((.((((((((........))))))))))).}.))).....)))}.. [-29.13]
-..(((...(((....(((.((((((((........)))))))))))...))).....)))... {-26.59 d=5.82}
-.((((...(((.(..(((.((((((((........))))))))))).).))).....)))).. {-27.97 MEA=54.87}
- frequency of mfe structure in ensemble 0.151171; ensemble diversity 8.50
 >6S_1
 GAAACCCUAAUGUAUUCGAUAUAGUUCCUGAUAUUUUUGAACCGAACAAUUUUUUAUACCUAGGGAGCUUGGAGUUCCGGCGCGGCGCACAUGCCUUCACACGAGGAAGUGCAAACCGUUAGACAGAGCACCCACCUGCUUUAAUUGAGAGCGGGUUCAAAGGAAGGGAAUCCUAAACGGUACGAUUGGGGUUUCU
 (((((((...(((((.((.....((((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((.(.((((.....))))).))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))))......)))))))....))))))). (-110.38)
-(((((((,,{(((((,((.....{(((((....(((((((((({{{....,},.........(((.((((.....((.((((.(..((((.{.((((.....)))),.))))...))))).))}.)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))),......))))))).}.,))))))). [-115.12]
-(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 d=10.73}
-(((((((..((((((.((......(((((....((((((((((...................(((.((((.....((.((((.(..((((...((((.....))))..))))...))))).))..)))).)))....(((((.....))))).))))))))))..))))).......))))))).)..))))))). {-109.37 MEA=177.59}
- frequency of mfe structure in ensemble 0.000456946; ensemble diversity 17.02
 >6S_2
 UUGUCCCUGCCGUGCUCGUGACUUGGCCAUACAUUCUCUGAACCUAUGUCUUACGGCAUAUGGGUUGCGGGAGUGUAGAGCUGGAGUGAUCGUCUACUCGUAGACGAACCCGAUGCUCUUCGGAUCGCGACCACCUUGAACCUCAGGGUUCGAGAUGCCGGCCUUGACGGCACAGGCGGGGCAUC
 .((.(((((((((((.(((.(...((((...((.((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))))..)))).).))))))).))))))))).. (-129.27)
-.((,(((((((((((.(((.{...((((...,,.((((.((((((..(((....))).....((((((((...{(.(((((.((.((..((((((,....,))))))))))...))))).)}..)))))))).....,,...,,.)))))))))),}..)))).}.))))))).))))))))).. [-132.48]
-.((.(((((((((((.(((.(...((((......((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............))))))))))....)))).).))))))).))))))))).. {-129.23 d=10.34}
-.((.(((((((((((.(((.(...((((...(..((((.((((((..(((....))).....((((((((...((.(((((.((.((..((((((......))))))))))...))))).))..)))))))).............)))))))))).)..)))).).))))))).))))))))).. {-128.23 MEA=168.16}
- frequency of mfe structure in ensemble 0.00547171; ensemble diversity 14.91