Mercurial > repos > xuebing > sharplabtool
directory / @ 11:b7f1d9f8f3bc
| name | size | permissions |
|---|---|---|
 StartGenometriCorr.xml
|
1025 | -rw-r--r-- |
|
Start_GenometriCorr.R
|
3007 | -rw-r--r-- |
|
align2database.py
|
4665 | -rw-r--r-- |
|
align2database.xml
|
4554 | -rw-r--r-- |
|
align2multiple.xml
|
4736 | -rw-r--r-- |
|
alignr.py
|
13819 | -rw-r--r-- |
|
alignr.xml
|
7471 | -rw-r--r-- |
|
alignvis.py
|
2647 | -rw-r--r-- |
|
alignvis.r
|
270 | -rw-r--r-- |
|
alignvis.xml
|
1979 | -rwxr-xr-x |
|
altschulEriksonDinuclShuffle.py
|
3960 | -rw-r--r-- |
|
bedClean.py
|
1112 | -rw-r--r-- |
|
bed_to_bam.xml
|
1421 | -rw-r--r-- |
|
bedclean.xml
|
1209 | -rwxr-xr-x |
|
bedsort.xml
|
692 | -rwxr-xr-x |
|
bigWigAverageOverBed.xml
|
560 | -rw-r--r-- |
|
binaverage.xml
|
3397 | -rw-r--r-- |
|
binnedAverage.py
|
2564 | -rw-r--r-- |
|
bowtie2bed.pl
|
1018 | -rwxr-xr-x |
|
bowtie2bed.xml
|
1580 | -rwxr-xr-x |
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bwBinavg.xml
|
1954 | -rw-r--r-- |
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cdf.r
|
2976 | -rwxr-xr-x |
|
cdf.xml
|
2876 | -rw-r--r-- |
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closestBed.py
|
0 | -rw-r--r-- |
|
closestBed.xml
|
1309 | -rw-r--r-- |
|
collapseBed.py
|
1711 | -rw-r--r-- |
|
collapseBed.xml
|
839 | -rw-r--r-- |
|
collapseBed2.py
|
1076 | -rw-r--r-- |
|
collapseTab.py
|
1032 | -rw-r--r-- |
|
collapseTab.xml
|
737 | -rw-r--r-- |
|
convertEnsembl.py
|
413 | -rw-r--r-- |
|
convertEnsembl.xml
|
667 | -rw-r--r-- |
|
dreme.xml
|
2480 | -rw-r--r-- |
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endbias.py
|
1351 | -rw-r--r-- |
|
endbias.xml
|
504 | -rw-r--r-- |
|
fasta-dinucleotide-shuffle.py
|
5849 | -rwxr-xr-x |
|
fastamarkov.xml
|
727 | -rwxr-xr-x |
|
fastashuffle1.xml
|
579 | -rwxr-xr-x |
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fastashuffle2.xml
|
1306 | -rw-r--r-- |
|
fastqdump.xml
|
677 | -rwxr-xr-x |
|
fimo2-old.xml
|
2628 | -rw-r--r-- |
|
fimo2.xml
|
1762 | -rwxr-xr-x |
|
fimo2bed.py
|
1881 | -rw-r--r-- |
|
fimo2bed.xml
|
635 | -rw-r--r-- |
|
genomeView.xml
|
4704 | -rw-r--r-- |
|
genomeview.r
|
2146 | -rw-r--r-- |
|
getGenomicScore.py
|
3471 | -rw-r--r-- |
|
headtail.xml
|
1021 | -rwxr-xr-x |
|
intersectSig.py
|
3539 | -rw-r--r-- |
|
intersectSig.xml
|
2305 | -rw-r--r-- |
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intersectbed.xml
|
4311 | -rw-r--r-- |
|
intervalOverlap.py
|
2880 | -rw-r--r-- |
|
intervalSize.py
|
430 | -rw-r--r-- |
|
intervalSize.xml
|
475 | -rwxr-xr-x |
|
iupac2meme.xml
|
2083 | -rwxr-xr-x |
|
makebigwig.sh
|
1366 | -rwxr-xr-x |
|
makebigwig.xml
|
1723 | -rw-r--r-- |
|
makewindow.py
|
526 | -rw-r--r-- |
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makewindow.xml
|
594 | -rwxr-xr-x |
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meme.xml
|
16934 | -rw-r--r-- |
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memelogo.xml
|
673 | -rwxr-xr-x |
|
metaintv.py
|
3359 | -rw-r--r-- |
|
metaintv.xml
|
1288 | -rw-r--r-- |
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metaintv2.py
|
3410 | -rw-r--r-- |
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metaintv3.py
|
3410 | -rw-r--r-- |
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metaintv_ext.py
|
4265 | -rw-r--r-- |
|
metaintv_ext.xml
|
958 | -rw-r--r-- |
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phastCons.xml
|
2355 | -rw-r--r-- |
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plotmatrix.py
|
2626 | -rw-r--r-- |
|
plotmatrix.xml
|
2110 | -rwxr-xr-x |
|
r_wrapper.sh
|
36 | -rwxr-xr-x |
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random_interval.py
|
2843 | -rw-r--r-- |
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random_interval.xml
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2941 | -rw-r--r-- |
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removeDuplicate.xml
|
316 | -rw-r--r-- |
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resize.py
|
1869 | -rw-r--r-- |
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resize.xml
|
1691 | -rwxr-xr-x |
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revcompl.py
|
1911 | -rw-r--r-- |
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revcompl.xml
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998 | -rw-r--r-- |
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sampline.py
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sampline.xml
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seq2meme.py
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3335 | -rw-r--r-- |
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seq2meme.xml
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seqshuffle.py
|
1121 | -rw-r--r-- |
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sequence.py
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shuffleBed.py
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3247 | -rw-r--r-- |
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shuffleBed.xml
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2107 | -rw-r--r-- |
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spatial_proximity.py
|
1038 | -rw-r--r-- |
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spatial_proximity.xml
|
1701 | -rw-r--r-- |
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splicesite.xml
|
1438 | -rw-r--r-- |
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venn.xml
|
3138 | -rw-r--r-- |