Mercurial > repos > yhoogstrate > segmentation_fold

comparison test-data/DBNFile.test_03.in.dbn @ 4:63df1e23f4ff draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
planemo upload for repository https://github.com/ErasmusMC-Bioinformatics/segmentation_fold_galaxy_wrapper commit 00690c63c51a7f7563f2428c313d7fa75f2657e5-dirty
author yhoogstrate
date Thu, 28 Jul 2016 10:25:37 -0400
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
3:cd1bba1c66b3 4:63df1e23f4ff
1 >chr3.rna:5-35(+) x Kt-CD-box.CGU
2 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGT
3 >chr3.rna:5-35(+) x Kt-CD-box.UGU
4 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGT
5 (((.(((........))).)))........ .((...(((((...........))))))). -13.125
6 >chr3.rna:5-80(+) x Kt-CD-box.CGU
7 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
8 >chr3.rna:5-80(+) x Kt-CD-box.UGU
9 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
10 (((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0
11 (((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0
12 >chr3.rna:50-80(+) x Kt-CD-box.CGU
13 ACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
14 >chr3.rna:50-80(+) x Kt-CD-box.UGU
15 ACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
16 ..(..(((((...)).)))..)........ .((...(((((....(....).))))))). -13.125
17 >chr4_SNORD118_revised:1-74(+) x Kt-CD-box.CGU
18 GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTG
19 ...((............(((((.((.((((.....)))).))))))).((((((...........)))))))) ...((..((((((............))...)))).(((......))).((((((...........)))))))) 0.0
20 >chr4_SNORD118_revised:1-74(+) x Kt-CD-box.UGU
21 GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTG
22 >chr4_SNORD118_revised:1-88(+) x Kt-CD-box.CGU
23 GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTGCTCCTGTCTGATTT
24 .........(((.(((((((((.((.((((.....)))).)))))))(((((((...........))))))).)))).)))...... ..(((..((((((............))...))))...........(((((((((...........)))))))))...)))....... 0.0
25 >chr4_SNORD118_revised:1-88(+) x Kt-CD-box.UGU
26 GAACATGATGATTGGAGATGCATGAAACGTGATTAACGTCTCTGCGTAATCAGGACTTGCAACACCCTGATTGCTCCTGTCTGATTT
27 >chr3.rna.RC:35-5(-) x Kt-CD-box.CGU
28 ACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
29 >chr3.rna.RC:35-5(-) x Kt-CD-box.UGU
30 ACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
31 ..(..(((((...)).)))..)........ .((...(((((....(....).))))))). -13.125
32 >chr3.rna.RC:80-5(-) x Kt-CD-box.CGU
33 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
34 >chr3.rna.RC:80-5(-) x Kt-CD-box.UGU
35 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGTAGCCCTTTTTGGGCTACTTGTGATGAAACACTCATGGTCTGAAGA
36 (((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0
37 (((((((........))).((((((((((((((((.....))))))))(((......))).))).))))).)))) (((...(((((..(....((..(((((((((((((.....))))))))...)))))..))....)..)))))))) 0.0
38 >chr3.rna.RC:80-50(-) x Kt-CD-box.CGU
39 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGT
40 >chr3.rna.RC:80-50(-) x Kt-CD-box.UGU
41 TCTTGTGATGAGAAGTACTGGATCTGAAGT
42 (((.(((........))).)))........ .((...(((((...........))))))). -13.125