Mercurial > repos > artbio > pindel
changeset 0:decc6b5631dc draft
"planemo upload for repository https://github.com/ARTbio/tools-artbio/tree/master/tools/pindel commit 9bae2cc35b71dabcb73cd586eb1bdc458132548c"
| author | artbio |
|---|---|
| date | Wed, 29 Sep 2021 21:30:31 +0000 |
| parents | |
| children | 078c6ab38858 |
| files | create_config_file.py pindelwrapper.xml test-data/README test-data/X_100000_Hum1.bam test-data/X_100000_Hum1.bam_Breakpoints.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Close_End_Mapped.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Deletions.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_INT_final.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Inversions.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Long_Insertions.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Read_Pair_Evidence.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Short_Insertions.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Tandem_Duplications.txt test-data/X_100000_Hum1.bam_Tandom_Duplications.txt test-data/dm6_X.fasta |
| diffstat | 11 files changed, 1573 insertions(+), 0 deletions(-) [+] |
line wrap: on
line diff
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/create_config_file.py Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,27 @@ +import argparse + + +description = ("This script will create a configuration file for samples \ + to be run in Pindel") + + +parser = argparse.ArgumentParser() +parser.add_argument("--input_file", nargs="*", + help="One or more alignment files") +parser.add_argument("--insert_size", nargs="+", + help="Expected Insert size") +parser.add_argument("--sample_label", nargs="+", + help="Sample label") +parser.add_argument("--output_config_file", + help="Output config file") +args = parser.parse_args() + +template = "{input_file}\t{insert_size}\t{sample_label}\n" +with open(args.output_config_file, "w") as output: + for input_file, insert_size, sample_label in zip(args.input_file, + args.insert_size, + args.sample_label): + config_line = template.format(input_file=input_file, + insert_size=insert_size, + sample_label=sample_label) + output.write(config_line)
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/pindelwrapper.xml Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,101 @@ +<tool id ="pindel" name="Pindel" version="0.2.5b8+galaxy1"> + <description></description> + <requirements> + <requirement type="package" version="0.2.5b8">pindel</requirement> + <requirement type="package" version="1.0">openssl</requirement> + <requirement type="package" version="1.7">samtools</requirement> + <requirement type="package" version="3.7">python</requirement> + </requirements> + <stdio> + <exit_code range="1:" /> + </stdio> + <command><![CDATA[ + ln -f -s "$input_file.metadata.bam_index" alignment.sorted.bam.bai && + ln -f -s "$input_file" alignment.sorted.bam && + ln -f -s "$reference" ref.fa && + samtools faidx ref.fa && + python $__tool_directory__/create_config_file.py + --input_file alignment.sorted.bam + --insert_size "$insert_size" + --sample_label "$input_file.element_identifier" + --output_config_file output_config_file && + pindel + -f ref.fa + -i output_config_file + -c "$chromosome" + -o prefix && + mv prefix_D $Deletions && + mv prefix_SI $Short_Insertions && + mv prefix_LI $Long_Insertions && + mv prefix_INV $Inversions && + mv prefix_TD $Tandem_Duplications && + mv prefix_RP $Read_Pair && + mv prefix_INT_final $int_final && + mv prefix_CloseEndMapped $Close_End_Mapped + ]]></command> + <inputs> + <param format="bam" name="input_file" type="data" label="One or more BAM alignment files produced by BWA"/> + <param name="insert_size" type="integer" value="" label="Expected Insert size" /> + <param format="fasta" name="reference" type="data" label="Reference genome in fasta format"/> + <param name="chromosome" type="text" value="ALL" help="Select a chromsome. ALL will use all chromosomes" + label="Which chromosome to operate on"/> + </inputs> + <outputs> + <data format="txt" name="Deletions" label="${input_file.element_identifier} Deletions"/> + <data format="txt" name="Short_Insertions" label="${input_file.element_identifier} Short Insertions"/> + <data format="txt" name="Long_Insertions" label="${input_file.element_identifier} Long Insertions"/> + <data format="txt" name="Inversions" label="${input_file.element_identifier} Inversions"/> + <data format="txt" name="Tandem_Duplications" label="${input_file.element_identifier} Tandem Duplications"/> + <data format="txt" name="Breakpoints" label="${input_file.element_identifier} Breakpoints"/> + <data format="txt" name="Read_Pair" label="${input_file.element_identifier} Read Pair Evidence"/> + <data format="txt" name="int_final" label="${input_file.element_identifier} INT_final"/> + <data format="txt" name="Close_End_Mapped" label="${input_file.element_identifier} Close End Mapped"/> + </outputs> + <tests> + <test> + <param name="input_file" value="X_100000_Hum1.bam" ftype="bam"/> + <param name="insert_size" value="250"/> + <param name="reference" value="dm6_X.fasta" ftype="fasta"/> + <param name="chromosome" value="ALL"/> + <output name="Deletions" file="X_100000_Hum1.bam_Deletions.txt" ftype="txt"/> + <output name="Short_Insertions" file="X_100000_Hum1.bam_Short_Insertions.txt" ftype="txt"/> + <output name="Long_Insertions" file="X_100000_Hum1.bam_Long_Insertions.txt" ftype="txt"/> + <output name="Inversions" file="X_100000_Hum1.bam_Inversions.txt" ftype="txt"/> + <output name="Tandem_Duplications" file="X_100000_Hum1.bam_Tandem_Duplications.txt" ftype="txt"/> + <output name="Breakpoints" file="X_100000_Hum1.bam_Breakpoints.txt" ftype="txt"/> + <output name="Read_Pair" file="X_100000_Hum1.bam_Read_Pair_Evidence.txt" ftype="txt"/> + <output name="int_final" file="X_100000_Hum1.bam_INT_final.txt" ftype="txt"/> + <output name="Close_End_Mapped" file="X_100000_Hum1.bam_Close_End_Mapped.txt" ftype="txt"/> + </test> + </tests> + <help> <![CDATA[ + +Pindel can detect breakpoints of large deletions, medium sized insertions, inversions, +tandem duplications and other structural variants at single-based resolution from +next-generation sequencing data. It uses a pattern growth approach to identify the +breakpoints of these variants from paired-end short reads. + +The following inputs/parameters are required: +- One or more BAM alignment files produced by BWA +- Expected Insert Size for each alignment file +- Sample label for each alignment file +- Reference genome in fasta format (the same one used in alignment) +- Which chromosome to operate on + +The following output files are produced by Pindel: +- Deletions +- Short Insertions +- Long Insertions +- Inversions +- Tandom Duplications +- Breakpoints +- Read Pair Evidence +- INT_final +- Close End Mapped + + + ]]> </help> + <citations> + <citation type="doi">doi:10.1093/bioinformatics/btp394</citation> + </citations> +</tool>
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/README Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,9 @@ +This folder contains test data for the pindel galaxy tool. + +X_100000_Hum1.bam = The first 100,000 nucleotides of the X chromosome of the 'Hum' sample sequence in bam format. +X_dm6.fasta = The X chromosome sequence of the Drosophila Melanogaster reference genome release 6 (dm6) in fasta format. + +Information: +The readlength for the test data alignment file is 250 + +
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Deletions.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,726 @@ +#################################################################################################### +0 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 2678 2680 BP_range 2678 2680 Supports 5 5 + 3 3 - 2 2 S1 12 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 72 72 3 3 2 2 +TTCGACGAGCGCCTACAGCGAATTGCCGCTAAAACCTAAAAACAAAAAATTTATTAACAAATGAAATACAAATATACAAAATTCAAATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTGcACGCAACACATCCATATCCAACATAACAGACAAGAGGAGACGGGCCCTCAAACGTAAAACAATATCGCCAACTTTGCGCTTACAAACACAAAAAAATTTACAATTTTATGATGCCGTCTCCTCT + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 2541 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36691003/2 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCAACAT + 2550 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18630759/1 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 2541 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2940085/1 + AAATTCAAATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCAACATAACAGACAAGAGGAGACGGGCCCTCAAACGTAAAACAATATCGCCAACTTTGCG - 2994 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35723011/2 + AAATTCAAATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCAACATAACAGACAAGAGGAGACGGGCCCTCAAACGTAAAACAATATCGCCAACTTTGCG - 2994 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12975399/2 +#################################################################################################### +1 D 51970 NT 0 "" ChrID X BP 3911 55882 BP_range 3911 55886 Supports 7 7 + 2 2 - 5 5 S1 18 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 11 2 2 5 5 +CAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAaaaat<51960>aatacAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAAATTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAAT + CCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTAT - 55922 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45145040/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACA + 3752 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20131510/1 + AACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTA + 3835 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29185366/2 + CCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT - 56074 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13515042/2 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATATA AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA - 55981 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37954302/1 + CTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGAA - 56015 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2919186/1 + CCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACA AAAAATTAGAGA - 55988 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19871417/2 +#################################################################################################### +2 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 4037 4039 BP_range 4037 4042 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 26 0 0 1 1 +AAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAAATTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTaAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCCCGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAA + GTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCT AAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCCCGCTGACGT - 4208 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3056233/2 +#################################################################################################### +3 D 327 NT 0 "" ChrID X BP 4229 4557 BP_range 4229 4563 Supports 25 25 + 3 3 - 22 22 S1 92 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 18 3 3 22 22 +ATTTGCAACACCATCCCGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATtgcca<317>taaacTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAAT + ACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATC - 4659 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3277934/2 + TATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAAC - 4781 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19506718/2 + CTGGGAAATAAATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA - 4765 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22276267/1 + TAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAA - 4637 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38096708/2 + TAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAA - 4637 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24309078/2 + GCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAA - 4786 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39075505/1 + AAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTG - 4633 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14534420/2 + CACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTAC - 4675 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-508558/1 + ACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTA - 4717 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17057283/1 + AAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATG - 4627 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35638428/2 + AAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAA - 4624 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39789891/2 + AAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAA - 4711 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26322656/2 + AAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAA - 4711 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29424587/2 + AAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAA - 4666 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4441838/2 + AAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTCCAAA - 4666 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39564451/2 + AAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCA - 4792 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26542571/2 + AAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACGACGACCTCCAAAATAACTTTCA - 4792 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12363975/2 + AAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAAC + 3982 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39517234/1 + ACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACT - 4616 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45862267/1 + CAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAA - 4656 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-41617787/1 + CCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGA - 4641 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24539072/1 + TCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACG + 4148 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17963329/1 + CTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAAC - 4692 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22118156/1 + ACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGC - 4671 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40728320/2 + CTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTC + 4122 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27379833/1 +#################################################################################################### +4 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 4704 4706 BP_range 4704 4711 Supports 2 2 + 0 0 - 2 2 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 43 43 0 0 2 2 +TGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACaAAAAATTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTAC + TCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAAC - 4770 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-886730/2 + TCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAAC - 4770 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-360539/1 +#################################################################################################### +5 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 4722 4724 BP_range 4722 4724 Supports 2 2 + 0 0 - 2 2 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 41 41 0 0 2 2 +ACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTAtATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCTAACTTTACAT + TAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCT - 4952 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20738624/1 + CCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAA - 4843 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4123302/1 +#################################################################################################### +6 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 4844 4846 BP_range 4844 4846 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 6 6 0 0 4 4 +CTATATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCTAACTTTAcATTCATTTCCATGCCCGTATCGCTGCGGCGGACTTCTGCAACAAATCTTGAACCGGCGGCCCCAAGCTGCCAATCCCGACGCAATGGCCAATAGACGAGGCGCTCCTGGCAACTCTTGGCGAAC + CTATTTCTAACTTTA ATTCATTTCCATGCCCGTATCGCTGCGGCGGACCTCTGCAACAAATCTTGAACCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCCGACGCAATGGCCAATAGACGAGGCGCTCCTGGC - 4964 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-72439/1 + CTTACCTATTTCTAACTTTA ATTCATTTCCATGCCCGTATCGCTGCGGCGGACCCCTGCAACAAATCTTGAACCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCCGACGCAATGGCCAATAGACGAGGCGCTC - 4973 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16514254/1 + CTTACCTATTTCTAACTTTA ATTCATTTCCATGCCCGTATCGCTGCGGCGGACCTCTGCAACAAATCTTGAACCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCCGACGCAATGGCCAATAGACGAGGCGCTC - 4973 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11235130/1 + CTTACCTATTTCTAACTTTA ATTCATTTCCATGCCCGTATCGCTGCGGCGGACCTCTGCAACAAATCTTGAACCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCCGACGCAATGGCCAATAGACGAGGCGCTC - 4973 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1893764/2 +#################################################################################################### +7 D 59620 NT 0 "" ChrID X BP 5694 65315 BP_range 5694 65315 Supports 5 5 + 4 4 - 1 1 S1 10 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 24 4 4 1 1 +TGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAaaaaa<59610>ctcacCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAATGTTAGTCTTAAATGTCAATGTTTTT + TCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAA CTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAATGTTAGTCTTAAAT - 65439 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5971113/1 + TATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAA CTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTC + 5600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45616280/2 + TATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAA CTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTC + 5600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14563280/2 + ACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAA CTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGA + 5597 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33564979/2 + ACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGATAAAA CTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGA + 5597 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32959379/2 +#################################################################################################### +8 D 60065 NT 0 "" ChrID X BP 5935 66001 BP_range 5935 66003 Supports 9 9 + 7 7 - 2 2 S1 24 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 17 7 7 2 2 +AATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAaacaa<60055>acaatAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTA + CAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGC + 5931 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38064939/1 + CAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAG + 5931 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31361550/1 + CAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + 5931 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30153092/1 + CAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + 5931 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3008455/1 + TTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTG + 5888 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16849452/2 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAA AAAAAACAATTAA - 66157 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31804145/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAA AAAAAACAATTAA - 66157 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30434545/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAA AAAAAACAATTAATCGAC + 5864 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43881794/1 + AATATAATTTAAATCGCCTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATT + 5798 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2160431/2 +#################################################################################################### +9 D 60064 NT 0 "" ChrID X BP 5936 66001 BP_range 5936 66002 Supports 4 4 + 2 2 - 2 2 S1 9 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 17 17 2 2 2 2 +ATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAacaat<60054>acaatAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTA + CAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAA + 5910 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26602340/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAA AAAAAACAATTA - 66217 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29441672/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAA - 66217 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5700068/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAA AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAA + 5900 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27434100/1 +#################################################################################################### +10 D 93 NT 0 "" ChrID X BP 6473 6567 BP_range 6473 6568 Supports 25 25 + 11 11 - 14 14 S1 180 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 27 34 11 11 14 14 +AAGAAAATCCATAGAGACGAAAAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAGAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAGggtat<83>acgaaGAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT + CAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32799209/1 + CAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6252094/1 + ACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCT + 6566 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18354876/2 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA + 6369 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32617519/1 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA + 6369 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20093588/2 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17966998/1 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15202821/2 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA + 6369 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7277176/2 + AGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18354876/1 + AGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTGCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAA - 6858 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14247255/1 + AGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAA + 6566 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43166623/1 + GAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA + 6323 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39330985/1 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 6387 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31621137/1 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 6566 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39858663/1 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 6387 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4924534/2 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 6566 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21340168/1 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6474 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34930000/2 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6474 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9781965/2 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32617519/2 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20093588/1 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6691 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7277176/1 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6474 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17966998/2 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6474 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15202821/1 + AAGATGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA - 6474 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4835601/2 + AAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCA + 6323 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15130807/2 +#################################################################################################### +11 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 11211 11213 BP_range 11211 11217 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 23 23 2 2 0 0 +GGTAGAGACAACCACCAAATGACAGCGGCGCGGGATGCAGCCACCATCTTTGAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCaAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAATGTTAGTCTTAAATGTCAATGTT + GAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCC AAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCG + 11087 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46361604/2 + GAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCC AAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCG + 11087 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2967327/2 +#################################################################################################### +12 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 15567 15571 BP_range 15567 15583 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 0 0 +AAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCTGCTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTATATTTGCCCGATAAGCGATATGCTGGCGGCaaaAAAAAAAAAAAAGATAATAGCCGATAAGCCCGCCAAAAAAAAGCGCGAAATATCGATAACGAGCTGGCACGAAAATTGCTGGCATATCGATCAACCGCTGTGTCTTTGAGCTATCGAAAAAG + GATATGCTGGCGGC AAAAAAAAAAAAGATAATAGCCGATAAG + 15415 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9766224/2 +#################################################################################################### +13 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 15751 15753 BP_range 15751 15753 Supports 5 5 + 0 0 - 5 5 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 2 2 0 0 5 5 +TAACGAGCTGGCACGAAAATTGCTGGCATATCGATCAACCGCTGTGTCTTTGAGCTATCGAAAAAGCCCGCCTACGCGCCTAGCCCAAATTTGCAAGTCAGTTGAGATTATAAAACCGACAGAGGcGCGCGCGCAACAGTAGCTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGCCAGAACGTGAACCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTG + AACCGACAGAGG GCGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCAGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGAC - 15975 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32826972/2 + AAAACCGACAGAGG GCGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGG - 15961 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42973087/2 + AAAACCGACAGAGG GCGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGG - 15950 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33191199/1 + AAAACCGACAGAGG GCGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGG - 15950 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27921262/1 + CCCAAATTTGCAAGTCATTTGAGATTATAAAACCGACAGAGG GCGCGCGCAACAGTAACTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGA - 15956 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16040907/1 +#################################################################################################### +14 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 15948 15952 BP_range 15948 15958 Supports 3 3 + 2 2 - 1 1 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 10 2 2 1 1 +CAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTaagAAGAAGCCTATATCAAACAAATGCCGACATGAAATCTTACGATTTTGAAAATATTGTATTAAATGAAAATAAAAATACCATATTGCCAGACCCTTTATTTGTTGATAAATGCGGGAGTACTG + CCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATATCAAACAAATGGCGACATGAAATCTTACGATTTTGAAAATATTGTATTAAATGA + 15840 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7006105/1 + ATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATATCAAA - 16011 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7006105/2 + GGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATAT + 15737 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42973087/1 +#################################################################################################### +15 D 40 NT 0 "" ChrID X BP 20725 20766 BP_range 20725 20767 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 5 6 1 1 1 1 +TTTGAGCGAAAGGAATACTGCTCAGCGGTTTTCCTTGACATCTCTGAGGCTTTCGATAGGGTCTGGCACGAAGGCCTTTTACTTAAACTAGCTAAAATATTACCATACAACCTATACATTATTCTcgaaa<30>aagacCAAGCTGGAGAGACTTCGAGAGCAGGACAAATAGGCGCAGGGGTGCCCCAAGGAAGCAACCTTGGACCCATACTGTACTCTATCTTCTCCTCAGACATGCCACTCCCACAC + GGGTATGGCACGAAGGCCTTTTACTTAAACTAGCTAAAATATTACCATACAACCTATACATTATTCT CAAGCTGGAGAGACTTCGAGAACAGGGCAAATAGGCGCAGGTGTGCCCCAAGGAAGCA - 20743 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17080904/1 + GCTCAGCGGTTTTCCTTGACATCTCTGAGGCTTTCGATAGGGTATGGCACGAAGGCCTTTTACTTAAACTAGCTAAAATATTACCATACAACCTATACATTATTCT CAAGCTGGAGAGACTTCGA + 20619 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5907093/1 +#################################################################################################### +16 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 22392 22394 BP_range 22392 22400 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 0 0 +CTGCGACTGCGGCCTTCTGCCGTTCGGCTCCTGATGGATCCATCTGCTGCTGGAATGGGTGCCACACCGGCGCTCCAACCTAAAAGAAAGATAATATGTCTTAGTTTTCTTTCCCTTTTTCTCATaAAAAAACAACAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCAACAGTGGAGGCAGAGACCAAGCGGTTTGCTGAACATTTCGCTGCC + ATATGTCTTAGTTTTCTTTCCCTTTTTCTCAT AAAAAACAAAAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCAACAGTGGAGGCAGA + 22360 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7945605/2 +#################################################################################################### +17 D 57 NT 0 "" ChrID X BP 26531 26589 BP_range 26531 26590 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 0 0 1 1 +TCAGTCAGACTGTACTCACGCATGCACTTAGACAAACCGAAGCCTATTCCACAAAAGGCTGTGAGTGCACCAAAGTTGACGGGCCACGCCGGCCGATGCTTGCTGCATACCGGCATCTCCGCATCagcga<47>cgcagAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCTGCTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTATATTTGCCCGATAAG + CCGGCCGATGCTTGCTGCATACCGGCATCTCCGCATC AAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGC - 26559 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43577205/1 +#################################################################################################### +18 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 33898 33900 BP_range 33898 33906 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 1 0 0 1 1 +CTGCGACTGCGGCCTTCTGCCGTTCGGCTCCTGATGGATCCATCTGCTGCTGGAATGGGTGCCACACCGGCGCTCCAACCTAAAAGAAAGATAATATGTCTTAGTTTTCTTTCCCTTTTTCTCATaAAAAAACAACAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCAACAGTGGAGGCAGAGACCAAGCGGTTTGCTGAACATTTCGCTGCC + CTAAAAGAAAGATAATATGTCTTAGTTTTCTTTCCCTTTTTCTCAT AAAAAACAAAAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCA - 34163 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21479160/1 +#################################################################################################### +19 D 4 NT 0 "" ChrID X BP 36790 36795 BP_range 36790 36801 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 0 0 1 1 +TGGCAGCAGCAGGGAGATTTCATTGCTGCAGTCGCCAAATTACATGCATCCTACGACTCGACTCACGCTTTTTGGCCCCTGGCCGATCTTCATATATCTCAAATCGACGGCTGCTTTTACCCTGGaaaaAAAAAAGGAGCTTGGGTTATATTGAACTACACTAGGCGGCGACACACTCACCAGCAGCAGCCAGAACAACAACAGCGGCAGAAGTAGCAGGAAATTATCTCACTGCAAAATCCAATTGGCA + CTGCTTTCACCCTGG AAAAAAGAAGC - 37023 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23520852/1 +#################################################################################################### +20 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 39125 39129 BP_range 39125 39135 Supports 3 3 + 2 2 - 1 1 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 1 2 2 1 1 +CAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTaagAAGAAGCCTATATCAAACAAATGCCGACATGAAATCTTACGATTTTGAAAATATTGTATTAAATGAAAATAAAAATACCATATTGCCAGACCCTTTATTTGTTGATAAATGCGGGAGTACTG + CCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATATCAAACAAATGGCGACATGAAATCTTACGATTTTGAAAATATTGTATTAAATGA + 39017 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1255350/2 + TTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATATCAAACAAATG + 38968 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6058307/1 + ATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGT AAGAAGCCTATATCAAA - 39188 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1255350/1 +#################################################################################################### +21 D 40 NT 0 "" ChrID X BP 43902 43943 BP_range 43902 43944 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 5 1 1 0 0 +TTTGAGCGAAAGGAATACTGCTCAGCGGTTTTCCTTGACATCTCTGAGGCTTTCGATAGGGTCTGGCACGAAGGCCTTTTACTTAAACTAGCTAAAATATTACCATACAACCTATACATTATTCTcgaaa<30>aagacCAAGCTGGAGAGACTTCGAGAGCAGGACAAATAGGCGCAGGGGTGCCCCAAGGAAGCAACCTTGGACCCATACTGTACTCTATCTTCTCCTCAGACATGCCACTCCCACAC + GATAGGGTATGGCACGAAGGCCTTTTACTTAAACTAGCTAAAATATTACCATACAACCTATACATTATTCT CAAGCTGGAGAGACTTCGAGAACAGGGCAAATAGGCGCAGGTGTGCCCCAAGGA + 43755 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3894915/1 +#################################################################################################### +22 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 45569 45571 BP_range 45569 45577 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 0 0 1 1 +CTGCGACTGCGGCCTTCTGCCGTTCGGCTCCTGATGGATCCATCTGCTGCTGGAATGGGTGCCACACCGGCGCTCCAACCTAAAAGAAAGATAATATGTCTTAGTTTTCTTTCCCTTTTTCTCATaAAAAAACAACAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCAACAGTGGAGGCAGAGACCAAGCGGTTTGCTGAACATTTCGCTGCC + TTTCTCAT AAAAAACAAAAGCTCATCTGGAGTCTGATAATAGCTTTAGCTCACCAAGACAGCAAAAACAACAGCATCAAGGCCAGCAACAGTGGAGGCAGAGACCAAGCGGTTTGCTGAACATTT - 45685 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17610951/1 +#################################################################################################### +23 D 57 NT 0 "" ChrID X BP 49708 49766 BP_range 49708 49767 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 0 0 1 1 +TCAGTCAGACTGTACTCACGCATGCACTTAGACAAACCGAAGCCTATTCCACAAAAGGCTGTGAGTGCACCAAAGTTGACGGGCCACGCCGGCCGATGCTTGCTGCATACCGGCATCTCCGCATCagcga<47>cgcagAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCTGCTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTATATTTGCCCGATAAG + GCTGCATACCGGCATCTCCGCATC AAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCTG - 49831 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7542003/2 +#################################################################################################### +24 D 8722 NT 0 "" ChrID X BP 51008 59731 BP_range 51008 59738 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 29 2 2 0 0 +CAATAAAAAATTATGCGCGACTTCCAACTTTGTAACTCCCAGCATTTTTCCGCCGCTCATCACTCCCGTTTTCAAGAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTACGAGGAATCCAAAGCCAGAAATGGACccccc<8712>atggaCCCCCCCCGCCGGCCCTCGCCTGCAGCATCAATGCCTCTGCTCGCAGCGCAGCGGCGCCACCCGGGATCGCCCCCCTACCCCCTCATAATACAGATGCAGAGCTGCCTC + CGAGGAATCCAAAGCCAGAAATGGAC CCCCCCCCGCCGGCCCTCGCCTGCAGCATCAATGCCTCTGCTCGCAGCGCAGCGGCGCCACCCGGGATCGCCCCCCTACCCCCT + 50838 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38735938/2 + GCTCATCACTCCCGTTTTCAAGAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTACGAGGAATCCAAAGCCAGAAATGGAC CCCCCCCCGCCGGCCCCCGCCTGCAGCATCAATGCCTCTGCTCGCAGCGCAGCG + 50893 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11923621/2 +#################################################################################################### +25 D 5 NT 0 "" ChrID X BP 53485 53491 BP_range 53485 53493 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 0 0 +AGGAAACGGGCCTTGTAAAAGCAAAACAAAATCGCCAAATTTTGCGATTATAAACACAAAAAATTGACAATTTTACAATGCCGCCTGCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAACAAGGATCAGTAGCgcggaGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCTTCCTCAGTATCATACTGTCAACGAACTTCCACTAACCTGCAATGAAAGGAAAATAAATAAGTATATGAT + CCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCACTAGC GCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCA + 53173 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1732005/2 +#################################################################################################### +26 D 56 NT 0 "" ChrID X BP 53919 53976 BP_range 53919 53982 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 2 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 5 8 1 1 0 0 +TATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAAGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTAACGCAACCATAAAAacaaa<46>gaaatACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAACACTTACTTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAACAAAAATTAATTCAATAAA + AAAAACTAAAAATTAACACAACCATAAAA ACAAAACCAAT + 53792 2 X_100000_Hum1.bam @HWI-24429584/1 +#################################################################################################### +27 D 504 NT 0 "" ChrID X BP 55429 55934 BP_range 55429 55946 Supports 8 8 + 0 0 - 8 8 S1 9 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 3 0 0 8 8 +CTATATAAACAAATAAATACACAAATAATACTTACCTCCGAACTGCATTCCACCTAATGTACCTGAAAAAATACAAAAATTACAGAAATCACAAAAATAAATAACAAATGCTATACTTACCTAATtttaa<494>taaaaTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAAT + AACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACA - 56149 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42977092/1 + AACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCGTTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACA - 56149 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17662060/1 + ACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAA - 56033 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27317211/2 + ACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAA - 56033 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17395941/2 + AGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAA - 56161 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20297375/2 + AGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCAT - 56042 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32680310/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATT - 56057 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30087311/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAAC - 56057 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27539376/2 +#################################################################################################### +28 D 327 NT 0 "" ChrID X BP 56200 56528 BP_range 56200 56534 Supports 21 21 + 7 7 - 14 14 S1 120 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 22 7 7 14 14 +ATTTGCAACACCATCCCGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATtgcca<317>taaacTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAAT + TATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATG - 56766 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33400121/1 + CTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA - 56736 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45325275/1 + TAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAA + 56059 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44133590/2 + GCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAA - 56757 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1144677/1 + AAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAA - 56595 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5377193/2 + AAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAA - 56682 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34798038/1 + AAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAA - 56682 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20563265/2 + AAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAA - 56637 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22429267/1 + AAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAA - 56637 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7946303/2 + AAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCA - 56763 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20194856/1 + CAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAA - 56627 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17920974/2 + GCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCA + 55943 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40051364/1 + AGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCC + 56093 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16516358/2 + AGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCC - 56578 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-842663/2 + CTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAAC + 56049 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12042530/1 + CTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAAC + 56049 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46528/1 + AAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCAT - 56765 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13265499/1 + ACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGC - 56642 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24154247/2 + CTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTC + 56093 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16516358/1 + CTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTC - 56578 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-842663/1 + GCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTT + 56003 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31341510/2 +#################################################################################################### +29 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 56449 56451 BP_range 56449 56451 Supports 3 3 + 2 2 - 1 1 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 7 2 2 1 1 +ACAAATAAGAATGCGACTCAAAATTAAGAAATAACACACAAAAAATAACAAACCTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCATGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCtAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAAATATATATTTTTAACAAAATACTTATCTAAACTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACC + ACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTCTCTCC AAGACCGCAGAAACTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAA - 56493 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7685870/2 + ACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTCTCTCC AAGACCGCAGAAACTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGG + 56277 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18280265/1 + ACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTCTCTCC AAGACCGCAGAAACTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAA + 56363 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12051947/1 +#################################################################################################### +30 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 56655 56657 BP_range 56655 56658 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 40 40 0 0 1 1 +CAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGAtTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAAC + AAGCTGCGGCATCATAACTACAATGGCCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGA TAGCTATT - 56783 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25997372/1 +#################################################################################################### +31 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 56675 56677 BP_range 56675 56682 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 36 36 2 2 0 0 +TGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACaAAAAATTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTAC + AAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATATA + 56627 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18079907/2 + CAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAACAA + 56576 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40053860/2 +#################################################################################################### +32 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 56693 56695 BP_range 56693 56695 Supports 6 6 + 1 1 - 5 5 S1 12 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 38 38 1 1 5 5 +ACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTAtATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCTAACTTTACAT + TAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCT - 56923 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36573009/2 + TAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCT - 56923 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35648576/2 + TAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCT - 56923 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34360521/2 + TAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCT - 56923 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5429922/1 + CCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAA - 56814 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44003598/2 + CTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAAC + 56514 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20779381/2 +#################################################################################################### +33 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 61453 61455 BP_range 61453 61460 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 120 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 87 87 1 1 1 1 +GGAGCCTAATTTATTGGAAAAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACaAAAAATATGAATAGATAGATCGATATGAAAAGGATAAGTGCGGCAGAAACATGATGAGCAAAAGGCGACTCGCTGCAGCAACTTATGCACAACGTCACTTACCTGAAATTTCTTGCCGTACGAT + CACAAAAATGTAAACACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAAC AAAAATATGAATAGATAGATCGATATGAAAAGGATAAG + 61347 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-22871936/2 + AAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAAC AAAAATATGAATAGATAGA - 61490 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-22871936/1 +#################################################################################################### +34 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 61688 61690 BP_range 61688 61690 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 60 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 100 100 1 1 0 0 +TTCTTGCCGTACGATCTCCTGTAGTATCCCTTATCACAGCTGCAATCTACTTGCAATGCTGCACTGCAATAAACGTACTACAAAAGCTGCATACGTTTTGATCAGGACACCTCGTGCGGAGCTGCtAAAAAATTTCCTTCCTGCTGCTCTTATCGACGCTAAAACCTTAAAACCTACAAACAAAACAATTAAATAATAACAAATCAAATAAGACAACCAAATAATACACTTACCTCATTGACTGCAGCTA + AAACGTACTACAAAAGCTGCATACGTTTTGATCAGGACACCTCGTGCGGAGCTGC AAAAAATTTCCTTCCTGCTGCTCTTATTGACGCTAAAACCTTAAAACCTACAAACAAAACAATTAAATAA + 61498 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-20953292/1 +#################################################################################################### +35 D 15 NT 0 "" ChrID X BP 62741 62757 BP_range 62741 62768 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 46 39 1 1 0 0 +TTATTTAAACAAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCCAATTAATTACAAAATGTACCTGAAAAACATAAaatta<5>accatAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACCAAAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATA + CGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATTAATTACAAAATGTACCTGAAAAACATAA AATTAACGCAACT + 62390 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-470784/2 +#################################################################################################### +36 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 62833 62835 BP_range 62833 62845 Supports 3 3 + 2 2 - 1 1 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 35 35 2 2 1 1 +CAATTAATTACAAAATGTACCTGAAAAACATAAAATTAACGCAACCATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACCaAAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAA + AAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCT + 62697 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44395624/2 + TACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCT + 62697 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5928132/1 + CATAAAATTAACGCAACCATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAAT - 62993 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5781178/2 +#################################################################################################### +37 D 2 NT 0 "" ChrID X BP 62833 62836 BP_range 62833 62845 Supports 40 40 + 25 25 - 15 15 S1 416 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 35 36 25 25 15 15 +CAATTAATTACAAAATGTACCTGAAAAACATAAAATTAACGCAACCATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACCaaAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAA + ACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAA + 62647 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-10008010/2 + AACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACA - 63322 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25092436/2 + AACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACA + 62835 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17105227/1 + AAAACC AAAAAAAAATTAATGAAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAA + 62731 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29225999/1 + AACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40460429/2 + AACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39353076/2 + AACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACCTAATCTAATACAATCTCAAAAACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34951432/2 + AACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17468574/2 + AACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8655993/2 + AAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGT + 62697 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25854412/2 + GAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAA - 62959 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26758274/1 + GAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAAT + 62754 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46564463/1 + GAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-41480828/1 + CTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAA - 63114 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17688162/1 + CTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAA + 62818 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5339682/2 + ACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATAC + 62722 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7467936/1 + AAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAA - 62986 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34529022/1 + AAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAA - 62986 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22009451/2 + AAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAA - 62986 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8693605/2 + AAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAA - 62986 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4727187/2 + CCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAA + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29014266/1 + CTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAAT - 63100 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12622785/1 + ACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATA + 62785 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2670943/2 + TACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAAGTAATGCAATAAAT + 62704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39211861/2 + CTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAAC - 62968 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36468090/2 + CAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGT + 62486 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37972779/2 + ACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATG - 62923 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2670943/1 + AAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAAT + 62560 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17065055/2 + ATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCT + 62774 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14979301/2 + AATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCA + 62544 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43075969/2 + AATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCA + 62544 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4088926/2 + AATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATAC + 62618 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40447350/2 + AATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATGAATAAATCAAATAAATACAAACATAATA + 62567 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38477368/2 + AATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATA + 62567 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32747312/2 + TAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAAT + 62755 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19113520/1 + ATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAA - 62935 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46564463/2 + ACGCAACTATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATAC - 62994 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28271874/1 + AAAAACATAAAATTAACGCAACTATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGCAATAAAT - 62954 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27683315/2 + AAAAACATAAAATTAACGCAACTATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAATGAAATAAAT - 62950 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29225999/2 + ATGTACCTGAAAAACATAAAATTAACGCAACTATAATTAACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACC AAAAAAAAATTAAT - 62869 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7467936/2 +#################################################################################################### +38 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 65772 65776 BP_range 65772 65780 Supports 2 2 + 0 0 - 2 2 S1 3 SUM_MS 6 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 0 0 2 2 +GTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAaccACCAGCAAAGTTAAAAAAATAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCCCTTG + AGTTAAAC ACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTC - 66095 3 X_100000_Hum1.bam @HWI-46027927/1 + AGTTAAAC ACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTC - 66095 3 X_100000_Hum1.bam @HWI-43807848/1 +#################################################################################################### +39 D 93 NT 0 "" ChrID X BP 66542 66636 BP_range 66542 66637 Supports 14 14 + 4 4 - 10 10 S1 55 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 19 19 4 4 10 10 +AAGAAAATCCATAGAGACGAAAAGAAGAAAGTCGACCGCAACCAGGAAGAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAGggtat<83>acgaaGAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT + CAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37726796/1 + CAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35405969/2 + CAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCTCAGAATAATACAACCATTATT - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15011723/2 + ACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGACAATTCT + 66635 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27265562/2 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34930000/1 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9781965/1 + AAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCAGA - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4835601/1 + AGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATCA - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27265562/1 + AAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATC - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26838202/1 + AAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATCGCCCATGTCCCACGAATC - 66760 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2200623/1 + AAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCCTCCCCATTCTACCTTAATATATC - 66604 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19416873/2 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 66635 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45322524/2 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 66635 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31621137/1 + AACCAGGAAAAGTTAAAAGGAGGAAAGGAGAAAGCCTAATAAAGAAGACGAACTAAACTAAAGGAGACGCCACAAACAAAAGCCAG GAAATACATTCAATTTCTTCAAGCCCAGAACGGCGATCC + 66456 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19208770/2 +#################################################################################################### +40 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 76327 76329 BP_range 76327 76329 Supports 6 6 + 6 6 - 0 0 S1 7 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 72 72 6 6 0 0 +TTCGACGAGCGCCTACAGCGAATTGCCGCTAAAACCTAAAAACAAAAAATTTATTAACAAATGAAATACAAATATACAAAATTCAAATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTGcACGCAACACATCCATATCCAACATAACAGACAAGAGGAGACGGGCCCTCAAACGTAAAACAATATCGCCAACTTTGCGCTTACAAACACAAAAAAATTTACAATTTTATGATGCCGTCTCCTCT + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 76190 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35097117/1 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 76190 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32493598/1 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 76190 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23470581/1 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 76190 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22426531/2 + ATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCA + 76190 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3762767/2 + CAAATGAAATACAAATATACAAAATTCAAATAAAACAAAGCACTTACCTCACTGACCGCATCCAACTG ACGCAACACATCCATATCCAACATAACAGACAAGAGGAGACGGGCCCTCAAACGTAA + 76259 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20565367/1 +#################################################################################################### +41 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 77385 77387 BP_range 77385 77393 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 1 0 0 1 1 +AAATTAGCTGACGATAAATTACAACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATTCTCTCTCCTAAAACACGGGATCCCAGCGGCGATGTCCTTAACTTTAGCTGCTACAAATGTACCTGAAAACaAAAAAACAAAAATTAATTCAATTATAAAAACAAACATAATACTTACCTCCAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATAT + CCTTAACTTTAGCTGCTACAAATGTACCTGAAAAC AAAAAACAAAAATTAATTCAATTATAAAAACAAACATAATACTTACCTCCAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAA - 77492 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2188462/1 +#################################################################################################### +42 D 327 NT 0 "" ChrID X BP 77878 78206 BP_range 77878 78212 Supports 14 14 + 5 5 - 9 9 S1 60 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 13 5 5 9 9 +ATTTGCAACACCATCCCGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATtgcca<317>taaacTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAAT + ATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAA - 78326 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3121927/2 + ATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAA - 78326 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7400269/2 + TATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATG - 78430 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35492663/1 + TATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATG - 78430 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16245213/2 + CTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA - 78414 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2954969/2 + ACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAAC - 78288 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-463451/2 + ACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCATAAAATGTACC - 78551 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39961997/1 + AAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCA - 78441 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-41051007/2 + ACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACT - 78351 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26786605/2 + GCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCA + 77621 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13668439/2 + AGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCC + 77771 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-842663/2 + CTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAAC + 77727 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39610965/1 + CTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTGACGACTTC + 77719 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21845915/2 + CCATCCCGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCAAGAGCGCAAAAACTGAAAAAAGAAACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAAT TGCCAAATTG + 77762 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-653774/2 +#################################################################################################### +43 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 78127 78129 BP_range 78127 78129 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 9 9 2 2 0 0 +ACAAATAAGAATGCGACTCAAAATTAAGAAATAACACACAAAAAATAACAAACCTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCATGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCtAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAAATATATATTTTTAACAAAATACTTATCTAAACTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACC + ACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTCTCTCC AAGACCGCAGAAACTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGG + 77955 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34835809/1 + ACACCATCCTGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTCTCTCC AAGACCGCAGAAACTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAA + 78041 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7685870/2 +#################################################################################################### +44 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 78353 78355 BP_range 78353 78360 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 37 37 0 0 4 4 +TGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACaAAAAATTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTAC + AAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAACAAATAAAAACAAATAT - 78410 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21995749/1 + CAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAACAA - 78661 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40053860/2 + TCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAAC - 78419 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30550473/1 + TCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCTGCAGATTAGCTATTGCCTGAAAAAC AAAAGTTAATGCAACTATATAAAC - 78419 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6472539/1 +#################################################################################################### +45 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 78371 78373 BP_range 78371 78373 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 42 42 1 1 0 0 +ACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAAAACAAATATAATACTTACCCCCAGATTAGCTATTACCTGAAAAACAAAAAATTAATGCAACTAtATAAACAAATAAAAACAAATATACTTACCATCAAACTATCCATCACATTGTACCTGAAAACAAAAACAAATGCAATCATAAAAAACAATCCTAATGCAATACTTACCTATCTCTAACTTTACAT + AAAAACAAAAAATTAATGCAACTA ATAAACAAATAAAAAC + 78192 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24131739/1 +#################################################################################################### +46 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 79188 79190 BP_range 79188 79190 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 5 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 3 0 0 1 1 +TTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAAGTCTACAAAATACTAACTACTTTTACATTATTACTAACTaTGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCT + CTACAAAATACTAACTACTTTTATATTAATACTAACT TGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGCTATATTCAAAAATGCAAAT - 79489 5 X_100000_Hum1.bam @HWI-44861908/1 +#################################################################################################### +47 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 79431 79435 BP_range 79431 79435 Supports 6 6 + 6 6 - 0 0 S1 7 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 6 6 0 0 +TTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTtaaAAAAAACCAGCAAAGTTAAAAACTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGTTAAAAAAAACAAAGTTAAAATAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAATTAAACAAAT + AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79391 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30064472/1 + AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79391 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18608667/2 + AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79391 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12954838/2 + AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79391 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8393873/1 + AACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79391 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1887220/1 + ATCGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT AAAAAACCAGCAAAGTTAAAAA + 79378 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20499038/1 +#################################################################################################### +48 D 22 NT 0 "" ChrID X BP 81361 81384 BP_range 81361 81385 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 15 1 1 0 0 +CTTCCTTACGCTCTTCTGCTCAGGTTGATTCAAATTTAAATCCCAACACTAGCGCCATGCCCACTGTGGGGAATTTACCAGCAGCCCGCACACTTAGCCGGCCTGCTGCAAAGCGGGATTTATTTaattc<12>cccaaACGAGCATCCTATGAGTTTTTCGGAAGTGGTAGCTGGAACAGGTCCAGTTTCTGTGGCACCCTCTAATCCGGCACCACTGACGAAAACTCCAGGCAAGAGGACAAATGGCG + CTTAGCCGACCTGCTGCAAAGCGGGATTTATTT ACGAGCACCCTATGAGTTTTTCGGAAGTGGTAGCTGGAGCAGGTCCAGTTTCTGTGGCACCCTCTAACCCGGCACCACTGACGAAAACTCCA + 81328 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46562622/1 +#################################################################################################### +49 D 6328 NT 0 "" ChrID X BP 82600 88929 BP_range 82600 88979 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 20 7 2 2 0 0 +ACAAAATAAGAACATTCAAGGACGCAACAAATAACTATTATAGACGTCAAGGCCCCCCTCCACACAATAACACCCCTCGGCTGCCACATAGCTCAGCAATCCTGAGCAAATCAATCGCTGCAGCTcgcca<6318>cagcgCGCCAGGAGGCCGCCAGAAAGTCGATGCTAAATCCTTATTGGCAAAACTCGAACGACAGAAAGCCACGCTTCTCCTCCCATGACATGGCCATTCAGAAAAGACTGAATA + CAATAACACCCCTAGGATGCCACATAGCTCAGCAATCCTGAGCAAATCAATCGCTGCAGCT CGCCAGGAGGCCGCCAGAAAGTCGATGCTAAATCCTTATTGGCAAAACTCGAACGACAGAAAGC + 82487 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7835488/2 + AACATTCAAGGACGCAACAAATAACTATTATGGACGTCAAGGCCCCCCTCCACACAATAACACCCCTAGGATGCCACATAGCTCAGCAATCCTGAGCAAATCAATCGCTGCAGCT CGCCAGGAGG + 82365 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37376097/1 +#################################################################################################### +50 D 6328 NT 0 "" ChrID X BP 82859 89188 BP_range 82859 89634 Supports 8 8 + 8 8 - 0 0 S1 9 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 7 8 8 0 0 +ACCCAAAAAGGGTAGGATAGCTTCAAAGGACAACGCAAAGCCACGACCGGTATCCAAGACAAGCAACCCAGCGCAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAAGAAAGGAGTGAATtaaat<6318>tgaacTAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTACCACAAATCCCATGCGAGTCGGCAAAGATAGCCCTCCGACCACTAGCAGAGCCGCCAGAGCTAGCTTCAAGCCAAGAATCAT + CTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTACTCCAAATCCCATGCGAGTCGGCAAAGATAGCCCTCCGACCACTAGCAGAGCCGCCAGAGCTA + 82824 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37312683/2 + CTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTACTCCAAATCCCATGCGAGTCGGCAAAGATAGCCCTCCGACCACTAGCAGAGCCGCCAGAGCTA + 82824 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24262287/2 + CTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTACTCCAAATCCCATGCGAGTCGGCAAAGATAGCCCTCCGACCACTAGCAGAGCCGCCAGAGCTA + 82824 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2131350/1 + CAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTACTCCAAATCCCATGCGAGTCGGCAAAGATAGCCCTCCGACCACTAG + 82807 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3458143/1 + AACGCAAAGCCACGACCGGTATGCAAGACAAGCAATCCAGCGCAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGTAC + 82494 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37755496/2 + AGGACAACGCAAAGCCACGATCGGTATCCAAGACAAGCAATCCAGCGCAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAACCTAAAAAAGGT + 82708 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38785446/2 + GATAGCTTCAAAGGACAACGCAAAGCCACGATCGGTATCCAAGACAAGCAATCCAGCGCAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGAAC + 82749 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20101979/1 + AGGATAGCTTCAAAGGACAACGCAAAGCCACGACCGGTATGCAAGACAAGCAATCCAGCGCAAAAACATCTGGAAAACTACCAGGACATGCTCCAAAAGGAAAGGAGTGAAT TAAATGACCAGGA + 82747 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13493992/1 +#################################################################################################### +51 D 6376 NT 0 "" ChrID X BP 84479 90856 BP_range 84479 90856 Supports 15 15 + 10 10 - 5 5 S1 66 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 8 10 10 5 5 +AATACTCACCCCAGACTAGCTCCCTCCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACctgaa<6366>aaataACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCT + CTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3102178/1 + CTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCT - 90994 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3987797/1 + AAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGC - 91015 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37520992/2 + CTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAG + 84527 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34806997/1 + ATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCG - 91114 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37593252/2 + ATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCG - 91114 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-103189/2 + ATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATC + 84433 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43015590/2 + TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27052876/2 + TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21873573/2 + TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5331471/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTAT - 90818 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3102178/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27052876/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21873573/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC ACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + 84379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5331471/1 +#################################################################################################### +52 D 6 NT 0 "" ChrID X BP 85915 85922 BP_range 85915 85925 Supports 3 3 + 0 0 - 3 3 S1 4 SUM_MS 120 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 0 0 0 3 3 +ACCCCACGCAATGTACTCTCAAAAATTTAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCaaagttAAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAAA + CACCAGC AAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAA - 86124 40 X_100000_Hum1.bam @HWI-32908418/1 + CACCAGC AAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGTCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAA - 86124 40 X_100000_Hum1.bam @HWI-18632060/2 + CACCAGC AAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAA - 86124 40 X_100000_Hum1.bam @HWI-14761093/1 +#################################################################################################### +53 D 22 NT 0 "" ChrID X BP 87689 87712 BP_range 87689 87713 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 4 5 1 1 0 0 +CTTCCTTACGCTCTTCTGCTCAGGTTGATTCAAATTTAAATCCCAACACTAGCGCCATGCCCACTGTGGGGAATTTACCAGCAGCCCGCACACTTAGCCGGCCTGCTGCAAAGCGGGATTTATTTaattc<12>cccaaACGAGCATCCTATGAGTTTTTCGGAAGTGGTAGCTGGAACAGGTCCAGTTTCTGTGGCACCCTCTAATCCGGCACCACTGACGAAAACTCCAGGCAAGAGGACAAATGGCG + CTTAGCCGACCTGCTGCAAAGCGGGATTTATTT ACGAGCACCCTATGAGTTTTTCGGAAGTGGTAGCTGGAGCAGGTCCAGTTTCTGTGGCACCCTCTAACCCGGCACCACTGACGAAAACTCCA + 87656 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25913708/1 +#################################################################################################### +54 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 87894 87896 BP_range 87894 87900 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 18 1 1 1 1 +ACCCTCTAATCCGGCACCACTGACGAAAACTCCAGGCAAGAGGACAAATGGCGAACTGGACTCCTCCAGCTTTAAGACTCCCAACAAACGACTATGCGCTACATCAAACTTTAAAACTCCCAGCAtTTTTCCTCCTCTTATCACACCTGTTTTTAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAATGGACCCCCCCGCCAGCCGTTACCCTGCAGCACCAATGCCTCTGCTCGC + CCCAGCA TTTTCCTCCTCTTATCACACCTGTTTTTAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAATGGACCCCCCCGCCAGCCGTTACCCTGCAGCACCAATGCCTCT + 87867 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42659987/2 + CTACATCAAACTTTAAAACTCCCAGCA TTTTCCTCCTCTTATCACACCTGTTTTTAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAATGGACCCCCCCGCCAGCCGTTAC - 88011 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42659987/1 +#################################################################################################### +55 D 3 NT 0 "" ChrID X BP 93955 93959 BP_range 93955 93960 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 25 22 0 0 1 1 +AATATGTGACTCCATCCTGCTGACGACACACAAGTAAATCCTTCAACGCAACCGACAACAGGAAACGGGCCTTGCAAAAGCAAAACAAAATCGCCAAATTTTGCGATTATAAACACAAAAAATTGacaATTTTACAATGCCGCCTGCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCAGTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCTTCCTCAGTAT + AATTTTGCGATTATAAACACAAAAAATTG ATTTTACAATGCCGCCTCCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCACTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCC - 94090 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1245579/2 +#################################################################################################### +56 D 5 NT 0 "" ChrID X BP 94014 94020 BP_range 94014 94022 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 24 25 0 0 1 1 +AGGAAACGGGCCTTGCAAAAGCAAAACAAAATCGCCAAATTTTGCGATTATAAACACAAAAAATTGACAATTTTACAATGCCGCCTGCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCAGTAGCgcggaGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCTTCCTCAGTATCATACTGTCAACGAACTTCCACTAACCTGCAATGAAAGGAAAATAAATAAGTATATGAT + ACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCACTAGC GCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCTTCCTCAGTATCATACTGTCAACGAACTTCCACTAACC - 94204 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22468619/2 +#################################################################################################### +57 D 61 NT 0 "" ChrID X BP 94069 94131 BP_range 94069 94131 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 30 1 1 0 0 +ACAAAAAATTGACAATTTTACAATGCCGCCTGCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCAGTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCttcct<51>aataaGTATATGATACAAAACAAACAAAGGACAATCTAAAATTAGCAAACCAGACAGGCATACAGGCATACTAGCAGATGCTAATATGCAACTCCATCCTGCTGACGACAACCACG + AATGCCGCCTCCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCACTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTC GTATATGACACAAAACAAACA + 93926 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1245579/1 +#################################################################################################### +58 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 94593 94595 BP_range 94593 94602 Supports 5 5 + 0 0 - 5 5 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 23 23 0 0 5 5 +CACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACaAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTAAAAAACAAAAAATTTAATACAATCTTAAAAGCAAATAACAAAT + ACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTAAAAAACA - 95097 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20075430/1 + ACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAA - 94724 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34448436/2 + ACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAA - 94724 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15512287/1 + ACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAA - 94724 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34232282/2 + ACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAA - 94724 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24154913/1 +#################################################################################################### +59 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 95525 95527 BP_range 95525 95527 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 11 0 0 1 1 +ATTATAAACTAACTCACCACGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGcGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGCAGCGCTGGCCGGACATGCATGTTGCGACGCGCATTCAGCGTCCACAACAAGCCCCAGCCAGAATACAACAAAC + ATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATG GGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAG - 95565 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20124521/2 +#################################################################################################### +60 D 1 NT 0 "" ChrID X BP 97934 97936 BP_range 97934 97940 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 20 20 1 1 0 0 +ACCCCCTAATCCGGCACCACTGACGAAAACCCCAGGAAAGCGGACAAACGACGATCTGGATTGCTCAAATTTTAAGACGCCCAATAAAAAATTATGCGCGACATCCAATTTTGTAACTCCCTGCAtTTTTCCCCCGCTCATCACACCAGTTTTCAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAACGGACCCACCCGCCAGCCGTTACCCTGTAGCATCAATGTCTCTGCTTGC + TCTGGATTGCTCAAATTTTAAGACGCCCAATAAAAAATTATGCGCGACATCCAATTTTGTAACTCCCTGCA TTTTCCCCCGCTCATCACACCAGTTTTCAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTA + 97714 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18507559/2 +#################################################################################################### +61 D 3 NT 2 "TC" ChrID X BP 484 488 BP_range 484 488 Supports 9 9 + 5 5 - 4 4 S1 30 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 19 19 5 5 4 4 +ACTACTGAAACGACTGTATGACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAGCTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTCTAAAAG TTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTGCCACATTCCTTGACATTACGGAAGCCTTTGACCGAGTATGGCACGACGGCTTGCTATATAAACTATCCAGACTCATCCCCAGATACCTATTCGACCTACTT + CCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCT + 260 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17867420/2 + TCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTGCC + 387 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23965898/1 + TCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTGCC - 736 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2029754/2 + ACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTG + 385 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38328527/1 + ACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTG - 539 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38328527/1 + CATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTG + 380 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12031808/2 + CATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTG - 540 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12031808/2 + ACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCT - 623 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43669573/1 + ACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCT + 379 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43669573/1 +#################################################################################################### +62 D 47 NT 47 "ATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT" ChrID X BP 3915 3963 BP_range 3915 3963 Supports 11 11 + 6 6 - 5 5 S1 42 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 2 6 6 5 5 +CTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCC + 3896 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9381498/2 + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCC - 4063 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9381498/2 + AATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAA + 3892 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22544107/2 + AATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAA - 4193 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22544107/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAA + 3889 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23086971/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTC + 3786 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8544935/2 + CCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAG + 3813 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45525114/1 + CATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCC + 3882 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29236202/2 + CATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCC - 4053 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29236202/2 + AATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGC - 4108 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24131917/2 + CAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATT - 4146 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30014670/1 +#################################################################################################### +63 D 33 NT 32 "TAAGTAAATAACAAATGTTATACTTACTTAAT" ChrID X BP 3929 3963 BP_range 3929 3963 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 2 0 0 1 1 +GAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + AAAATTAGAAAAATCACATAAGTAAATAACAAATGTTATACTTACTTAATTTTAATATTACAT - 4179 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15529215/1 +#################################################################################################### +64 D 2 NT 1 "T" ChrID X BP 3960 3963 BP_range 3960 3963 Supports 9 9 + 7 7 - 2 2 S1 24 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 2 2 7 7 2 2 +AACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + TTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAA + 3952 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42402525/2 + GGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAA + 3944 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14862151/2 + GGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAA - 4154 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39849104/1 + AAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAA + 3929 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28996201/1 + ACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAA + 3926 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27317211/2 + AGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAA + 3919 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18202504/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAAC + 3906 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8715007/1 + TGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAGATC + 3894 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3468445/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATG - 3984 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24912759/2 +#################################################################################################### +65 D 3 NT 4 "CTTC" ChrID X BP 4531 4535 BP_range 4531 4535 Supports 5 5 + 5 5 - 0 0 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 12 5 5 0 0 +CTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCATGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCTAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAAATATATA TTAACAAAATACTTATCTAAACTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAA + CTGGGAAATAAATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA + 4517 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22276267/1 + ACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAG + 4477 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24539072/2 + GCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAA + 4510 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39075505/1 + CACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTAC + 4505 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-508558/1 + ACACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTA + 4504 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17057283/1 +#################################################################################################### +66 D 48 NT 15 "CGGCAAAGACAAAAG" ChrID X BP 8377 8426 BP_range 8377 8426 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 36 33 1 1 0 0 +CTTCACCATTCCACACCATGTTCGTGGATAGTTGAGGAACTGCTGAAGCTCGGATTCCATGCGCGCTTCGTCAGAAATATGACGAATCCGGCCACAGGTGGCCCCATGAGAATGTTTGAAGTGGA ACAAATCGGTGGGCAAAGGGTTGATATAGAAAGGAAAAATAGGACACGTGAGCCGGTCCAGTGCTACAGATGCCAGGGCTTCAGGCATTCAAAAAACTCTTGCATGAGGCCGCCAAAATGCATGA + GATAGTTGAGGAACTGCTGAAGCTCGGATTCCATGCGCGCTTCGTCAGAAATATGACGAATTCGGCAACAGGTGGCCCCATGAGAATGTTTGAAGTGGACGGCAAAGACAAAAGACAAATCGGTG + 8278 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44418692/1 +#################################################################################################### +67 D 80 NT 69 "TGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTC" ChrID X BP 13406 13487 BP_range 13406 13487 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 4 1 1 0 0 +GGCGAGGCGTCGGAAATCCGATAGCCGGAAGAGAGGCCGGAGCAGCATGTTGGGCATTTTCGCCCCAGTAGCAGCTGCTGGGGCAGCAAGGGCAGAGGTAGCAGTGTCAGCGCTCCTGGTAAACC TGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGCTTCTCCAACTTTCCTCCCTGAAAGAAGAGAATATTAGTAGGAGCATGAGACCAACAACAGCCCTAGCTTACCACGTCAGCGGAAACAGC + GTCAGCGCTCCTGGCAAACCTGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTCTGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGC + 13386 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5145995/1 +#################################################################################################### +68 D 71 NT 70 "CTGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGAGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTC" ChrID X BP 13415 13487 BP_range 13415 13487 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 4 1 1 0 0 +TCGGAAATCCGATAGCCGGAAGAGAGGCCGGAGCAGCATGTTGGGCATTTTCGCCCCAGTAGCAGCTGCTGGGGCAGCAAGGGCAGAGGTAGCAGTGTCAGCGCTCCTGGTAAACCGGCCTTTTC TGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGCTTCTCCAACTTTCCTCCCTGAAAGAAGAGAATATTAGTAGGAGCATGAGACCAACAACAGCCCTAGCTTACCACGTCAGCGGAAACAGC + CGGCTTTTTCCTGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGAGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTCTGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGG + 13405 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33589454/1 +#################################################################################################### +69 D 3 NT 6 "GCGATT" ChrID X BP 15481 15485 BP_range 15481 15485 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 1 1 +GCTTGCTGCATACCGGCATCTCCGCATCAGCGACGTTACAAGCACCACTAAAATTAGAAAGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTC TTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTATATTTGCCCGATAAGCGATATGCTGGCGGCAAAAAAAAAAAAAAAGATAATAGCCGATAAGCCCGCCAAAAA + AGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCGCGATTTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTA + 15415 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9766224/1 + AGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCGCGATTTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTA - 15592 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9766224/1 +#################################################################################################### +70 D 5 NT 6 "AGCTGA" ChrID X BP 15869 15875 BP_range 15869 15875 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 12 1 1 1 1 +ACAGAGGCGCGCGCGCAACAGTAGCTAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGCCAGAACGTGAACCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATG TGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTAAGAAGAAGCCTATATCAAACAAATGCCGACATGAAATCTTACGATTTTGA + AACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGAGCTGATGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGA + 15791 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45099876/1 + AACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGAGCTGATGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGA - 16008 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45099876/1 +#################################################################################################### +71 D 80 NT 69 "TGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTC" ChrID X BP 24553 24634 BP_range 24553 24634 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 2 1 1 0 0 +GGCGAGGCGTCGGAAATCCGATAGCCGGAAGAGAGGCCGGAGCAGCATGTTGGGCATTTTCGCCCCAGTAGCAGCTGCTGGGGCAGCAAGGGCAGAGGTAGCAGTGTCAGCGCTCCTGGTAAACC TGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGCTTCTCCAACTTTCCTCCCTGAAAGAAGAGAATATTAGTAGGAGCATGAGACCAACAACAGCCCTAGCTTACCACGTCAGCGGAAACAGC + GTCAGCGCTCCTGGCAAACCTGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTCTGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGC + 24533 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6049780/1 +#################################################################################################### +72 D 3 NT 6 "GCGATT" ChrID X BP 38134 38138 BP_range 38134 38138 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 1 1 +GCTTGCTGCATACCGGCATCTCCGCATCAGCGACGTTACAAGCACCACTAAAATTAGAAAGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTC TTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTATATTTGCCCGATAAGCGATATGCTGGCGGCAAAAAAAAAAAAAAAGATAATAGCCGATAAGCCCGCCAAAAA + AGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCGCGATTTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTA + 38068 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24428995/1 + AGAGGCTTACTATAGGCAAAGCGCAGAAAAACAAATATTACAATAAGAAATAGCACGCGATTTTTCGCGATTTTCGTTTCCGCTTGGTACAAGTGAGACCATTCTCCCTATATGCCATTCTAGTA - 38251 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24428995/1 +#################################################################################################### +73 D 5 NT 6 "AGCTGA" ChrID X BP 39046 39052 BP_range 39046 39052 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 3 0 0 1 1 +AAATATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGCCAGAACGTGAACCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATG TGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTAAGAAGAAGCCTATATCAAACAAATGCCGACATGAAATCTTACGATTTTGA + GAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGACAGAACGTGAGCCAAAGCGGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGAGCTGATGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTAT - 39076 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39320331/1 +#################################################################################################### +74 D 19 NT 11 "TAGATGAAGGA" ChrID X BP 43112 43132 BP_range 43112 43132 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 4 4 0 0 1 1 +CAAAGCTAAACTAAAAGCAGCTGAAAATCGACTAAAAAAAGCGGTAAAGATCTTGAGAGAAAAGAGAATTAATAAACAAATTGAAGGAATAGACACGAAAAACCCGGACAGAATGAGGAAAATGT AAAAAAGACAAACCAACCGAACTTTCCCCTCAAACTGGAAACCAAAAGAGGCCCCAAATGGACAAAAACGATAAAGGAGACAACAGAAGCATTTGTTTCCCACTTAGAAGGAAGATTTAAGCCAA + GGACAGAATGAGGAAAATGTTAGATGAAGGAAAAAAAGACA - 43124 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45616874/1 +#################################################################################################### +75 D 80 NT 69 "TGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTC" ChrID X BP 47730 47811 BP_range 47730 47811 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 3 0 0 1 1 +GGCGAGGCGTCGGAAATCCGATAGCCGGAAGAGAGGCCGGAGCAGCATGTTGGGCATTTTCGCCCCAGTAGCAGCTGCTGGGGCAGCAAGGGCAGAGGTAGCAGTGTCAGCGCTCCTGGTAAACC TGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGCTTCTCCAACTTTCCTCCCTGAAAGAAGAGAATATTAGTAGGAGCATGAGACCAACAACAGCCCTAGCTTACCACGTCAGCGGAAACAGC + GTCAGCGCTCCTGGCAAACCTGTTGAAGACGCGGGACTGCCGCGCAATCGTTCTTTCCAACCGGGGGTTCTTTGCGCCTGCGGTCTTTCTGCTTCAGCGGCTCCATCTGCTGTTGCATCTGGCGC - 47861 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5145995/1 +#################################################################################################### +76 D 92 NT 92 "TCCTCTTATCACACCTGTTTTTAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAATGGACCCCCCCGCCAGCCGTTAC" ChrID X BP 50934 51027 BP_range 50934 51027 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 25 23 1 1 0 0 +GTCCCGGCACCTTTAACGAAAACTCCAGGCAAGCGGACAAACGACGATCTGGACTGCTCCAACTTTAAGACGCCCAATAAAAAATTATGCGCGACTTCCAACTTTGTAACTCCCAGCATTTTTCC CCTGCAGCATCAATGCCTCTGCTCGCAGCGCAGCGGCGCCACCCGGGATCGCCCCCCTACCCCCTCATAATACAGATGCAGAGCTGCCTCCATGGAAAATCGTGCCCCAGAGCCGTAGAGCACCT + AACTCCCAGCATTTTTCCTCCTCTTATCACACCTGTTTTTAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGTTTATGAGGAATCAAAAGCCAGAAATGGACCCCCCCGCCAGCCGTTACCCTGCAGCATCAATG + 50815 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-41091610/2 +#################################################################################################### +77 D 47 NT 47 "ATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT" ChrID X BP 55886 55934 BP_range 55886 55934 Supports 8 8 + 3 3 - 5 5 S1 24 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 3 3 3 5 5 +CTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + TCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAAT + 55769 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19871417/1 + ATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAAT - 55988 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37632218/1 + AATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCTCAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAA + 55863 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-167684/1 + AATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCTCAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAA - 56164 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-167684/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTC + 55757 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34234489/2 + CTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGG - 56048 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36622386/2 + CATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGT - 56151 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17390279/2 + AATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGC - 56079 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46241246/2 +#################################################################################################### +78 D 2 NT 1 "T" ChrID X BP 55931 55934 BP_range 55931 55934 Supports 4 4 + 4 4 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 3 4 4 0 0 +AACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + TACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGC + 55920 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24687226/1 + AACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCGTTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACA + 55909 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17662060/1 + AGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAA + 55890 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20297375/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAAC + 55877 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27539376/2 +#################################################################################################### +79 D 3 NT 4 "CTTC" ChrID X BP 56502 56506 BP_range 56502 56506 Supports 3 3 + 3 3 - 0 0 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 10 3 3 0 0 +CTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCATGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCTAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAAATATATA TTAACAAAATACTTATCTAAACTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAA + CTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA + 56488 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45325275/1 + GCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAA + 56481 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1144677/1 + ACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACC + 56477 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11843196/1 +#################################################################################################### +80 D 56 NT 70 "AAAACTCTTGCATGAAGCCACCAAGATGCATGAAATGCGCTGGCGATCACCTATCATCCTGTTGCACCAA" ChrID X BP 60333 60390 BP_range 60333 60390 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 39 27 0 0 1 1 +CCATGCGAATGTTTGAAGTGGAGATCGTCATGGCCAAAGACGGCAGTCATGACAAAATACTCTCACTCAAACAAATCGGTGGGCAAAGGGTGGACATTGAAAGGAAAAACAGGACACGGGAGCCA GCCAAGATGCATGAAATGCGCTGGCGAACACCTGTCTTCCTGTTGCACCAAACCAAGAACCACCCCCGCCACCTGCGTAAATTGCTCTGGGCAGCATATTAGCGCGTACAAAGGATGCCCTGCAT + GTGGGCAAAGGGTGGATATTGAAAGGAAAAACAGGACACGGGAGCCAAAAACTCTTGCATGAAGCCACCAAGATGCATGAAATGCGCTGGCGATCACCTATCATCCTGTTGCACCAAGCCAAGAT - 60333 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42598949/1 +#################################################################################################### +81 D 93 NT 94 "CTATCTTAACAATAAATATATCCGATGAAAAGCGTAGTCTGTCTGCTTCCAAATTCCTGCATGTCATCACCTTCCTCGACGGAGCCTAATTTAT" ChrID X BP 61248 61342 BP_range 61248 61342 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 95 81 0 0 1 1 +CAAGCTTAGCTAATAGAGTCGACAATTTAGAAAAGAAAATTGACATTTTAATGGCCTTAATCATACAAGGAAGAAATAACAATCTTGACATGGATACATCCAATTAATCTTACAACTACTTATAT TTGGAAAAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACAAAAAATATGAAT + CAACTAATTATATCTATCTTAACAATAAATATATCCGATGAAAAGCGTAGTCTGTCTGCTTCCAAATTCCTGCATGTCATCACCTTCCTCGACGGAGCCTAATTTATTTGGAAAAATAAATCAAT - 61684 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-350764/1 +#################################################################################################### +82 D 97 NT 5 "AAACC" ChrID X BP 62738 62836 BP_range 62738 62836 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 48 36 2 2 0 0 +TATTTATTTAAACAAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCCAATTAATTACAAAATGTACCTGAAAAACA AAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATG + TACCTGAAAAACAAAACCAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGT + 62486 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29058890/1 + GTACCTGAAAAACAAAACCAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCA + 62544 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36318467/1 +#################################################################################################### +83 D 69 NT 69 "TGGCGAACAACGATCTACAATTCCATGACGACTCCTCTGTCACGACGAGACAGAAGACACCACCATAAT" ChrID X BP 63103 63173 BP_range 63103 63173 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 27 32 1 1 1 1 +AATTTTGTATTCATTTCCATGACCCCAACGCTGCAACTGTCCTCGGCAACAATTCCTGTTCCGGCGGCTCCATGCTGCCAATCCTGACGCACTGGCCACAAGACGCGGCGCTGCTGGCAATCTCT GCCAGCAGCTCCAAAACAATACAACGACGGCCGCGCGGAACCCATCTTCAGAATTCCCTCTTCCTGACGACCGGCGAAGCAGTTCTGGAATAAACAATGTATTAATTGCAAACATCTACCGATGA + CTGGCAATCTCTTGGCGAACAACGATCTACAATTCCATGACGACTCCTCTGTCACGACGAGACAGAAGACACCACCATAATGCCAGCAGCTCCAAAGCAATACAACGACGGCCGCGCGGAACCCA + 63091 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35558188/1 + CTGGCAATCTCTTGGCGAACAACGATCTACAATTCCATGACGACTCCTCTGTCACGACGAGACAGAAGACACCACCATAATGCCAGCAGCTCCAAAGCAATACAACGACGGCCGCGCGGAACCCA - 63256 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35558188/1 +#################################################################################################### +84 D 32 NT 9 "TAAAAAAAA" ChrID X BP 63808 63841 BP_range 63808 63841 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 1 1 +TGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT CAATCTACATACATTGATGCAGCGCAAAAGACGGTCAACCATGTCGTCTCCGAGTCGATCAGGACACCTTGCTGCTCTCAAAAACCTCCAGCCTGACGAGCGCCAACAGCGAGTTGACGCTAAAA + CTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAACAATCTACATACATTGATGCAGCGCAAAAGACGGTCAACCATGTCGTCTCCGAGTCGATCAGGACACCTTGCTGCTCTCAAAAACCTCC - 63965 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44544144/1 + GGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAACAATCTACATACATTGATGCAGCGCAAAAGACGGTCAACCATGTCGTCTCCGAGTCGATCAGGACACCTTGCTG + 63766 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16139812/2 +#################################################################################################### +85 D 77 NT 8 "TAAAAAAA" ChrID X BP 63808 63886 BP_range 63808 63886 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 2 1 1 0 0 +TGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGT GTCTCCGAGTCGATCAGGACACCTTGCTGCTCTCAAAAACCTCCAGCCTGACGAGCGCCAACAGCGAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAATTAAATACAAACAAATAAAATCA + GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGTCTCCGAGTCGATCAGGACACCTTGCTGCTCTCAAAAACCTCCAGCCTGACGAGCGCCAACAGCGAGTTGACGCTAAAACCTAAAA + 63885 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8364547/1 +#################################################################################################### +86 D 76 NT 29 "ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATAC" ChrID X BP 65441 65518 BP_range 65441 65518 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 15 9 0 0 1 1 +GCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAGCAATGTTAGTCTTAAATGTCAATGTTTTTTGTAAAATAATTTTATTTA TACTAGCTACTTTAACATTAACATTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGCAATGTTAAAATCTAAAAATCGAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAACTGTAATCAAAGGCAAAAT + ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCTACTTTAACATTAACATTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGCAATGTTAAAATCTAAAAATCGAAATTATT - 65646 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34622816/2 +#################################################################################################### +87 D 6 NT 6 "CAAAGT" ChrID X BP 65791 65798 BP_range 65791 65798 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 81 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 6 1 1 1 1 +TTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAA TAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATA + AAACCACCAGCAAAGTTTAAACAAAGTTAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCACT + 65770 41 X_100000_Hum1.bam @HWI-5907661/2 + AAACCACCAGCAAAGTTTAAACAAAGTTAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCACT - 65938 40 X_100000_Hum1.bam @HWI-5907661/2 +#################################################################################################### +88 D 1 NT 15 "ACTAAGGTTAGTTAA" ChrID X BP 73286 73288 BP_range 73286 73288 Supports 16 16 + 9 9 - 7 7 S1 80 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 28 28 9 9 7 7 +TCAATAACATAAAATCCGCAGCCAATGAAGCCACCCCACCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTAAAAGGTTACTT AGGAGAAAAAGGAGCTAAATCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACGAAGCCCGAAGATGGTTTAAGAACGTGCAAAATAGACTGTCTAAAGAAATCAGAAAGCTCAAACAAAAACTACTCAAC + AACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACGAAGCCCGAAGATGGTTTAAGAACGTGCAAAATAGACTGTCTAAAGA - 73412 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35879412/1 + CAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACGAAGCCCGAAGATGGTTTAAGAACG + 73208 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2406974/2 + TCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACGAAGCCCGAAGATGGTTTAAG + 73194 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5557433/2 + ACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACGAAG + 73042 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36079962/1 + CCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGTAGGAACTGACG + 73189 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43401778/1 + AAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGT + 73213 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38095603/2 + AAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAGCAGT - 73439 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38095603/2 + CCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAG - 73412 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6204284/2 + CCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGAG + 73209 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32942618/1 + CCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGA - 73373 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2406974/1 + AATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATC - 73412 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4990057/2 + AATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATC + 73202 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4990057/2 + CCCCATCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAA - 73369 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5557433/1 + CCCCATCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAA + 73194 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5557433/1 + AGCCACCCCATCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGA + 73189 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43401778/2 + AGCCACCCCATCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGA - 73349 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43401778/2 +#################################################################################################### +89 D 3 NT 2 "TC" ChrID X BP 74133 74137 BP_range 74133 74137 Supports 8 8 + 6 6 - 2 2 S1 21 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 29 28 6 6 2 2 +ACTACTGAAACGACTGTATGACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAGCTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTCTAAAAG TTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTGCCACATTCCTTGACATTACGGAAGCCTTTGACCGAGTATGGCACGACGGCTTGCTATATAAACTATCCAGACTCATCCCCAGATACCTATTCGACCTACTT + TCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTGCC + 74036 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12488803/2 + ACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTG + 74034 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27349460/2 + ACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCTG - 74188 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27349460/2 + GACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCT + 73987 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38522017/1 + GACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCTGTTCT - 74157 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20424712/1 + ACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGATGTCT + 74028 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13716353/2 + GTATGACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAGA + 74023 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-220659/2 + TGTATGACATTGACTCTTTTGCCAAAGCAATCCCTTCCCATCAATTTGGTTTCAGAAAGGATCATGGAGCGGAACATCAACTGGCCAGGGTGACCCAATTTATTTTAAAAGTCTTGATGAAAAAG + 73966 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13683091/2 +#################################################################################################### +90 D 47 NT 47 "ATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT" ChrID X BP 77564 77612 BP_range 77564 77612 Supports 7 7 + 4 4 - 3 3 S1 20 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 6 4 4 3 3 +CTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCC + 77545 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32552961/2 + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCC - 77712 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32552961/2 + ATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAAT + 77447 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11566427/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTC + 77435 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32787632/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCA - 77639 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46102035/1 + CATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCC - 77723 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1239853/2 + CATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCC + 77531 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1239853/2 +#################################################################################################### +91 D 2 NT 1 "T" ChrID X BP 77609 77612 BP_range 77609 77612 Supports 10 10 + 8 8 - 2 2 S1 27 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 6 6 8 8 2 2 +AACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAA TTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAAATAGCAAACCTGACAGG + GGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAA + 77593 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45647343/1 + GGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACATAAA - 77803 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45647343/1 + CAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACACA + 77589 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39142891/1 + AACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAAAGGCAAATAAAATAACACA + 77587 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25178253/2 + ACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCG + 77575 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20247962/1 + AGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATAAA + 77568 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44043927/1 + AGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAATA + 77566 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3015096/2 + TTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCACGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATCCTAAAA + 77564 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27716821/2 + TGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAGATC + 77543 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34434529/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATTCCCATG - 77633 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43182070/2 +#################################################################################################### +92 D 3 NT 4 "CTTC" ChrID X BP 78180 78184 BP_range 78180 78184 Supports 3 3 + 3 3 - 0 0 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 13 3 3 0 0 +CTGACAGGCAAACTAGCAGATGCTAATTTGCAACACCATCATGCTGACGTCACGCACGAAAATCCTTTCTCCTAAGACCGCAAAAGCTGAAAAAGGAAACACAAGCTAATACTGGGAAATATATA TTAACAAAATACTTATCTAAACTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGAAACTAATGAAATCATAAA + CTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAGA + 78166 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2954969/2 + ACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACCTGAAAAACAG + 78126 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45023120/2 + ACAAGCTAACACTGGGAAATATATACTTCTTAACAAAATACTTATCTAAATTGCCAAATTGACGACTTCAAAGCTGCGGCATCATAACTACAACGACCTCCAAAATAACTTTCAAAAAATGTACC + 78155 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33234321/2 +#################################################################################################### +93 D 58 NT 55 "TACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAACCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAA" ChrID X BP 79439 79498 BP_range 79439 79498 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 6 1 1 1 1 +TCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAA AAAATAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAATTAAACAAATAATTAAACTAAACTTATTTAACAACATAATCCGCGCTTCCACCTGCAAAATTTTTTCTGACGCGCA + AGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAACCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAACAAAATAAAATAAATTA + 79394 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19161730/2 + AGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAACCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAACAAAATAAAATAAATTA - 79674 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9511017/1 +#################################################################################################### +94 D 62 NT 22 "GATAAGCCTCCACCAGCAAAGT" ChrID X BP 79439 79502 BP_range 79439 79502 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 7 1 1 1 1 +TCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAA TAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAATTAAACAAATAATTAAACTAAACTTATTTAACAACATAATCCGCGCTTCCACCTGCAAAATTTTTTCTGACGCGCAAATA + TTATACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGATAAGCCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAACAAATTAAACAAATAATTAAAC - 79784 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14156964/1 + GCGGAACAGAATTTATACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGATAAGCCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAACAAATTAAAC + 79387 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3298349/1 +#################################################################################################### +95 D 80 NT 90 "TAGTACATGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGACACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGAT" ChrID X BP 83324 83405 BP_range 83324 83405 Supports 5 5 + 3 3 - 2 2 S1 12 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 22 13 3 3 2 2 +CACTTTCGCCTACTCCCAAATACATTCATCGACACCACCTTCCTCCATGCAAAGCCTAAAACAAATAAATGGAAAAATAAATTAATTAGACGGAAGGCATAAAAACACAAACACTACTCTCACCT GAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGCGGCAAAAGCAGGATGAGTATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACCTGAATTTTCTTGCCGCACTGTCTTCTGAAG + ACTCTCACCTTAGTACATGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGACACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAG + 83128 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40846192/1 + CACTACTCTCACCTTAGTACATGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGACACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAA + 83310 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35688750/2 + CACTACTCTCACCTTAGTACATGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGACACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAA - 83529 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12470768/1 + AAAACACAAACACTACTCTCACCTTAGTACCTGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGATACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGA + 83113 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21895065/1 + ATAAAAACACAAACACTACTCTCACCTTAGTACCTGGATAATTAATCACATGACAACGCACACCAGCTGATCCTGACGAAGCGATACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGA - 83543 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11201763/2 +#################################################################################################### +96 D 52 NT 3 "CCG" ChrID X BP 83807 83860 BP_range 83807 83860 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 20 1 1 0 0 +TAAAAACAAACAAATCATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATTAAAACAAACTACCTACCTCAACGACCGCAGCAAATTGCTGACCCACATCCAACGCAACAGACAACAGGAGACGGGCTCCGC TCTTACGACGCCGTCTCCATCTCCTGATGCCACTGCGTTAATAAGGATCATTAGCGCGAAGCTGACGTCACATTAACAAGCTGCAAAAATCATCCTCAAAATCTATACTTCTCGTCAATACCGTA + AAATACAAACAAATAAAATAAAATTAAAACAAACTACCTACCTCAACGACCGCAGCAAATTGCTGACCCACATCCAACGCAACAGACAACAGGAGACGGGCTCCGCCCGTCTTACGACGCCGTCT + 83613 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3696962/1 +#################################################################################################### +97 D 52 NT 3 "CCG" ChrID X BP 90135 90188 BP_range 90135 90188 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 20 1 1 0 0 +TAAAAACAAACAAATCATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATTAAAACAAACTACCTACCTCAACGACCGCAGCAAATTGCTGACCCACATCCAACGCAACAGACAACAGGAGACGGGCTCCGC TCTTACGACGCCGTCTCCATCTCCTGATGCCACTGCCTTAATAAGGATCATTAGCGCGAAGCTGACGTCACATTAACAAGCTGCAAAAATCATCCTCAAAATCTATACTTCTCGTCAATACCGTA + AAATACAAACAAATAAAATAAAATTAAAACAAACTACCTACCTCAACGACCGCAGCAAATTGCTGACCCACATCCAACGCAACAGACAACAGGAGACGGGCTCCGCCCGTCTTACGACGCCGTCT + 89941 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16357853/1 +#################################################################################################### +98 D 77 NT 12 "GTATATGACACA" ChrID X BP 94069 94147 BP_range 94069 94147 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 24 0 0 1 1 +ACAAAAAATTGACAATTTTACAATGCCGCCTGCACCTCCTGTTGCCACTGCATCAATAAGGATCAGTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTC AAACAAAGGACAATCTAAAATTAGCAAACCAGACAGGCATACAGGCATACTAGCAGATGCTAATATGCAACTCCATCCTGCTGACGACAACCACGCAACTCCTTTCTCCAAGACCGCAAATACTG + ACTGCATCAATAAGGATCACTAGCGCGGAGCTGATGCCACTTTAAAAAGCTGAAAAATCCGTCCACAAAATGTATACTCGTATATGACACAAAACAAAGGACAATCCAAAATTAGCAAACCAGAC - 94115 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11608458/1
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Inversions.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,35 @@ +#################################################################################################### +0 INV 63 NT 0:0 "":"" ChrID X BP 67129 67193 BP_range 67129 67193 Supports 2 1 + 2 1 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 29 32 2 1 0 0 +CACACTAAAGCAGCTACACACACTTACACCGACGCTTCTCAAGAAGAGAATATATTCACCTCAGCGACATGCACTAACGCAGCTGCACCCACTCATACGGATGCAGAACTTAAAAGCGCCAAAACgagctgaggttaatgctgccatcactgtgtgagagggaggggaagatttccaaagcttcgctcgttttggcgcttttaagttctgcatccgtatgagtgggtgcagctgcgttagtgcatgtcgc + ATATTCACCTCAGCGACATGCACTAACGCAGCTGCACCCACTCATACAGATGCAGAACTTAAAGGCGCCAAAACGAGCTAAGCTT + 67055 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42297995/2 + ATATTCACCTCAGCGACATGCACTAACGCAGCTGCACCCACTCATACAGATGCAGAACTTAAAGGCGCCAAAACGAGCTAAGCTT + 67055 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42297995/2 +---------------------------------------------------------------------------------------------------- +tgtttgtgttagtgtgtgcatgagaaagaggggaaatagtattgcgtccaattttggtggaagagctgaggttaatgctgccatcactgtgtgagagggaggggaagatttccaaagcttcgctcTTCCACCAAAATTGGACGCAATACTATTTCCCCTCTTTCTCATGCACACACTAACACAAACAAGGCCACAAACTCAAGCACAGAAAGGCGCTCAAAATGTCCCGCGCTTATTATTACAGACGCAA +#################################################################################################### +1 INV 87 NT 16:0 "GCTTTTTTTTGCTGGT":"" ChrID X BP 5407 5495 BP_range 5407 5495 Supports 4 1 + 4 1 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 1 4 1 0 0 +CCAGCCAGAATGCCAAAATTACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCCGACGGGGGTACCTGAAAAGAATAAATCAATAACAATGTTAGTTTTAAATTT ttttgacagtaattaggacaggtaacattatcatattgtatggtatgtttacaatttacaattgaaatgattttatagaaaacattgaaatttaaaactaacattgttattgatttattcttttc + AGTTTTAAATTTCAATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAACCAGCAAAAAAAAGCAAAGTTAAAA + 5395 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35741779/1 + AGTTTTAAATTTCAATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAACCAGCAAAAAAAAGCAAAGTTAAAA + 5395 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40771345/2 + AGTTTTAAATTTCAATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAACCAGCAAAAAAAAGCAAAGTTAAAA + 5395 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40771345/2 + AGTTTTAAATTTCAATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAACCAGCAAAAAAAAGCAAAGTTAAAA + 5395 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35741779/1 +---------------------------------------------------------------------------------------------------- +aataatgtaaaagtagttagtattttgtagacttaggcttttgacagtaattaggacaggtaacattatcatattgtatggtatgtttacaatttacaattgaaatgattttatagaaaacattgGCCTAAGTCTACAAAATACTAACTACTTTTACATTATTACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGT +#################################################################################################### +2 INV 98 NT 7:0 "CCTATAT":"" ChrID X BP 39131 39230 BP_range 39131 39230 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 2 1 1 0 0 +GGAGGATGGGCATCGGTTTTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTAAGAAG caaataaagggtctggcaatatggtatttttattttcatttaatacaatattttcaaaatcgtaagatttcatgtcggcatttgtttgatataggcttcttcttactatggtggtttcatttgac + TTATCCATCTCATCGGACGATGGTAACTGCTCATCCTCGCCGCCATCAGCTATAGTCTCATCGCTGGATACCACGCCAACGTCAAATGAAACCACCATAGTAAGAAGCCTATATCAAACAAATGG + 39024 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19317189/2 +---------------------------------------------------------------------------------------------------- +tattagcagtactcccgcatttatcaacaaataaagggtctggcaatatggtatttttattttcatttaatacaatattttcaaaatcgtaagatttcatgtcggcatttgtttgatataggcttTTGATAAATGCGGGAGTACTGCTAATACCACAGAAGCCAATGAAAAACAGCCTGCCGATAGCCCCTTCCCCATTTCCATAAGCAAAAATTTTAGCACTTCCTCGCCACTAACACATGTAGACACG +#################################################################################################### +3 INV 95 NT 39:0 "ACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAA":"" ChrID X BP 73286 73382 BP_range 73286 73382 Supports 2 1 + 2 1 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 28 49 2 1 0 0 +TCAATAACATAAAATCCGCAGCCAATGAAGCCACCCCACCTAATCGCCCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTAAAAGGTTACTT tctttagacagtctattttgcacgttcttaaaccatcttcgggcttcgtcagttcctactgctctaaagattcgatttagctcctttttctcctcaagtaaccttttagttgcttcatctagcct + CCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGA + 73208 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2406974/1 + CCCCAAAATAACCGCACCTACAATTCTTCAAGAAGATCCACAAACCTAAGGCTAGATGAAGCAACTTAAAGGTTACTTACTAAGGTTAGTTAAAGGAGAAAAAGGAGCTAAACCGAATCTTTAGA + 73208 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2406974/1 +---------------------------------------------------------------------------------------------------- +ttgagtagtttttgtttgagctttctgatttctttagacagtctattttgcacgttcttaaaccatcttcgggcttcgtcagttcctactgctctaaagattcgatttagctcctttttctcctcAATCAGAAAGCTCAAACAAAAACTACTCAACCGCAACCTACAAGATATTGACACTACGGACCGATATAGAATGCAAAAACTATGGAAAACCACAAATACAATTAAAATGCAACCTCGACCCTGCT +#################################################################################################### +4 INV 85 NT 0:33 "":"ATATATTCTACATACGTACATCCCTTCGTCCTT" ChrID X BP 97985 98071 BP_range 97985 98071 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 16 10 0 0 1 1 +CGATCTGGATTGCTCAAATTTTAAGACGCCCAATAAAAAATTATGCGCGACATCCAATTTTGTAACTCCCTGCATTTTTCCCCCGCTCATCACACCAGTTTTCAAAAGCAAGGCAGCTCAATCTGgccgctgcgctgcaagcagagacattgatgctacagggtaacggctggcgggtgggtccgtttctggcttttgattcctcataaacagattgagctgccttgcttttgaaaactggtgtgatgag +---------------------------------------------------------------------------------------------------- +atctgtattttgagggggtaggggggcgataacgggtggcgccgctgcgctgcaagcagagacattgatgctacagggtaacggctggcgggtgggtccgtttctggcttttgattcctcataaa GCCACCCGTTATCGCCCCCCTACCCCCTCAAAATACAGATGCACAGCTGCCTCCATGGAAAATCGTGCCCCAGAGCCGTAGAGCACCCCCTATACTCGTCAATGATGTGAAGGAAATTGTCCCTC + CCACATAAAATATATTCTACATACGTACATCCCTTCGTCCTTGCCACCCGTTATCGCCCCCCTACCCCCTCAAAATACAGATGCACAGCTGCCTCCATGGAAAATCGTGCCCCAGAGCCGTAGAG - 98195 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22154325/1
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Read_Pair_Evidence.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,61 @@ +X 96886 97636 + 750 X 117413 117788 - 375 20527 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 91168 91918 + 750 X 95825 96200 - 375 4657 Support: 8 X_100000_Hum1.bam 8 +X 84924 85674 + 750 X 93540 93915 - 375 8616 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 84187 84812 - 625 X 90634 91182 + 548 6447 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 84586 85290 + 704 X 90605 90903 - 298 6019 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 82409 83159 + 750 X 89078 89390 - 312 6669 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 81907 82657 + 750 X 88112 88481 - 369 6205 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 78543 79103 - 560 X 116002 116532 + 530 37459 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 64685 65310 - 625 X 70824 71449 + 625 6139 Support: 12 X_100000_Hum1.bam 12 +X 64838 65588 + 750 X 70860 71235 - 375 6022 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 62599 63224 - 625 X 95259 95794 + 535 32660 Support: 8 X_100000_Hum1.bam 8 +X 59948 60573 - 625 X 110239 110864 + 625 50291 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 57135 57885 + 750 X 77881 78256 - 375 20746 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 55791 56336 - 545 X 78059 78606 + 547 22268 Support: 25 X_100000_Hum1.bam 25 +X 56252 56986 + 734 X 77881 78256 - 375 21629 Support: 11 X_100000_Hum1.bam 11 +X 55718 56468 + 750 X 77881 78256 - 375 22163 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 51404 52029 - 625 X 60730 61343 + 613 9326 Support: 12 X_100000_Hum1.bam 12 +X 52092 52748 + 656 X 60049 60424 - 375 7957 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 50894 51519 - 625 X 60116 60646 + 530 9222 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 51411 52161 + 750 X 59914 60205 - 291 8503 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 52092 52748 + 656 X 59914 60205 - 291 7822 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 50729 51354 - 625 X 59672 60297 + 625 8943 Support: 8 X_100000_Hum1.bam 8 +X 50864 51614 + 750 X 59914 60205 - 291 9050 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 30732 31357 - 625 X 42178 42803 + 625 11446 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 23504 24254 + 750 X 46741 47116 - 375 23237 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 13236 13861 - 625 X 47452 48077 + 625 34216 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 11156 11906 + 750 X 65547 65915 - 368 54391 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 5502 6127 - 625 X 64939 65564 + 625 59437 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 5502 6086 - 584 X 64177 64776 + 599 58675 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 5502 6127 - 625 X 69227 69852 + 625 63725 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 9019 9769 + 750 X 65509 65884 - 375 56490 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 5502 6127 - 625 X 68427 69052 + 625 62925 Support: 14 X_100000_Hum1.bam 14 +X 8400 9150 + 750 X 65509 65884 - 375 57109 Support: 18 X_100000_Hum1.bam 18 +X 5502 6127 - 625 X 68038 68663 + 625 62536 Support: 28 X_100000_Hum1.bam 28 +X 7727 8477 + 750 X 65509 65884 - 375 57782 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 5502 6127 - 625 X 67241 67817 + 576 61739 Support: 26 X_100000_Hum1.bam 26 +X 7212 7962 + 750 X 65509 65884 - 375 58297 Support: 23 X_100000_Hum1.bam 23 +X 5502 6127 - 625 X 66910 67445 + 535 61408 Support: 16 X_100000_Hum1.bam 16 +X 6549 7299 + 750 X 65509 65884 - 375 58960 Support: 18 X_100000_Hum1.bam 18 +X 6047 6797 + 750 X 65509 65884 - 375 59462 Support: 11 X_100000_Hum1.bam 11 +X 6221 6797 + 576 X 65509 65884 - 375 59288 Support: 14 X_100000_Hum1.bam 14 +X 5502 6127 - 625 X 66227 66770 + 543 60725 Support: 9 X_100000_Hum1.bam 9 +X 5502 6127 - 625 X 65724 66349 + 625 60222 Support: 8 X_100000_Hum1.bam 8 +X 5522 6272 + 750 X 65509 65884 - 375 59987 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 5189 5939 + 750 X 56258 56633 - 375 51069 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 4443 5068 - 625 X 78387 79012 + 625 73944 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 4658 5408 + 750 X 56258 56633 - 375 51600 Support: 7 X_100000_Hum1.bam 7 +X 4443 5068 - 625 X 77976 78601 + 625 73533 Support: 8 X_100000_Hum1.bam 8 +X 4362 5112 + 750 X 78027 78402 - 375 73665 Support: 12 X_100000_Hum1.bam 12 +X 4188 4813 - 625 X 56322 56873 + 551 52134 Support: 12 X_100000_Hum1.bam 12 +X 4188 4813 - 625 X 56068 56653 + 585 51880 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 4158 4908 + 750 X 56258 56633 - 375 52100 Support: 7 X_100000_Hum1.bam 7 +X 3646 4271 - 625 X 55704 56238 + 534 52058 Support: 5 X_100000_Hum1.bam 5 +X 3575 4325 + 750 X 56258 56633 - 375 52683 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 3575 4325 + 750 X 54832 55207 - 375 51257 Support: 6 X_100000_Hum1.bam 6 +X 1372 1941 - 569 X 76372 76997 + 625 75000 Support: 20 X_100000_Hum1.bam 20 +X 2636 3234 + 598 X 75383 75758 - 375 72747 Support: 13 X_100000_Hum1.bam 13 +X 1960 2710 + 750 X 75383 75758 - 375 73423 Support: 11 X_100000_Hum1.bam 11 +X 723 1473 + 750 X 74057 74432 - 375 73334 Support: 10 X_100000_Hum1.bam 10 +X 408 1033 - 625 X 74125 74717 + 592 73717 Support: 14 X_100000_Hum1.bam 14 +X 1 626 - 625 X 73204 73752 + 548 73203 Support: 7 X_100000_Hum1.bam 7
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Short_Insertions.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,216 @@ +#################################################################################################### +0 I 58 NT 58 "GTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTG" ChrID X BP 665 666 BP_range 665 673 Supports 3 3 + 2 2 - 1 1 S1 6 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 25 25 2 2 1 1 +GACCGAGTATGGCACGACGGCTTGCTATATAAACTATCCAGACTCATCCCCAGATACCTATTCGACCTACTTGAAAACTATTTATCTAATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAAC GTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAGTGCCCCAGGGCAGCATACTGGGACCGGTCCTCTACTCAATATACTCATCCGACATGCCCTATCCCATCGTAAAAGACTATATGCGTAACATATCCT + ATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAGT - 695 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3101202/2 + AATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAG + 443 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25769383/2 + AATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAG + 443 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1199625/2 +#################################################################################################### +1 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 3910 3911 BP_range 3910 3916 Supports 9 9 + 9 9 - 0 0 S1 10 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 11 9 9 0 0 +CCAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATAC AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAAATTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATC + ATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAA + 3746 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34902444/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAA + 3746 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13892636/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + 3770 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1696698/1 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA + 3813 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45525114/2 + TACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAA + 3812 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9492711/1 + TACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAA + 3812 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6629964/1 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + 3808 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18344603/1 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + 3808 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1724059/1 + CCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGA + 3798 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24082355/1 +#################################################################################################### +2 I 54 NT 54 "CGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATA" ChrID X BP 5646 5647 BP_range 5646 5697 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 78 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 3 3 0 0 4 4 +TTTACATTATTACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATG CGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAACCAGCAAAGTTAAAAAAATAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAAT + AAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACC - 5792 21 X_100000_Hum1.bam @HWI-7343352/2 + AAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACC - 5814 15 X_100000_Hum1.bam @HWI-16559430/1 + AAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACC - 5797 21 X_100000_Hum1.bam @HWI-35928118/1 + AAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACC - 5797 21 X_100000_Hum1.bam @HWI-34726262/1 +#################################################################################################### +3 I 4 NT 4 "AAAA" ChrID X BP 5931 5932 BP_range 5931 5938 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 18 0 0 4 4 +AAATAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAAT AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAGCAAAGTTA + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGC - 6210 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38064939/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAG - 6210 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31361550/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG - 6210 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30153092/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG - 6210 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3008455/1 +#################################################################################################### +4 I 5 NT 5 "AAAAA" ChrID X BP 5931 5932 BP_range 5931 5938 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 18 1 1 0 0 +AAATAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAAT AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAGCAAAGTTA + TTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAA + 5866 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28997954/2 +#################################################################################################### +5 I 2 NT 2 "AC" ChrID X BP 16822 16823 BP_range 16822 16828 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 0 0 +CCAAGCCAACACAGCCCGCCAAAAACCCCTCACCCCTCTCCCAGAAGCAAATAACAAGCATAGCAGCCAATACACTCACCCACACAAACAAACACACAGCATCACAAAACTTTATTCCCGCCAAA ACACATATAAACATACCCACACAATATAACGACACCAATGCAACCAAAGCATTAAAAACCGCAAAACCAGCTTCTCCCTCCCACACATACTCACGCCAGACAAAACCAATAAAGCCCGCCATAAA + CCGCCAAAAAACACATATAAACATACCCACACAATATA + 16814 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31487804/2 +#################################################################################################### +6 I 8 NT 8 "CTGGATGA" ChrID X BP 22202 22203 BP_range 22202 22206 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 2 2 1 1 0 0 +AAAGGAAATAAATACAAAAAGGCTAAAGGCTAAGTTACAGGTTACATAAAAAGGGAAATGTGCTTATAGATATAATGGTAAAATTAACTTAACTAAACACCTACTGGAAAACAAAACCATGATGG CTGCGTACTTAAAACGTTTCTCCTGGCGCGATTGAAAATCCATCTTTCCTATCCAACCGAGGGATCTGCGACTGCGGCCTTCTGCCGTTCGGCTCCTGATGGATCCATCTGCTGCTGGAATGGGT + AAAGGCTAAGTTACAGGTTACATAAAAAGGAAAATGTGCTTATAGATATAATGGTAAAATTAACTTAACTAAACACCTACTGGAAAACAAAACCATGATGGCTGGATGACTGCGAACTTAAATCG + 22051 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23432543/1 +#################################################################################################### +7 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 31349 31350 BP_range 31349 31357 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 6 5 1 1 0 0 +CACACCCTCACACTAGACGAAAACACAAGCAGATTGTTGGAAGAAAAACGGATACTAAGTAGAATTTTTAAAGCTACTAGAACGGACGAGGACAAAGCTAAACTAAAAGCAGCTGAAAATCGACT AAAAAAAGCGGTAAAGATCTTGAGAGAAAAGAGAATTAATAAACAAATTGAAGGAATAGACACGAAAAACCCGGACAGAATGAGGAAAATGTGGAGACTGCTAGATGAAGGAAAAAAGACAAACC + GACAAACCTAAACTAAAAGCAGCTGAAAATCGACTAAAAAAAAGCGGTAAAAATCTTGAGAGAAAAGAGAATTAATAAACAAATTGAAGGAGT + 31219 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26492474/1 +#################################################################################################### +8 I 80 NT 80 "GGTGTGTTCTTTGGCTCTACATTTATCGTTGAAATCCGTCTCCAACTGCCGCGAGTCACCCACGACTTCCACTCCCTGCA" ChrID X BP 35041 35042 BP_range 35041 35043 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 1 1 0 0 1 1 +GACTCCTCGCTTGGCCCCTGGCGATTCGCCCTGAAAGAAAGAAAGAAGCATGGATTAGTCAAATACCAAAGCACAACAAGCATGCACGAAATCTGCGCAACAAGGACTATTCCAAGGCAAGCGAT GACGGACGGAATGCACTACTATGTGTAAATTTTCCGGATCCAAGTGAACGCCAGGCGGAAGAGGATTCCCTGGATGTGAAGGATCACAAACTGCTGCTTCTTCAAGAGGTAACCGGCCTCATTTC + AAATCTTCGCAACAAGGACTATTCCAAGGCAAGCGATGGTGTGTTCTTTGGCTCTACATTTATCGTTGAAATCCGTCTCCAACTGCCGCGAGTCACCCACGACTTCCACTCCCTGCAGACGGACG - 35207 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14355603/2 +#################################################################################################### +9 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 35738 35739 BP_range 35738 35744 Supports 2 2 + 1 1 - 1 1 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 4 4 1 1 1 1 +ATGAATCGTCCTGGAAGAAAGAAGCATGGATTATTTCTTCATACACAGCTTGTCTACTAAAATGCATTTCCCGGCAAACTGGCACTGGGGCGTTGAAAATACGACACTACTCACCAAACAGCAGC AAAAACAACAGCATCGGCAGCAGGCGACCAGCAGCTGCTCTGGCTCACCCAATGCGACAGCAATATCTGCGGCATGGCCAGCAACATGCAGCAAGCAAAAGACCGGCATGGTGGTGAACAACATA + ACTACTCACCAAACAGCAGCAAAAAAAAACAGCATCGGCAGCAGGCGACCAGCAGCTGCTTTGGCTCACCCAATGCGACAGCAATATCTGCGGCGTGGCCAGCAACATGCAGCAAGCAAAAGACC + 35659 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9284460/1 + AGCTTGTCTACTAAAATGCATTTCCCGGCAAACTGGCACTGTGGCGTTGAAAATACGACACTACTCACCAAACAGCAGCAAAAAAAAACAGCATCGGCAGCAGGCGACCA - 35843 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9284460/2 +#################################################################################################### +10 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 43020 43021 BP_range 43020 43028 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 2 2 1 1 0 0 +CACACCCTCACACTAGACGAAAACACAAGCAGATTGTTGGAAGAAAAACGGATACTAAGTAGAATTTTTAAAGCTACTAGAACGGACGAGGACAAAGCTAAACTAAAAGCAGCTGAAAATCGACT AAAAAAAGCGGTAAAGATCTTGAGAGAAAAGAGAATTAATAAACAAATTGAAGGAATAGACACGAAAAACCCGGACAGAATGAGGAAAATGTGGAGACTGCTAGATGAAGGAAAAAAGACAAACC + GAGGACAAACCTAAACTAAAAGCAGCTGAAAATCGACTAAAAAAAAGCGGTAAAAATCTTGAGAGAAAAGAGAATTAATAAACAAATTGAAGGAGT + 42890 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45718882/2 +#################################################################################################### +11 I 19 NT 19 "AGACATTTTCGGTCTGGGC" ChrID X BP 44171 44172 BP_range 44171 44184 Supports 1 1 + 0 0 - 1 1 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 12 0 0 1 1 +CCCACACATATACCACCCCTCCCCAACAGAAAGAATTATGCTCTCAACATACGCAGACGACACTATAGTACTCAGCTCAGACATACTAGCAACTGCTGCCACAAGAAACAACGAAAACTACCTCA AGACATTTTCGGACTGGGCAGACAAATGGGGTATCTCAGTAAATGCTGCTAAAACAGGACATGTCATTTATACATTAAAAAACGACATACCTACAAATCTAAAGACCATGAAGATTAAGGGTCAA + CTGCTGCCACAAGAAACAACGAAAACTACCTCAAGACATTTTCGGTCTGGGCAGACAATTT - 44328 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6175226/2 +#################################################################################################### +12 I 9 NT 9 "AGCAAAGTA" ChrID X BP 55013 55014 BP_range 55013 55022 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 6 6 1 1 0 0 +TCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACC AGCAAAGTTAAAATCCATGCATCCTTCTTCCAAGACTGCAAAACAGAAAGAAGGAAACACAAGCTATACTGGGAAAAATATATTAAATCACAATACTTATCTAATTGCCAATTTGAAGAATCCTA + ATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAGCAAAGTTA + 54794 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28381653/1 +#################################################################################################### +13 I 60 NT 60 "CCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAA" ChrID X BP 57639 57640 BP_range 57639 57666 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 13 13 2 2 0 0 +CCAACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCT CCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATAATAAAGTTAATAAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAACTAAA + ATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAACCGTACCTCCACCAGCA + 57591 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44912383/1 + ATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAATACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAATAAAAACCGTACCTCCACCAGCA + 57591 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38117308/1 +#################################################################################################### +14 I 24 NT 24 "GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA" ChrID X BP 57641 57642 BP_range 57641 57690 Supports 3 3 + 0 0 - 3 3 S1 4 SUM_MS 108 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 13 0 0 3 3 +AACCCCCAAACTCACCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCC GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATAATAAAGTTAATAAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAACTAAATA + ACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAC - 57699 36 X_100000_Hum1.bam @HWI-27783478/2 + ACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAC - 57699 36 X_100000_Hum1.bam @HWI-13781192/1 + ACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAC - 57699 36 X_100000_Hum1.bam @HWI-2099308/2 +#################################################################################################### +15 I 1 NT 1 "C" ChrID X BP 57665 57666 BP_range 57665 57666 Supports 2 2 + 0 0 - 2 2 S1 3 SUM_MS 98 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 4 4 0 0 2 2 +TGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTACCTATATATTACAAACTCTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATAATAAAGTTAATAAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAACTAAATAATTAAATAACTAAAATTAATAATA + TCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATAATAAAGTTAATAAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAAT - 57853 49 X_100000_Hum1.bam @HWI-30327738/2 + TCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGTTAAAATAATAAAGTTAATAAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAAT - 57853 49 X_100000_Hum1.bam @HWI-21538020/1 +#################################################################################################### +16 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 61384 61385 BP_range 61384 61386 Supports 5 5 + 5 5 - 0 0 S1 6 SUM_MS 300 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 87 87 5 5 0 0 +AATATATCCAATAGAAAAGCGCACGTCGGTCTGCTTTTAAAATCCTTCACCGTCATCACCTTCCTCGACGGAGCCTAATTTATTGGAAAAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAAC ACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACAAAAAATATGAATAGATAGATCGATATGAAAAGGATAAGTGCGGCAGAAACATGAT + ATGTTGGCACAAAAATGTAAACAACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACAAAAAATATGAATAGATAGATCG + 61268 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-10124805/2 + AATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACAACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACAAAAAATATGAATAGATAGATCG + 61268 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-25047933/2 + AATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACAACACACTCACCTAAACGCACCCGGACGAACAAGCCTATGACAACGCACTCCAGCTGATCTGTAAGAAACAAAAAATATGAATAGATAGATCG + 61268 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-15345398/1 + GTCGGTCTGCTTTTAAAATCCTTCACCGTCATCACCTTCCTCGACGGAGCCTAATTTATTGGAAAAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACAACACACTCACCTAAACGCACCCG + 61161 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-31974573/1 + GTCGGTCTGCTTTTAAAATCCTTCACCGTCATCACCTTCCTCGACGGAGCCTAATTTATTGGAAAAATAAATCAATTATATGTTGGCACAAAAATGTAAACAACACACTCACCTAAACGCACCCG + 61161 60 X_100000_Hum1.bam @HWI-12539869/1 +#################################################################################################### +17 I 59 NT 59 "GCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAA" ChrID X BP 62885 62886 BP_range 62885 62886 Supports 4 4 + 4 4 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 42 42 4 4 0 0 +AACGCAATTAATAAATCAAATAAATACAAGTATAATACTTACCTCCAAGCAAACGTACCTGAAAAACAAAACCAAAAAAAAAAATTAATGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACT TACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAATACTTACCAAATTTTAATTTTGTATTCATTTCCATGACCCCAACGCT + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + 62849 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42119375/1 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + 62849 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18910856/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + 62849 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18358275/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + 62849 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14417818/2 +#################################################################################################### +18 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 64595 64596 BP_range 64595 64601 Supports 11 11 + 4 4 - 7 7 S1 40 SUM_MS 120 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 46 46 4 4 7 7 +AAGCCAATACTGGGAATTATTTAATTAAACAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACT AAAAATTAACGCAATCATAAAAACAAAAACAATCATAATACTCATCTCTACAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAATGCAATTAATAAATCAAATAAATACAA + ACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAA + 64329 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13691642/2 + CCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAA + 64329 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42317732/2 + CGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAA + 64329 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-17996011/2 + CGACTCCAAACCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAA + 64329 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16344600/2 + ATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAAACAAAAACAA - 64652 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-44263008/1 + ATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAAACAAAAACAA - 64653 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-39374863/2 + ATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAAACAAAAACAA - 64653 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-2017663/2 + ATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCATAAAAACAAAAACAA - 64653 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-1449632/1 + ATTTAATTAAACAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCA - 64730 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13078047/2 + ATTTAATTAAACAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCA - 64730 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4533477/2 + ATTTAATTAAACAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCACGGCACACCGGTCGCGATTAATTATAATTAATTACAAAAAGTACCTGAAAAACTAAAAAATTAACGCAATCA - 64730 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-3636742/2 +#################################################################################################### +19 I 35 NT 35 "AGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCT" ChrID X BP 65773 65774 BP_range 65773 65774 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 18 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 2 2 0 0 +TGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAA CCACCAGCAAAGTTAAAAAAATAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCCCTTGC + AAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTATAAAATTAA + 65637 9 X_100000_Hum1.bam @HWI-4874218/2 + AAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGATACGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTATAAAATTAA + 65637 9 X_100000_Hum1.bam @HWI-8891868/1 +#################################################################################################### +20 I 33 NT 33 "TAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGT" ChrID X BP 65794 65795 BP_range 65794 65798 Supports 3 3 + 0 0 - 3 3 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 4 3 0 0 3 3 +TTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAA TAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATATTTAATAAAATAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAAT + CAGCAAAGTTATAAAATTAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATAT - 66264 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16133224/1 + CAGCAAAGTTATAAAATTAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATAT - 66264 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13424625/1 + CAGCAAAGTTATAAAATTAAAAAAGTTAAACACCAGCAAAGTTAAAAAGTTAATAAATAAAATAAAATTAAATAATTTAAACAAATAATAACAAATAATAAATAAATAATAAATTAAATAAATAT - 66264 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-597984/1 +#################################################################################################### +21 I 4 NT 4 "AAAA" ChrID X BP 66000 66001 BP_range 66000 66007 Supports 3 3 + 0 0 - 3 3 S1 4 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 17 17 0 0 3 3 +AAATAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAAT AAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAGCAAAGTTA + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAA - 66279 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24777307/2 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG - 66279 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45677736/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG - 66279 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1340718/1 +#################################################################################################### +22 I 58 NT 58 "GTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTG" ChrID X BP 74314 74315 BP_range 74314 74322 Supports 4 4 + 3 3 - 1 1 S1 8 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 31 31 3 3 1 1 +GACCGAGTATGGCACGACGGCTTGCTATATAAACTATCCAGACTCATCCCCAGATACCTATTCGACCTACTTGAAAACTATTTATCTAATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAAC GTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAGTGCCCCAGGGCAGCATACTGGGACCGGTCCTCTACTCAATATACTCATCCGACATGCCCTATCCCATCGTAAAAGACTATATGCGTAACATATCCT + TAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAGTGCCCCAGGGCAGCAT - 74439 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-4285160/1 + AATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAG + 74092 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16706244/1 + AATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGGAG + 74092 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-6947013/2 + CTAATAGAACCTTCTCAGTAAGGATCGACGGTGAAACAACGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAATTATAATAATATAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTCTAGGATAGGTAATATTAGAGCAGG + 74274 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-7575195/2 +#################################################################################################### +23 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 77559 77560 BP_range 77559 77565 Supports 10 10 + 3 3 - 7 7 S1 32 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 19 19 3 3 7 7 +CCAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATAC AAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAAATTTAATATTACATCCATTCCCATGGCCCAATCGTTGCGGCGGTCCTCAGCAACAATTCCTGACCCGGAACATC + AAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACA + 77401 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37835687/1 + AGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTT - 77613 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37680776/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + 77419 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31263500/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAG - 77595 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28076462/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAAT - 77584 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20579317/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTAT - 77600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9137354/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAA + 77395 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3569690/1 + ACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGG - 77730 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2922639/2 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA - 77697 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18857718/2 + CCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGA - 77666 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-11566427/2 +#################################################################################################### +24 I 15 NT 15 "AAAATTTTTCAAATT" ChrID X BP 79592 79593 BP_range 79592 79593 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 23 23 1 1 0 0 +AAGTTAAAAAAAGTTAAAAAAAACAAAGTTAAAATAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTAAATTAAATAAAATAAATTAAACAAATAATTAAACTAAACTTATTTAACAACATAATCCGCGC TTCCACCTGCAAAATTTTTTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAAAACAATT + TAAATTAAATAAAACAAATTAAACAAATAATTAAACTAAATTTATTTAACAACATAATCCGCGCAAAATTTTTCAAATTTTCCACCTGC + 79501 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32017280/1 +#################################################################################################### +25 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 79987 79988 BP_range 79987 79991 Supports 4 4 + 4 4 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 20 20 4 4 0 0 +AATAAATTAAACTAATTAAATAAACTAGTAAATTGAACCTATTTAACAAAATAATTCGCGCTTCCACCTGCATAATTTTCTCACGCGCAAATTTAATTTTAAATCGCCTTTTCGTACGAGAAATT AAAGTTTAAAATTGTTTTCCGGACGCAAAGTTAAAACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGACAAACGAAAGGTGAACAATTAATTGTGTAATAATTGTGCGAATTGACAAGCTGCCGCCATAA + TGCATAATTTTCTCTCGCTCAAATTTAATTTTAAATCGCCTTTTCGTACGAGAAATTAAAAGTTTAAAATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGACAAA + 79930 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31405451/2 + ACCTGCATAATTTTCTCTCGCTCAAATTTAATTTTAAATCGCCTTTTCGTACGAGAAATTAAAAGTTTAAAATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGAC + 79900 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38946675/1 + ACCTGCATAATTTTCTCTCGCTCAAATTTAATTTTAAATCGCCTTTTCGTACGAGAAATTAAAAGTTTAAAATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGAC + 79900 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-38596247/2 + ACCTGCATAATTTTCTCTCGCTCAAATTTAATTTTAAATCGCCTTTTCGTACGAGAAATTAAAAGTTTAAAATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAACAATAAACATTTAGTGGAC + 79900 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18530029/1 +#################################################################################################### +26 I 12 NT 12 "GACATGGAAGAT" ChrID X BP 83404 83405 BP_range 83404 83407 Supports 6 6 + 4 4 - 2 2 S1 15 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 13 13 4 4 2 2 +ATTAATTAGACGGAAGGCATAAAAACACAAACACTACTCTCACCTCAACGTACCTGGATAATTAAGCACATGACAACGCCCACCAGCTGATCCTGACGAAGCGATACGAAGAAGAACAACACCAA GAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGCGGCAAAAGCAGGATGAGTATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACCTGAATTTTCTTGCCGCACTGTCTTCTGAAG + CACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACCTGAATTTTCTTG + 83310 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35688750/1 + CACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACCTGAATTTTCTTG + 83310 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12470768/2 + GAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACC - 83529 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23660629/1 + GAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATATGCACAACGTCACTTACC + 83404 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30671627/1 + TGACGAAGCGATACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCT + 82951 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2389423/1 + ATCCTGACGAAGCGATACGAAGAAGTACAACACCAAGACATGGAAGATGAATCGGAAGATCGATATAAATAAGATTAGTGGGGCAAAAGCATGATGAGCATAAGGCGACTCGCTGCAGCAATATA - 83529 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44011423/1 +#################################################################################################### +27 I 47 NT 47 "AAAGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGC" ChrID X BP 85921 85922 BP_range 85921 85925 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 51 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 0 0 1 1 0 0 +CGCAATGTACTCTCAAAAATTTAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTT AAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAATACCGCGACAATAAAAAACAATT + CCTCCACCAGCAAAGTTAAAGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAATTAACCAGCAAAGTTAAAAACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCATTTTGAC + 85872 51 X_100000_Hum1.bam @HWI-18346568/2 +#################################################################################################### +28 I 44 NT 44 "ACTAATGTAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAC" ChrID X BP 90866 90867 BP_range 90866 90870 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 7 8 2 2 0 0 +TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACCTGAAAAAATAAAATAAAAACAAATTAACGCATTCACAAAAACAAATAACTAATGTAAT ACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAGCTGCCAATCCTGACTCAATCGCCACAAGACGCGGCGCA + ATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCG + 90855 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37593252/2 + ATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCG + 90855 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-103189/2 +#################################################################################################### +29 I 1 NT 1 "T" ChrID X BP 94431 94432 BP_range 94431 94434 Supports 20 20 + 8 8 - 12 12 S1 117 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 17 17 8 8 12 12 +TATTTCAACAAAATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAA TTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAAC + AAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGT + 94305 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8452747/1 + TACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATC + 94413 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27853291/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCTTAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAA - 94513 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40914648/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAGCAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCC - 94488 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39998802/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGT - 94497 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-34538004/2 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCC - 94488 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27434584/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGT - 94497 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16862748/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGT + 94327 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15266293/1 + AAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAA - 94512 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9722032/2 + CAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTA + 94406 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13784344/2 + ACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATT - 94704 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12295663/2 + ATAAAGGGCCTCCTAATATATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAATCATAACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATAC - 94641 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13509398/2 + CGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAA + 94323 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20500475/2 + CAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACAAAAACAA - 94657 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24266208/2 + TAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAAACA - 94497 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15266293/2 + ATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAAA - 94501 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8667848/1 + TATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAA - 94456 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-20500475/1 + TATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAA + 94323 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-40640722/2 + TATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCATAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACCATAAA + 94323 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-22627520/2 + ATACTTATCTAATTGCCAATTCGACGACTCCAAATCCGCGGCACACCGGCGGCGATGGCCCGTAAATAAAGGGCCTCCTAATAAATTACAAAACGTACCTGAAAAACCAAAAATTTAACGCAACC + 94318 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26871085/2 +#################################################################################################### +30 I 4 NT 4 "AAAC" ChrID X BP 94588 94589 BP_range 94588 94592 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 22 22 1 1 0 0 +ACACTCACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACA AAAACAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTAAAAAACAAAAAATTTAATACAATCTTAAAAGCAAATAA + TCAAAGCTAATGTACCTGAAAAACTAAACAAAACAAAAATAATTA + 94339 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16455266/1 +#################################################################################################### +31 I 1 NT 1 "A" ChrID X BP 94593 94594 BP_range 94593 94602 Supports 6 6 + 3 3 - 3 3 S1 16 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 23 22 3 3 3 3 +CACCTTCAGATTAGCTTCCACCTAATGTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAAC AAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTAAAAAACAAAAAATTTAATACAATCTTAAAAGCAAATAACAAAT + AAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAACCAATGTACCTAAAAAACAAAAAATTTAATACAATCTTAAAAG - 94867 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-15976189/2 + AAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAACCAATGTACCTAAAAAACAAAAAATTTAATACAATCTTAAAAG - 94754 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-12772747/2 + CCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAACCAATGTACCTAAAAAACAAAAAAT + 94564 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45117575/2 + CCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAACCAATGTACCTAAAAAACAAAAAAT + 94564 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42539010/1 + CCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAATCAAATAAATACAAATATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAACCAATGTACCTAAAAAACAAAAAAT + 94564 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27918485/1 + GTACCTGAAATACAAAAACAATAATTAACGCAATTAATAAATCAATTAAATACAAGTATAACACTTACCTCCAAGCTAATGTACCTGAAAAACAAAAACAAAAAAAAATTAATTCAATAAATAAA - 94658 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21816194/1
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Tandem_Duplications.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,198 @@ +#################################################################################################### +0 TD 73649 NT 0 "" ChrID X BP 886 74536 BP_range 886 74536 Supports 12 12 + 12 12 - 0 0 S1 13 SUM_MS 347 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 31 1 12 12 0 0 +CGTAAAAGACTATATGCGTAACATATCCTTCCCTGATTACCACCCAACTAATATTATCTTAGCTACATATGCAGATGATACCATAATTCTTAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTtaaatcaaaactaccttaacgtcttctgtaggtggtcaaaaaaatgggacatagcaattaatgcaaaaaaaaccggacacattcttttctccctaaaaaaagaacaaactaatatatacactccc + AGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACC + + 74277 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-27065092/1 + CCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTTAAAAAAAGAACAA + + 74438 43 X_100000_Hum1.bam @HWI-14387472/2 + TACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTTAAAAAAAGAAC + + 74369 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-13158805/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-36846840/1 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-31272692/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-31241471/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-23526438/1 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74465 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1105161/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-799738/1 + TAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-45384311/1 + TAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-23069738/2 + ATCTTAGCTACATATGCAGACGATACCATTATTCTTAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGC + + 74465 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1105161/1 +#################################################################################################### +1 TD 504 NT 0 "" ChrID X BP 3407 3912 BP_range 3407 3912 Supports 4 4 + 4 4 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 11 4 4 0 0 +CAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAaaaaattacagaaatcacaaaaataaataacaaatgctatacttacctaattttaatattacacccattcccatggcccaatctttgggcggtccccagcaacaattcctgacccggaacattct + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3575 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18471672/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATT + + 3759 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25620164/1 + CTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3837 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35518358/1 + CTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3837 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27938133/1 +#################################################################################################### +2 TD 52474 NT 0 "" ChrID X BP 3444 55919 BP_range 3444 55919 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 13 6 2 2 0 0 +ACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTtatacttacctaattttaatattacacccattcccatggcccaatctttgggcggtccccagcaacaattcctgacccggaacattctaaaataataggaaaataaataagattgcgactcaaaa + AGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCAT + + 55888 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32680310/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATT + + 55877 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30087311/2 +#################################################################################################### +3 TD 51972 NT 0 "" ChrID X BP 3910 55883 BP_range 3910 55883 Supports 11 11 + 8 8 - 3 3 S1 36 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 11 8 8 3 3 +CAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAaaaaattagagaaatcacaaaaataaataacaaaggttatacttacctaaaatttaatattacatccattcccatggcccaatcgttgcggcggtcctcagcaacaattcctgacccggaacatc + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTAT + + 55800 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45814234/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACC + + 55756 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36765844/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAACCACAAAAATAAAT + + 55741 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35470691/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + + 55741 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29602246/2 + CCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + + 55785 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13515042/2 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATATAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA + + 55784 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37954302/1 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA + - 4010 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45525114/2 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + - 4048 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18344603/1 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + - 4048 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1724059/1 + CTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAA + + 55770 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2919186/1 + CCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGA + + 55769 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19871417/2 +#################################################################################################### +4 TD 60073 NT 0 "" ChrID X BP 5930 66004 BP_range 5930 66004 Supports 7 7 + 5 5 - 2 2 S1 18 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 16 5 5 2 2 +TAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAtaaaaaacaattaatcgacaaacgaaaagcgaacaattacacttgtgcaaaatcgacaagctgccgttataacaaaaaggagacgaataaccacaaagaactaaagttaaactaccagcaaagtt + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAA + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24777307/2 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45677736/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1340718/1 + TTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTG + - 6324 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16849452/2 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAA + + 65933 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31804145/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAA + + 65933 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30434545/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAATCGAC + - 6088 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43881794/1 +#################################################################################################### +5 TD 60074 NT 0 "" ChrID X BP 5930 66005 BP_range 5930 66005 Supports 5 5 + 2 2 - 3 3 S1 12 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 16 2 2 3 3 +AATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAtaaaaaacaattaatcgacaaacgaaaagcgaacaattacacttgtgcaaaatcgacaagctgccgttataacaaaaaggagacgaataaccacaaagaactaaagttaaactaccagcaaagtt + CAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAA + - 6113 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26602340/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTA + + 65969 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29441672/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAA + + 65969 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5700068/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAA + - 6148 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27434100/1 + TTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAA + - 6259 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28997954/2 +#################################################################################################### +6 TD 32724 NT 0 "" ChrID X BP 62849 95574 BP_range 62849 95574 Supports 13 13 + 4 4 - 9 9 S1 50 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 37 3 4 4 9 9 +TGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAgcaataaataaatcaaataaatacaaacataatacttacctccaatttacctcccagccaatgtacctgaaaaacataatctaatacaatctcaaaaacaaataacaaatgtaatacttaccaaa + AGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAATAC + + 95406 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43434438/2 + AGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAATAC + + 95406 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8805597/2 + AAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAAT + + 95334 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23275593/1 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42119375/1 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18910856/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18358275/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14417818/2 + CTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATC + - 62974 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28479484/2 + GGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATA + + 95480 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8706175/1 + TATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39391996/1 + TATAGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44227324/1 + TATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18610394/2 + ATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAA + - 62974 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8706175/2 +#################################################################################################### +7 TD 5985 NT 0 "" ChrID X BP 65295 71281 BP_range 65295 71281 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 24 15 2 2 0 0 +GGTAGAGACAACCACCAAATGACAGCGGCGCGGGATGCAGCCACCATCTTTGAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCaaaatcaacaaatactcacctgcaacgtctcctgaagcttcctgcgactcggtgcttccgtccttctggcgggggtacctgaaaagaaacaaattaagcaatgttagtcttaaatgtcaatgttt + CGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAATCAACAAACACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCT + + 71109 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36991539/1 + GAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCG + + 71156 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31795637/1 +#################################################################################################### +8 TD 6280 NT 0 "" ChrID X BP 84526 90807 BP_range 84526 90807 Supports 9 9 + 4 4 - 5 5 S1 30 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 16 10 4 4 5 5 +TAATACTCACCCCAGACTAGCTCCCTCCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAaactaatgtaatacttacctaattataactttacatttatttcatgcccgtatcgttgcggcggtccttggcaacaaatcccggtccggcggctccaagctgccaatcctgactcaatcgccaca + AAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGC + + 90855 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37520992/2 + CTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAG + + 90730 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9842854/1 + TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + + 90707 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/1 + TCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCC + - 84652 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9842854/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + + 90707 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3102178/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27052876/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21873573/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5331471/1 +#################################################################################################### +9 TD 20606 NT 0 "" ChrID X BP 96786 117393 BP_range 96786 117393 Supports 11 11 + 0 0 - 11 11 S1 12 SUM_MS 458 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 0 0 0 11 11 +ACCACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTATACCAACAAGTATCAAACTTTTATACATTAAGAATCAGCAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCCTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATgtcccacggatcagacaattctctgcttaataatatcattattaatcaaaagaaattgccctcaaagacaaataaaagttcaaaaaactcttctggcgctgccataaaaattgttaattcccttt + GACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGGTGCTGCCATAAAA + - 97015 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-27641226/1 + TTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGG + - 96889 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-28971924/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-40350610/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-37646907/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-25711382/2 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-20017185/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-4796567/2 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1069628/1 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-27876204/2 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-22209972/2 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-1569561/1 +#################################################################################################### +10 TD 55836 NT 2 "AA" ChrID X BP 9868 65705 BP_range 9868 65705 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 0 0 0 4 4 +TAAAATCTAAAAATCGAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAA agttgacgctaaaacctaaaaacaaacaacaacaaattaaatacaaacaaataaaataaaatcaaacaaaacacttacctcactgacaacagccaattactgatccacattcaacgcaacagaca + TGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATCAAAC + - 9993 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24932951/2 + AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT + - 9905 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46415327/1 + AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT + - 9905 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33395688/1 + CTATATATTACAAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAA + - 9993 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24932951/1 +#################################################################################################### +11 TD 63 NT 79 "TATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAAC" ChrID X BP 85861 85925 BP_range 85861 85925 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 0 1 1 0 0 +AATGTACTCTCAAAAATTTAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAA aaataaattgtggatgcggaacagaactcattctgtctccgtacctccaccagcaaagttaaaattaaccagcaaagttaaaaacgcgcaaatataatttaaatcgccttttcattttgacaaat + TCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAACAAATAAATAGT + + 85619 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18164980/2
--- /dev/null Thu Jan 01 00:00:00 1970 +0000 +++ b/test-data/X_100000_Hum1.bam_Tandom_Duplications.txt Wed Sep 29 21:30:31 2021 +0000 @@ -0,0 +1,198 @@ +#################################################################################################### +0 TD 73649 NT 0 "" ChrID X BP 886 74536 BP_range 886 74536 Supports 12 12 + 12 12 - 0 0 S1 13 SUM_MS 347 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 31 1 12 12 0 0 +CGTAAAAGACTATATGCGTAACATATCCTTCCCTGATTACCACCCAACTAATATTATCTTAGCTACATATGCAGATGATACCATAATTCTTAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTtaaatcaaaactaccttaacgtcttctgtaggtggtcaaaaaaatgggacatagcaattaatgcaaaaaaaaccggacacattcttttctccctaaaaaaagaacaaactaatatatacactccc + AGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACC + + 74277 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-27065092/1 + CCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTTAAAAAAAGAACAA + + 74438 43 X_100000_Hum1.bam @HWI-14387472/2 + TACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTTAAAAAAAGAAC + + 74369 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-13158805/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-36846840/1 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-31272692/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-31241471/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-23526438/1 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74465 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1105161/2 + CGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCTCCTT + + 74361 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-799738/1 + TAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-45384311/1 + TAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGCAATTAACGCAAAAAAAACCGGACACATTCTTTTCT + + 74316 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-23069738/2 + ATCTTAGCTACATATGCAGACGATACCATTATTCTTAGCCGGTCCAAATATACCAAGCTTGCGATCAACTTAAATCAAAATTACCTTGACGTCTTCTGTAGGTGGTCAAAAAAATGGGACATAGC + + 74465 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1105161/1 +#################################################################################################### +1 TD 504 NT 0 "" ChrID X BP 3407 3912 BP_range 3407 3912 Supports 4 4 + 4 4 - 0 0 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 12 11 4 4 0 0 +CAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAaaaaattacagaaatcacaaaaataaataacaaatgctatacttacctaattttaatattacacccattcccatggcccaatctttgggcggtccccagcaacaattcctgacccggaacattct + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3575 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18471672/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATT + + 3759 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-25620164/1 + CTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3837 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35518358/1 + CTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAAT + + 3837 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27938133/1 +#################################################################################################### +2 TD 52474 NT 0 "" ChrID X BP 3444 55919 BP_range 3444 55919 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 13 6 2 2 0 0 +ACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTtatacttacctaattttaatattacacccattcccatggcccaatctttgggcggtccccagcaacaattcctgacccggaacattctaaaataataggaaaataaataagattgcgactcaaaa + AGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCAT + + 55888 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-32680310/2 + ATACAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACCTAATTTTAATATTACATCCATT + + 55877 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30087311/2 +#################################################################################################### +3 TD 51972 NT 0 "" ChrID X BP 3910 55883 BP_range 3910 55883 Supports 11 11 + 8 8 - 3 3 S1 36 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 11 8 8 3 3 +CAGACTATTTTTCCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAaaaaattagagaaatcacaaaaataaataacaaaggttatacttacctaaaatttaatattacatccattcccatggcccaatcgttgcggcggtcctcagcaacaattcctgacccggaacatc + TATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTAT + + 55800 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45814234/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAATAACAAAGGTTATACTTACC + + 55756 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36765844/1 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAACCACAAAAATAAAT + + 55741 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-35470691/2 + CCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + + 55741 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29602246/2 + CCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAAT + + 55785 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-13515042/2 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATATAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA + + 55784 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37954302/1 + ACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAAATAAA + - 4010 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45525114/2 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + - 4048 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18344603/1 + AACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAAATCACAAAA + - 4048 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1724059/1 + CTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGAA + + 55770 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-2919186/1 + CCTCCCGAAAAACATACCTGGAAAACAAAAACAAGGCAACTATATAAACAAATAAATACATATATAATACTTACATCCAAACTACATTCCACCTAATGTATCTGAGAAATACAAAAAATTAGAGA + + 55769 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-19871417/2 +#################################################################################################### +4 TD 60073 NT 0 "" ChrID X BP 5930 66004 BP_range 5930 66004 Supports 7 7 + 5 5 - 2 2 S1 18 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 16 5 5 2 2 +TAATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAtaaaaaacaattaatcgacaaacgaaaagcgaacaattacacttgtgcaaaatcgacaagctgccgttataacaaaaaggagacgaataaccacaaagaactaaagttaaactaccagcaaagtt + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAA + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24777307/2 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-45677736/1 + CAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAACCACAAAGAACTAAAGTTAAACTACCAG + + 66000 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-1340718/1 + TTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTG + - 6324 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-16849452/2 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAA + + 65933 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31804145/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAA + + 65933 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-30434545/1 + CTTTTCGTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAACAATTAATCGAC + - 6088 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43881794/1 +#################################################################################################### +5 TD 60074 NT 0 "" ChrID X BP 5930 66005 BP_range 5930 66005 Supports 5 5 + 2 2 - 3 3 S1 12 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 18 16 2 2 3 3 +AATCCGCGCTTTCCCTTGCTAAATATTCTGACGCGCAAATATAATTTAAATCGCCTTTTCTTTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAtaaaaaacaattaatcgacaaacgaaaagcgaacaattacacttgtgcaaaatcgacaagctgccgttataacaaaaaggagacgaataaccacaaagaactaaagttaaactaccagcaaagtt + CAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAA + - 6113 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-26602340/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTA + + 65969 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-29441672/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAA + + 65969 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5700068/1 + CTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAATCGACAAACGAAAAGCGAACAATTACACTTGTGCAAAATCGACAAGCTGCCGTTATAACAAAAAGGAGACGAATAA + - 6148 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27434100/1 + TTTCATTTTGACAAATTAAAAGTTTAAATATTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTAAAACCGCGACAATAAAAAAAAAAACAATTAA + - 6259 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28997954/2 +#################################################################################################### +6 TD 32724 NT 0 "" ChrID X BP 62849 95574 BP_range 62849 95574 Supports 13 13 + 4 4 - 9 9 S1 50 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 37 3 4 4 9 9 +TGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAgcaataaataaatcaaataaatacaaacataatacttacctccaatttacctcccagccaatgtacctgaaaaacataatctaatacaatctcaaaaacaaataacaaatgtaatacttaccaaa + AGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAATAC + + 95406 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-43434438/2 + AGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAATAC + + 95406 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8805597/2 + AAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACAAATAACAAATGTAAT + + 95334 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-23275593/1 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-42119375/1 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18910856/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18358275/2 + CGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATCTCAAAAACA + - 62995 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-14417818/2 + CTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATAATCTAATACAATC + - 62974 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28479484/2 + GGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATACTTACCTCCAATTTACCTCCCAGCCAATGTACCTGAAAAACATA + + 95480 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8706175/1 + TATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-39391996/1 + TATAGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-44227324/1 + TATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAATAC + - 62884 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18610394/2 + ATATATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATCGTGGATGCGGAACAGAATTTACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGCAATAAATAAATCAAATAAATACAAACATAA + - 62974 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-8706175/2 +#################################################################################################### +7 TD 5985 NT 0 "" ChrID X BP 65295 71281 BP_range 65295 71281 Supports 2 2 + 2 2 - 0 0 S1 3 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 24 15 2 2 0 0 +GGTAGAGACAACCACCAAATGACAGCGGCGCGGGATGCAGCCACCATCTTTGAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCaaaatcaacaaatactcacctgcaacgtctcctgaagcttcctgcgactcggtgcttccgtccttctggcgggggtacctgaaaagaaacaaattaagcaatgttagtcttaaatgtcaatgttt + CGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAATCAACAAACACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCT + + 71109 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-36991539/1 + GAACTACCTGCAACGTTGGCCGGACATACATGTTGCAAGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCTTCCTGCGACTCG + + 71156 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-31795637/1 +#################################################################################################### +8 TD 6280 NT 0 "" ChrID X BP 84526 90807 BP_range 84526 90807 Supports 9 9 + 4 4 - 5 5 S1 30 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 16 10 4 4 5 5 +TAATACTCACCCCAGACTAGCTCCCTCCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCAaactaatgtaatacttacctaattataactttacatttatttcatgcccgtatcgttgcggcggtccttggcaacaaatcccggtccggcggctccaagctgccaatcctgactcaatcgccaca + AAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGC + + 90855 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-37520992/2 + CTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCGGCGGTCCTTGGCAACAAATCCCGGTCCGGCGGCTCCAAG + + 90730 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9842854/1 + TCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCCGTATCGTTGCG + + 90707 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/1 + TCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTATAACTTTACATTTATTTCATGCCC + - 84652 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-9842854/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + + 90707 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-28658481/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84600 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-3102178/2 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-27052876/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-21873573/1 + CCAAACGTACCTGAAAAACAAAATCAAAATTAAATCAAACATAAAAACAAATAAATAATAAAATAATACTTACCTCAAAACTACCTCTCACCAAATGCACACTAATGTAATACTTACCTAATTAT + - 84490 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-5331471/1 +#################################################################################################### +9 TD 20606 NT 0 "" ChrID X BP 96786 117393 BP_range 96786 117393 Supports 11 11 + 0 0 - 11 11 S1 12 SUM_MS 458 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 26 0 0 0 11 11 +ACCACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTATACCAACAAGTATCAAACTTTTATACATTAAGAATCAGCAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCCTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATgtcccacggatcagacaattctctgcttaataatatcattattaatcaaaagaaattgccctcaaagacaaataaaagttcaaaaaactcttctggcgctgccataaaaattgttaattcccttt + GACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGGTGCTGCCATAAAA + - 97015 24 X_100000_Hum1.bam @HWI-27641226/1 + TTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAAAAACTCTTCTGG + - 96889 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-28971924/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-40350610/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-37646907/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-25711382/2 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-20017185/1 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-4796567/2 + CCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCATTATTAATCAAAAGAAATTGCCCTCAAAGCCAAATAAAAGTTCAAA + - 96884 44 X_100000_Hum1.bam @HWI-1069628/1 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-27876204/2 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-22209972/2 + ATCAAACTTTTATACATTAAGAATCATTAAACACCATGTCCAACAACCTATTTACTGATTCTTCTTCTGACGACGAGGTACATTTATCGCCCACGGATCAGACAATTCTCTGCTTAATACTATCA + - 96839 42 X_100000_Hum1.bam @HWI-1569561/1 +#################################################################################################### +10 TD 55836 NT 2 "AA" ChrID X BP 9868 65705 BP_range 9868 65705 Supports 4 4 + 0 0 - 4 4 S1 5 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 11 0 0 0 4 4 +TAAAATCTAAAAATCGAAATTATTGTACCTATATATTACAAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAA agttgacgctaaaacctaaaaacaaacaacaacaaattaaatacaaacaaataaaataaaatcaaacaaaacacttacctcactgacaacagccaattactgatccacattcaacgcaacagaca + TGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAATTAAATACAAACAAATAAAATAAAATCAAAC + - 9993 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24932951/2 + AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT + - 9905 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-46415327/1 + AAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAACAACAACAAAT + - 9905 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-33395688/1 + CTATATATTACAAAAACTGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTGACGCTAAAACCTAAAAACAAA + - 9993 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-24932951/1 +#################################################################################################### +11 TD 63 NT 79 "TATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAAC" ChrID X BP 85861 85925 BP_range 85861 85925 Supports 1 1 + 1 1 - 0 0 S1 2 SUM_MS 0 1 NumSupSamples 1 1 X_100000_Hum1.bam 10 0 1 1 0 0 +AATGTACTCTCAAAAATTTAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTCATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAA aaataaattgtggatgcggaacagaactcattctgtctccgtacctccaccagcaaagttaaaattaaccagcaaagttaaaaacgcgcaaatataatttaaatcgccttttcattttgacaaat + TCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAAACCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAGCTTTGCTTGCCAAAAAACAAATAAATAGT + + 85619 0 X_100000_Hum1.bam @HWI-18164980/2