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view test-data/cid1_GMX.top @ 0:9faa4f4b8b76 draft default tip
"planemo upload for repository https://github.com/galaxycomputationalchemistry/galaxy-tools-compchem/tree/master/tools/buildtools/topologyeditors commit ae026d4ea6fe2ebaa53611b86f9047941c7b899b"
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H31 - C12 - H32 35 15 36 1 1.0975e+02 3.2803e+02 ; H35 - C15 - H36 35 15 37 1 1.0975e+02 3.2803e+02 ; H35 - C15 - H37 36 15 37 1 1.0975e+02 3.2803e+02 ; H36 - C15 - H37 38 16 39 1 1.0846e+02 3.2803e+02 ; H38 - C16 - H39 [ dihedrals ] ; propers ; for gromacs 4.5 or higher, using funct 9 ; i j k l func phase kd pn 1 2 7 5 9 180.00 15.16700 2 ; C1- C2- C7- C5 1 2 7 13 9 180.00 15.16700 2 ; C1- C2- C7- C13 1 4 17 5 9 180.00 20.08320 2 ; C1- C4- N17- C5 2 1 4 17 9 180.00 15.16700 2 ; C2- C1- C4- N17 2 1 4 26 9 180.00 15.16700 2 ; C2- C1- C4- H26 2 7 5 17 9 180.00 15.16700 2 ; C2- C7- C5- N17 2 7 5 27 9 180.00 15.16700 2 ; C2- C7- C5- H27 2 7 13 14 9 0.00 0.00000 0 ; C2- C7- C13- C14 2 7 13 20 9 0.00 0.00000 0 ; C2- C7- C13- N20 2 7 13 33 9 0.00 0.00000 0 ; C2- C7- C13- H33 3 8 6 18 9 180.00 16.73600 2 ; C3- C8- C6- N18 3 8 6 28 9 180.00 16.73600 2 ; C3- C8- C6- H28 3 9 10 19 9 180.00 12.02900 2 ; C3- C9- C10- N19 3 9 10 21 9 180.00 12.02900 2 ; C3- C9- C10- O21 3 9 18 6 9 180.00 7.11280 2 ; 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C11- C14- C16- N19 11 14 16 38 9 0.00 0.65084 3 ; C11- C14- C16- H38 11 14 16 39 9 0.00 0.65084 3 ; C11- C14- C16- H39 12 11 14 13 9 0.00 0.75312 3 ; C12- C11- C14- C13 12 11 14 13 9 180.00 0.83680 1 ; C12- C11- C14- C13 12 11 14 13 9 180.00 1.04600 2 ; C12- C11- C14- C13 12 11 14 16 9 0.00 0.75312 3 ; C12- C11- C14- C16 12 11 14 16 9 180.00 0.83680 1 ; C12- C11- C14- C16 12 11 14 16 9 180.00 1.04600 2 ; C12- C11- C14- C16 12 11 14 34 9 0.00 0.66944 3 ; C12- C11- C14- H34 12 20 13 14 9 0.00 0.65084 3 ; C12- N20- C13- C14 12 20 13 33 9 0.00 0.65084 3 ; C12- N20- C13- H33 12 20 15 35 9 0.00 0.65084 3 ; C12- N20- C15- H35 12 20 15 36 9 0.00 0.65084 3 ; C12- N20- C15- H36 12 20 15 37 9 0.00 0.65084 3 ; C12- N20- C15- H37 13 7 2 24 9 180.00 15.16700 2 ; C13- C7- C2- H24 13 7 5 17 9 180.00 15.16700 2 ; C13- C7- C5- N17 13 7 5 27 9 180.00 15.16700 2 ; C13- C7- C5- H27 13 14 11 29 9 0.00 0.66944 3 ; C13- C14- C11- H29 13 14 11 30 9 0.00 0.66944 3 ; C13- C14- C11- H30 13 14 16 19 9 0.00 0.65084 3 ; C13- C14- C16- N19 13 14 16 38 9 0.00 0.65084 3 ; C13- C14- C16- H38 13 14 16 39 9 0.00 0.65084 3 ; C13- C14- C16- H39 13 20 12 31 9 0.00 0.65084 3 ; C13- N20- C12- H31 13 20 12 32 9 0.00 0.65084 3 ; C13- N20- C12- H32 13 20 15 35 9 0.00 0.65084 3 ; C13- N20- C15- H35 13 20 15 36 9 0.00 0.65084 3 ; C13- N20- C15- H36 13 20 15 37 9 0.00 0.65084 3 ; C13- N20- C15- H37 14 11 12 20 9 0.00 0.65084 3 ; C14- C11- C12- N20 14 11 12 31 9 0.00 0.65084 3 ; C14- C11- C12- H31 14 11 12 32 9 0.00 0.65084 3 ; C14- C11- C12- H32 14 13 20 15 9 0.00 0.65084 3 ; C14- C13- N20- C15 14 13 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; C14- C13- N20- H42 14 16 19 41 9 0.00 0.00000 0 ; C14- C16- N19- H41 15 20 12 31 9 0.00 0.65084 3 ; C15- N20- C12- H31 15 20 12 32 9 0.00 0.65084 3 ; C15- N20- C12- H32 15 20 13 33 9 0.00 0.65084 3 ; C15- N20- C13- H33 16 14 11 29 9 0.00 0.66944 3 ; C16- C14- C11- H29 16 14 11 30 9 0.00 0.66944 3 ; C16- C14- C11- H30 16 14 13 20 9 0.00 0.65084 3 ; C16- C14- C13- N20 16 14 13 33 9 0.00 0.65084 3 ; C16- C14- C13- H33 16 19 10 21 9 180.00 10.46000 2 ; C16- N19- C10- O21 18 6 8 22 9 180.00 16.73600 2 ; N18- C6- C8- CL22 18 9 3 25 9 180.00 16.73600 2 ; N18- C9- C3- H25 18 9 10 19 9 180.00 12.02900 2 ; N18- C9- C10- N19 18 9 10 21 9 180.00 12.02900 2 ; N18- C9- C10- O21 19 16 14 34 9 0.00 0.65084 3 ; N19- C16- C14- H34 20 12 11 29 9 0.00 0.65084 3 ; N20- C12- C11- H29 20 12 11 30 9 0.00 0.65084 3 ; N20- C12- C11- H30 20 13 14 34 9 0.00 0.65084 3 ; N20- C13- C14- H34 21 10 19 41 9 0.00 8.36800 1 ; O21- C10- N19- H41 21 10 19 41 9 180.00 10.46000 2 ; O21- C10- N19- H41 22 8 3 25 9 180.00 16.73600 2 ; CL22- C8- C3- H25 22 8 6 28 9 180.00 16.73600 2 ; CL22- C8- C6- H28 23 1 2 7 9 180.00 15.16700 2 ; H23- C1- C2- C7 23 1 2 24 9 180.00 15.16700 2 ; H23- C1- C2- H24 23 1 4 17 9 180.00 15.16700 2 ; H23- C1- C4- N17 23 1 4 26 9 180.00 15.16700 2 ; H23- C1- C4- H26 28 6 18 40 9 180.00 7.11280 2 ; H28- C6- N18- H40 29 11 12 31 9 0.00 0.65084 3 ; H29- C11- C12- H31 29 11 12 32 9 0.00 0.65084 3 ; H29- C11- C12- H32 29 11 14 34 9 0.00 0.62760 3 ; H29- C11- C14- H34 30 11 12 31 9 0.00 0.65084 3 ; H30- C11- C12- H31 30 11 12 32 9 0.00 0.65084 3 ; H30- C11- C12- H32 30 11 14 34 9 0.00 0.62760 3 ; H30- C11- C14- H34 31 12 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H31- C12- N20- H42 32 12 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H32- C12- N20- H42 33 13 14 34 9 0.00 0.65084 3 ; H33- C13- C14- H34 33 13 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H33- C13- N20- H42 34 14 16 38 9 0.00 0.65084 3 ; H34- C14- C16- H38 34 14 16 39 9 0.00 0.65084 3 ; H34- C14- C16- H39 35 15 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H35- C15- N20- H42 36 15 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H36- C15- N20- H42 37 15 20 42 9 0.00 0.65084 3 ; H37- C15- N20- H42 38 16 19 41 9 0.00 0.00000 0 ; H38- C16- N19- H41 39 16 19 41 9 0.00 0.00000 0 ; H39- C16- N19- H41 [ dihedrals ] ; impropers ; treated as propers in GROMACS to use correct AMBER analytical function ; i j k l func phase kd pn 1 7 2 24 4 180.00 4.60240 2 ; C1- C7- C2- H24 1 26 4 17 4 180.00 4.60240 2 ; C1- H26- C4- N17 2 5 7 13 4 180.00 4.60240 2 ; C2- C5- C7- C13 3 6 8 22 4 180.00 4.60240 2 ; C3- C6- C8- CL22 6 9 18 40 4 180.00 4.60240 2 ; C6- C9- N18- H40 7 27 5 17 4 180.00 4.60240 2 ; C7- H27- C5- N17 8 9 3 25 4 180.00 4.60240 2 ; C8- C9- C3- H25 8 28 6 18 4 180.00 4.60240 2 ; C8- H28- C6- N18 9 19 10 21 4 180.00 43.93200 2 ; C9- N19- C10- O21 10 3 9 18 4 180.00 4.60240 2 ; C10- C3- C9- N18 10 16 19 41 4 180.00 4.60240 2 ; C10- C16- N19- H41 23 1 4 2 4 180.00 4.60240 2 ; H23- C1- C4- C2 [ system ] cid1 [ molecules ] ; Compound nmols cid1 1