view test-data/input83.fasta @ 5:34e40c872149 draft default tip

Correct requirement for blat version 35x1 .
author crs4
date Mon, 24 Feb 2014 06:27:47 -0500
parents c4ad58c4bc7d
children
line wrap: on
line source

>OR83b
TTTTTATAATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCGCATTGATTTCGC
AATTTATGGGCGATTTGATGGATTGCTTGAATAACTTTATATGCTTATTT
TTGAGTTTTTATTGTTTTACAACTTGCGGTATTTTATGTAGAGATCCTGT
GGACGACCTAATGGAAATCATTTGGTTTTGGCTGAAATGCGGCCATAAAG
GTGTGAATCAAAATAATGTTGCCTATACTTCGGGTATATCATTTCATATG
GAAAGCGCTTAATAATAATTATATAAATATATAATTTCTAGTTAATGTGA
CTTTATTAACCCATTAGTGCGTTTTAATCATTTAATTTGGCATCAGAATC
GATCACAGTCACGAACACAAAAGCGTAATGGTAAAAATAAAGGCTCATTT
GTTTAAGTTGTAAATTAAATAAAGCAAGTGTCACTTTCCATTTAAATGTT
GCCTAATAATTAATGACAAAAGGCTGCAGGGCTCACGATGTCCGCGGTTA
GCTAATTGATCCAAACGCATCCGCGTAATTAAACTTTCAGCCACAAGCCC
ATAAAATAAATCAAAAAGCGAAGGACCGAAAGGGGCAACATTTAGGGGGG
GGGGGCTTGTTTCGCATGGCTGAGTTCAGGACGATTAAACGTTAAATCAA
TATTGTTAAATCCCCGCTCGCATCCCCGCAATCCACACAGGCAAGTGTTC
ACGTATTAATTGATGTTCGTGAGTGTCCTGCATTTAAATAATCCATGATT
TGGGACATCTGTGTCTGAGTTCCCATTCATATATGTATGCATATGTGTAT
ATGAGTGGTGGAAACTAGCTGCAGATATAGCTACAGACACAGATACATTT
ACATTCCGGCACATAGTTTTAAGTGTGATTCAGTTATTCACAATAGTCGC
CGCTTTTTGTTCTTGCCACGTTTTAATATTGTCACAACTAGTTTCGAATA
ACTAAATTGGATGTTTTCGATTAGCATTCAATACACTGCTCAGCAATTTC
GTTTGCGTTGCAATTTGAGTACTAGATTTTGAATTAGACAATTGTTTTAT
TAATTGCCTACATGTATATTACCTAACTGATTTCGAAGGCCACTTGTACG
ACCTTGAGATAGAGTATTAATTATTTAAATTCTACTGTATTATAATTGCA
AAGAATTGTAAGTATTCATAATATATAATGGCAACCCAATTTAAGACTTC
TTTTGAAGGCCCCCGCCTACCGAAATTCAGTGCCTATGAGAACTGAGAAC
GAAAAAAATTGAGCAAGGACCAAATATCCATCAGGCTGAACACACACATT
TTCATGCAAATAGGCAATGTGTTATTTTTTTGGGTCAGCGATTCACGGAG
GGATCCCCACCAAATGGGTTGGCTGAGGAATGGCCTATCCCCATATCTCA
GCGGCACTTGGGGCAGGCCAACAAATACAAGCAGGCATAATAAAATAATC
GATGCTTTTAAAATTTGCATAAGTTTGGATACCGCAGATGCCGCGCAAGG
ATGAGCCCATCTCCAGTCCCAGTGCCATTCCGCCAGTGCGCATACGCCGC
GTGGAGGGCACAGGACTGGGCCATGGCCCATGGCCCAAAAGCGGAGTCCT
AGACCCGGAGACGACAGCAGTGGTGGACAAGTTCGTGGGCGTTCGATTTA
ATTGTGGGAATTCTGCGTCTGCCACGCACCCATCACATCGATGGACGTGG
CTGAAGAGCTGAATTTTTAAGCGCTCCAAGGCGGCCCGATACCCATATTG
TATATTTTCATTACCATGTGTGGGTCGGAGTGAAAGTCGCGGGCTAGGAT
TTAATGTGGCCTTGTTGCAGCCGTGGGAACTCGTCCTCAAAGTACACGTC
CTTATGTACAGCGGAGCAAGTACCTAGCCGACAGAAGGAGCAGGCACTTG
TCGACAGAGCTTTTTAACCTTCCGGATTTCACATTTCATTACCGTCGACA
TCGCGGTGCTGGCAGGTCAACTGTGTCCTGGTTCCGGAAAGCCTCATATC
TCGTATCTTAAAGTATCCCGGTTAAGCCTTAAAGAGTGAAATGATTGCCT
AGATGATTGCTGCATTACTGGCACTCAATTAACCCAAGTGTACCAGACAA
CAATTACATTTGTATTTTTAAAGTTCAATAGCAAGGTAATAGCACTGGGT
CTTTCAATATTACAATATTACCAATTAGAGAACCATATATCGTACACAAT
TGTTCCACATTCCGAATTTAATAACTCACGATCGATAGCCAAATTAATAT
TAATTTGAGAGGACATGAGTCCACCTGAATATTCAATATGCATTATACAT
TATCCCGCTATGAATAAAACATTCCAAATCGATTCATTTCGGGCAGGAAA
ATTCCTTTTCTACTCGGCAAGCAAACCAAGGACTAATCACAAATACGGAA
TATTGAACAGATTACGTTCATAATAGCTGATTGTGTTGGCGAAACCTATT
AATTTTGTCGTGCAATTTCCGCCGCTCAACAGGATGACAACCTCGATGCA
GCCGAGCAAGTACACGGGCCTGGTCGCCGACCTGATGCCCAACATCCGGG
CGATGAAGTACTCCGGCCTGTTCATGCACAACTTCACGGGCGGCAGTGCC
TTCATGAAGAAGGTGTACTCCTCCGTGCACCTGGTGTTCCTCCTCATGCA
GTTCACCTTCATCCTGGTCAACATGGCCCTGAACGCCGAGGAGGTCAACG
AGCTGTCGGGCAACACGATCACGACCCTCTTCTTCACCCACTGCATCACG
AAGTTTATCTACCTGGCTGTTAACCAGAAGAATTTCTACAGGTGAGCCTC
TGCTCACCGCACCGAGCTTACGAACACTTGGGGAATTTAAAATTTTATGT
TTTTCCGGCAGAACATTGAATATATGGAACCAGGTGAACACGCATCCCTT
GTTCGCCGAGTCGGATGCTCGTTACCATTCGATCGCACTGGCGAAGATGA
GGAAGCTGTTCTTTCTGGTGATGCTGACCACAGTCGCCTCGGCCACCGCC
TGGACCACGATCACCTTCTTTGGCGACAGCGTAAAAATGGTGGTGGACCA
TGAGACGAACTCCAGCATCCCGGTGGAGATACCCCGGCTGCCGATTAAGT
CCTTCTACCCGTGGAACGCCAGCCACGGCATGTTCTACATGATCAGCTTT
GCCTTTCAGATCTACTACGTGCTCTTCTCGATGATCCACTCCAATCTATG
CGACGTGATGTTCTGCTCTTGGCTGATATTCGCCTGCGAGCAGCTGCAGC
ACTTGAAGGGCATCATGAAGCCGCTGATGGAGCTGTCCGCCTCGCTGGAC
ACCTACAGGCCCAACTCGGCGGCCCTCTTCAGGTCCCTGTCGGCCAACTC
CAAGTCGGAGCTAATTCATAATGAAGGTGATTTGTTGAGTCTGAACCTAA
ACTTTTAGGCGGTTATTCAGTGAGCACTTCACTGAATAGGAAAATGCCAT
GACGAGCTGTTTTTCCATTGCAGAAAAGGATCCCGGCACCGACATGGACA
TGTCGGGCATCTACAGCTCGAAAGCGGATTGGGGCGCTCAGTTTCGAGCA
CCCTCGACACTGCAGTCCTTTGGCGGGAACGGGGGCGGAGGCAACGGGTT
GGTGAACGGCGCTAATCCCAACGGGCTGACCAAAAAGCAGGAGATGATGG
TGCGCAGTGCCATCAAGTACTGGGTCGAGCGGCACAAGCACGTGGTGCGG
TGAGTTCAAATCCTGGCCAAATTGGACCAGCCATTTCAAGGGGGCTTTGG
CCAGTGATGATTGGATTTTTGGCGATTTAAATGGCAGAGCAGTCCACTCA
TATTTCATGGACTTGGATTTTTGCCTTTAACAGAGCACCGAACATAATAA
ACACACACACTTTCCCCTCAGTTTTGTAAAACTTCAATAGGCGCCATCGG
AACATGTGTTCTCATTTATTAGGAGCTCAACAGATCCCTGCAGCTTGTTT
GACTTACTTGATTACTTCCTCAATTGCAATCATTGTTGGGGGCCCTAGAG
GAATGTCCTTGTTTGTCCTGTCCGACAGTTGGCGTGTGCAGTTGTTGATA
CCAATATTGACTTGATTCCTGCCTGCAATCCCTCATCCTTTCCCCCGTTG
CCTTTTCCCCACAGACTGGTGGCTGCCATCGGCGATACTTACGGAGCCGC
CCTCCTCCTCCACATGCTGACCTCGACCATCAAGCTGACCCTGCTGGCAT
ACCAGGCCACCAAAATCAACGGAGTGAATGTCTACGCCTTCACAGTCGTC
GGATACCTAGGATACGCGCTGGCCCAGGTGTTCCACTTTTGCATCTTTGG
CAATCGTCTGATTGAAGAGGTGAGTTTGTGCAGGGTTGCAAGATAAATTT
ATAAGTAAATCAGACATCAGTCTCAACTGATTAATAATCGAGAACATCCT
TATTTGAGTTATAGGGATATTTATAAAAAATTTTGAGACTTCATTAAAAC
TAAATGAATTGTAAGTTGAGAGTCAACAGATTGGTCCGTTCACTACAAGC
TAACCAGTGTGTTTTTTCCATGTGGTAGAAATAAAAGGGTGTTTTTGCGT
ATGAGATAAAATTGAACCAATGTTTTCAAGTTTATAGATTGGGAAACATA
CATAGTTCTAAACGTTGTTATAGTTATAGTTTGTGTAGTTAGTTATCTAG
AGCATCCTTAATACGACTTTCATTTCGCAGAGTTCATCCGTCATGGAGGC
CGCCTACTCGTGCCACTGGTACGATGGCTCCGAGGAGGCCAAGACCTTCG
TCCAGATCGTGTGCCAGCAGTGCCAGAAGGCGATGAGCATATCGGGAGCG
AAATTCTTCACCGTCTCCCTGGATTTGTTTGCTTCGGTTTGTTGCATTTG
ATTTATTGATCTATTGATGGAGTTAAAACTGAATCGGATATTCCCGATTC
GCAGGTTCTGGGTGCCGTCGTCACCTACTTTATGGTGCTGGTGCAGCTCA
AGTAAGTTGCTGCGAAGCTGATGGATTTTTGTACCAGAAAAGCGAATGCC
AAGAAGCCACCTACCGCCCCTTGCCCCCTCCGCACTGTGCAACCAGCAAT
ATCACAGAGCAATTATAACGCAAATTATATATTTTATACCTGCGACGAGC
GAGCCTCGTGGGGCATAATGGAGACATTCTGGGGCACATAGAAGCCTGCA
AATACTTATCGATTTTGTACACGCGTAGAGCTTTTAATGTAAACCCAAGA
TGCAAACTAAATAAATGTGTAGTG