view Roary/t/data/core_alignment_gene_lookup/expected_core_gene_alignment.aln @ 3:e95344f6dfc5 draft default tip

Uploaded
author dereeper
date Fri, 12 Nov 2021 16:32:26 +0000
parents c47a5f61bc9f
children
line wrap: on
line source

>query_1
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG
>query_2
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATNNNNNNNNNATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATNNNNNNNNNAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTTGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG
>query_3
ATGAATCTACCTTTACCTGATAATTATGAATTTGTGTTTTTATCTGGTGGATTATCTGGG
CATGCTGCAATGATGTCATTTTTTAATGTTTGTGGCATTGGATATTTGTATCATCATATG
GATTTAATGAAAAATAGATATATAGATTATTACCATTTTTCTAGGATTGAAAATTTATAT
TCAATTATAACATATGGACAATACAGTTTAACGCAAGGAATGAATAATATAGGTAAATAT
TTGACTTTAATTAATAAAATTCCAATTCTTTTTTTGGTAAGAGATCCCATATCAAGACTA
AAAACCGGAGTAAATCATCCTATTCTAAATCCAAAAAGTATGAAGGAGATATGTTTAAAC
AATGATTATAGTGATGTGTTTAAGAATAAAATGTATGTTGGCGATATTGGAAAAAATTTT
TACTATTCAGAAAAGCCAAGCATGAAATATTTACCTAGATTGAAATATGAAAATTTGGGA
ATATTTTTAAAACCACAAGAATTCGAGCGTTTAAAGCAAGATTCTAAGCTATTTGATGTT
GCTAAAAGATATTTGAATAATTTTATTGAAGCTTTAGAAGAGAGAATAGACCTAGAAAAA
GCTAAATTATTTAAAGAAAAAGACGTGTTAAACTATTTAAAAGAAAATAAAGAATTAAGA
GTTAAGTTAAAAAACATATTAGATAAAGAACTTGTTCATATTAAACAACATCGTCCAGAT
ATAGTAGCTTCTTGGAAATACTATCAAGAATTTGAACAAATGTGCAAGGAGTTGAATGGT
AATATTTAG