Mercurial > repos > estrain > seqsero_v1

comparison SeqSero/database/FliC_Family_k,z_special_genes.fasta @ 0:c577b57b7c74 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author estrain
date Wed, 06 Dec 2017 15:59:29 -0500
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:c577b57b7c74
1 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.42:k:e,n,x,z15_AY353436
2 GATAGCAAACCAGCGCAGAGCATTAAACTGGATACCAGTGCTCTTACTGCTACTGCAATTAAAAATGGTGTAACTGGTGCATCGACAGATGGTGCCCTAAAAGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGCACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGATACTGCTAAAGGTGGTTTCCTTAAAGTAGATGTTGATTCCGCTACTGGTGCAGTTACCGTTCCGGGTACGGCAGCAACAGCAGCTGCAACTAAACCTGCCGGTGTGAAAGAGGTTACAGAAGTACAAGGTAAAATCCCAGCATCTACTGCTATTCAAGACCAATTGAAAGCAGGCGGTGTGACTACTGCAGATGCAGCTACTGCTGAAGTT
3 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.61:k:1,5_AY353539
4 GATAGCAAACCAGCGCAGAGCATTAAACTGGATACCAGTGCTCTTACTGCTACTGCAATTAAAAATGGTGTAACTGGTGCATCGACAGATGGTGCCCTAAAAGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGCACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGATACTGCTAAAGGTGGTTTCCTTAAAGTAGATGTTGATTCCGCTACTGGTGCAGTTACCGTTCCGGGTACGGCAGCAACAGCAGCTGCAACTAAACCTGCCGGTGTGAAAGAGGTTACAGAAGTACAAGGTAAAATCCCAGCATCTACTGCTATTCAAGACCAATTGAAAGCAGGCGGTGTGACTACTGCAGATGCAGCTACTGCTGAA
5 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.50:k:z_AY353538
6 GATAGCAAACCAGCGCAGAGCATTAAACTGGATACCAGTGCTCTTACTGCTACTGCAATTAAAGATGGTGTAACTGGTGCATCGACAGATGGTGCCCTAAAAGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGCACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGATTCTGCTAAAAGTGGTTTCCTTAAAGTAGATGTTGATTCCGCTACTGGTGCAGTTACCGTTCCGGGTACGGCAGCAACAGCAGCTGCAACTAAACCTGCCGGTGTGAAAGAGGTTACAGAAGTACAAGGTAAAATCCCAGCATCTACTGCTATTCAAGACCAATTGAAAGCAGGCGGTGTGACTACTGCAGATGCAGCTACTGCTGAA
7 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.50:k:z53_AY353440
8 GATAGCAAACCAGCGCAGAGCATTAAACTGGATACCAGTGCTCTTACTGCTACTGCAATTAAAGATGGTGTAACTGGTGCATCGACAGATGGTGCCCTAAAAGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGCACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGATACTGCTAAAGGTGGTTTCCTTAAAGTAGATGTTGATTCCGCTACTGGTGCAGTTACCGTTCCGGGTACGGCAGCAACAGCAGCTGCAACTAAACCTGCCGGTGTGAAAGAGGTTACAGAAGTACAAGGTAAAATCCCAGCATCTACTGCTATTCAAGACCAATTGAAAGCAGGCGGTGTGACTACTGCAGATGCAGCTACTGCTGAA
9 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.17:k:z_AY353437
10 GATAGCAAACCAGCGCAGAGCATTAAACTGGATACCAGTGCTCTTACTGCTACTGCAATTAAAGATGGTGTAACTGGTGCATCGACAGATGGTGCCCTAAAAGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGCACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGATACTGCTAAAGGTGGTTTCCTTAAAGTAGATGTTGATTCCGCTACTGGTGCAGTTACCGTTCCGGGTACGGCAGCAACAGCAGCTGCAACTAAACCTGCCGGTGTGAAAGAGGTTACAGAAGTACAAGGTAAAATCCCAGCATCTACTGCTATTCAAGACCAATTGAAAGCAGGCGGTGTGACTACTGCAGATGCAGCTACTGCTGAAGTT
11 >fliC_(k)_Salmonella.enterica_IIIb.16:(k):e,n,x,z15_AY353541
12 GATAGCAAACCAACAAGTATGAAGTTGGATACTAGCGGTATAACAGCGGAGGCAATTAAAAACGGTGTAACTGGCGCAACGACAGATGGTGCACTTAAAGACGGCAAGATTTATTCCGATGGTACTAACTACTACGTAGAAGTTAGCTTTGCTGCTACCGCAGACACAAGTAAAGGCGGTTTTCTTAAAGTGGATGTTGATTCCTCTAATGGTAAAGTGTCTATTCCTACCACTGCTGCATCTGCTGTCGCGGCAAAACCAGCTGGAGTAAAAGAAGTTTCTGAAGTTCAAGGGAAAATTGCTGCATCAACAGATGTTAAAAATCAATTGACAGCAGGCGGTATTGATGCTGGTGTTGCCGCCAATGCAGAAATG
13 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.65:(k):z_AY353438
14 GATAGCAAACCAACAAGTATGAAGTTGGATACTAGCGGTATAACAGCGGAGGCAATTAAAAACGGTGTAACTGGCGCAACGACAGATGGTGCACTTAAAGACGGCAAGATTTATTCCGATGGTACTAACTACTACGTAGAAGTTAGCTTTGCTGCTACCGCAGACACAAGTAAAGGCGGTTTTCTTAAAGTGGATGTTGATTCCTCTAATGGTAAAGTGTCTATTCCTACCACTGCTGCATCTGCTGTCGCGGCAAAACCAGCTGGAGTAAAAGAAGTTTCTGAAGTTCAAGGGAAAATTGCTGCATCAACAGATGTTAAAAATCAATTGACAGCAGGCGGTATTGATGCTGGTGTTGCCGCCAATGCAGAAATG
15 >fliC_(k)_Salmonella.enterica_IIIb.42:(k):z35_AY353542
16 GATAGCAAACCAACAAGTATGAAGTTGGATACTAGCGGTATAACAGCGGAGGCAATTAAAAACGGTGTAACTGGCGCAACGACAGATGGTGCACTTAAAGACGGCAAGATTTATTCCGATGGTACTAACTACTACGTAGAAGTTAGCTTTGCTGCTACCGCAGACACAAGTAAAGGCGGTTTTCTTAAAGTGGATGTTGATTCCTCTAATGGTAAAGTGTCTATTCCTACCACTGCTGCATCTGCTGTCGCGGCAAAACCAGCTGGAGTAAAAGAAGTTTCTGAAGTTCAAGGGAAAATTGCTGCATCAACAGATGTTAAAAATCAATTGACAGCAGGCGGTATTGATGCTGGTGTTGCCGCCAATGCAGAAATGGTC
17 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.38:(k):z53_AY353540
18 GATAGCAAACCAACAAGTATGAAGTTGGATACTAGCGGTATAACAGCGGAGGCAATTAAAAACGGTGTAACTGGCGCAACGACAGATGGTGCACTTAAAGACGGCAAGATTTATTCCGATGGTACTAACTACTACGTAGAAGTTAGCTTTGCTGCTACCGCAGACACAAGTAAAGGCGGTTTTCTTAAAGTGGATGTTGATTCCTCTAATGGTAAAGTGTCTATTCCTACCACTGCTGCATCTGCTGTCGCGGCAAAACCAGCTGGAGTAAAAGAAGTTTCTGAAGTTCAAGGGAAAATTGCTGCATCAACAGATGTTAAAAATCAATTGACAGCAGGCGGTATTGATGCTGGTGTTGCCGCCAATGCAGAAATGGTC
19 >fliC_k_Salmonella.enterica_IIIb.38:(k):z35_AY353439
20 GATAGCAAACCAACAAGTATGAAGTTGGATACTAGCGGTATAACAGCGGAGGCAATTAAAAACGGTGTAACTGGCGCAACGACAGATGGTGCACTTAAAGACGGCAAGATTTATTCCGATGGTACTAACTACTACGTAGAAGTTAGCTTTGCTGCTACCGCAGACACAAGTAAAGGCGGTTTTCTTAAAGTGGATGTTGATTCCTCTAATGGTAAAGTGTCTATTCCTACCACTGCTGCATCTGCTGTCGCGGCAAAACCAGCTGGAGTAAAAGAAGTTTCTGAAGTTCAAGGGAAAATTGCTGCATCAACAGATGTTAAAAATCAATTGACAGCAGGCGGTATTGATGCTGGTGTTGCCGCCAATGCAGAAATGGTC
21 >fliC_z6_Salmonella.enterica_II.48:e,n,x,z15:z6_AY353519
22 GATAGCAAAGCTGTAACAGTAGCTGCTAATTTAGATATTACTGATCTTAATAAAGATGCGGCCCTTAAAGCAGGGACTGGTGCTACAACAGGTACTGCAGCAATAAAAGATGACAAAGTTTATTATGATAGTGCTAGCAAAAACTACTACGTTGAAGTTACCGGTCTGACTACCCCTGATGACGGTAAAAATGGCTTCTATAAAGTAAATGTCGCCGATGATGGTAAGGTATCTATGGCCGCTGGTACGGCTATGGAGGCGGGTAAACCAGCTGGTGCGGTAGAAGTAACAAAAACTCAGGAAGAGAAAAATCCATTACCGTTATCAGCAGATCTCAAGACTTCTCTTAAATCTGGCGGGGTTACAGATCCAGAAATTGCTGCTGCCCAAGTT
23 >fliC_z_Salmonella.enterica_II.16:z:z42_AY353469
24 GATAGCAAAGCTGTGACCGGTGTTTCTAATTTGGATACTACAGGTCTTACTGGCGCAGCTATTAAAACTGGCGTTGCTGGAGCTACCACTACGAGTGGTTCCATTAAAAATGACAAAGTATACTATGATGATGCTACTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGACTTTTCTGATGCCGCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGCACTGTTACAATGGGGGCCTCGACTGCTAAAGAAGCCGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGGCGTCTGCTGATGTGAAAGCTGCTCTGACTGCTGGTGGCGTTGATACTGCTGATGCAGCTACG
25 >fliC_k_Thompsonstr_AOXP01000022
26 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGACGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCGAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTGAAAATGTCT
27 >fliC_k_Thompsonstr_AMSN01000007
28 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGACGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCGAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTGAAAATGTCT
29 >fliC_k_Salmonella.enterica_Blockley_AY353442
30 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGACGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCGAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTG
31 >fliC_z_Indianastr_AOZC01000051
32 GATAGCAAAGCTGTGACTGGTGTTTCTACTTTGGATACTACAGGTCTTACTGGCGCGAATATTAAAACTGGCGTTGATGGAGCTACCACTACGAGTGGCTCCATTAAAGATGGCAAAGTATACTATGATGGTGCTACTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGACTTTTCTGATGCCGCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGCACTGTTACAATGGGGGCCTCGACTACTAAAGAACCTGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGGCGTCTGCTGAGGTGAAAGCTGCTTTGACTGCTGGTGGCGTCGATGCTGCTGATGCAGCTACGGCAGAAATGGTC
33 >fliC_z_Salmonella.enterica_Indiana_AY353468
34 GATAGCAAAGCTGTGACTGGTGTTTCTACTTTGGATACTACAGGTCTTACTGGCGCGAATATTAAAACTGGCGTTGATGGAGCTACCACTACGAGTGGCTCCATTAAAGATGGCAAAGTATACTATGATGGTGCTACTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGACTTTTCTGATGCCGCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGCACTGTTACAATGGGGGCCTCGACTACTAAAGAACCTGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGGCGTCTGCTGAGGTGAAAGCTGCTTTGACTGCTGGTGGCGTCGATGCTGCTGATGCAGCTACG
35 >fliC_z41_Salmonella.enterica_Maska_AY353511
36 GATAGCAAAGCTGTTACTGCAACTCTTGATCTGGATGTGACAGATCTTGATACTAATGCTTTGAAAACCGCAACTGGTATCAGTGCAGGTAATCCTGCTGTTAAAGACGATAAAGTTTATTATGACAGCGCAAATAATAATTATTATGTAGAGGTTGAGGGCTTTACTGATAATACGAAAGATGGTTTCTACAAAGTTCAGGTTGGTGATGATGGCAAAGTGTCAATGGCCACAACTACCAATAAAGAAACAGCTACTCCTCCCGGAATTGTTGAAGTAAGTAAAACTCATGATGAGAAAGCTCTTAAAGCTTCTGCAGAGGTTAAAGCAGCTCTGATGGCTGGAAATATTGATACTGCTGATGCAGATGCTGCTGAAATGGTCAAAATG
37 >fliC_z_Salmonella.enterica_II.40:z:z42_AY353470
38 GATAGCAAAGCTGTGACCGGTGTTTCTACTTTGGATACTGCAGGACTTACTGGCGCAGCTATTAAAACTGGCGTTGATGGAGCTACCACTACGAGTGGTTCCATTAAAGATGGCAAAGTATACTTTGATGATGCTACTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGAGTTTTCTGATGCCGCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGTACTGTTACAATGGGGGCTTCGACTACTAAAGAAGCCGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGGCGTCTGTTGATGTGAAAGCTGCTCTGACTGCTGGTGGCGTTGATACTGCTGATGCAGCTACGGCAGAAATG
39 >fliC_k_Invernessstr_AOZD01000019
40 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGACGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCGAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTGAAAATGTCT
41 >fliC_k_Salmonella.enterica_Inverness_AY353441
42 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGACTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGACGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCGAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTG
43 >fliC_z44_Salmonella.enterica_Quinhon_AY353513_k,z
44 GATAGCAAAGCTGTGACTGGTGTTTCTACTTTGGATACTACAGGTCTTACTGGCACGGATATTAAAACTGGCGTTGATGGAGCTACCACTACGAGTGACTCCATTAAAGATGGCAAAGTATACTATGATGGTGCTGCTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGACTTTTCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGCACTGTTACAATGGGGGCCTCGACTACTAAAGAACCTGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGACGTCTGCTGAGGTGAAAGCTGCTTTGACTGCTGGTGGTGTCGATACTGCTGATGTAGCTACGGCAGAAATG
45 >fliC_z_Salmonella.enterica_Poona_AY353467
46 GATAGCAAAGCTGTGACTGGTGTTTCTACTTTGGATACTACAGGTCTTACTGGCACGGATATTAAAACTGGCGTTGATGGAGCTACCACTACGAGTGGCTCCATTAAAGATGGCAAAGTATACTATGATGGTGCTACTAAAAATTATTATGTTGAAGTAGACTTTTCTGATGCCGCTGATACTGCTAAAAATGGCTACTATAAAGTCAATGTTGCTGATGATGGCACTGTTACAATGGGGGCCTCGACTACTAAAGAACCTGCGAAACCTGCAGGTGTTGTTGAAGTAACGAAAACCCAAGAAGAGAAAGCAATTAAGGCGTCTGCTGAGGTGAAAGCTGCTTTGACTGCTGGTGGTGTCGATGCTGCTGATGTAGCTACG
47 >fliC_z41_Salmonella.enterica_Ottawa_AY353510
48 GATAGCAAAGCTGTTACTGCAACTCTTGATCTGGATGTGACAGATCTTGATACTAATGCTTTGAAAACCGCAACTGGGATCAGTGCAGGTAATCCTGCTGTTAAAGACGATAAAGTTTATTATGACAGCGCAAATAATAATTATTATGTAGAGGTTGAGGGCTTTACTGATAATACGAAAGATGGTTTCTACAAAGTTCAGGTTGGTGATGATGGCAAAGTGTCAATGGCCACAACTACCAATAAAGAAACAGCTACTCCTCCCGGAATTGTTGAAGTAAGTAAAACTCATGATGAGAAAGCTCTTAAAGCTTCTGCAGAGGTTAAAGCAGCTCTGATTGCTGGAGATATTGATACTGCTGATGCAGATGCTGCTGAAATG
49 >fliC_z44_Salmonella.enterica_Bulovka_AY353512_k,z
50 CAAGCTACAGTTGAAAACAGTGTCAAACTGGATACTAGTGCTCTTACTGCCGATGCAATTAAAGGTGGCGTAACAGGTGCGACAACAGCTGGTGCCCTCAAGGACGGTAAAGTTTACTCTAATGGTACAGATTACTATGTAGAAGTAAGCTTTGCTGATGCGGCTGACTCAGGTAAAAATGGTTTCCTTAAAGTTGATGTTAATACAACTACTGGAGCGGTTACAGTTCCTGCAGCAGCAAATACTGTAGCAGCAAAACCAGCAGGTGTGTCTGAAGTTACTGAAGTTCAGGGACTAAATACACCAAGTTCGGCTGTACAAGATCAGTTAACAGCTGCAGGTGTAAGTGCCGCTGATGCTGCTAAATCTGAAGTTGTGAAA
51 >fliC_z69_Salmonella.enterica_Pietersburg_AY353520
52 GATAGTAAAGCTGTAACAGTAGCTGCTGATTTAGATATTACCGCTCTTAATACCGATGCAGCTCTTAAAGCAGGAACGGGAGCTACAACAGGTACTCCATCAATAAAAGATGACAAAGTTTATTATGATAGTGCCAGCAAAAACTACTACGTTGAAGTTACCGGATTAACCGCCCCTGATGATGCTAAGAATGGCTTCTATAAAGTAAATGTTGCTGATGACGGTACAGTATCCATGGCCGCTAATACAGCTATAGAGGCGGGTAAACCAGCCGGTGCAGTAGAAGTAACAAAAACTCAAGAAGAAAAAAACCCATTACCATTATCAGCAGATCTCAAAACTTCTCTTAAATCTGGCGAGATTACAGATCCAGACATT