Mercurial > repos > estrain > seqsero_v1

comparison SeqSero/database/FliC_f_g_s_whole.fasta @ 0:c577b57b7c74 draft

Find changesets by keywords (author, files, the commit message), revision number or hash, or revset expression.
Uploaded
author estrain
date Wed, 06 Dec 2017 15:59:29 -0500
parents
children
comparison
equal deleted inserted replaced
-1:000000000000 0:c577b57b7c74
1 >fliC_f,g,s_Salmonella.enterica_Agona_AY353383
2 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCAGGTGCTGTAGTAACTGATGATGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTGACAACTGACGATGCGGAGAACAACACTGCGGTTAACCTATTCAAGACGACTAAATCTACTGCTGGTACCGATGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
3 >fliC_g,m_Salmonella.enterica_Enteritidis_AY353388
4 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTGATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTGCCACTGGCGCGACGGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
5 >fliC_f,g_Salmonella.enterica_Derby_AY353381
6 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAGGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCTACAGTGGGTGATCTGAAGTCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGTAGCACCGAATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGACCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
7 >fliC_g,z62_Salmonella.enterica_II.50:g,z62:e,n,x_AY353416
8 ATGGCACAAGTCATTAACACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAATAGTGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCACAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGTTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTGCTGCTGGTACCGCTGACGCCAAAGCGATAGCTAATGTCATTAAGGGTGGTAAAGAGGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTATCTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGATGGTAATGGTACGGTTTCTACTACTATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGGTAGTGTTAATGATGCTACCTTACAATCAAGCAGAAATGTTTATACATCTGCAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAATAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
9 >fliC_g,z51_Salmonella.enterica_Travis_AY353413
10 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCCCAGTCCGCTCTGGGCACCGCTATCGAGCGTCTCTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGTTTCACGTCTAACATTAAAGGTCTGACGCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAACGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAATGGTACTAACTCTGATTCCGATTTGAAATCCATTCAGGATGAAATCCAGCAGCGCTTATCGGAAATCGACCGTGTTTCTAACCAGACTCAGTTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGATAATCAGATGAAAATTCAGGTGGGCGCTAACGATGGCGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGTCTGGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGATACGTATACTGCTGGTGCTAATACTTATCGCGTAGATATTAATTCTGGAGCAGTAACTGATGATGCTGGTACCGATAAGATTTACGTAAATGCAGCAAACGGTCAGCTCACAACTGATGATGCACAGAATAACACTGCAGTTGATCTATTTAAGACAGCAAAATCATCAGCAGGTACAGCTGAATCTAAAGCAATAGCTGGCGCTATTAAAGGTGGTAAAGAAGGAGATACTTTTGATTATAAAGGTGTTTCTTTCACCATTGATACAAAGAATGGCGCTGACGGTAATGGTACTGTTTCCACTATGATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTGACTGTTGCTGATATTACCACTGGTGCGGCGGACGTTAATGCGGCTACCTTACAATCAAGTAAAAATGTTTATACATCTGTAGTAAACGGCCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTAGAAGCAAATAATGCTGTTAAAGGTGAAAGTAAAATCACGGTAAACGGCGCTGAGTATACAGCTAACGCTGAAGGTGATAAAGTTACCTTAGCAGGTAAAACCATGTTTATTGATAAGACCGCTTCTGGCGTTAGCACATTAATCAATGAAGATGCTGCTGCTGCTAAGAAGAGTACAGCTAATCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGATGCTGTACGTTCTTCACTGGGGGCGATCCAGAATCGCTTTGATTCTGCCATCACTAACCTGGGCAACACGGTAAATAACCTGTCTTCTGCACGTAGCCGTATCGAAGATTCCGACTATGCGACCGAAGTTTCCAACATGTCTCGCGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAGCGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
11 >fliC_f,g,t_Salmonella.enterica_II.17:f,g,t:e,n,x,z15_AY353534
12 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGCCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCCATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGTTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCAACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTGGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTAATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGCTGGTGCGGCAGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGTGAAAGTAAGATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
13 >fliC_m,t_Salmonella.enterica_Oranienburg_AY353411_g,m
14 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGGTATGATACCTATGCTGTTGGTGCCAATAAATATCGCGTGGATGTCAACTCAGGGGCGGTAGTAACTGACACCACTGCTCCAACTGTTCCTGATAAAGTATACGTAAACGCTGCAAACGGTCAGTTGACAACTGCCGATGCGCAAAATAACACCGCGGTTGATTTGTTTAAATCTACTAAATCTGCTGCAGGTACTGACGATGCCAAGGCTATCGCAACTTCTATCAAAGGCGGAAAAGTTGGTGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTGATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACATTAACAATTAGTGATATTGGCGCGAGTGCAACAGACGTAAATAGCGCGAAGATTCAATCAAGTAAAGATGTTTATACTTCCGTTGTAAGCGGTCAGTTTACTTTTGCTGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGGTCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCCAAAGCGCAGATCCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
15