view SeqSero/database/FliC_f_g_s_whole.fasta @ 4:ab0802d77891 draft default tip

Uploaded
author estrain
date Thu, 12 Sep 2019 06:46:00 -0400
parents c577b57b7c74
children
line wrap: on
line source

>fliC_f,g,s_Salmonella.enterica_Agona_AY353383
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCAGGTGCTGTAGTAACTGATGATGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTGACAACTGACGATGCGGAGAACAACACTGCGGTTAACCTATTCAAGACGACTAAATCTACTGCTGGTACCGATGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_g,m_Salmonella.enterica_Enteritidis_AY353388
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTGATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTGCCACTGGCGCGACGGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_f,g_Salmonella.enterica_Derby_AY353381
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAGGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCTACAGTGGGTGATCTGAAGTCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGTAGCACCGAATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGACCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_g,z62_Salmonella.enterica_II.50:g,z62:e,n,x_AY353416
ATGGCACAAGTCATTAACACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAATAGTGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCACAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGTTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTGCTGCTGGTACCGCTGACGCCAAAGCGATAGCTAATGTCATTAAGGGTGGTAAAGAGGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTATCTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGATGGTAATGGTACGGTTTCTACTACTATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGGTAGTGTTAATGATGCTACCTTACAATCAAGCAGAAATGTTTATACATCTGCAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAATAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_g,z51_Salmonella.enterica_Travis_AY353413
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCCCAGTCCGCTCTGGGCACCGCTATCGAGCGTCTCTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGTTTCACGTCTAACATTAAAGGTCTGACGCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAACGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAATGGTACTAACTCTGATTCCGATTTGAAATCCATTCAGGATGAAATCCAGCAGCGCTTATCGGAAATCGACCGTGTTTCTAACCAGACTCAGTTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGATAATCAGATGAAAATTCAGGTGGGCGCTAACGATGGCGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGTCTGGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGATACGTATACTGCTGGTGCTAATACTTATCGCGTAGATATTAATTCTGGAGCAGTAACTGATGATGCTGGTACCGATAAGATTTACGTAAATGCAGCAAACGGTCAGCTCACAACTGATGATGCACAGAATAACACTGCAGTTGATCTATTTAAGACAGCAAAATCATCAGCAGGTACAGCTGAATCTAAAGCAATAGCTGGCGCTATTAAAGGTGGTAAAGAAGGAGATACTTTTGATTATAAAGGTGTTTCTTTCACCATTGATACAAAGAATGGCGCTGACGGTAATGGTACTGTTTCCACTATGATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTGACTGTTGCTGATATTACCACTGGTGCGGCGGACGTTAATGCGGCTACCTTACAATCAAGTAAAAATGTTTATACATCTGTAGTAAACGGCCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTAGAAGCAAATAATGCTGTTAAAGGTGAAAGTAAAATCACGGTAAACGGCGCTGAGTATACAGCTAACGCTGAAGGTGATAAAGTTACCTTAGCAGGTAAAACCATGTTTATTGATAAGACCGCTTCTGGCGTTAGCACATTAATCAATGAAGATGCTGCTGCTGCTAAGAAGAGTACAGCTAATCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGATGCTGTACGTTCTTCACTGGGGGCGATCCAGAATCGCTTTGATTCTGCCATCACTAACCTGGGCAACACGGTAAATAACCTGTCTTCTGCACGTAGCCGTATCGAAGATTCCGACTATGCGACCGAAGTTTCCAACATGTCTCGCGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAGCGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_f,g,t_Salmonella.enterica_II.17:f,g,t:e,n,x,z15_AY353534
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGCCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCCATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGTTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCAACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTGGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTAATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGCTGGTGCGGCAGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGTGAAAGTAAGATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA
>fliC_m,t_Salmonella.enterica_Oranienburg_AY353411_g,m
ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGGTATGATACCTATGCTGTTGGTGCCAATAAATATCGCGTGGATGTCAACTCAGGGGCGGTAGTAACTGACACCACTGCTCCAACTGTTCCTGATAAAGTATACGTAAACGCTGCAAACGGTCAGTTGACAACTGCCGATGCGCAAAATAACACCGCGGTTGATTTGTTTAAATCTACTAAATCTGCTGCAGGTACTGACGATGCCAAGGCTATCGCAACTTCTATCAAAGGCGGAAAAGTTGGTGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTGATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACATTAACAATTAGTGATATTGGCGCGAGTGCAACAGACGTAAATAGCGCGAAGATTCAATCAAGTAAAGATGTTTATACTTCCGTTGTAAGCGGTCAGTTTACTTTTGCTGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGGTCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCCAAAGCGCAGATCCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA