Mercurial > repos > estrain > seqsero_v1
view SeqSero/database/FliC_f_g_s_whole.fasta @ 4:ab0802d77891 draft default tip
Uploaded
author | estrain |
---|---|
date | Thu, 12 Sep 2019 06:46:00 -0400 |
parents | c577b57b7c74 |
children |
line wrap: on
line source
>fliC_f,g,s_Salmonella.enterica_Agona_AY353383 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCAGGTGCTGTAGTAACTGATGATGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTGACAACTGACGATGCGGAGAACAACACTGCGGTTAACCTATTCAAGACGACTAAATCTACTGCTGGTACCGATGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_g,m_Salmonella.enterica_Enteritidis_AY353388 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTGATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTGCCACTGGCGCGACGGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_f,g_Salmonella.enterica_Derby_AY353381 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAGGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCTACAGTGGGTGATCTGAAGTCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGTAGCACCGAATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGACCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAGGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTGACTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGACGGTAATGGTAAGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGCGGCGAATGTTGATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAAGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAACGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGGTCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_g,z62_Salmonella.enterica_II.50:g,z62:e,n,x_AY353416 ATGGCACAAGTCATTAACACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAATAGTGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGTGCGCTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCACAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGTTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTGCTGCTGGTACCGCTGACGCCAAAGCGATAGCTAATGTCATTAAGGGTGGTAAAGAGGGAGATACCTTTGATTATAAAGGCGTATCTTTTACTATTGATACAAAAACTGGTAATGATGGTAATGGTACGGTTTCTACTACTATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGGTGGTGGTAGTGTTAATGATGCTACCTTACAATCAAGCAGAAATGTTTATACATCTGCAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAATAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_g,z51_Salmonella.enterica_Travis_AY353413 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCCCAGTCCGCTCTGGGCACCGCTATCGAGCGTCTCTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGTTTCACGTCTAACATTAAAGGTCTGACGCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAACGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAATGGTACTAACTCTGATTCCGATTTGAAATCCATTCAGGATGAAATCCAGCAGCGCTTATCGGAAATCGACCGTGTTTCTAACCAGACTCAGTTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGATAATCAGATGAAAATTCAGGTGGGCGCTAACGATGGCGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGTCTGGATGGATTCAATGTTAACGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGATACGTATACTGCTGGTGCTAATACTTATCGCGTAGATATTAATTCTGGAGCAGTAACTGATGATGCTGGTACCGATAAGATTTACGTAAATGCAGCAAACGGTCAGCTCACAACTGATGATGCACAGAATAACACTGCAGTTGATCTATTTAAGACAGCAAAATCATCAGCAGGTACAGCTGAATCTAAAGCAATAGCTGGCGCTATTAAAGGTGGTAAAGAAGGAGATACTTTTGATTATAAAGGTGTTTCTTTCACCATTGATACAAAGAATGGCGCTGACGGTAATGGTACTGTTTCCACTATGATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTGACTGTTGCTGATATTACCACTGGTGCGGCGGACGTTAATGCGGCTACCTTACAATCAAGTAAAAATGTTTATACATCTGTAGTAAACGGCCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTAGAAGCAAATAATGCTGTTAAAGGTGAAAGTAAAATCACGGTAAACGGCGCTGAGTATACAGCTAACGCTGAAGGTGATAAAGTTACCTTAGCAGGTAAAACCATGTTTATTGATAAGACCGCTTCTGGCGTTAGCACATTAATCAATGAAGATGCTGCTGCTGCTAAGAAGAGTACAGCTAATCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGATGCTGTACGTTCTTCACTGGGGGCGATCCAGAATCGCTTTGATTCTGCCATCACTAACCTGGGCAACACGGTAAATAACCTGTCTTCTGCACGTAGCCGTATCGAAGATTCCGACTATGCGACCGAAGTTTCCAACATGTCTCGCGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAGCGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_f,g,t_Salmonella.enterica_II.17:f,g,t:e,n,x,z15_AY353534 ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAATAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATCGAGCGTCTGTCCTCTGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGTCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGCCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGTATCTCCATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGTTGAATGAAATTAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCAACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAGTTCAACGGCGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTGGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGTTACGACACCTATGCAGCGGGTGCCGATAAATATCGTGTAGATATTAATTCCGGTGCTGTAGTGACTGATGCAGCAGCACCGGATAAAGTATATGTAAATGCAGCAAACGGTCAGTTAACAACTGACGATGCGGAAAATAACACTGCGGTTGATCTCTTTAAGACCACTAAATCTACTGCTGGTACCGCTGAAGCCAAAGCGATAGCTGGTGCCATTAAAGGTGGTAAGGAAGGAGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTAATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACGTTAACTGTCGCTGATATTACCGCTGGTGCGGCAGATGTTAATGCTGCTACCTTACAATCAAGCAAAAATGTTTATACATCTGTAGTGAACGGTCAGTTTACTTTTGATGATAAAACCAAAAATGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGTGAAAGTAAGATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCACGGGTGATAAGATCACCTTAGCAGGCAAAACCATGTTTATTGACAAAACAGCTTCTGGCGTTAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCTGCTAAGAAAAGTACCGCTAATCCACTGGCTGCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCGCTGGGGGCAATTCAGAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCTAAAGCGCAGATTCTGCAGCAGGCCGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCTAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA >fliC_m,t_Salmonella.enterica_Oranienburg_AY353411_g,m ATGGCACAAGTCATTAATACAAACAGCCTGTCGCTGTTGACCCAGAATAACCTGAACAAATCTCAGTCCTCACTGAGTTCCGCTATTGAGCGTCTGTCTTCCGGTCTGCGTATCAACAGCGCGAAAGACGATGCGGCAGGCCAGGCGATTGCTAACCGCTTCACTTCTAATATCAAAGGTCTGACTCAGGCTTCCCGTAACGCTAACGACGGCATTTCTATTGCGCAGACCACTGAAGGCGCGCTGAATGAAATCAACAACAACCTGCAGCGTGTGCGTGAGTTGTCTGTTCAGGCCACTAACGGGACTAACTCTGATTCCGATCTGAAATCTATCCAGGATGAAATTCAGCAACGTCTGGAAGAAATCGATCGCGTTTCTAATCAGACTCAATTTAACGGTGTTAAAGTCCTGTCTCAGGACAACCAGATGAAAATCCAGGTTGGTGCTAACGATGGTGAAACCATTACCATCGATCTGCAAAAAATTGATGTGAAAAGCCTTGGCCTTGATGGGTTCAATGTTAATGGGCCAAAAGAAGCGACAGTGGGTGATCTGAAATCCAGCTTCAAGAATGTTACGGGGTATGATACCTATGCTGTTGGTGCCAATAAATATCGCGTGGATGTCAACTCAGGGGCGGTAGTAACTGACACCACTGCTCCAACTGTTCCTGATAAAGTATACGTAAACGCTGCAAACGGTCAGTTGACAACTGCCGATGCGCAAAATAACACCGCGGTTGATTTGTTTAAATCTACTAAATCTGCTGCAGGTACTGACGATGCCAAGGCTATCGCAACTTCTATCAAAGGCGGAAAAGTTGGTGATACCTTTGATTATAAAGGTGTGTCTTTTACTATTGATACAAAAGCTGGTGATGACGGTAATGGTACGGTTTCTACTACCATCAATGGTGAAAAAGTTACATTAACAATTAGTGATATTGGCGCGAGTGCAACAGACGTAAATAGCGCGAAGATTCAATCAAGTAAAGATGTTTATACTTCCGTTGTAAGCGGTCAGTTTACTTTTGCTGATAAAACCAAAAACGAGAGTGCGAAACTTTCTGATTTGGAAGCAAACAATGCTGTTAAGGGCGAAAGTAAAATTACAGTAAATGGGGCTGAATATACTGCTAACGCCGCGGGTGATAAGGTCACCTTAGCTGGCAAAACCATGTTTATTGATAAAACAGCTTCTGGCGTAAGTACATTAATCAATGAAGACGCTGCCGCAGCCAAGAAAAGTACCGCTAACCCACTGGCTTCAATTGATTCTGCATTGTCAAAAGTGGACGCAGTTCGTTCTTCTCTGGGGGCAATTCAAAACCGTTTTGATTCAGCCATTACCAACCTTGGCAATACGGTAACCAATCTGAACTCCGCGCGTAGCCGTATCGAAGATGCTGACTATGCAACGGAAGTTTCTAATATGTCCAAAGCGCAGATCCTGCAGCAGGCTGGTACTTCCGTTCTGGCGCAGGCGAACCAGGTTCCGCAAAACGTCCTCTCTTTACTGCGTTAA