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     # load proBAMr from GitHub
-    download.file("https://github.com/chambm/proBAMr/archive/master.zip", "proBAMr.zip", quiet=TRUE)
+    download.file("https://github.com/chambm/proBAMr/archive/a03edf68f51215be40717c5374f39ce67bd2e68b.zip", "proBAMr.zip", quiet=TRUE)
     unzip("proBAMr.zip")
-    devtools::load_all("proBAMr-master")
+    devtools::load_all("proBAMr-a03edf68f51215be40717c5374f39ce67bd2e68b")
     
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+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4180	16	chr9	67031069	255	30M353N3M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4339	16	chr9	67031069	255	30M353N3M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4209	16	chr4	43518270	255	30M102N3M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4209	0	chr8	72147117	255	3M78N30M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4404	16	chr4	43518270	255	30M102N3M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:3.021148e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4404	0	chr3	90089857	255	3M150N30M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:3.021148e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4404	16	chr9	67031069	255	30M353N3M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:3.021148e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.4404	0	chr8	72147117	255	3M78N30M	*	0	0	TCTTTCAGCAAACTCTGCTCGGGTCTCAGCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EAETRAEFAER	XR:Z:EAETRAEFAER	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:3.021148e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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-Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.6182	16	chr9	67031476	255	27M	*	0	0	CTGGGCATCTTTGAGAGCCTCGGAGTA	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EDKYEEEIK	XR:Z:EDKYEEEIK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:2.923977e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(3, 9), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
-Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.6182	0	chr8	72147069	255	27M	*	0	0	GAGGATAAATATGAAGAAGAAATCAAG	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EDKYEEEIK	XR:Z:EDKYEEEIK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:2.923977e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(3, 9), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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+Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.6182	0	chr8	72147069	255	27M	*	0	0	TTTGATCTCTTCTTCGTATTTGTCCTC	*	XA:Z:0	NH:i:4	XL:i:1	XP:Z:EDKYEEEIK	XR:Z:EDKYEEEIK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:2.923977e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(3, 9), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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+Mo_Tai_iTRAQ_f8 0.1.15885	16	chr8	85553360	255	45M	*	0	0	TCGCCTCTCTGGATTTGACAATACTTCATATGCAAAACTTATTTC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:EISFAYEVLSNPERR	XR:Z:EISFAYEVLSNPEKR	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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+Mo_Tai_iTRAQ_f4 0.1.13698	16	chrX	74226885	255	69M	*	0	0	GCGGGCGTCACCAGACGGAGAAGCCACAGGCACCACGAAGGGGCTATCAGGTATGTGCTCCTCGTCGAA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:FDEEHIPDSPFVVPVASPSGDAR	XR:Z:FNEEHIPDSPFVVPVASPSGDAR	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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+Mo_Tai_iTRAQ_f8 0.1.7600	16	chr17	36949355	255	90M	*	0	0	GTGCTGCATAGGTCCTGGAGGGGGCTGAGAGGGATCAGGAGGCTGTGGAGGAGTGGTTGGGGTGGGTGCTGGGGTTGTAGGACGCCGTCC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:GRRPTTPAPTPTTPPQPPDPSQPPPGPMQH	XR:Z:GRRPTTPAPTPTTPPQPPDPSKPPPGPMQH	XC:i:4	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.1579	16	chr18	34938644	255	27M	*	0	0	CCTGATGTTCTCTCCTGTCTCACTGCC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:GSETGENIR	XR:Z:DSETGENIR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.1750	16	chr18	34938644	255	27M	*	0	0	CCTGATGTTCTCTCCTGTCTCACTGCC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:GSETGENIR	XR:Z:DSETGENIR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:2.237136e-02	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f6 0.1.1980	16	chr18	34938644	255	27M	*	0	0	CCTGATGTTCTCTCCTGTCTCACTGCC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:GSETGENIR	XR:Z:DSETGENIR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:2.898551e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f8 0.1.11694	16	chr18	34938608	255	63M	*	0	0	TTTCAATGACGCCTGCTGTAGGGAAGATGCTGCCTGCCTGATGTTCTCTCCTGTCTCACTGCC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:GSETGENIRQAASSLQQASLK	XR:Z:DSETGENIRQAASSLQQASLK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(21), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f8 0.1.9738	16	chr5	123547093	255	30M	*	0	0	CTTGATCTCCCCGCCTGTCTTAGCGTTGTG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:HNAKTGGEIK	XR:Z:HNAKTVGEIK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:2.064897e-01	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(4, 10), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
 Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.4170	0	chr7	65691191	255	24M	*	0	0	ATCGACAATGCAGTAAATGTTCGA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:IDNAVNVR	XR:Z:INNAVNVR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:1.155606e-01	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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 Mo_Tai_iTRAQ_f6 0.1.13161	0	chr8	72135361	255	60M	*	0	0	ATCCAGGCCCTGCAGCAGCAGGCAGACGACGCAGAGGATCGCGCGCAAGGCCTGCAGCGC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:IQALQQQADDAEDRAQGLQR	XR:Z:IQALQQQADDAEDRAQGLQR	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
@@ -143,39 +143,39 @@
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 Mo_Tai_iTRAQ_f3 0.1.8109	0	chr5	123239670	255	42M	*	0	0	CTGGCCTCCAACAGCCCCGCCCTGCCCCAGGCCTTTGCCAGA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:LASNSPALPQAFAR	XR:Z:LASNSPVLPQAFAR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
 Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.16441	0	chr8	72144690	255	27M	*	0	0	TTGGTCATCCTGGAGGGTGAGCTGAAG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:LVILEGELK	XR:Z:LVILEGELK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(9), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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 Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.13232	0	chr8	72143496	255	27M	*	0	0	ATGGAGATCCTGGAGATGCAGCTCAAA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:MEILEMQLK	XR:Z:MEILEMQLK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:1.365188e-02	XM:Z:Oxidation of M(1), iTRAQ 4-plex of K(9), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
 Mo_Tai_iTRAQ_f3 0.1.5182	0	chr7	3630887	255	19M1762N35M	*	0	0	CAAGCCAACGCGTCGGAAGTGATGGGACCAGTGGAGGCAGCTCCTGAGTACCGA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:QANASEVMGPVEAAPEYR	XR:Z:QANVSEVMGPVEAAPEYR	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:Oxidation of M(8), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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-Mo_Tai_iTRAQ_f6 0.1.14910	16	chr5	121445280	255	30M	*	0	0	GTCCCTGACCTACCGGAGGATTCACACTTC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:QGLDGLLSVK	XR:Z:QGQDGLLSVK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(10), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.14090	16	chr5	121445280	255	30M	*	0	0	CTTCACACTTAGGAGGCCATCCAGTCCCTG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:QGLDGLLSVK	XR:Z:QGQDGLLSVK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(10), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f6 0.1.14910	16	chr5	121445280	255	30M	*	0	0	CTTCACACTTAGGAGGCCATCCAGTCCCTG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:QGLDGLLSVK	XR:Z:QGQDGLLSVK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(10), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
 Mo_Tai_iTRAQ_f9 0.1.5212	0	chr5	120814546	255	42M	*	0	0	CAGCCGTGCGAGGTTCAGCATGAGAGACGTTGTGGAGTGAAG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:QPCEVQHERRCGVK	XR:Z:QLCEVQHERRCGVK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:1.785714e-02	XM:Z:Carbamidomethylation of C(3, 11), iTRAQ 4-plex of K(14), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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 Mo_Tai_iTRAQ_f3 0.1.8302	0	chr2	103091867	255	39M	*	0	0	CGTCATGGGGTGAACGTGTGGGGAGAAACATGGGAGAAA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:RHGVNVWGETWEK	XR:Z:RHGVYVWGETWEK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:1.283582e-01	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(13), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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-Mo_Tai_iTRAQ_f4 0.1.13289	16	chr14	54664714	255	45M	*	0	0	AGACGAGGGGAGGGAGATTGTCACCTCCTCAACCGTGGACGGTTT	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:SAPLPLTVEELAPAK	XR:Z:SAPLPLTVEEFAPAK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:5.660377e-02	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(15), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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 Mo_Tai_iTRAQ_f3 0.1.5021	0	chr17	23821341	255	63M	*	0	0	TCAGTTGCCCAGACCACTCCTGTAGCAGGGTCTCAGTCCCTTTCATCCGGGACAGTAGCGAAG	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:SVAQTTPVAGSQSLSSGTVAK	XR:Z:SVVQTTPVAGSQSLSSGTVAK	XC:i:3	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(21), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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 Mo_Tai_iTRAQ_f3 0.1.5705	0	chr2	120022722	255	27M	*	0	0	ACAGAGTCTCGGAGCATCTCATCACGA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:TESRSISSR	XR:Z:TESQSISSR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:1.481481e-01	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
 Mo_Tai_iTRAQ_f4 0.1.6840	0	chr2	120022722	255	27M	*	0	0	ACAGAGTCTCGGAGCATCTCATCACGA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:TESRSISSR	XR:Z:TESQSISSR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:2.667984e-01	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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 Mo_Tai_iTRAQ_f6 0.1.8367	0	chr8	72147249	255	19M4474N5M	*	0	0	ACAATCGATGACCTGGAAGAAAAA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:TIDDLEEK	XR:Z:TIDDLEEK	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:3.04878e-03	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(8), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:N
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-Mo_Tai_iTRAQ_f4 0.1.3241	16	chr8	4268354	255	24M	*	0	0	TGGTAGCTTAGTCTTTGACACGCA	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:TIESETVR	XR:Z:SIESETVR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
+Mo_Tai_iTRAQ_f5 0.1.3743	16	chr8	4268354	255	24M	*	0	0	ACGCACAGTTTCTGATTCGATGGT	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:TIESETVR	XR:Z:SIESETVR	XC:i:2	XS:f:NA	XQ:f:9.578107e-02	XM:Z:iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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+Mo_Tai_iTRAQ_f8 0.1.14638	16	chr14	54514786	255	90M	*	0	0	TTTCTCTTCTCCACTGTACTCCTCTGTGTGTGTAGTCGGGGCATTCGCAATTACATCATCTCTCAGGTCCTCTGGGGCCACCAAGGGTAC	*	XA:Z:0	NH:i:1	XL:i:1	XP:Z:VPLVAPEDLRDDVIANAPTTHTEEYSGEEK	XR:Z:VPLVAPEDLRDDVIENAPTTHTEEYSGEEK	XC:i:4	XS:f:NA	XQ:f:0e+00	XM:Z:iTRAQ 4-plex of K(30), iTRAQ 4-plex of peptide N-term(1)	XN:i:NA	XT:i:NA	XG:Z:V
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