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comparison test-data/art.solid.02_F5.map @ 0:b98d6fffd00b draft

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author iuc
date Thu, 11 Jun 2015 11:51:06 -0400
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1 ##ART_SOLiD read_length 50
2 @CM art_SOLiD -s -r 42 test-data/input.fa test-data/art.solid.02 50 50 20 75 10
3 @SQ chr1 1626
4 ##Header End
5 chr1 1_1_1_F5 88 - 1 7 32
6 chr1 1_1_2_F5 1423 - 2 21 03 34 13
7 chr1 1_1_3_F5 809 + 0
8 chr1 1_1_4_F5 181 + 0
9 chr1 1_1_5_F5 948 - 2 1 32 35 23
10 chr1 1_1_6_F5 1218 - 3 24 02 34 03 46 10
11 chr1 1_1_7_F5 86 + 2 13 30 48 10
12 chr1 1_1_8_F5 179 - 0
13 chr1 1_1_9_F5 282 - 1 32 32
14 chr1 1_1_10_F5 1136 - 2 33 03 35 32
15 chr1 1_1_11_F5 636 + 1 32 32
16 chr1 1_1_12_F5 393 + 6 13 01 34 03 41 20 42 03 47 21 49 30
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18 chr1 1_1_14_F5 681 - 4 2 13 19 03 32 03 49 13
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23 chr1 1_1_19_F5 541 + 0
24 chr1 1_1_20_F5 729 - 1 49 13
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26 chr1 1_1_22_F5 1101 + 2 40 03 43 23
27 chr1 1_1_23_F5 1471 - 1 47 32
28 chr1 1_1_24_F5 563 - 2 13 23 38 30
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34 chr1 1_1_30_F5 333 - 2 35 32 46 02
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40 chr1 1_1_36_F5 609 - 2 6 32 17 13
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43 chr1 1_1_39_F5 1250 + 2 13 23 42 13
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45 chr1 1_1_41_F5 544 + 2 8 32 37 03
46 chr1 1_1_42_F5 1417 - 0
47 chr1 1_1_43_F5 120 + 2 46 30 48 02
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232 chr1 1_1_228_F5 492 - 1 40 13
233 chr1 1_1_229_F5 1240 - 3 14 32 30 13 43 23
234 chr1 1_1_230_F5 117 - 2 23 32 37 03
235 chr1 1_1_231_F5 57 + 1 23 32
236 chr1 1_1_232_F5 295 + 4 12 23 19 23 39 23 43 02
237 chr1 1_1_233_F5 443 - 2 7 03 44 03
238 chr1 1_1_234_F5 762 - 4 24 32 32 03 47 23 49 32
239 chr1 1_1_235_F5 638 - 3 22 32 30 12 48 32
240 chr1 1_1_236_F5 745 - 2 14 10 47 03
241 chr1 1_1_237_F5 1297 - 0
242 chr1 1_1_238_F5 1538 - 2 34 03 40 10
243 chr1 1_1_239_F5 368 + 0
244 chr1 1_1_240_F5 956 + 0
245 chr1 1_1_241_F5 1489 - 1 43 32
246 chr1 1_1_242_F5 523 + 1 6 23
247 chr1 1_1_243_F5 1095 - 1 48 32
248 chr1 1_1_244_F5 1156 + 1 23 32
249 chr1 1_1_245_F5 641 - 4 28 03 36 03 41 10 42 13
250 chr1 1_1_246_F5 277 + 3 24 32 30 23 33 23
251 chr1 1_1_247_F5 1136 + 2 24 30 42 32
252 chr1 1_1_248_F5 219 - 0
253 chr1 1_1_249_F5 988 - 1 19 32
254 chr1 1_1_250_F5 694 - 0
255 chr1 1_1_251_F5 1042 + 0
256 chr1 1_1_252_F5 278 - 1 29 32
257 chr1 1_1_253_F5 1125 - 0
258 chr1 1_1_254_F5 1380 - 3 3 02 23 03 26 03
259 chr1 1_1_255_F5 1264 + 2 8 03 31 02
260 chr1 1_1_256_F5 328 + 1 30 02
261 chr1 1_1_257_F5 1267 + 2 47 32 48 23
262 chr1 1_1_258_F5 71 + 2 32 13 39 03
263 chr1 1_1_259_F5 445 - 2 39 13 48 02
264 chr1 1_1_260_F5 1147 + 2 13 32 27 01
265 chr1 1_1_261_F5 1529 + 0
266 chr1 1_1_262_F5 1566 - 1 42 23
267 chr1 1_1_263_F5 338 - 2 33 03 41 03
268 chr1 1_1_264_F5 1101 + 0
269 chr1 1_1_265_F5 578 + 1 11 03
270 chr1 1_1_266_F5 246 + 0
271 chr1 1_1_267_F5 1491 - 3 20 01 34 03 41 30
272 chr1 1_1_268_F5 374 - 1 47 13
273 chr1 1_1_269_F5 978 - 3 14 32 18 01 20 32
274 chr1 1_1_270_F5 1110 + 0
275 chr1 1_1_271_F5 1516 - 3 25 13 34 13 45 13
276 chr1 1_1_272_F5 1263 + 1 25 03
277 chr1 1_1_273_F5 295 - 3 20 03 42 30 48 01
278 chr1 1_1_274_F5 845 - 4 12 03 46 03 47 03 48 03
279 chr1 1_1_275_F5 1076 + 1 22 20
280 chr1 1_1_276_F5 559 + 4 1 03 33 30 46 32 47 02
281 chr1 1_1_277_F5 1001 + 2 34 23 45 02
282 chr1 1_1_278_F5 912 - 4 18 01 25 32 31 03 33 03
283 chr1 1_1_279_F5 188 + 2 13 32 32 02
284 chr1 1_1_280_F5 1043 + 0
285 chr1 1_1_281_F5 1436 + 1 31 13
286 chr1 1_1_282_F5 1225 + 3 23 32 24 32 47 02
287 chr1 1_1_283_F5 623 - 0
288 chr1 1_1_284_F5 1387 + 0
289 chr1 1_1_285_F5 461 - 2 40 23 48 03
290 chr1 1_1_286_F5 1531 - 2 40 32 43 13
291 chr1 1_1_287_F5 529 + 3 24 02 35 31 48 32
292 chr1 1_1_288_F5 1300 + 2 36 20 44 21
293 chr1 1_1_289_F5 540 + 2 20 03 24 32
294 chr1 1_1_290_F5 464 - 1 48 32
295 chr1 1_1_291_F5 1344 + 1 13 32
296 chr1 1_1_292_F5 776 + 3 23 32 35 01 47 13
297 chr1 1_1_293_F5 271 + 1 10 03
298 chr1 1_1_294_F5 699 - 3 13 13 37 12 47 13
299 chr1 1_1_295_F5 89 + 2 34 32 45 13
300 chr1 1_1_296_F5 349 - 0
301 chr1 1_1_297_F5 67 + 2 7 03 13 31
302 chr1 1_1_298_F5 577 - 3 34 03 40 32 41 30
303 chr1 1_1_299_F5 206 + 3 8 01 32 30 49 12
304 chr1 1_1_300_F5 377 + 2 29 03 39 02
305 chr1 1_1_301_F5 1012 + 2 42 32 48 03
306 chr1 1_1_302_F5 677 + 2 28 30 30 13
307 chr1 1_1_303_F5 733 + 0
308 chr1 1_1_304_F5 1261 - 2 14 23 46 13
309 chr1 1_1_305_F5 686 + 0
310 chr1 1_1_306_F5 1084 + 1 13 13
311 chr1 1_1_307_F5 229 + 2 1 01 4 03
312 chr1 1_1_308_F5 838 + 2 13 32 47 02
313 chr1 1_1_309_F5 152 - 1 42 03
314 chr1 1_1_310_F5 1248 - 2 0 01 41 13
315 chr1 1_1_311_F5 914 + 0
316 chr1 1_1_312_F5 1232 - 2 34 13 48 03
317 chr1 1_1_313_F5 1095 - 2 14 13 20 32
318 chr1 1_1_314_F5 1027 - 1 48 03
319 chr1 1_1_315_F5 1343 + 2 3 13 38 23
320 chr1 1_1_316_F5 335 - 0
321 chr1 1_1_317_F5 1201 + 1 35 03
322 chr1 1_1_318_F5 1076 - 1 47 23
323 chr1 1_1_319_F5 447 - 0
324 chr1 1_1_320_F5 38 - 1 8 03