view test-data/art.solid.02_F5.map @ 0:b98d6fffd00b draft

planemo upload for repository https://github.com/galaxyproject/tools-iuc/tree/master/tools/art commit 2b8fe4bffea74c80e20d2d4d0c426cc1631fc05f
author iuc
date Thu, 11 Jun 2015 11:51:06 -0400
parents
children
line wrap: on
line source

##ART_SOLiD	read_length	50
@CM	art_SOLiD -s -r 42 test-data/input.fa test-data/art.solid.02 50 50 20 75 10 
@SQ	chr1	1626
##Header End
chr1	1_1_1_F5	88	-	1	7	32
chr1	1_1_2_F5	1423	-	2	21	03	34	13
chr1	1_1_3_F5	809	+	0
chr1	1_1_4_F5	181	+	0
chr1	1_1_5_F5	948	-	2	1	32	35	23
chr1	1_1_6_F5	1218	-	3	24	02	34	03	46	10
chr1	1_1_7_F5	86	+	2	13	30	48	10
chr1	1_1_8_F5	179	-	0
chr1	1_1_9_F5	282	-	1	32	32
chr1	1_1_10_F5	1136	-	2	33	03	35	32
chr1	1_1_11_F5	636	+	1	32	32
chr1	1_1_12_F5	393	+	6	13	01	34	03	41	20	42	03	47	21	49	30
chr1	1_1_13_F5	370	-	1	47	23
chr1	1_1_14_F5	681	-	4	2	13	19	03	32	03	49	13
chr1	1_1_15_F5	372	-	1	41	32
chr1	1_1_16_F5	493	+	2	7	01	46	31
chr1	1_1_17_F5	722	+	1	49	32
chr1	1_1_18_F5	1447	-	1	39	12
chr1	1_1_19_F5	541	+	0
chr1	1_1_20_F5	729	-	1	49	13
chr1	1_1_21_F5	415	+	2	20	03	35	32
chr1	1_1_22_F5	1101	+	2	40	03	43	23
chr1	1_1_23_F5	1471	-	1	47	32
chr1	1_1_24_F5	563	-	2	13	23	38	30
chr1	1_1_25_F5	1033	-	1	20	03
chr1	1_1_26_F5	1290	-	3	18	02	31	12	44	03
chr1	1_1_27_F5	1314	-	1	48	02
chr1	1_1_28_F5	393	+	3	23	02	42	02	49	32
chr1	1_1_29_F5	237	+	1	31	02
chr1	1_1_30_F5	333	-	2	35	32	46	02
chr1	1_1_31_F5	387	+	2	5	02	35	12
chr1	1_1_32_F5	1372	-	3	16	32	44	03	49	02
chr1	1_1_33_F5	1043	-	3	8	31	32	03	38	23
chr1	1_1_34_F5	860	+	2	8	13	9	03
chr1	1_1_35_F5	359	+	3	13	32	21	03	28	23
chr1	1_1_36_F5	609	-	2	6	32	17	13
chr1	1_1_37_F5	220	-	1	45	03
chr1	1_1_38_F5	662	+	2	8	30	19	01
chr1	1_1_39_F5	1250	+	2	13	23	42	13
chr1	1_1_40_F5	570	+	2	6	12	12	32
chr1	1_1_41_F5	544	+	2	8	32	37	03
chr1	1_1_42_F5	1417	-	0
chr1	1_1_43_F5	120	+	2	46	30	48	02
chr1	1_1_44_F5	738	+	1	48	03
chr1	1_1_45_F5	697	-	3	16	01	28	02	46	32
chr1	1_1_46_F5	92	+	1	25	32
chr1	1_1_47_F5	161	-	0
chr1	1_1_48_F5	46	-	1	48	13
chr1	1_1_49_F5	272	-	1	47	02
chr1	1_1_50_F5	318	-	1	39	30
chr1	1_1_51_F5	1141	+	2	15	01	23	01
chr1	1_1_52_F5	1209	-	3	46	30	47	03	48	13
chr1	1_1_53_F5	180	+	2	23	13	49	30
chr1	1_1_54_F5	321	-	0
chr1	1_1_55_F5	949	-	2	36	02	45	03
chr1	1_1_56_F5	1369	+	0
chr1	1_1_57_F5	882	-	0
chr1	1_1_58_F5	1286	+	1	30	03
chr1	1_1_59_F5	273	+	0
chr1	1_1_60_F5	894	-	1	33	32
chr1	1_1_61_F5	1159	+	1	31	03
chr1	1_1_62_F5	1464	-	2	44	03	48	03
chr1	1_1_63_F5	1531	+	0
chr1	1_1_64_F5	1087	+	0
chr1	1_1_65_F5	452	+	0
chr1	1_1_66_F5	830	-	0
chr1	1_1_67_F5	807	+	2	29	03	49	32
chr1	1_1_68_F5	652	-	0
chr1	1_1_69_F5	514	+	3	17	13	32	01	37	03
chr1	1_1_70_F5	1542	+	1	35	32
chr1	1_1_71_F5	441	-	1	43	13
chr1	1_1_72_F5	1530	+	0
chr1	1_1_73_F5	998	-	3	15	03	43	32	45	03
chr1	1_1_74_F5	741	-	1	24	32
chr1	1_1_75_F5	1132	-	1	35	03
chr1	1_1_76_F5	406	+	2	14	03	47	03
chr1	1_1_77_F5	956	-	2	31	03	37	32
chr1	1_1_78_F5	402	-	2	3	20	39	03
chr1	1_1_79_F5	1090	-	0
chr1	1_1_80_F5	1161	+	1	49	12
chr1	1_1_81_F5	165	-	0
chr1	1_1_82_F5	124	-	1	19	30
chr1	1_1_83_F5	198	+	2	14	03	48	03
chr1	1_1_84_F5	1013	-	2	26	32	49	32
chr1	1_1_85_F5	582	-	1	35	32
chr1	1_1_86_F5	1105	-	2	34	23	48	12
chr1	1_1_87_F5	262	+	0
chr1	1_1_88_F5	1118	-	0
chr1	1_1_89_F5	540	+	2	23	32	45	32
chr1	1_1_90_F5	1313	+	2	25	30	40	23
chr1	1_1_91_F5	624	+	1	47	13
chr1	1_1_92_F5	1554	-	2	47	13	48	13
chr1	1_1_93_F5	721	+	0
chr1	1_1_94_F5	82	+	2	34	02	45	02
chr1	1_1_95_F5	405	-	1	22	03
chr1	1_1_96_F5	139	-	2	32	32	40	32
chr1	1_1_97_F5	1364	-	1	40	03
chr1	1_1_98_F5	1535	+	2	33	13	45	03
chr1	1_1_99_F5	1404	+	3	20	02	28	03	39	30
chr1	1_1_100_F5	228	-	3	15	13	30	03	40	03
chr1	1_1_101_F5	386	+	3	30	03	31	12	35	30
chr1	1_1_102_F5	471	+	1	48	13
chr1	1_1_103_F5	366	-	1	47	32
chr1	1_1_104_F5	978	+	1	5	03
chr1	1_1_105_F5	1438	-	0
chr1	1_1_106_F5	623	+	1	27	23
chr1	1_1_107_F5	1443	+	1	44	32
chr1	1_1_108_F5	1095	-	3	7	03	35	03	39	31
chr1	1_1_109_F5	652	+	1	46	30
chr1	1_1_110_F5	239	-	7	2	03	4	12	13	03	31	32	36	13	39	02	48	13
chr1	1_1_111_F5	539	+	0
chr1	1_1_112_F5	1114	-	1	36	32
chr1	1_1_113_F5	45	+	2	26	03	45	32
chr1	1_1_114_F5	853	+	1	31	32
chr1	1_1_115_F5	814	+	1	37	32
chr1	1_1_116_F5	668	-	4	13	03	30	32	32	02	46	10
chr1	1_1_117_F5	46	-	1	24	01
chr1	1_1_118_F5	1526	+	2	3	03	21	13
chr1	1_1_119_F5	300	+	2	8	01	18	03
chr1	1_1_120_F5	1056	-	2	17	01	47	12
chr1	1_1_121_F5	359	-	2	12	01	34	03
chr1	1_1_122_F5	1406	-	0
chr1	1_1_123_F5	346	-	0
chr1	1_1_124_F5	292	+	2	44	13	48	32
chr1	1_1_125_F5	24	+	1	19	13
chr1	1_1_126_F5	791	-	1	33	03
chr1	1_1_127_F5	791	-	0
chr1	1_1_128_F5	612	-	4	0	01	7	13	34	03	41	30
chr1	1_1_129_F5	500	+	2	37	12	44	03
chr1	1_1_130_F5	453	+	1	40	13
chr1	1_1_131_F5	1396	+	1	22	03
chr1	1_1_132_F5	956	+	1	33	03
chr1	1_1_133_F5	564	+	1	18	31
chr1	1_1_134_F5	1274	-	2	23	32	25	13
chr1	1_1_135_F5	1398	-	0
chr1	1_1_136_F5	1039	+	1	17	13
chr1	1_1_137_F5	394	-	1	15	01
chr1	1_1_138_F5	1568	-	0
chr1	1_1_139_F5	191	+	2	41	23	43	03
chr1	1_1_140_F5	716	-	2	26	32	47	32
chr1	1_1_141_F5	1402	+	1	35	12
chr1	1_1_142_F5	1559	-	1	48	32
chr1	1_1_143_F5	1097	-	0
chr1	1_1_144_F5	329	+	3	4	32	7	13	24	23
chr1	1_1_145_F5	1231	+	2	7	13	21	30
chr1	1_1_146_F5	1421	-	3	42	01	46	32	48	32
chr1	1_1_147_F5	1438	+	1	15	02
chr1	1_1_148_F5	725	-	1	10	03
chr1	1_1_149_F5	1274	+	0
chr1	1_1_150_F5	1484	-	1	35	23
chr1	1_1_151_F5	1559	-	5	13	02	14	32	18	01	29	13	46	03
chr1	1_1_152_F5	770	+	1	16	03
chr1	1_1_153_F5	842	+	3	19	32	36	32	47	21
chr1	1_1_154_F5	264	+	2	14	03	47	03
chr1	1_1_155_F5	414	+	2	8	13	19	31
chr1	1_1_156_F5	1060	+	1	37	13
chr1	1_1_157_F5	668	-	0
chr1	1_1_158_F5	276	+	2	7	32	46	23
chr1	1_1_159_F5	1218	-	0
chr1	1_1_160_F5	762	-	0
chr1	1_1_161_F5	1339	+	0
chr1	1_1_162_F5	473	+	3	22	13	34	13	46	13
chr1	1_1_163_F5	1105	+	3	12	03	29	02	45	03
chr1	1_1_164_F5	879	-	2	41	31	48	32
chr1	1_1_165_F5	1487	-	5	31	32	33	03	39	03	42	10	47	13
chr1	1_1_166_F5	47	+	1	29	13
chr1	1_1_167_F5	1350	+	4	28	03	30	21	33	13	35	03
chr1	1_1_168_F5	709	+	0
chr1	1_1_169_F5	383	-	3	34	23	39	12	49	03
chr1	1_1_170_F5	378	+	3	7	30	12	03	35	03
chr1	1_1_171_F5	108	-	3	25	13	37	03	48	03
chr1	1_1_172_F5	774	-	0
chr1	1_1_173_F5	175	+	0
chr1	1_1_174_F5	637	+	0
chr1	1_1_175_F5	399	+	0
chr1	1_1_176_F5	278	+	2	21	13	49	13
chr1	1_1_177_F5	746	-	1	47	23
chr1	1_1_178_F5	1293	+	3	6	13	40	13	43	23
chr1	1_1_179_F5	1566	-	1	40	32
chr1	1_1_180_F5	536	+	1	23	13
chr1	1_1_181_F5	1250	-	3	32	03	34	32	49	13
chr1	1_1_182_F5	1331	-	0
chr1	1_1_183_F5	916	+	3	32	32	41	03	44	03
chr1	1_1_184_F5	1298	-	0
chr1	1_1_185_F5	883	+	3	27	30	35	13	49	32
chr1	1_1_186_F5	1561	+	0
chr1	1_1_187_F5	1315	-	4	0	03	7	32	40	30	49	12
chr1	1_1_188_F5	741	-	0
chr1	1_1_189_F5	336	-	1	47	02
chr1	1_1_190_F5	1071	+	1	14	03
chr1	1_1_191_F5	419	+	2	8	02	34	02
chr1	1_1_192_F5	473	+	2	25	03	47	03
chr1	1_1_193_F5	305	+	1	13	03
chr1	1_1_194_F5	252	-	0
chr1	1_1_195_F5	882	-	4	5	23	29	03	33	23	36	13
chr1	1_1_196_F5	1420	+	0
chr1	1_1_197_F5	891	+	0
chr1	1_1_198_F5	1393	-	2	36	13	47	23
chr1	1_1_199_F5	1343	+	1	32	02
chr1	1_1_200_F5	1301	-	1	22	01
chr1	1_1_201_F5	831	-	0
chr1	1_1_202_F5	1061	+	1	41	10
chr1	1_1_203_F5	1013	-	1	26	30
chr1	1_1_204_F5	344	-	3	25	02	30	32	45	03
chr1	1_1_205_F5	1359	-	1	5	13
chr1	1_1_206_F5	832	-	1	41	02
chr1	1_1_207_F5	956	-	4	1	03	32	03	45	03	49	03
chr1	1_1_208_F5	619	+	1	42	32
chr1	1_1_209_F5	651	+	2	37	10	40	13
chr1	1_1_210_F5	1361	-	3	22	03	39	13	41	02
chr1	1_1_211_F5	1283	+	4	23	23	29	32	30	13	34	30
chr1	1_1_212_F5	1157	-	1	42	01
chr1	1_1_213_F5	1484	+	1	39	03
chr1	1_1_214_F5	842	-	1	5	03
chr1	1_1_215_F5	1250	-	3	31	32	33	20	37	03
chr1	1_1_216_F5	670	-	2	29	01	34	32
chr1	1_1_217_F5	1424	-	1	0	01
chr1	1_1_218_F5	800	+	2	18	23	27	03
chr1	1_1_219_F5	1512	-	2	39	10	44	20
chr1	1_1_220_F5	128	-	1	22	23
chr1	1_1_221_F5	301	-	3	20	30	37	03	48	13
chr1	1_1_222_F5	641	-	0
chr1	1_1_223_F5	920	-	1	24	13
chr1	1_1_224_F5	1284	+	4	0	23	11	03	29	10	47	23
chr1	1_1_225_F5	1373	+	2	27	02	40	13
chr1	1_1_226_F5	1297	+	1	23	03
chr1	1_1_227_F5	238	-	1	49	12
chr1	1_1_228_F5	492	-	1	40	13
chr1	1_1_229_F5	1240	-	3	14	32	30	13	43	23
chr1	1_1_230_F5	117	-	2	23	32	37	03
chr1	1_1_231_F5	57	+	1	23	32
chr1	1_1_232_F5	295	+	4	12	23	19	23	39	23	43	02
chr1	1_1_233_F5	443	-	2	7	03	44	03
chr1	1_1_234_F5	762	-	4	24	32	32	03	47	23	49	32
chr1	1_1_235_F5	638	-	3	22	32	30	12	48	32
chr1	1_1_236_F5	745	-	2	14	10	47	03
chr1	1_1_237_F5	1297	-	0
chr1	1_1_238_F5	1538	-	2	34	03	40	10
chr1	1_1_239_F5	368	+	0
chr1	1_1_240_F5	956	+	0
chr1	1_1_241_F5	1489	-	1	43	32
chr1	1_1_242_F5	523	+	1	6	23
chr1	1_1_243_F5	1095	-	1	48	32
chr1	1_1_244_F5	1156	+	1	23	32
chr1	1_1_245_F5	641	-	4	28	03	36	03	41	10	42	13
chr1	1_1_246_F5	277	+	3	24	32	30	23	33	23
chr1	1_1_247_F5	1136	+	2	24	30	42	32
chr1	1_1_248_F5	219	-	0
chr1	1_1_249_F5	988	-	1	19	32
chr1	1_1_250_F5	694	-	0
chr1	1_1_251_F5	1042	+	0
chr1	1_1_252_F5	278	-	1	29	32
chr1	1_1_253_F5	1125	-	0
chr1	1_1_254_F5	1380	-	3	3	02	23	03	26	03
chr1	1_1_255_F5	1264	+	2	8	03	31	02
chr1	1_1_256_F5	328	+	1	30	02
chr1	1_1_257_F5	1267	+	2	47	32	48	23
chr1	1_1_258_F5	71	+	2	32	13	39	03
chr1	1_1_259_F5	445	-	2	39	13	48	02
chr1	1_1_260_F5	1147	+	2	13	32	27	01
chr1	1_1_261_F5	1529	+	0
chr1	1_1_262_F5	1566	-	1	42	23
chr1	1_1_263_F5	338	-	2	33	03	41	03
chr1	1_1_264_F5	1101	+	0
chr1	1_1_265_F5	578	+	1	11	03
chr1	1_1_266_F5	246	+	0
chr1	1_1_267_F5	1491	-	3	20	01	34	03	41	30
chr1	1_1_268_F5	374	-	1	47	13
chr1	1_1_269_F5	978	-	3	14	32	18	01	20	32
chr1	1_1_270_F5	1110	+	0
chr1	1_1_271_F5	1516	-	3	25	13	34	13	45	13
chr1	1_1_272_F5	1263	+	1	25	03
chr1	1_1_273_F5	295	-	3	20	03	42	30	48	01
chr1	1_1_274_F5	845	-	4	12	03	46	03	47	03	48	03
chr1	1_1_275_F5	1076	+	1	22	20
chr1	1_1_276_F5	559	+	4	1	03	33	30	46	32	47	02
chr1	1_1_277_F5	1001	+	2	34	23	45	02
chr1	1_1_278_F5	912	-	4	18	01	25	32	31	03	33	03
chr1	1_1_279_F5	188	+	2	13	32	32	02
chr1	1_1_280_F5	1043	+	0
chr1	1_1_281_F5	1436	+	1	31	13
chr1	1_1_282_F5	1225	+	3	23	32	24	32	47	02
chr1	1_1_283_F5	623	-	0
chr1	1_1_284_F5	1387	+	0
chr1	1_1_285_F5	461	-	2	40	23	48	03
chr1	1_1_286_F5	1531	-	2	40	32	43	13
chr1	1_1_287_F5	529	+	3	24	02	35	31	48	32
chr1	1_1_288_F5	1300	+	2	36	20	44	21
chr1	1_1_289_F5	540	+	2	20	03	24	32
chr1	1_1_290_F5	464	-	1	48	32
chr1	1_1_291_F5	1344	+	1	13	32
chr1	1_1_292_F5	776	+	3	23	32	35	01	47	13
chr1	1_1_293_F5	271	+	1	10	03
chr1	1_1_294_F5	699	-	3	13	13	37	12	47	13
chr1	1_1_295_F5	89	+	2	34	32	45	13
chr1	1_1_296_F5	349	-	0
chr1	1_1_297_F5	67	+	2	7	03	13	31
chr1	1_1_298_F5	577	-	3	34	03	40	32	41	30
chr1	1_1_299_F5	206	+	3	8	01	32	30	49	12
chr1	1_1_300_F5	377	+	2	29	03	39	02
chr1	1_1_301_F5	1012	+	2	42	32	48	03
chr1	1_1_302_F5	677	+	2	28	30	30	13
chr1	1_1_303_F5	733	+	0
chr1	1_1_304_F5	1261	-	2	14	23	46	13
chr1	1_1_305_F5	686	+	0
chr1	1_1_306_F5	1084	+	1	13	13
chr1	1_1_307_F5	229	+	2	1	01	4	03
chr1	1_1_308_F5	838	+	2	13	32	47	02
chr1	1_1_309_F5	152	-	1	42	03
chr1	1_1_310_F5	1248	-	2	0	01	41	13
chr1	1_1_311_F5	914	+	0
chr1	1_1_312_F5	1232	-	2	34	13	48	03
chr1	1_1_313_F5	1095	-	2	14	13	20	32
chr1	1_1_314_F5	1027	-	1	48	03
chr1	1_1_315_F5	1343	+	2	3	13	38	23
chr1	1_1_316_F5	335	-	0
chr1	1_1_317_F5	1201	+	1	35	03
chr1	1_1_318_F5	1076	-	1	47	23
chr1	1_1_319_F5	447	-	0
chr1	1_1_320_F5	38	-	1	8	03